RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000455631.5

PTPRA-208, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type A, humanhuman

TSL 5

Gene PTPRA, Length 1,107 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRA-208ENST00000455631 HERPUD2Q9BSE4 406 aa23.01■■□□□ 1.27
PTPRA-208ENST00000455631 SNRNP25Q9BV90 132 aaKnown RBP23.01■■□□□ 1.27
PTPRA-208ENST00000455631 EPB41L1Q9H4G0 881 aa23.01■■□□□ 1.27
PTPRA-208ENST00000455631 ESPL1Q14674 2120 aa23■■□□□ 1.27
PTPRA-208ENST00000455631 PIPSLA2A3N6 862 aa23■■□□□ 1.27
PTPRA-208ENST00000455631 EPHB6O15197 1021 aa23■■□□□ 1.27
PTPRA-208ENST00000455631 CREG1O75629 220 aa23■■□□□ 1.27
PTPRA-208ENST00000455631 NDUFA10O95299 355 aa23■■□□□ 1.27
PTPRA-208ENST00000455631 SLC2A4P14672 509 aa23■■□□□ 1.27
PTPRA-208ENST00000455631 CASP14P31944 242 aa23■■□□□ 1.27
PTPRA-208ENST00000455631 MAXP61244 160 aa23■■□□□ 1.27
PTPRA-208ENST00000455631 ZNF787Q6DD87 383 aa23■■□□□ 1.27
PTPRA-208ENST00000455631 OR6C1Q96RD1 312 aa23■■□□□ 1.27
PTPRA-208ENST00000455631 PEBP4Q96S96 227 aa23■■□□□ 1.27
PTPRA-208ENST00000455631 MGME1Q9BQP7 344 aa23■■□□□ 1.27
PTPRA-208ENST00000455631 PCSK1NQ9UHG2 260 aa23■■□□□ 1.27
PTPRA-208ENST00000455631 LNPEPQ9UIQ6 1025 aa23■■□□□ 1.27
PTPRA-208ENST00000455631 RP1L1Q8IWN7 2480 aaPredicted RBP23■■□□□ 1.27
PTPRA-208ENST00000455631 ATP1A1P05023 1023 aaKnown RBP22.99■■□□□ 1.27
PTPRA-208ENST00000455631 PYGLP06737 847 aa22.99■■□□□ 1.27
PTPRA-208ENST00000455631 ACP5P13686 325 aa22.99■■□□□ 1.27
PTPRA-208ENST00000455631 PSMA2P25787 234 aa22.99■■□□□ 1.27
PTPRA-208ENST00000455631 SEPHS1P49903 392 aa22.99■■□□□ 1.27
PTPRA-208ENST00000455631 SH3BP2P78314 561 aa22.99■■□□□ 1.27
PTPRA-208ENST00000455631 DPCR1Q3MIW9 517 aa22.99■■□□□ 1.27
PTPRA-208ENST00000455631 NADK2Q4G0N4 442 aa22.99■■□□□ 1.27
PTPRA-208ENST00000455631 TCP11X2Q5H9J9 407 aa22.99■■□□□ 1.27
PTPRA-208ENST00000455631 ERMARDQ5T6L9 678 aa22.99■■□□□ 1.27
PTPRA-208ENST00000455631 APLFQ8IW19 511 aaPredicted RBP22.99■■□□□ 1.27
PTPRA-208ENST00000455631 BBS5Q8N3I7 341 aa22.99■■□□□ 1.27
PTPRA-208ENST00000455631 COX14Q96I36 57 aa22.99■■□□□ 1.27
PTPRA-208ENST00000455631 C9orf72Q96LT7 481 aa22.99■■□□□ 1.27
PTPRA-208ENST00000455631 TRIM55Q9BYV6 548 aa22.99■■□□□ 1.27
PTPRA-208ENST00000455631 CASS4Q9NQ75 786 aa22.99■■□□□ 1.27
PTPRA-208ENST00000455631 SAMSN1Q9NSI8 373 aaKnown RBP22.99■■□□□ 1.27
PTPRA-208ENST00000455631 CPNE7Q9UBL6 633 aa22.99■■□□□ 1.27
PTPRA-208ENST00000455631 SHANK1Q9Y566 2161 aa22.99■■□□□ 1.27
PTPRA-208ENST00000455631 DNAJC6O75061 913 aa22.98■■□□□ 1.27
PTPRA-208ENST00000455631 F3P13726 295 aa22.98■■□□□ 1.27
PTPRA-208ENST00000455631 PGDP52209 483 aa22.98■■□□□ 1.27
PTPRA-208ENST00000455631 SEMA5AQ13591 1074 aa22.98■■□□□ 1.27
PTPRA-208ENST00000455631 DNASE1L3Q13609 305 aa22.98■■□□□ 1.27
PTPRA-208ENST00000455631 ZNF765Q7L2R6 523 aa22.98■■□□□ 1.27
PTPRA-208ENST00000455631 LYSMD3Q7Z3D4 306 aa22.98■■□□□ 1.27
PTPRA-208ENST00000455631 EXD1Q8NHP7 514 aa22.98■■□□□ 1.27
PTPRA-208ENST00000455631 SMIM14Q96QK8 99 aa22.98■■□□□ 1.27
PTPRA-208ENST00000455631 VPS18Q9P253 973 aa22.98■■□□□ 1.27
PTPRA-208ENST00000455631 MAP4K5Q9Y4K4 846 aa22.98■■□□□ 1.27
PTPRA-208ENST00000455631 KIR2DS5A0A0G2JLQ3 304 aa22.97■■□□□ 1.27
