RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000482054.1

CTSL-205, Transcript of cathepsin L, human

TSL 2

Gene CTSL, Length 908 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CTSL-205	ENST00000482054	NRSN1	Q8IZ57	195 aa		12.83	□□□□□ -0.36
CTSL-205	ENST00000482054	ZC3H8	Q8N5P1	291 aa	Known RBP eCLIP	12.83	□□□□□ -0.36
CTSL-205	ENST00000482054	TEX26	Q8N6G2	289 aa		12.83	□□□□□ -0.36
CTSL-205	ENST00000482054	OR10G6	Q8NH81	332 aa		12.83	□□□□□ -0.36
CTSL-205	ENST00000482054	C9orf43	Q8TAL5	461 aa	Predicted RBP	12.83	□□□□□ -0.36
CTSL-205	ENST00000482054	TRIM11	Q96F44	468 aa		12.83	□□□□□ -0.36
CTSL-205	ENST00000482054	AHCYL2	Q96HN2	611 aa	Known RBP	12.83	□□□□□ -0.36
CTSL-205	ENST00000482054	COX14	Q96I36	57 aa		12.83	□□□□□ -0.36
CTSL-205	ENST00000482054	SLC38A3	Q99624	504 aa		12.83	□□□□□ -0.36
CTSL-205	ENST00000482054	RTN4	Q9NQC3	1192 aa	Known RBP	12.83	□□□□□ -0.36
CTSL-205	ENST00000482054	AIPL1	Q9NZN9	384 aa		12.83	□□□□□ -0.36
CTSL-205	ENST00000482054	PDP2	Q9P2J9	529 aa		12.83	□□□□□ -0.36
CTSL-205	ENST00000482054	PILRA	Q9UKJ1	303 aa		12.83	□□□□□ -0.36
CTSL-205	ENST00000482054	PRKAB1	Q9Y478	270 aa		12.83	□□□□□ -0.36
CTSL-205	ENST00000482054	PCYT1B	Q9Y5K3	369 aa	Predicted RBP	12.83	□□□□□ -0.36
CTSL-205	ENST00000482054	ESPL1	Q14674	2120 aa		12.83	□□□□□ -0.36
CTSL-205	ENST00000482054	APC	P25054	2843 aa		12.82	□□□□□ -0.36
CTSL-205	ENST00000482054	ADGRG4	Q8IZF6	3080 aa		12.82	□□□□□ -0.36
CTSL-205	ENST00000482054		A0A0J9YYE9	177 aa		12.82	□□□□□ -0.36
CTSL-205	ENST00000482054	ZNF891	A8MT65	544 aa	Predicted RBP	12.82	□□□□□ -0.36
CTSL-205	ENST00000482054	MTSS1	O43312	755 aa		12.82	□□□□□ -0.36
CTSL-205	ENST00000482054	ASMTL	O95671	621 aa		12.82	□□□□□ -0.36
CTSL-205	ENST00000482054	TRBC1	P01850	177 aa		12.82	□□□□□ -0.36
CTSL-205	ENST00000482054	MYBL1	P10243	752 aa		12.82	□□□□□ -0.36
CTSL-205	ENST00000482054	SKIL	P12757	684 aa		12.82	□□□□□ -0.36
CTSL-205	ENST00000482054	ZNF30	P17039	623 aa		12.82	□□□□□ -0.36
CTSL-205	ENST00000482054	POU3F2	P20265	443 aa	Predicted RBP	12.82	□□□□□ -0.36
CTSL-205	ENST00000482054	EPHB1	P54762	984 aa		12.82	□□□□□ -0.36
CTSL-205	ENST00000482054	RIPPLY3	P57055	190 aa		12.82	□□□□□ -0.36
CTSL-205	ENST00000482054	HHEX	Q03014	270 aa		12.82	□□□□□ -0.36
CTSL-205	ENST00000482054	ITK	Q08881	620 aa		12.82	□□□□□ -0.36
CTSL-205	ENST00000482054	LRP8	Q14114	963 aa		12.82	□□□□□ -0.36
