RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000491139.5

NELFE-210, Transcript of negative elongation factor complex member E, humanhuman

TSL 3

Gene NELFE, Length 582 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NELFE-210ENST00000491139 PSTKQ8IV42 348 aaKnown RBP20.64■□□□□ 0.89
NELFE-210ENST00000491139 EXD1Q8NHP7 514 aa20.64■□□□□ 0.89
NELFE-210ENST00000491139 NSMCE1Q8WV22 266 aa20.64■□□□□ 0.89
NELFE-210ENST00000491139 PIH1D2Q8WWB5 315 aa20.64■□□□□ 0.89
NELFE-210ENST00000491139 COX14Q96I36 57 aa20.64■□□□□ 0.89
NELFE-210ENST00000491139 PCMTD1Q96MG8 357 aaPredicted RBP20.64■□□□□ 0.89
NELFE-210ENST00000491139 HERPUD2Q9BSE4 406 aa20.64■□□□□ 0.89
NELFE-210ENST00000491139 PARVAQ9NVD7 372 aa20.64■□□□□ 0.89
NELFE-210ENST00000491139 CNOT8Q9UFF9 292 aaKnown RBP20.64■□□□□ 0.89
NELFE-210ENST00000491139 INPP4BO15327 924 aa20.63■□□□□ 0.89
NELFE-210ENST00000491139 RFPL1O75677 317 aa20.63■□□□□ 0.89
NELFE-210ENST00000491139 SLC2A4P14672 509 aa20.63■□□□□ 0.89
NELFE-210ENST00000491139 UQCRFS1P47985 274 aa20.63■□□□□ 0.89
NELFE-210ENST00000491139 PTSQ03393 145 aa20.63■□□□□ 0.89
NELFE-210ENST00000491139 EFCAB3Q8N7B9 438 aa20.63■□□□□ 0.89
NELFE-210ENST00000491139 NEK11Q8NG66 645 aa20.63■□□□□ 0.89
NELFE-210ENST00000491139 AGAP2Q99490 1192 aa20.63■□□□□ 0.89
NELFE-210ENST00000491139 ZWILCHQ9H900 591 aa20.63■□□□□ 0.89
NELFE-210ENST00000491139 SIDT1Q9NXL6 827 aaKnown RBP20.63■□□□□ 0.89
NELFE-210ENST00000491139 VPS18Q9P253 973 aa20.63■□□□□ 0.89
NELFE-210ENST00000491139 CROTQ9UKG9 612 aa20.63■□□□□ 0.89
NELFE-210ENST00000491139 PRKAB1Q9Y478 270 aa20.63■□□□□ 0.89
NELFE-210ENST00000491139 ESPL1Q14674 2120 aa20.63■□□□□ 0.89
NELFE-210ENST00000491139 CACNA1DQ01668 2161 aa20.62■□□□□ 0.89
NELFE-210ENST00000491139 DNAJC6O75061 913 aa20.62■□□□□ 0.89
NELFE-210ENST00000491139 KATNA1O75449 491 aa20.62■□□□□ 0.89
NELFE-210ENST00000491139 ANKRD34CP0C6C1 535 aa20.62■□□□□ 0.89
NELFE-210ENST00000491139 ZNF30P17039 623 aa20.62■□□□□ 0.89
NELFE-210ENST00000491139 MIPP30301 263 aa20.62■□□□□ 0.89
NELFE-210ENST00000491139 GALNT11Q8NCW6 608 aa20.62■□□□□ 0.89
NELFE-210ENST00000491139 RIOK2Q9BVS4 552 aaKnown RBP20.62■□□□□ 0.89
NELFE-210ENST00000491139 NUP62CLQ9H1M0 184 aa20.62■□□□□ 0.89
NELFE-210ENST00000491139 KCND3Q9UK17 655 aa20.62■□□□□ 0.89
NELFE-210ENST00000491139 TLK1Q9UKI8 766 aa20.62■□□□□ 0.89
NELFE-210ENST00000491139 KCNK6Q9Y257 313 aa20.62■□□□□ 0.89
NELFE-210ENST00000491139 MN1Q10571 1320 aaPredicted RBP20.61■□□□□ 0.89
NELFE-210ENST00000491139 KIR2DS5A0A0G2JLQ3 304 aa20.61■□□□□ 0.89
NELFE-210ENST00000491139 A0A0G2JNG1 304 aa20.61■□□□□ 0.89
NELFE-210ENST00000491139 TTLL8A6PVC2 850 aa20.61■□□□□ 0.89
NELFE-210ENST00000491139 KIR2DS3K7RE56 304 aa20.61■□□□□ 0.89
NELFE-210ENST00000491139 MAFKO60675 156 aa20.61■□□□□ 0.89
NELFE-210ENST00000491139 SNX2O60749 519 aa20.61■□□□□ 0.89
NELFE-210ENST00000491139 ATP1A1P05023 1023 aaKnown RBP20.61■□□□□ 0.89
NELFE-210ENST00000491139 PDHA1P08559 390 aa20.61■□□□□ 0.89
NELFE-210ENST00000491139 FURINP09958 794 aa20.61■□□□□ 0.89
NELFE-210ENST00000491139 F3P13726 295 aa20.61■□□□□ 0.89
NELFE-210ENST00000491139 ZNF28P17035 718 aa20.61■□□□□ 0.89
NELFE-210ENST00000491139 GNLYP22749 145 aa20.61■□□□□ 0.89
