RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000461017.1

RABGEF1-206, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

TSL 3

Gene RABGEF1, Length 711 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-206ENST00000461017 TEAD1P28347 426 aa6.96□□□□□ -1.3
RABGEF1-206ENST00000461017 CXCR5P32302 372 aa6.96□□□□□ -1.3
RABGEF1-206ENST00000461017 UGT1A3P35503 534 aa6.96□□□□□ -1.3
RABGEF1-206ENST00000461017 UGT1A5P35504 534 aa6.96□□□□□ -1.3
RABGEF1-206ENST00000461017 ADCY8P40145 1251 aa6.96□□□□□ -1.3
RABGEF1-206ENST00000461017 GNPDA1P46926 289 aa6.96□□□□□ -1.3
RABGEF1-206ENST00000461017 MAZP56270 477 aaKnown RBP6.96□□□□□ -1.3
RABGEF1-206ENST00000461017 DAB2P98082 770 aa6.96□□□□□ -1.3
RABGEF1-206ENST00000461017 TARDBPQ13148 414 aaKnown RBP eCLIP6.96□□□□□ -1.3
RABGEF1-206ENST00000461017 OASLQ15646 514 aaKnown RBP6.96□□□□□ -1.3
RABGEF1-206ENST00000461017 INAVAQ3KP66 663 aa6.96□□□□□ -1.3
RABGEF1-206ENST00000461017 PYCR3Q53H96 274 aa6.96□□□□□ -1.3
RABGEF1-206ENST00000461017 HES3Q5TGS1 186 aa6.96□□□□□ -1.3
RABGEF1-206ENST00000461017 CDCP2Q5VXM1 449 aa6.96□□□□□ -1.3
RABGEF1-206ENST00000461017 KCTD11Q693B1 232 aa6.96□□□□□ -1.3
RABGEF1-206ENST00000461017 ZCCHC8Q6NZY4 707 aaKnown RBP6.96□□□□□ -1.3
RABGEF1-206ENST00000461017 OGFOD3Q6PK18 319 aa6.96□□□□□ -1.3
RABGEF1-206ENST00000461017 UNQ6494/PRO21346Q6UXR6 183 aa6.96□□□□□ -1.3
RABGEF1-206ENST00000461017 ADAMTSL4Q6UY14 1074 aa6.96□□□□□ -1.3
RABGEF1-206ENST00000461017 RANBP10Q6VN20 620 aa6.96□□□□□ -1.3
RABGEF1-206ENST00000461017 MARK2Q7KZI7 788 aaKnown RBP6.96□□□□□ -1.3
RABGEF1-206ENST00000461017 ZNF765Q7L2R6 523 aa6.96□□□□□ -1.3
RABGEF1-206ENST00000461017 EFL1Q7Z2Z2 1120 aaKnown RBP6.96□□□□□ -1.3
RABGEF1-206ENST00000461017 TMPRSS9Q7Z410 1059 aa6.96□□□□□ -1.3
RABGEF1-206ENST00000461017 SLC13A5Q86YT5 568 aaPredicted RBP6.96□□□□□ -1.3
RABGEF1-206ENST00000461017 NRSN1Q8IZ57 195 aa6.96□□□□□ -1.3
RABGEF1-206ENST00000461017 SYCE1Q8N0S2 351 aa6.96□□□□□ -1.3
RABGEF1-206ENST00000461017 TAB3Q8N5C8 712 aaPredicted RBP6.96□□□□□ -1.3
RABGEF1-206ENST00000461017 UBL4BQ8N7F7 174 aa6.96□□□□□ -1.3
RABGEF1-206ENST00000461017 FAM71DQ8N9W8 422 aa6.96□□□□□ -1.3
RABGEF1-206ENST00000461017 CCDC112Q8NEF3 446 aa6.96□□□□□ -1.3
