RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000478279.5

APTX-222, Transcript of aprataxin, human

TSL 1 (best)

Gene APTX, Length 684 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
APTX-222	ENST00000478279	NPIPB15	A6NHN6	443 aa	Predicted RBP	10.48	□□□□□ -0.73
APTX-222	ENST00000478279	LILRA5	A6NI73	299 aa		10.48	□□□□□ -0.73
APTX-222	ENST00000478279	SIGLEC16	A6NMB1	481 aa		10.48	□□□□□ -0.73
APTX-222	ENST00000478279	OR5K4	A6NMS3	321 aa		10.48	□□□□□ -0.73
APTX-222	ENST00000478279	C21orf140	B9A014	251 aa		10.48	□□□□□ -0.73
APTX-222	ENST00000478279		F8VZ95	297 aa		10.48	□□□□□ -0.73
APTX-222	ENST00000478279	KIR2DS3	K7RE56	304 aa		10.48	□□□□□ -0.73
APTX-222	ENST00000478279	TOX3	O15405	576 aa	Predicted RBP	10.48	□□□□□ -0.73
APTX-222	ENST00000478279	SPAG6	O75602	509 aa		10.48	□□□□□ -0.73
APTX-222	ENST00000478279	KRT38	O76015	456 aa		10.48	□□□□□ -0.73
APTX-222	ENST00000478279	ASMTL	O95671	621 aa		10.48	□□□□□ -0.73
APTX-222	ENST00000478279	MT-ND3	P03897	115 aa		10.48	□□□□□ -0.73
APTX-222	ENST00000478279	PYGL	P06737	847 aa		10.48	□□□□□ -0.73
APTX-222	ENST00000478279	FGF5	P12034	268 aa		10.48	□□□□□ -0.73
APTX-222	ENST00000478279	SLC2A4	P14672	509 aa		10.48	□□□□□ -0.73
APTX-222	ENST00000478279	SEPHS1	P49903	392 aa		10.48	□□□□□ -0.73
APTX-222	ENST00000478279	CCL11	P51671	97 aa		10.48	□□□□□ -0.73
APTX-222	ENST00000478279	GFER	P55789	205 aa		10.48	□□□□□ -0.73
APTX-222	ENST00000478279	SH3BP2	P78314	561 aa		10.48	□□□□□ -0.73
APTX-222	ENST00000478279	LBR	Q14739	615 aa	Known RBP	10.48	□□□□□ -0.73
APTX-222	ENST00000478279	KIR2DS5	Q14953	304 aa		10.48	□□□□□ -0.73
APTX-222	ENST00000478279	PRR30	Q53SZ7	412 aa	Predicted RBP	10.48	□□□□□ -0.73
APTX-222	ENST00000478279	C1QL3	Q5VWW1	255 aa		10.48	□□□□□ -0.73
APTX-222	ENST00000478279	CPZ	Q66K79	652 aa		10.48	□□□□□ -0.73
APTX-222	ENST00000478279	TRIM72	Q6ZMU5	477 aa		10.48	□□□□□ -0.73
APTX-222	ENST00000478279	ARHGAP36	Q6ZRI8	547 aa		10.48	□□□□□ -0.73
APTX-222	ENST00000478279	RFLNA	Q6ZTI6	216 aa		10.48	□□□□□ -0.73
APTX-222	ENST00000478279	TSPAN33	Q86UF1	283 aa		10.48	□□□□□ -0.73
APTX-222	ENST00000478279	AVL9	Q8NBF6	648 aa		10.48	□□□□□ -0.73
APTX-222	ENST00000478279	C3orf20	Q8ND61	904 aa		10.48	□□□□□ -0.73
APTX-222	ENST00000478279	CT55	Q8WUE5	264 aa		10.48	□□□□□ -0.73
APTX-222	ENST00000478279	SCAMP4	Q969E2	229 aa		10.48	□□□□□ -0.73