NELFE-210ENST00000491139 MMP13P45452 471 aa20.61■□□□□ 0.89
NELFE-210ENST00000491139 KIR2DS5Q14953 304 aa20.61■□□□□ 0.89
NELFE-210ENST00000491139 MARC1Q5VT66 337 aa20.61■□□□□ 0.89
NELFE-210ENST00000491139 CDKAL1Q5VV42 579 aa20.61■□□□□ 0.89
NELFE-210ENST00000491139 CAPRIN2Q6IMN6 1127 aaKnown RBP20.61■□□□□ 0.89
NELFE-210ENST00000491139 PLEKHA7Q6IQ23 1121 aa20.61■□□□□ 0.89
NELFE-210ENST00000491139 TMCO3Q6UWJ1 677 aa20.61■□□□□ 0.89
NELFE-210ENST00000491139 CYP4V2Q6ZWL3 525 aaPredicted RBP20.61■□□□□ 0.89
NELFE-210ENST00000491139 LYSMD3Q7Z3D4 306 aa20.61■□□□□ 0.89
NELFE-210ENST00000491139 AVL9Q8NBF6 648 aa20.61■□□□□ 0.89
NELFE-210ENST00000491139 GALNT6Q8NCL4 622 aa20.61■□□□□ 0.89
NELFE-210ENST00000491139 ENOX1Q8TC92 643 aaKnown RBP20.61■□□□□ 0.89
NELFE-210ENST00000491139 STAMBPL1Q96FJ0 436 aa20.61■□□□□ 0.89
NELFE-210ENST00000491139 TBC1D10AQ9BXI6 508 aa20.61■□□□□ 0.89
NELFE-210ENST00000491139 CPNE7Q9UBL6 633 aa20.61■□□□□ 0.89
NELFE-210ENST00000491139 PCYT1BQ9Y5K3 369 aaPredicted RBP20.61■□□□□ 0.89
NELFE-210ENST00000491139 PRRC2CQ9Y520 2896 aaKnown RBP20.61■□□□□ 0.89
NELFE-210ENST00000491139 CDC14CA4D256 554 aa20.6■□□□□ 0.89
NELFE-210ENST00000491139 A6NCN8 305 aa20.6■□□□□ 0.89
NELFE-210ENST00000491139 OR5K4A6NMS3 321 aa20.6■□□□□ 0.89
NELFE-210ENST00000491139 H3BRJ5 948 aa20.6■□□□□ 0.89
NELFE-210ENST00000491139 ACP5P13686 325 aa20.6■□□□□ 0.89
NELFE-210ENST00000491139 PMS2P54278 862 aa20.6■□□□□ 0.89
NELFE-210ENST00000491139 EPHB1P54762 984 aa20.6■□□□□ 0.89
NELFE-210ENST00000491139 PPP1R2P3Q6NXS1 205 aa20.6■□□□□ 0.89
NELFE-210ENST00000491139 ATPAF2Q8N5M1 289 aa20.6■□□□□ 0.89
NELFE-210ENST00000491139 SSC4DQ8WTU2 575 aa20.6■□□□□ 0.89
NELFE-210ENST00000491139 RNF31Q96EP0 1072 aa20.6■□□□□ 0.89
NELFE-210ENST00000491139 C9orf72Q96LT7 481 aa20.6■□□□□ 0.89
NELFE-210ENST00000491139 SMIM14Q96QK8 99 aa20.6■□□□□ 0.89
NELFE-210ENST00000491139 RMI1Q9H9A7 625 aa20.6■□□□□ 0.89
NELFE-210ENST00000491139 TAS2R14Q9NYV8 317 aa20.6■□□□□ 0.89
NELFE-210ENST00000491139 A0A0J9YYE9 177 aa20.59■□□□□ 0.89
NELFE-210ENST00000491139 PIPSLA2A3N6 862 aa20.59■□□□□ 0.89
NELFE-210ENST00000491139 TMEM191CA6NGB0 347 aa20.59■□□□□ 0.89
NELFE-210ENST00000491139 LILRA5A6NI73 299 aa20.59■□□□□ 0.89
NELFE-210ENST00000491139 ATMINO43313 823 aaPredicted RBP20.59■□□□□ 0.89
NELFE-210ENST00000491139 FZD6O60353 706 aa20.59■□□□□ 0.89
NELFE-210ENST00000491139 TRBC1P01850 177 aa20.59■□□□□ 0.89
NELFE-210ENST00000491139 CCDC172P0C7W6 258 aa20.59■□□□□ 0.89
NELFE-210ENST00000491139 AMPD1P23109 780 aa20.59■□□□□ 0.89
NELFE-210ENST00000491139 ARL4AP40617 200 aa20.59■□□□□ 0.89
NELFE-210ENST00000491139 STC1P52823 247 aa20.59■□□□□ 0.89
NELFE-210ENST00000491139 CDH6P55285 790 aa20.59■□□□□ 0.89
NELFE-210ENST00000491139 GFERP55789 205 aa20.59■□□□□ 0.89
NELFE-210ENST00000491139 IL11RAQ14626 422 aa20.59■□□□□ 0.89
NELFE-210ENST00000491139 TMEM135Q86UB9 458 aa20.59■□□□□ 0.89
NELFE-210ENST00000491139 RASGRP3Q8IV61 690 aa20.59■□□□□ 0.89
NELFE-210ENST00000491139 OR6C1Q96RD1 312 aa20.59■□□□□ 0.89
NELFE-210ENST00000491139 TWSG1Q9GZX9 223 aa20.59■□□□□ 0.89
NELFE-210ENST00000491139 ETNK2Q9NVF9 386 aa20.59■□□□□ 0.89
NELFE-210ENST00000491139 DNPEPQ9ULA0 475 aa20.59■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.2 ms