RABGEF1-206ENST00000461017 IPMKQ8NFU5 416 aa6.96□□□□□ -1.3
RABGEF1-206ENST00000461017 MDM1Q8TC05 714 aa6.96□□□□□ -1.3
RABGEF1-206ENST00000461017 GPBAR1Q8TDU6 330 aa6.96□□□□□ -1.3
RABGEF1-206ENST00000461017 NAT14Q8WUY8 206 aa6.96□□□□□ -1.3
RABGEF1-206ENST00000461017 TBATAQ96M53 351 aa6.96□□□□□ -1.3
RABGEF1-206ENST00000461017 TMEM121Q9BTD3 319 aa6.96□□□□□ -1.3
RABGEF1-206ENST00000461017 GBA3Q9H227 469 aa6.96□□□□□ -1.3
RABGEF1-206ENST00000461017 FAM83DQ9H4H8 585 aa6.96□□□□□ -1.3
RABGEF1-206ENST00000461017 CARS2Q9HA77 564 aaKnown RBP6.96□□□□□ -1.3
RABGEF1-206ENST00000461017 UGT1A7Q9HAW7 530 aa6.96□□□□□ -1.3
RABGEF1-206ENST00000461017 UGT1A10Q9HAW8 530 aa6.96□□□□□ -1.3
RABGEF1-206ENST00000461017 UGT1A8Q9HAW9 530 aa6.96□□□□□ -1.3
RABGEF1-206ENST00000461017 PHPT1Q9NRX4 125 aaPredicted RBP6.96□□□□□ -1.3
RABGEF1-206ENST00000461017 IL17CQ9P0M4 197 aa6.96□□□□□ -1.3
RABGEF1-206ENST00000461017 ATXN10Q9UBB4 475 aa6.96□□□□□ -1.3
RABGEF1-206ENST00000461017 GULP1Q9UBP9 304 aa6.96□□□□□ -1.3
RABGEF1-206ENST00000461017 SLC23A2Q9UGH3 650 aa6.96□□□□□ -1.3
RABGEF1-206ENST00000461017 RSPH14Q9UHP6 348 aa6.96□□□□□ -1.3
RABGEF1-206ENST00000461017 TRHDEQ9UKU6 1024 aa6.96□□□□□ -1.3
RABGEF1-206ENST00000461017 SLC17A4Q9Y2C5 497 aa6.96□□□□□ -1.3
RABGEF1-206ENST00000461017 PCDHB1Q9Y5F3 818 aa6.96□□□□□ -1.3
RABGEF1-206ENST00000461017 ARL5AQ9Y689 179 aa6.96□□□□□ -1.3
RABGEF1-206ENST00000461017 KMT2BQ9UMN6 2715 aaPredicted RBP6.95□□□□□ -1.3
RABGEF1-206ENST00000461017 USP24Q9UPU5 2620 aa6.95□□□□□ -1.3
RABGEF1-206ENST00000461017 TRBV23OR9-2A0A075B6M9 112 aa6.95□□□□□ -1.3
RABGEF1-206ENST00000461017 A0A1W2PQM1 296 aa6.95□□□□□ -1.3
RABGEF1-206ENST00000461017 GOLGA6L3A6NEY3 463 aa6.95□□□□□ -1.3
RABGEF1-206ENST00000461017 NEMP2A6NFY4 417 aa6.95□□□□□ -1.3
RABGEF1-206ENST00000461017 LIASO43766 372 aa6.95□□□□□ -1.3
RABGEF1-206ENST00000461017 KRT86O43790 486 aa6.95□□□□□ -1.3
RABGEF1-206ENST00000461017 MT-CO3P00414 261 aa6.95□□□□□ -1.3
RABGEF1-206ENST00000461017 EPOP01588 193 aa6.95□□□□□ -1.3
RABGEF1-206ENST00000461017 PROS1P07225 676 aa6.95□□□□□ -1.3
RABGEF1-206ENST00000461017 IVLP07476 585 aa6.95□□□□□ -1.3
RABGEF1-206ENST00000461017 ZSCAN5DPP0CG00 497 aa6.95□□□□□ -1.3
