RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000488243.1

NISCH-211, Transcript of nischarin, humanhuman

TSL 2

Gene NISCH, Length 584 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NISCH-211ENST00000488243 SLC17A9Q9BYT1 436 aa11.65□□□□□ -0.54
NISCH-211ENST00000488243 SLC6A17Q9H1V8 727 aa11.65□□□□□ -0.54
NISCH-211ENST00000488243 VPS37BQ9H9H4 285 aa11.65□□□□□ -0.54
NISCH-211ENST00000488243 POLR3BQ9NW08 1133 aaPredicted RBP11.65□□□□□ -0.54
NISCH-211ENST00000488243 IGF2RP11717 2491 aa11.65□□□□□ -0.54
NISCH-211ENST00000488243 GLYATL1P3A0A0U1RQE8 302 aa11.64□□□□□ -0.55
NISCH-211ENST00000488243 A0A1W2PQU0 124 aa11.64□□□□□ -0.55
NISCH-211ENST00000488243 AGAP14A8MT82 685 aa11.64□□□□□ -0.55
NISCH-211ENST00000488243 F8W8V4 182 aa11.64□□□□□ -0.55
NISCH-211ENST00000488243 DYNC1I1O14576 645 aa11.64□□□□□ -0.55
NISCH-211ENST00000488243 MMP20O60882 483 aa11.64□□□□□ -0.55
NISCH-211ENST00000488243 BANF1O75531 89 aa11.64□□□□□ -0.55
NISCH-211ENST00000488243 SRP72O76094 671 aaKnown RBP11.64□□□□□ -0.55
NISCH-211ENST00000488243 RECQL5O94762 991 aaPredicted RBP11.64□□□□□ -0.55
NISCH-211ENST00000488243 VAPBO95292 243 aa11.64□□□□□ -0.55
NISCH-211ENST00000488243 IVLP07476 585 aa11.64□□□□□ -0.55
NISCH-211ENST00000488243 NUDT17P0C025 328 aa11.64□□□□□ -0.55
NISCH-211ENST00000488243 ITGALP20701 1170 aa11.64□□□□□ -0.55
NISCH-211ENST00000488243 OGNP20774 298 aaKnown RBP11.64□□□□□ -0.55
NISCH-211ENST00000488243 ACSL1P33121 698 aa11.64□□□□□ -0.55
NISCH-211ENST00000488243 MPLP40238 635 aa11.64□□□□□ -0.55
NISCH-211ENST00000488243 ARCN1P48444 511 aaKnown RBP11.64□□□□□ -0.55
NISCH-211ENST00000488243 GPX6P59796 221 aa11.64□□□□□ -0.55
NISCH-211ENST00000488243 XIAPP98170 497 aa11.64□□□□□ -0.55
NISCH-211ENST00000488243 CACNG1Q06432 222 aa11.64□□□□□ -0.55
NISCH-211ENST00000488243 MTM1Q13496 603 aa11.64□□□□□ -0.55
NISCH-211ENST00000488243 FASTKD1Q53R41 847 aaKnown RBP11.64□□□□□ -0.55
NISCH-211ENST00000488243 LRRC73Q5JTD7 316 aa11.64□□□□□ -0.55
NISCH-211ENST00000488243 HENMT1Q5T8I9 393 aaKnown RBP11.64□□□□□ -0.55
NISCH-211ENST00000488243 RNF187Q5TA31 235 aaPredicted RBP11.64□□□□□ -0.55
NISCH-211ENST00000488243 KIAA0895LQ68EN5 471 aa11.64□□□□□ -0.55
NISCH-211ENST00000488243 Q6ZVL8 140 aa11.64□□□□□ -0.55
NISCH-211ENST00000488243 HSD11B1LQ7Z5J1 315 aa11.64□□□□□ -0.55
NISCH-211ENST00000488243 SNX20Q7Z614 316 aa11.64□□□□□ -0.55
NISCH-211ENST00000488243 KCNMB4Q86W47 210 aa11.64□□□□□ -0.55
NISCH-211ENST00000488243 CACUL1Q86Y37 369 aa11.64□□□□□ -0.55
NISCH-211ENST00000488243 CNTN4Q8IWV2 1026 aa11.64□□□□□ -0.55
NISCH-211ENST00000488243 GSPT2Q8IYD1 628 aaKnown RBP11.64□□□□□ -0.55
NISCH-211ENST00000488243 OR13C4Q8NGS5 318 aa11.64□□□□□ -0.55
NISCH-211ENST00000488243 OR6P1Q8NGX9 317 aa11.64□□□□□ -0.55
NISCH-211ENST00000488243 UBLCP1Q8WVY7 318 aaPredicted RBP11.64□□□□□ -0.55
NISCH-211ENST00000488243 NUS1Q96E22 293 aa11.64□□□□□ -0.55
NISCH-211ENST00000488243 CFAP36Q96G28 342 aa11.64□□□□□ -0.55
NISCH-211ENST00000488243 TOE1Q96GM8 510 aaKnown RBP11.64□□□□□ -0.55
NISCH-211ENST00000488243 LOXL4Q96JB6 756 aa11.64□□□□□ -0.55
NISCH-211ENST00000488243 TBATAQ96M53 351 aa11.64□□□□□ -0.55
NISCH-211ENST00000488243 ZNF778Q96MU6 729 aa11.64□□□□□ -0.55
NISCH-211ENST00000488243 FCRL3Q96P31 734 aaPredicted RBP11.64□□□□□ -0.55
NISCH-211ENST00000488243 VPS35Q96QK1 796 aa11.64□□□□□ -0.55
