RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000481173.1

CCNL1-223, Transcript of cyclin L1, human

TSL 2

Gene CCNL1, Length 571 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CCNL1-223	ENST00000481173	GRIK2	Q13002	908 aa		3.06	□□□□□ -1.92
CCNL1-223	ENST00000481173	TRPC3	Q13507	836 aa		3.06	□□□□□ -1.92
CCNL1-223	ENST00000481173	DRAP1	Q14919	205 aa	Predicted RBP	3.06	□□□□□ -1.92
CCNL1-223	ENST00000481173	LPAL2	Q16609	132 aa		3.06	□□□□□ -1.92
CCNL1-223	ENST00000481173	USP41	Q3LFD5	358 aa		3.06	□□□□□ -1.92
CCNL1-223	ENST00000481173	ZNF876P	Q49A33	203 aa		3.06	□□□□□ -1.92
CCNL1-223	ENST00000481173	SLC27A1	Q6PCB7	646 aa		3.06	□□□□□ -1.92
CCNL1-223	ENST00000481173	ATF7IP	Q6VMQ6	1270 aa		3.06	□□□□□ -1.92
CCNL1-223	ENST00000481173	KRTAP5-2	Q701N4	177 aa		3.06	□□□□□ -1.92
CCNL1-223	ENST00000481173	CTAGE4	Q8IX94	777 aa		3.06	□□□□□ -1.92
CCNL1-223	ENST00000481173	SPAG16	Q8N0X2	631 aa		3.06	□□□□□ -1.92
CCNL1-223	ENST00000481173	ADSSL1	Q8N142	457 aa		3.06	□□□□□ -1.92
CCNL1-223	ENST00000481173	SRBD1	Q8N5C6	995 aa	Known RBP	3.06	□□□□□ -1.92
CCNL1-223	ENST00000481173	CNBD1	Q8NA66	436 aa		3.06	□□□□□ -1.92
CCNL1-223	ENST00000481173	APBB2	Q92870	758 aa		3.06	□□□□□ -1.92
CCNL1-223	ENST00000481173	GCC1	Q96CN9	775 aa		3.06	□□□□□ -1.92
CCNL1-223	ENST00000481173	STAMBPL1	Q96FJ0	436 aa		3.06	□□□□□ -1.92
CCNL1-223	ENST00000481173	PPP1R13B	Q96KQ4	1090 aa		3.06	□□□□□ -1.92
CCNL1-223	ENST00000481173	NEUROD6	Q96NK8	337 aa		3.06	□□□□□ -1.92
CCNL1-223	ENST00000481173	EIF2AK1	Q9BQI3	630 aa	Known RBP	3.06	□□□□□ -1.92
CCNL1-223	ENST00000481173	NEURL2	Q9BR09	285 aa		3.06	□□□□□ -1.92
CCNL1-223	ENST00000481173	PYGO2	Q9BRQ0	406 aa		3.06	□□□□□ -1.92
CCNL1-223	ENST00000481173	PCDHB16	Q9NRJ7	776 aa		3.06	□□□□□ -1.92
CCNL1-223	ENST00000481173	PPP1R14D	Q9NXH3	145 aa		3.06	□□□□□ -1.92
CCNL1-223	ENST00000481173	MAP3K20	Q9NYL2	800 aa	Known RBP	3.06	□□□□□ -1.92
CCNL1-223	ENST00000481173	FBXL2	Q9UKC9	423 aa		3.06	□□□□□ -1.92
CCNL1-223	ENST00000481173	TBX20	Q9UMR3	447 aa		3.06	□□□□□ -1.92
CCNL1-223	ENST00000481173	KCNK7	Q9Y2U2	307 aa		3.06	□□□□□ -1.92
CCNL1-223	ENST00000481173	FAM237A	A0A1B0GTK4	181 aa		3.05	□□□□□ -1.92
CCNL1-223	ENST00000481173		A0A1W2PQM1	296 aa		3.05	□□□□□ -1.92
CCNL1-223	ENST00000481173	SMIM1	B2RUZ4	78 aa		3.05	□□□□□ -1.92