CTSL-205	ENST00000482054	SNAP47	Q5SQN1	464 aa		12.82	□□□□□ -0.36
CTSL-205	ENST00000482054	CHCHD2P9	Q5T1J5	151 aa	Predicted RBP	12.82	□□□□□ -0.36
CTSL-205	ENST00000482054	NLRP8	Q86W28	1048 aa		12.82	□□□□□ -0.36
CTSL-205	ENST00000482054	ATCAY	Q86WG3	371 aa		12.82	□□□□□ -0.36
CTSL-205	ENST00000482054	NDUFAF2	Q8N183	169 aa		12.82	□□□□□ -0.36
CTSL-205	ENST00000482054	EXD1	Q8NHP7	514 aa		12.82	□□□□□ -0.36
CTSL-205	ENST00000482054	TEKT4	Q8WW24	435 aa		12.82	□□□□□ -0.36
CTSL-205	ENST00000482054	RTP4	Q96DX8	246 aa		12.82	□□□□□ -0.36
CTSL-205	ENST00000482054	SLC45A3	Q96JT2	553 aa		12.82	□□□□□ -0.36
CTSL-205	ENST00000482054	CTRC	Q99895	268 aa		12.82	□□□□□ -0.36
CTSL-205	ENST00000482054	RIOK2	Q9BVS4	552 aa	Known RBP	12.82	□□□□□ -0.36
CTSL-205	ENST00000482054	POLR1E	Q9GZS1	481 aa	Known RBP	12.82	□□□□□ -0.36
CTSL-205	ENST00000482054	ISCU	Q9H1K1	167 aa		12.82	□□□□□ -0.36
CTSL-205	ENST00000482054	TBC1D29	Q9UFV1	150 aa		12.82	□□□□□ -0.36
CTSL-205	ENST00000482054	ZNHIT2	Q9UHR6	403 aa		12.82	□□□□□ -0.36
CTSL-205	ENST00000482054	OAS3	Q9Y6K5	1087 aa	Known RBP	12.82	□□□□□ -0.36
CTSL-205	ENST00000482054	ZFHX3	Q15911	3703 aa		12.82	□□□□□ -0.36
CTSL-205	ENST00000482054	MTOR	P42345	2549 aa		12.81	□□□□□ -0.36
CTSL-205	ENST00000482054	LOC101059948	A0A1B0GTJ6	334 aa		12.81	□□□□□ -0.36
CTSL-205	ENST00000482054	NKX2-8	O15522	239 aa		12.81	□□□□□ -0.36
CTSL-205	ENST00000482054	MFSD11	O43934	449 aa		12.81	□□□□□ -0.36
CTSL-205	ENST00000482054	AGFG2	O95081	481 aa		12.81	□□□□□ -0.36
CTSL-205	ENST00000482054	ATP1A1	P05023	1023 aa	Known RBP	12.81	□□□□□ -0.36
CTSL-205	ENST00000482054	PYGL	P06737	847 aa		12.81	□□□□□ -0.36
CTSL-205	ENST00000482054	PRKAR1A	P10644	381 aa		12.81	□□□□□ -0.36
CTSL-205	ENST00000482054	MC2R	Q01718	297 aa		12.81	□□□□□ -0.36
CTSL-205	ENST00000482054	DSC2	Q02487	901 aa		12.81	□□□□□ -0.36
CTSL-205	ENST00000482054	SLC25A11	Q02978	314 aa	Known RBP	12.81	□□□□□ -0.36
CTSL-205	ENST00000482054	MMRN1	Q13201	1228 aa		12.81	□□□□□ -0.36
CTSL-205	ENST00000482054	NFATC2	Q13469	925 aa		12.81	□□□□□ -0.36
CTSL-205	ENST00000482054	PIGH	Q14442	188 aa	Predicted RBP	12.81	□□□□□ -0.36
CTSL-205	ENST00000482054	WDR74	Q6RFH5	385 aa	Predicted RBP	12.81	□□□□□ -0.36
CTSL-205	ENST00000482054	CHST15	Q7LFX5	561 aa	Predicted RBP	12.81	□□□□□ -0.36
CTSL-205	ENST00000482054	ARHGAP22	Q7Z5H3	698 aa		12.81	□□□□□ -0.36
