RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000495423.1

SIMC1-208, Transcript of SUMO interacting motifs containing 1, humanhuman

TSL 2

Gene SIMC1, Length 913 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIMC1-208ENST00000495423 LOC107983988A0A1B0GUW6 1196 aaPredicted RBP23■■□□□ 1.27
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SIMC1-208ENST00000495423 HTRA2O43464 458 aaPredicted RBP23■■□□□ 1.27
SIMC1-208ENST00000495423 HEXIM1O94992 359 aaKnown RBP23■■□□□ 1.27
SIMC1-208ENST00000495423 VIPR1P32241 457 aa23■■□□□ 1.27
SIMC1-208ENST00000495423 ADCY8P40145 1251 aa23■■□□□ 1.27
SIMC1-208ENST00000495423 RENBPP51606 427 aa23■■□□□ 1.27
SIMC1-208ENST00000495423 GPLD1P80108 840 aa23■■□□□ 1.27
SIMC1-208ENST00000495423 MESDQ14696 234 aa23■■□□□ 1.27
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SIMC1-208ENST00000495423 GPATCH2LQ9NWQ4 482 aa23■■□□□ 1.27
SIMC1-208ENST00000495423 KCNK4Q9NYG8 393 aa23■■□□□ 1.27
SIMC1-208ENST00000495423 TMEM9Q9P0T7 183 aa23■■□□□ 1.27
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SIMC1-208ENST00000495423 MPSTP25325 297 aa22.99■■□□□ 1.27
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SIMC1-208ENST00000495423 ARHGAP36Q6ZRI8 547 aa22.99■■□□□ 1.27
SIMC1-208ENST00000495423 SYCE1Q8N0S2 351 aa22.99■■□□□ 1.27
SIMC1-208ENST00000495423 FAM71BQ8TC56 605 aa22.99■■□□□ 1.27
SIMC1-208ENST00000495423 PEBP4Q96S96 227 aa22.99■■□□□ 1.27
SIMC1-208ENST00000495423 PCSK1NQ9UHG2 260 aa22.99■■□□□ 1.27
SIMC1-208ENST00000495423 MYO9AB2RTY4 2548 aa22.99■■□□□ 1.27
SIMC1-208ENST00000495423 EFCAB7A8K855 629 aa22.98■■□□□ 1.27
SIMC1-208ENST00000495423 ZNF487B1APH4 448 aa22.98■■□□□ 1.27
SIMC1-208ENST00000495423 NKX2-8O15522 239 aa22.98■■□□□ 1.27
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SIMC1-208ENST00000495423 ETV3P41162 512 aa22.98■■□□□ 1.27
SIMC1-208ENST00000495423 FASLGP48023 281 aa22.98■■□□□ 1.27
SIMC1-208ENST00000495423 PDK2Q15119 407 aa22.98■■□□□ 1.27
SIMC1-208ENST00000495423 CA9Q16790 459 aa22.98■■□□□ 1.27
SIMC1-208ENST00000495423 RFX8Q6ZV50 586 aa22.98■■□□□ 1.27
SIMC1-208ENST00000495423 HSD11B1LQ7Z5J1 315 aa22.98■■□□□ 1.27
SIMC1-208ENST00000495423 FAM129CQ86XR2 697 aa22.98■■□□□ 1.27
SIMC1-208ENST00000495423 NPWQ8N729 165 aa22.98■■□□□ 1.27
SIMC1-208ENST00000495423 RTP4Q96DX8 246 aa22.98■■□□□ 1.27
SIMC1-208ENST00000495423 EFHD1Q9BUP0 239 aa22.98■■□□□ 1.27
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SIMC1-208ENST00000495423 GPN2Q9H9Y4 310 aaPredicted RBP22.98■■□□□ 1.27
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SIMC1-208ENST00000495423 DFFAO00273 331 aa22.97■■□□□ 1.27
SIMC1-208ENST00000495423 ZSCAN12O43309 604 aa22.97■■□□□ 1.27
SIMC1-208ENST00000495423 PSTPIP1O43586 416 aa22.97■■□□□ 1.27
SIMC1-208ENST00000495423 RARAP10276 462 aa22.97■■□□□ 1.27
SIMC1-208ENST00000495423 LHCGRP22888 699 aa22.97■■□□□ 1.27
SIMC1-208ENST00000495423 NFKBIAP25963 317 aa22.97■■□□□ 1.27
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SIMC1-208ENST00000495423 IL1R2P27930 398 aa22.97■■□□□ 1.27
SIMC1-208ENST00000495423 ACTR1BP42025 376 aa22.97■■□□□ 1.27
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SIMC1-208ENST00000495423 ACTR1AP61163 376 aa22.97■■□□□ 1.27
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SIMC1-208ENST00000495423 NLGN4YQ8NFZ3 816 aaPredicted RBP22.97■■□□□ 1.27
SIMC1-208ENST00000495423 KIAA1143Q96AT1 154 aaPredicted RBP22.97■■□□□ 1.27
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SIMC1-208ENST00000495423 MAN2B2Q9Y2E5 1009 aa22.97■■□□□ 1.27
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SIMC1-208ENST00000495423 PCDHGC4Q9Y5F7 938 aa22.97■■□□□ 1.27
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SIMC1-208ENST00000495423 CYP2A6P11509 494 aaPredicted RBP22.96■■□□□ 1.27
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SIMC1-208ENST00000495423 SLC10A7Q0GE19 358 aa22.96■■□□□ 1.27
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SIMC1-208ENST00000495423 LRRC57Q8N9N7 239 aa22.96■■□□□ 1.27
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SIMC1-208ENST00000495423 KCTD15Q96SI1 283 aaPredicted RBP22.96■■□□□ 1.27
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SIMC1-208ENST00000495423 SBDSQ9Y3A5 250 aaKnown RBP eCLIP22.96■■□□□ 1.27
SIMC1-208ENST00000495423 PLEKHM1Q9Y4G2 1056 aa22.96■■□□□ 1.27
SIMC1-208ENST00000495423 LOC101059948A0A1B0GTJ6 334 aa22.95■■□□□ 1.26
SIMC1-208ENST00000495423 TTC24A2A3L6 582 aaPredicted RBP22.95■■□□□ 1.26
SIMC1-208ENST00000495423 H3BRJ5 948 aa22.95■■□□□ 1.26
SIMC1-208ENST00000495423 DAPK3O43293 454 aa22.95■■□□□ 1.26
SIMC1-208ENST00000495423 SPOPO43791 374 aa22.95■■□□□ 1.26
SIMC1-208ENST00000495423 COMTP21964 271 aa22.95■■□□□ 1.26
SIMC1-208ENST00000495423 HSPA9P38646 679 aaKnown RBP22.95■■□□□ 1.26
SIMC1-208ENST00000495423 ARL4AP40617 200 aa22.95■■□□□ 1.26
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