CCNL1-223	ENST00000481173	IFRD1	O00458	451 aa	Predicted RBP	3.05	□□□□□ -1.92
CCNL1-223	ENST00000481173	IGHV4-39	P01824	125 aa		3.05	□□□□□ -1.92
CCNL1-223	ENST00000481173	HSD3B1	P14060	373 aa		3.05	□□□□□ -1.92
CCNL1-223	ENST00000481173	CDA	P32320	146 aa		3.05	□□□□□ -1.92
CCNL1-223	ENST00000481173	DCT	P40126	519 aa		3.05	□□□□□ -1.92
CCNL1-223	ENST00000481173	ARCN1	P48444	511 aa	Known RBP	3.05	□□□□□ -1.92
CCNL1-223	ENST00000481173	CTCF	P49711	727 aa	Predicted RBP	3.05	□□□□□ -1.92
CCNL1-223	ENST00000481173	MMP14	P50281	582 aa		3.05	□□□□□ -1.92
CCNL1-223	ENST00000481173	DRG2	P55039	364 aa	Known RBP	3.05	□□□□□ -1.92
CCNL1-223	ENST00000481173	CLDN20	P56880	219 aa		3.05	□□□□□ -1.92
CCNL1-223	ENST00000481173	NEXN	Q0ZGT2	675 aa		3.05	□□□□□ -1.92
CCNL1-223	ENST00000481173	WDR38	Q5JTN6	314 aa		3.05	□□□□□ -1.92
CCNL1-223	ENST00000481173	SLC9C2	Q5TAH2	1124 aa		3.05	□□□□□ -1.92
CCNL1-223	ENST00000481173	SFMBT2	Q5VUG0	894 aa		3.05	□□□□□ -1.92
CCNL1-223	ENST00000481173	BSPRY	Q5W0U4	402 aa		3.05	□□□□□ -1.92
CCNL1-223	ENST00000481173	FRG2	Q64ET8	278 aa		3.05	□□□□□ -1.92
CCNL1-223	ENST00000481173	C18orf63	Q68DL7	685 aa		3.05	□□□□□ -1.92
CCNL1-223	ENST00000481173	GPR180	Q86V85	440 aa		3.05	□□□□□ -1.92
CCNL1-223	ENST00000481173	NRROS	Q86YC3	692 aa		3.05	□□□□□ -1.92
CCNL1-223	ENST00000481173	STPG4	Q8N801	248 aa		3.05	□□□□□ -1.92
CCNL1-223	ENST00000481173	ZNF248	Q8NDW4	579 aa		3.05	□□□□□ -1.92
CCNL1-223	ENST00000481173	OR14L1P	Q8NHC6	308 aa		3.05	□□□□□ -1.92
CCNL1-223	ENST00000481173	SLC44A1	Q8WWI5	657 aa		3.05	□□□□□ -1.92
CCNL1-223	ENST00000481173	IGSF8	Q969P0	613 aa		3.05	□□□□□ -1.92
CCNL1-223	ENST00000481173	RNF125	Q96EQ8	232 aa		3.05	□□□□□ -1.92
CCNL1-223	ENST00000481173	ZNF599	Q96NL3	588 aa		3.05	□□□□□ -1.92
CCNL1-223	ENST00000481173	SCLT1	Q96NL6	688 aa		3.05	□□□□□ -1.92
CCNL1-223	ENST00000481173	ACOX2	Q99424	681 aa		3.05	□□□□□ -1.92
CCNL1-223	ENST00000481173	TMEM47	Q9BQJ4	181 aa		3.05	□□□□□ -1.92
CCNL1-223	ENST00000481173	PCGF1	Q9BSM1	259 aa		3.05	□□□□□ -1.92
CCNL1-223	ENST00000481173	FSD1	Q9BTV5	496 aa		3.05	□□□□□ -1.92
CCNL1-223	ENST00000481173	SLC25A18	Q9H1K4	315 aa		3.05	□□□□□ -1.92
CCNL1-223	ENST00000481173	TFB2M	Q9H5Q4	396 aa	Known RBP	3.05	□□□□□ -1.92
CCNL1-223	ENST00000481173	SLC28A3	Q9HAS3	691 aa		3.05	□□□□□ -1.92
CCNL1-223	ENST00000481173	RRN3	Q9NYV6	651 aa		3.05	□□□□□ -1.92