RABGEF1-206ENST00000461017 PRSS56P0CW18 603 aa6.95□□□□□ -1.3
RABGEF1-206ENST00000461017 ALPPL2P10696 532 aa6.95□□□□□ -1.3
RABGEF1-206ENST00000461017 ZNF8P17098 575 aaPredicted RBP6.95□□□□□ -1.3
RABGEF1-206ENST00000461017 HTR1BP28222 390 aa6.95□□□□□ -1.3
RABGEF1-206ENST00000461017 KCNJ1P48048 391 aa6.95□□□□□ -1.3
RABGEF1-206ENST00000461017 PDX1P52945 283 aa6.95□□□□□ -1.3
RABGEF1-206ENST00000461017 CCL7P80098 99 aa6.95□□□□□ -1.3
RABGEF1-206ENST00000461017 CTBSQ01459 385 aa6.95□□□□□ -1.3
RABGEF1-206ENST00000461017 MPP3Q13368 585 aa6.95□□□□□ -1.3
RABGEF1-206ENST00000461017 SNX1Q13596 522 aa6.95□□□□□ -1.3
RABGEF1-206ENST00000461017 ATP13A5Q4VNC0 1218 aa6.95□□□□□ -1.3
RABGEF1-206ENST00000461017 CCDC181Q5TID7 509 aa6.95□□□□□ -1.3
RABGEF1-206ENST00000461017 TAF8Q7Z7C8 310 aa6.95□□□□□ -1.3
RABGEF1-206ENST00000461017 ADGRG6Q86SQ4 1221 aa6.95□□□□□ -1.3
RABGEF1-206ENST00000461017 C17orf82Q86X59 251 aaPredicted RBP6.95□□□□□ -1.3
RABGEF1-206ENST00000461017 CDKL3Q8IVW4 592 aaPredicted RBP6.95□□□□□ -1.3
RABGEF1-206ENST00000461017 NAGSQ8N159 534 aa6.95□□□□□ -1.3
RABGEF1-206ENST00000461017 NDUFAF2Q8N183 169 aa6.95□□□□□ -1.3
RABGEF1-206ENST00000461017 KDF1Q8NAX2 398 aaPredicted RBP6.95□□□□□ -1.3
RABGEF1-206ENST00000461017 FAM46DQ8NEK8 389 aa6.95□□□□□ -1.3
RABGEF1-206ENST00000461017 OR13C4Q8NGS5 318 aa6.95□□□□□ -1.3
RABGEF1-206ENST00000461017 BLOC1S5Q8TDH9 187 aa6.95□□□□□ -1.3
RABGEF1-206ENST00000461017 HIC2Q96JB3 615 aa6.95□□□□□ -1.3
RABGEF1-206ENST00000461017 SPATA13Q96N96 652 aa6.95□□□□□ -1.3
RABGEF1-206ENST00000461017 VAT1Q99536 393 aa6.95□□□□□ -1.3
RABGEF1-206ENST00000461017 DUSP23Q9BVJ7 150 aa6.95□□□□□ -1.3
RABGEF1-206ENST00000461017 ADGRE3Q9BY15 652 aa6.95□□□□□ -1.3
RABGEF1-206ENST00000461017 GPR63Q9BZJ6 419 aa6.95□□□□□ -1.3
RABGEF1-206ENST00000461017 TSGA10Q9BZW7 698 aa6.95□□□□□ -1.3
RABGEF1-206ENST00000461017 IL26Q9NPH9 171 aa6.95□□□□□ -1.3
RABGEF1-206ENST00000461017 PIH1D1Q9NWS0 290 aaKnown RBP6.95□□□□□ -1.3
RABGEF1-206ENST00000461017 SMARCAL1Q9NZC9 954 aa6.95□□□□□ -1.3
RABGEF1-206ENST00000461017 PKD2L2Q9NZM6 624 aa6.95□□□□□ -1.3
RABGEF1-206ENST00000461017 TSR3Q9UJK0 312 aaKnown RBP6.95□□□□□ -1.3
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 40.7 ms