APTX-222	ENST00000478279	COX14	Q96I36	57 aa		10.48	□□□□□ -0.73
APTX-222	ENST00000478279	CNPY3	Q9BT09	278 aa		10.48	□□□□□ -0.73
APTX-222	ENST00000478279	SLAMF7	Q9NQ25	335 aa		10.48	□□□□□ -0.73
APTX-222	ENST00000478279	LHX9	Q9NQ69	397 aa		10.48	□□□□□ -0.73
APTX-222	ENST00000478279	KIAA1468	Q9P260	1216 aa		10.48	□□□□□ -0.73
APTX-222	ENST00000478279	CPNE7	Q9UBL6	633 aa		10.48	□□□□□ -0.73
APTX-222	ENST00000478279	ZNHIT2	Q9UHR6	403 aa		10.48	□□□□□ -0.73
APTX-222	ENST00000478279	CD84	Q9UIB8	345 aa		10.48	□□□□□ -0.73
APTX-222	ENST00000478279	ZNF451	Q9Y4E5	1061 aa		10.48	□□□□□ -0.73
APTX-222	ENST00000478279	PCDHGB7	Q9Y5F8	929 aa		10.48	□□□□□ -0.73
APTX-222	ENST00000478279	ADGRG4	Q8IZF6	3080 aa		10.48	□□□□□ -0.73
APTX-222	ENST00000478279	ANKRD62	A6NC57	917 aa		10.47	□□□□□ -0.73
APTX-222	ENST00000478279	DFFA	O00273	331 aa		10.47	□□□□□ -0.73
APTX-222	ENST00000478279	EEF2K	O00418	725 aa	Known RBP	10.47	□□□□□ -0.73
APTX-222	ENST00000478279	DPM1	O60762	260 aa		10.47	□□□□□ -0.73
APTX-222	ENST00000478279	LRCH4	O75427	683 aa		10.47	□□□□□ -0.73
APTX-222	ENST00000478279	CALB1	P05937	261 aa		10.47	□□□□□ -0.73
APTX-222	ENST00000478279	UNG	P13051	313 aa	Predicted RBP	10.47	□□□□□ -0.73
APTX-222	ENST00000478279	F3	P13726	295 aa		10.47	□□□□□ -0.73
APTX-222	ENST00000478279	PRKCSH	P14314	528 aa	Predicted RBP	10.47	□□□□□ -0.73
APTX-222	ENST00000478279	TNFAIP3	P21580	790 aa		10.47	□□□□□ -0.73
APTX-222	ENST00000478279	HSPA9	P38646	679 aa	Known RBP	10.47	□□□□□ -0.73
APTX-222	ENST00000478279	NSF	P46459	744 aa	Known RBP	10.47	□□□□□ -0.73
APTX-222	ENST00000478279	SLC10A7	Q0GE19	358 aa		10.47	□□□□□ -0.73
APTX-222	ENST00000478279	TRAF2	Q12933	501 aa		10.47	□□□□□ -0.73
APTX-222	ENST00000478279	PTPRR	Q15256	657 aa		10.47	□□□□□ -0.73
APTX-222	ENST00000478279	UGT8	Q16880	541 aa		10.47	□□□□□ -0.73
APTX-222	ENST00000478279	LARP7	Q4G0J3	582 aa	Known RBP eCLIP	10.47	□□□□□ -0.73
APTX-222	ENST00000478279	MIIP	Q5JXC2	388 aa		10.47	□□□□□ -0.73
APTX-222	ENST00000478279	TMCO4	Q5TGY1	634 aa		10.47	□□□□□ -0.73
APTX-222	ENST00000478279	JMJD6	Q6NYC1	403 aa	Predicted RBP	10.47	□□□□□ -0.73
APTX-222	ENST00000478279	USP45	Q70EL2	814 aa		10.47	□□□□□ -0.73
APTX-222	ENST00000478279	ZNF765	Q7L2R6	523 aa		10.47	□□□□□ -0.73
APTX-222	ENST00000478279	CHST15	Q7LFX5	561 aa	Predicted RBP	10.47	□□□□□ -0.73