CCNL1-223	ENST00000481173	SARDH	Q9UL12	918 aa		3.05	□□□□□ -1.92
CCNL1-223	ENST00000481173	CAMK2A	Q9UQM7	478 aa		3.05	□□□□□ -1.92
CCNL1-223	ENST00000481173	DGKB	Q9Y6T7	804 aa		3.05	□□□□□ -1.92
CCNL1-223	ENST00000481173	ZCWPW2	A0A1B0GU75	182 aa		3.04	□□□□□ -1.92
CCNL1-223	ENST00000481173	EIF3D	O15371	548 aa	Known RBP eCLIP	3.04	□□□□□ -1.92
CCNL1-223	ENST00000481173	NCAM2	O15394	837 aa		3.04	□□□□□ -1.92
CCNL1-223	ENST00000481173	SYNGR3	O43761	229 aa		3.04	□□□□□ -1.92
CCNL1-223	ENST00000481173	CIDEA	O60543	219 aa		3.04	□□□□□ -1.92
CCNL1-223	ENST00000481173	MLYCD	O95822	493 aa		3.04	□□□□□ -1.92
CCNL1-223	ENST00000481173	FAM106CP	P0CH98	169 aa		3.04	□□□□□ -1.92
CCNL1-223	ENST00000481173	CHRNB4	P30926	498 aa		3.04	□□□□□ -1.92
CCNL1-223	ENST00000481173	ABCD1	P33897	745 aa		3.04	□□□□□ -1.92
CCNL1-223	ENST00000481173	CPOX	P36551	454 aa		3.04	□□□□□ -1.92
CCNL1-223	ENST00000481173	APOBEC1	P41238	236 aa	Known RBP	3.04	□□□□□ -1.92
CCNL1-223	ENST00000481173	PIP4K2A	P48426	406 aa	Predicted RBP	3.04	□□□□□ -1.92
CCNL1-223	ENST00000481173	RUNX1T1	Q06455	604 aa		3.04	□□□□□ -1.92
CCNL1-223	ENST00000481173	BAK1	Q16611	211 aa		3.04	□□□□□ -1.92
CCNL1-223	ENST00000481173	DECR1	Q16698	335 aa		3.04	□□□□□ -1.92
CCNL1-223	ENST00000481173	GSTA3	Q16772	222 aa		3.04	□□□□□ -1.92
CCNL1-223	ENST00000481173	PRICKLE4	Q2TBC4	344 aa		3.04	□□□□□ -1.92
CCNL1-223	ENST00000481173	C6orf141	Q5SZD1	244 aa		3.04	□□□□□ -1.92
CCNL1-223	ENST00000481173	DCST1	Q5T197	706 aa		3.04	□□□□□ -1.92
CCNL1-223	ENST00000481173	CCNYL2	Q5T2Q4	361 aa		3.04	□□□□□ -1.92
CCNL1-223	ENST00000481173	NAA35	Q5VZE5	725 aa		3.04	□□□□□ -1.92
CCNL1-223	ENST00000481173	SUSD1	Q6UWL2	747 aa		3.04	□□□□□ -1.92
CCNL1-223	ENST00000481173	DPPA4	Q7L190	304 aa		3.04	□□□□□ -1.92
CCNL1-223	ENST00000481173	HTRA1	Q92743	480 aa		3.04	□□□□□ -1.92
CCNL1-223	ENST00000481173	GTF3C6	Q969F1	213 aa		3.04	□□□□□ -1.92
CCNL1-223	ENST00000481173	LGALS12	Q96DT0	336 aa		3.04	□□□□□ -1.92
CCNL1-223	ENST00000481173	USP44	Q9H0E7	712 aa		3.04	□□□□□ -1.92
CCNL1-223	ENST00000481173	LRMDA	Q9H2I8	198 aa		3.04	□□□□□ -1.92
CCNL1-223	ENST00000481173	ASAH2	Q9NR71	780 aa		3.04	□□□□□ -1.92
CCNL1-223	ENST00000481173	TCP11L1	Q9NUJ3	509 aa		3.04	□□□□□ -1.92
CCNL1-223	ENST00000481173	POLG2	Q9UHN1	485 aa		3.04	□□□□□ -1.92

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