NISCH-211ENST00000488243 WRAP53Q9BUR4 548 aaKnown RBP11.64□□□□□ -0.55
NISCH-211ENST00000488243 ACSS3Q9H6R3 686 aa11.64□□□□□ -0.55
NISCH-211ENST00000488243 IL26Q9NPH9 171 aa11.64□□□□□ -0.55
NISCH-211ENST00000488243 C20orf96Q9NUD7 363 aaPredicted RBP11.64□□□□□ -0.55
NISCH-211ENST00000488243 SMOXQ9NWM0 555 aa11.64□□□□□ -0.55
NISCH-211ENST00000488243 CYP8B1Q9UNU6 501 aa11.64□□□□□ -0.55
NISCH-211ENST00000488243 ITM2BQ9Y287 266 aa11.64□□□□□ -0.55
NISCH-211ENST00000488243 SPAG17Q6Q759 2223 aa11.64□□□□□ -0.55
NISCH-211ENST00000488243 TRBV5-4A0A0C4DH59 114 aa11.63□□□□□ -0.55
NISCH-211ENST00000488243 TCRBV9S1A1TA0A576 114 aa11.63□□□□□ -0.55
NISCH-211ENST00000488243 IGLON5A6NGN9 336 aa11.63□□□□□ -0.55
NISCH-211ENST00000488243 FAM159BA6NKW6 160 aa11.63□□□□□ -0.55
NISCH-211ENST00000488243 A8MX80 341 aa11.63□□□□□ -0.55
NISCH-211ENST00000488243 PLK4O00444 970 aa11.63□□□□□ -0.55
NISCH-211ENST00000488243 GIPC1O14908 333 aa11.63□□□□□ -0.55
NISCH-211ENST00000488243 TCEA3O75764 348 aa11.63□□□□□ -0.55
NISCH-211ENST00000488243 HOXC4P09017 264 aaPredicted RBP11.63□□□□□ -0.55
NISCH-211ENST00000488243 SPINK2P20155 84 aa11.63□□□□□ -0.55
NISCH-211ENST00000488243 SSTR1P30872 391 aa11.63□□□□□ -0.55
NISCH-211ENST00000488243 AKT2P31751 481 aa11.63□□□□□ -0.55
NISCH-211ENST00000488243 MC4RP32245 332 aa11.63□□□□□ -0.55
NISCH-211ENST00000488243 HSD17B3P37058 310 aa11.63□□□□□ -0.55
NISCH-211ENST00000488243 ETV3P41162 512 aa11.63□□□□□ -0.55
NISCH-211ENST00000488243 TTPAP49638 278 aa11.63□□□□□ -0.55
NISCH-211ENST00000488243 NOVA1P51513 510 aaKnown RBP11.63□□□□□ -0.55
NISCH-211ENST00000488243 FOXC1Q12948 553 aa11.63□□□□□ -0.55
NISCH-211ENST00000488243 SLC29A2Q14542 456 aa11.63□□□□□ -0.55
NISCH-211ENST00000488243 LRRC14Q15048 493 aa11.63□□□□□ -0.55
NISCH-211ENST00000488243 RASA2Q15283 850 aa11.63□□□□□ -0.55
NISCH-211ENST00000488243 PLA2G2CQ5R387 149 aa11.63□□□□□ -0.55
NISCH-211ENST00000488243 HP1BP3Q5SSJ5 553 aaPredicted RBP11.63□□□□□ -0.55
NISCH-211ENST00000488243 ALS2CLQ60I27 953 aa11.63□□□□□ -0.55
NISCH-211ENST00000488243 NEPROQ6NW34 567 aa11.63□□□□□ -0.55
NISCH-211ENST00000488243 FAM124AQ86V42 546 aa11.63□□□□□ -0.55
NISCH-211ENST00000488243 LRRC6Q86X45 466 aa11.63□□□□□ -0.55
NISCH-211ENST00000488243 GPR26Q8NDV2 337 aa11.63□□□□□ -0.55
NISCH-211ENST00000488243 ZNF398Q8TD17 642 aa11.63□□□□□ -0.55
NISCH-211ENST00000488243 FBF1Q8TES7 1133 aa11.63□□□□□ -0.55
NISCH-211ENST00000488243 AP2M1Q96CW1 435 aa11.63□□□□□ -0.55
NISCH-211ENST00000488243 ERLEC1Q96DZ1 483 aa11.63□□□□□ -0.55
NISCH-211ENST00000488243 SMIM14Q96QK8 99 aa11.63□□□□□ -0.55
NISCH-211ENST00000488243 EDEM2Q9BV94 578 aa11.63□□□□□ -0.55
NISCH-211ENST00000488243 TPSD1Q9BZJ3 242 aa11.63□□□□□ -0.55
NISCH-211ENST00000488243 ROPN1BQ9BZX4 212 aaPredicted RBP11.63□□□□□ -0.55
NISCH-211ENST00000488243 ABCG8Q9H221 673 aa11.63□□□□□ -0.55
NISCH-211ENST00000488243 ROPN1Q9HAT0 212 aaPredicted RBP11.63□□□□□ -0.55
NISCH-211ENST00000488243 PLAC1Q9HBJ0 212 aa11.63□□□□□ -0.55
NISCH-211ENST00000488243 CATSPERZQ9NTU4 200 aa11.63□□□□□ -0.55
NISCH-211ENST00000488243 INTS10Q9NVR2 710 aaKnown RBP11.63□□□□□ -0.55
NISCH-211ENST00000488243 ZFATQ9P243 1243 aa11.63□□□□□ -0.55
NISCH-211ENST00000488243 SLC2A6Q9UGQ3 507 aa11.63□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.6 ms