CTSL-205	ENST00000482054	UNC5B	Q8IZJ1	945 aa		12.81	□□□□□ -0.36
CTSL-205	ENST00000482054	NLGN4X	Q8N0W4	816 aa		12.81	□□□□□ -0.36
CTSL-205	ENST00000482054	NLGN4Y	Q8NFZ3	816 aa	Predicted RBP	12.81	□□□□□ -0.36
CTSL-205	ENST00000482054	NCSTN	Q92542	709 aa		12.81	□□□□□ -0.36
CTSL-205	ENST00000482054	BTBD6	Q96KE9	485 aa		12.81	□□□□□ -0.36
CTSL-205	ENST00000482054	CATSPER2	Q96P56	530 aa		12.81	□□□□□ -0.36
CTSL-205	ENST00000482054	TEFM	Q96QE5	360 aa	Known RBP	12.81	□□□□□ -0.36
CTSL-205	ENST00000482054	SPRY4	Q9C004	299 aa		12.81	□□□□□ -0.36
CTSL-205	ENST00000482054	GPN2	Q9H9Y4	310 aa	Predicted RBP	12.81	□□□□□ -0.36
CTSL-205	ENST00000482054	KCNK6	Q9Y257	313 aa		12.81	□□□□□ -0.36
CTSL-205	ENST00000482054	CHKB	Q9Y259	395 aa		12.81	□□□□□ -0.36
CTSL-205	ENST00000482054	PDZD2	O15018	2839 aa		12.81	□□□□□ -0.36
CTSL-205	ENST00000482054	CAPN5	O15484	640 aa	Predicted RBP	12.8	□□□□□ -0.36
CTSL-205	ENST00000482054	DNAJC6	O75061	913 aa		12.8	□□□□□ -0.36
CTSL-205	ENST00000482054	CLDN7	O95471	211 aa		12.8	□□□□□ -0.36
CTSL-205	ENST00000482054	CD48	P09326	243 aa		12.8	□□□□□ -0.36
CTSL-205	ENST00000482054	RNF224	P0DH78	156 aa		12.8	□□□□□ -0.36
CTSL-205	ENST00000482054	IL4R	P24394	825 aa		12.8	□□□□□ -0.36
CTSL-205	ENST00000482054	GARS	P41250	739 aa	Known RBP	12.8	□□□□□ -0.36
CTSL-205	ENST00000482054	MAPK9	P45984	424 aa		12.8	□□□□□ -0.36
CTSL-205	ENST00000482054	UQCRFS1	P47985	274 aa		12.8	□□□□□ -0.36
CTSL-205	ENST00000482054	TYRO3	Q06418	890 aa		12.8	□□□□□ -0.36
CTSL-205	ENST00000482054	GALNT2	Q10471	571 aa		12.8	□□□□□ -0.36
CTSL-205	ENST00000482054	KRT81	Q14533	505 aa		12.8	□□□□□ -0.36
CTSL-205	ENST00000482054	ALG1L	Q6GMV1	187 aa		12.8	□□□□□ -0.36
CTSL-205	ENST00000482054	TIPARP	Q7Z3E1	657 aa	Known RBP	12.8	□□□□□ -0.36
CTSL-205	ENST00000482054	LRRC49	Q8IUZ0	686 aa		12.8	□□□□□ -0.36
CTSL-205	ENST00000482054	NIPA2	Q8N8Q9	360 aa		12.8	□□□□□ -0.36
CTSL-205	ENST00000482054	MAML1	Q92585	1016 aa		12.8	□□□□□ -0.36
CTSL-205	ENST00000482054	KIAA1143	Q96AT1	154 aa	Predicted RBP	12.8	□□□□□ -0.36
CTSL-205	ENST00000482054	WDR24	Q96S15	920 aa		12.8	□□□□□ -0.36
CTSL-205	ENST00000482054	TDRD1	Q9BXT4	1180 aa	Known RBP	12.8	□□□□□ -0.36
CTSL-205	ENST00000482054	APMAP	Q9HDC9	416 aa		12.8	□□□□□ -0.36
CTSL-205	ENST00000482054	SARS2	Q9NP81	518 aa	Known RBP	12.8	□□□□□ -0.36

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