APTX-222	ENST00000478279		Q8NA96	180 aa		10.47	□□□□□ -0.73
APTX-222	ENST00000478279	EXD1	Q8NHP7	514 aa		10.47	□□□□□ -0.73
APTX-222	ENST00000478279	ELMO2	Q96JJ3	720 aa		10.47	□□□□□ -0.73
APTX-222	ENST00000478279	ZNF599	Q96NL3	588 aa		10.47	□□□□□ -0.73
APTX-222	ENST00000478279	NUDCD1	Q96RS6	583 aa		10.47	□□□□□ -0.73
APTX-222	ENST00000478279	AGAP2	Q99490	1192 aa		10.47	□□□□□ -0.73
APTX-222	ENST00000478279	GPR87	Q9BY21	358 aa		10.47	□□□□□ -0.73
APTX-222	ENST00000478279	BRD8	Q9H0E9	1235 aa		10.47	□□□□□ -0.73
APTX-222	ENST00000478279	ACTL8	Q9H568	366 aa		10.47	□□□□□ -0.73
APTX-222	ENST00000478279	ZNF768	Q9H5H4	540 aa	Known RBP	10.47	□□□□□ -0.73
APTX-222	ENST00000478279	UCK1	Q9HA47	277 aa		10.47	□□□□□ -0.73
APTX-222	ENST00000478279	NOD2	Q9HC29	1040 aa		10.47	□□□□□ -0.73
APTX-222	ENST00000478279	ACSS2	Q9NR19	701 aa		10.47	□□□□□ -0.73
APTX-222	ENST00000478279	OGFR	Q9NZT2	677 aa		10.47	□□□□□ -0.73
APTX-222	ENST00000478279	VPS18	Q9P253	973 aa		10.47	□□□□□ -0.73
APTX-222	ENST00000478279	KCNK6	Q9Y257	313 aa		10.47	□□□□□ -0.73
APTX-222	ENST00000478279	PPIL1	Q9Y3C6	166 aa		10.47	□□□□□ -0.73
APTX-222	ENST00000478279	PRKAB1	Q9Y478	270 aa		10.47	□□□□□ -0.73
APTX-222	ENST00000478279	PCYT1B	Q9Y5K3	369 aa	Predicted RBP	10.47	□□□□□ -0.73
APTX-222	ENST00000478279	PDZD2	O15018	2839 aa		10.47	□□□□□ -0.73
APTX-222	ENST00000478279	ARGFX	A6NJG6	315 aa		10.46	□□□□□ -0.73
APTX-222	ENST00000478279	EIF3CL	B5ME19	914 aa	Known RBP	10.46	□□□□□ -0.73
APTX-222	ENST00000478279	DAPK3	O43293	454 aa		10.46	□□□□□ -0.73
APTX-222	ENST00000478279	SNX2	O60749	519 aa		10.46	□□□□□ -0.73
APTX-222	ENST00000478279	DNAJC6	O75061	913 aa		10.46	□□□□□ -0.73
APTX-222	ENST00000478279	GFPT2	O94808	682 aa		10.46	□□□□□ -0.73
APTX-222	ENST00000478279	PGLS	O95336	258 aa		10.46	□□□□□ -0.73
APTX-222	ENST00000478279	TYRP1	P17643	537 aa		10.46	□□□□□ -0.73
APTX-222	ENST00000478279	CTPS1	P17812	591 aa		10.46	□□□□□ -0.73
APTX-222	ENST00000478279	ERCC2	P18074	760 aa		10.46	□□□□□ -0.73
APTX-222	ENST00000478279	PTPN4	P29074	926 aa		10.46	□□□□□ -0.73
APTX-222	ENST00000478279	RPL7A	P62424	266 aa	Known RBP	10.46	□□□□□ -0.73
APTX-222	ENST00000478279	UBE2I	P63279	158 aa	Known RBP	10.46	□□□□□ -0.73
APTX-222	ENST00000478279	CHAF1B	Q13112	559 aa		10.46	□□□□□ -0.73

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