RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492723.1

TOM1-216, Transcript of target of myb1 membrane trafficking protein, humanhuman

TSL 2

Gene TOM1, Length 2,568 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOM1-216ENST00000492723 ZFYVE1Q9HBF4 777 aa16.64■□□□□ 0.25
TOM1-216ENST00000492723 C15orf41Q9Y2V0 281 aa16.64■□□□□ 0.25
TOM1-216ENST00000492723 A0A0J9YYE9 177 aa16.63■□□□□ 0.25
TOM1-216ENST00000492723 CCDC189A1A4V9 331 aa16.63■□□□□ 0.25
TOM1-216ENST00000492723 RGSL1A5PLK6 1076 aa16.63■□□□□ 0.25
TOM1-216ENST00000492723 E5RI56 91 aa16.63■□□□□ 0.25
TOM1-216ENST00000492723 CDC7O00311 574 aa16.63■□□□□ 0.25
TOM1-216ENST00000492723 BTN3A1O00481 513 aa16.63■□□□□ 0.25
TOM1-216ENST00000492723 HTRA2O43464 458 aaPredicted RBP16.63■□□□□ 0.25
TOM1-216ENST00000492723 TRBC1P01850 177 aa16.63■□□□□ 0.25
TOM1-216ENST00000492723 PFKLP17858 780 aa16.63■□□□□ 0.25
TOM1-216ENST00000492723 HLA-FP30511 346 aa16.63■□□□□ 0.25
TOM1-216ENST00000492723 BMPR1AP36894 532 aa16.63■□□□□ 0.25
TOM1-216ENST00000492723 CSNK1DP48730 415 aa16.63■□□□□ 0.25
TOM1-216ENST00000492723 ERFP50548 548 aa16.63■□□□□ 0.25
TOM1-216ENST00000492723 RPL26P61254 145 aaKnown RBP16.63■□□□□ 0.25
TOM1-216ENST00000492723 TRMT5Q32P41 509 aaKnown RBP16.63■□□□□ 0.25
TOM1-216ENST00000492723 METTL3Q86U44 580 aaKnown RBP16.63■□□□□ 0.25
TOM1-216ENST00000492723 RIN3Q8TB24 985 aa16.63■□□□□ 0.25
TOM1-216ENST00000492723 POF1BQ8WVV4 589 aa16.63■□□□□ 0.25
TOM1-216ENST00000492723 MEAF6Q9HAF1 191 aa16.63■□□□□ 0.25
TOM1-216ENST00000492723 SARS2Q9NP81 518 aaKnown RBP16.63■□□□□ 0.25
TOM1-216ENST00000492723 COPG1Q9Y678 874 aaKnown RBP16.63■□□□□ 0.25
TOM1-216ENST00000492723 NPEPPSL1A6NEC2 478 aa16.63■□□□□ 0.25
TOM1-216ENST00000492723 AIM2O14862 343 aa16.63■□□□□ 0.25
TOM1-216ENST00000492723 SLC22A2O15244 555 aa16.63■□□□□ 0.25
TOM1-216ENST00000492723 ARSAP15289 507 aa16.63■□□□□ 0.25
TOM1-216ENST00000492723 HNF1BP35680 557 aa16.63■□□□□ 0.25
TOM1-216ENST00000492723 SESN3P58005 492 aa16.63■□□□□ 0.25
TOM1-216ENST00000492723 SATB1Q01826 763 aa16.63■□□□□ 0.25
TOM1-216ENST00000492723 CCDC6Q16204 474 aa16.63■□□□□ 0.25
TOM1-216ENST00000492723 TMEM25Q86YD3 366 aa16.63■□□□□ 0.25
TOM1-216ENST00000492723 OR2AP1Q8NGE2 309 aa16.63■□□□□ 0.25
TOM1-216ENST00000492723 ACTRT2Q8TDY3 377 aa16.63■□□□□ 0.25
TOM1-216ENST00000492723 IQCF5A8MTL0 148 aa16.62■□□□□ 0.25
TOM1-216ENST00000492723 A8MX80 341 aa16.62■□□□□ 0.25
TOM1-216ENST00000492723 SOCS5O75159 536 aa16.62■□□□□ 0.25
TOM1-216ENST00000492723 ECI2O75521 394 aa16.62■□□□□ 0.25
TOM1-216ENST00000492723 PDE5AO76074 875 aa16.62■□□□□ 0.25
TOM1-216ENST00000492723 PRAMEF1O95521 474 aa16.62■□□□□ 0.25
TOM1-216ENST00000492723 ESR1P03372 595 aa16.62■□□□□ 0.25
TOM1-216ENST00000492723 SRCP12931 536 aa16.62■□□□□ 0.25
TOM1-216ENST00000492723 SERPINA4P29622 427 aa16.62■□□□□ 0.25
TOM1-216ENST00000492723 NUDT2P50583 147 aa16.62■□□□□ 0.25
TOM1-216ENST00000492723 CYLC2Q14093 348 aaPredicted RBP16.62■□□□□ 0.25
TOM1-216ENST00000492723 TMEM240Q5SV17 173 aa16.62■□□□□ 0.25
TOM1-216ENST00000492723 STK40Q8N2I9 435 aa16.62■□□□□ 0.25
TOM1-216ENST00000492723 FBXO39Q8N4B4 442 aa16.62■□□□□ 0.25
TOM1-216ENST00000492723 GIMAP7Q8NHV1 300 aa16.62■□□□□ 0.25
TOM1-216ENST00000492723 CD200R1Q8TD46 325 aa16.62■□□□□ 0.25