PTPRA-208ENST00000455631 A0A0G2JNG1 304 aa22.97■■□□□ 1.27
PTPRA-208ENST00000455631 A6NCN8 305 aa22.97■■□□□ 1.27
PTPRA-208ENST00000455631 LILRA5A6NI73 299 aa22.97■■□□□ 1.27
PTPRA-208ENST00000455631 KIR2DS3K7RE56 304 aa22.97■■□□□ 1.27
PTPRA-208ENST00000455631 CCNYL3P0C7X3 344 aa22.97■■□□□ 1.27
PTPRA-208ENST00000455631 COL8A1P27658 744 aa22.97■■□□□ 1.27
PTPRA-208ENST00000455631 GARSP41250 739 aaKnown RBP22.97■■□□□ 1.27
PTPRA-208ENST00000455631 KIR2DS5Q14953 304 aa22.97■■□□□ 1.27
PTPRA-208ENST00000455631 NDUFAF2Q8N183 169 aa22.97■■□□□ 1.27
PTPRA-208ENST00000455631 PIH1D2Q8WWB5 315 aa22.97■■□□□ 1.27
PTPRA-208ENST00000455631 TGM7Q96PF1 710 aa22.97■■□□□ 1.27
PTPRA-208ENST00000455631 RIOK2Q9BVS4 552 aaKnown RBP22.97■■□□□ 1.27
PTPRA-208ENST00000455631 PCDHGA6Q9Y5G7 932 aa22.97■■□□□ 1.27
PTPRA-208ENST00000455631 PEX11BO96011 259 aa22.96■■□□□ 1.27
PTPRA-208ENST00000455631 C9P02748 559 aa22.96■■□□□ 1.27
PTPRA-208ENST00000455631 TYRP1P17643 537 aa22.96■■□□□ 1.27
PTPRA-208ENST00000455631 EEF1GP26641 437 aaKnown RBP22.96■■□□□ 1.27
PTPRA-208ENST00000455631 PTSQ03393 145 aa22.96■■□□□ 1.27
PTPRA-208ENST00000455631 IL11RAQ14626 422 aa22.96■■□□□ 1.27
PTPRA-208ENST00000455631 AVL9Q8NBF6 648 aa22.96■■□□□ 1.27
PTPRA-208ENST00000455631 CT55Q8WUE5 264 aa22.96■■□□□ 1.27
PTPRA-208ENST00000455631 PPIL1Q9Y3C6 166 aa22.96■■□□□ 1.27
PTPRA-208ENST00000455631 TEP1Q99973 2627 aaKnown RBP22.95■■□□□ 1.27
PTPRA-208ENST00000455631 RASSF9O75901 435 aa22.95■■□□□ 1.26
PTPRA-208ENST00000455631 SORBS2O94875 1100 aaKnown RBP22.95■■□□□ 1.26
PTPRA-208ENST00000455631 DDAH2O95865 285 aa22.95■■□□□ 1.26
PTPRA-208ENST00000455631 PDHA1P08559 390 aa22.95■■□□□ 1.26
PTPRA-208ENST00000455631 ZNF30P17039 623 aa22.95■■□□□ 1.26
PTPRA-208ENST00000455631 DPYSQ14117 519 aa22.95■■□□□ 1.26
PTPRA-208ENST00000455631 RALGPS1Q5JS13 557 aa22.95■■□□□ 1.26
PTPRA-208ENST00000455631 CPZQ66K79 652 aa22.95■■□□□ 1.26
PTPRA-208ENST00000455631 MAMDC2Q7Z304 686 aaPredicted RBP22.95■■□□□ 1.26
PTPRA-208ENST00000455631 NLRP8Q86W28 1048 aa22.95■■□□□ 1.26
PTPRA-208ENST00000455631 PHYKPLQ8IUZ5 450 aa22.95■■□□□ 1.26
PTPRA-208ENST00000455631 MCOLN2Q8IZK6 566 aa22.95■■□□□ 1.26
PTPRA-208ENST00000455631 NSMCE1Q8WV22 266 aa22.95■■□□□ 1.26
PTPRA-208ENST00000455631 SLC25A23Q9BV35 468 aa22.95■■□□□ 1.26
PTPRA-208ENST00000455631 ACTL8Q9H568 366 aa22.95■■□□□ 1.26
PTPRA-208ENST00000455631 ZNF768Q9H5H4 540 aaKnown RBP22.95■■□□□ 1.26
PTPRA-208ENST00000455631 OGFRQ9NZT2 677 aa22.95■■□□□ 1.26
PTPRA-208ENST00000455631 CWC15Q9P013 229 aaKnown RBP22.95■■□□□ 1.26
PTPRA-208ENST00000455631 PADI1Q9ULC6 663 aa22.95■■□□□ 1.26
PTPRA-208ENST00000455631 ITPR2Q14571 2701 aa22.95■■□□□ 1.26
PTPRA-208ENST00000455631 OR5K4A6NMS3 321 aa22.94■■□□□ 1.26
PTPRA-208ENST00000455631 PRPSAP2O60256 369 aa22.94■■□□□ 1.26
PTPRA-208ENST00000455631 RECKO95980 971 aa22.94■■□□□ 1.26
PTPRA-208ENST00000455631 DCTP40126 519 aa22.94■■□□□ 1.26
PTPRA-208ENST00000455631 MMP13P45452 471 aa22.94■■□□□ 1.26
PTPRA-208ENST00000455631 LEPRP48357 1165 aaKnown RBP22.94■■□□□ 1.26
PTPRA-208ENST00000455631 STC1P52823 247 aa22.94■■□□□ 1.26
PTPRA-208ENST00000455631 CHAF1BQ13112 559 aa22.94■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.1 ms