TOM1-216ENST00000492723 DTX3LQ8TDB6 740 aa16.62■□□□□ 0.25
TOM1-216ENST00000492723 KCNJ9Q92806 393 aa16.62■□□□□ 0.25
TOM1-216ENST00000492723 TBRG4Q969Z0 631 aaKnown RBP eCLIP16.62■□□□□ 0.251e-8■■■■■ 35.2
TOM1-216ENST00000492723 ZBTB26Q9HCK0 441 aa16.62■□□□□ 0.25
TOM1-216ENST00000492723 NEDD8-MDP1E9PL57 170 aa16.62■□□□□ 0.25
TOM1-216ENST00000492723 PPP6CO00743 305 aa16.62■□□□□ 0.25
TOM1-216ENST00000492723 CLDN7O95471 211 aa16.62■□□□□ 0.25
TOM1-216ENST00000492723 ADSLP30566 484 aaPredicted RBP16.62■□□□□ 0.25
TOM1-216ENST00000492723 IL2P60568 153 aa16.62■□□□□ 0.25
TOM1-216ENST00000492723 SH3BP2P78314 561 aa16.62■□□□□ 0.25
TOM1-216ENST00000492723 ZRSR2Q15696 482 aaKnown RBP16.62■□□□□ 0.25
TOM1-216ENST00000492723 FUT11Q495W5 492 aa16.62■□□□□ 0.25
TOM1-216ENST00000492723 RP9Q8TA86 221 aaKnown RBP16.62■□□□□ 0.25
TOM1-216ENST00000492723 EEF1AKMT1Q8WVE0 214 aa16.62■□□□□ 0.25
TOM1-216ENST00000492723 LINGO1Q96FE5 620 aa16.62■□□□□ 0.25
TOM1-216ENST00000492723 LMLNQ96KR4 655 aa16.62■□□□□ 0.25
TOM1-216ENST00000492723 NSUN5Q96P11 429 aaKnown RBP16.62■□□□□ 0.25
TOM1-216ENST00000492723 TLR9Q9NR96 1032 aa16.62■□□□□ 0.25
TOM1-216ENST00000492723 LZTS1Q9Y250 596 aa16.62■□□□□ 0.25
TOM1-216ENST00000492723 GBF1Q92538 1859 aa16.61■□□□□ 0.25
TOM1-216ENST00000492723 NCF1BA6NI72 391 aaPredicted RBP16.61■□□□□ 0.25
TOM1-216ENST00000492723 NCF1CA8MVU1 366 aaPredicted RBP16.61■□□□□ 0.25
TOM1-216ENST00000492723 NCF1P14598 390 aaPredicted RBP16.61■□□□□ 0.25
TOM1-216ENST00000492723 PTPN2P17706 415 aa16.61■□□□□ 0.25
TOM1-216ENST00000492723 PTDSS1P48651 473 aaKnown RBP16.61■□□□□ 0.25
TOM1-216ENST00000492723 ACTR3P61158 418 aa16.61■□□□□ 0.25
TOM1-216ENST00000492723 SNRPD1P62314 119 aaKnown RBP16.61■□□□□ 0.25
TOM1-216ENST00000492723 TBL3Q12788 808 aaKnown RBP16.61■□□□□ 0.25
TOM1-216ENST00000492723 PPP1R3AQ16821 1122 aa16.61■□□□□ 0.25
TOM1-216ENST00000492723 GEN1Q17RS7 908 aa16.61■□□□□ 0.25
TOM1-216ENST00000492723 FBXO48Q5FWF7 155 aa16.61■□□□□ 0.25
TOM1-216ENST00000492723 ZSWIM9Q86XI8 627 aa16.61■□□□□ 0.25
TOM1-216ENST00000492723 CPNE9Q8IYJ1 553 aa16.61■□□□□ 0.25
TOM1-216ENST00000492723 SP7Q8TDD2 431 aaPredicted RBP16.61■□□□□ 0.25
TOM1-216ENST00000492723 FUBP1Q96AE4 644 aaKnown RBP16.61■□□□□ 0.25
TOM1-216ENST00000492723 MID1IP1Q9NPA3 183 aa16.61■□□□□ 0.25
TOM1-216ENST00000492723 HECAQ9UBI9 543 aaPredicted RBP16.61■□□□□ 0.25
TOM1-216ENST00000492723 CDH22Q9UJ99 828 aa16.61■□□□□ 0.25
TOM1-216ENST00000492723 SLC4A7Q9Y6M7 1214 aa16.61■□□□□ 0.25
TOM1-216ENST00000492723 SYCE1LA8MT33 242 aa16.61■□□□□ 0.25
TOM1-216ENST00000492723 CLASP2O75122 1294 aaKnown RBP16.61■□□□□ 0.25
TOM1-216ENST00000492723 MOSPD3O75425 235 aa16.61■□□□□ 0.25
TOM1-216ENST00000492723 TSPAN12O95859 305 aa16.61■□□□□ 0.25
TOM1-216ENST00000492723 RHOP08100 348 aa16.61■□□□□ 0.25
TOM1-216ENST00000492723 EEF1DP29692 281 aaKnown RBP16.61■□□□□ 0.25
TOM1-216ENST00000492723 ADARP55265 1226 aaKnown RBP16.61■□□□□ 0.25
TOM1-216ENST00000492723 ARHGAP15Q53QZ3 475 aa16.61■□□□□ 0.25
TOM1-216ENST00000492723 ASTLQ6HA08 431 aaPredicted RBP16.61■□□□□ 0.25
TOM1-216ENST00000492723 SERPINA9Q86WD7 417 aa16.61■□□□□ 0.25
TOM1-216ENST00000492723 KIRREL3Q8IZU9 778 aa16.61■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.5 ms