RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000439272.6

GNB1-204, Transcript of G protein subunit beta 1, humanhuman

TSL 5

Gene GNB1, Length 602 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNB1-204ENST00000439272 DCDC1P59894 354 aa9.5□□□□□ -0.89
GNB1-204ENST00000439272 SRP54P61011 504 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
GNB1-204ENST00000439272 GPS1Q13098 491 aa9.5□□□□□ -0.89
GNB1-204ENST00000439272 SEPT6Q14141 434 aa9.5□□□□□ -0.89
GNB1-204ENST00000439272 POU6F1Q14863 301 aa9.5□□□□□ -0.89
GNB1-204ENST00000439272 TCEA2Q15560 299 aa9.5□□□□□ -0.89
GNB1-204ENST00000439272 TAF1AQ15573 450 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
GNB1-204ENST00000439272 ALG11Q2TAA5 492 aa9.5□□□□□ -0.89
GNB1-204ENST00000439272 HS1BP3Q53T59 392 aa9.5□□□□□ -0.89
GNB1-204ENST00000439272 DOK6Q6PKX4 331 aa9.5□□□□□ -0.89
GNB1-204ENST00000439272 PIP4P1Q86T03 277 aa9.5□□□□□ -0.89
GNB1-204ENST00000439272 TRIM74Q86UV6 250 aa9.5□□□□□ -0.89
GNB1-204ENST00000439272 CREG2Q8IUH2 290 aa9.5□□□□□ -0.89
GNB1-204ENST00000439272 RBFAQ8N0V3 343 aa9.5□□□□□ -0.89
GNB1-204ENST00000439272 EID2Q8N6I1 236 aa9.5□□□□□ -0.89
GNB1-204ENST00000439272 GPR26Q8NDV2 337 aa9.5□□□□□ -0.89
GNB1-204ENST00000439272 ZNF548Q8NEK5 533 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
GNB1-204ENST00000439272 OR4K2Q8NGD2 314 aa9.5□□□□□ -0.89
GNB1-204ENST00000439272 OR52K1Q8NGK4 314 aa9.5□□□□□ -0.89
GNB1-204ENST00000439272 BRSK1Q8TDC3 778 aa9.5□□□□□ -0.89
GNB1-204ENST00000439272 LMX1AQ8TE12 382 aa9.5□□□□□ -0.89
GNB1-204ENST00000439272 RHBDD1Q8TEB9 315 aa9.5□□□□□ -0.89
GNB1-204ENST00000439272 BTN2A2Q8WVV5 523 aa9.5□□□□□ -0.89
GNB1-204ENST00000439272 PDXPQ96GD0 296 aa9.5□□□□□ -0.89
GNB1-204ENST00000439272 HIC2Q96JB3 615 aa9.5□□□□□ -0.89
GNB1-204ENST00000439272 CAMK1GQ96NX5 476 aa9.5□□□□□ -0.89
GNB1-204ENST00000439272 PLEKHG4BQ96PX9 1271 aa9.5□□□□□ -0.89
GNB1-204ENST00000439272 ZSCAN5AQ9BUG6 496 aa9.5□□□□□ -0.89
GNB1-204ENST00000439272 DDX47Q9H0S4 455 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
GNB1-204ENST00000439272 TCEAL2Q9H3H9 227 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
GNB1-204ENST00000439272 SUDS3Q9H7L9 328 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
GNB1-204ENST00000439272 CYP4F12Q9HCS2 524 aa9.5□□□□□ -0.89
GNB1-204ENST00000439272 FGF22Q9HCT0 170 aa9.5□□□□□ -0.89
GNB1-204ENST00000439272 MRPL40Q9NQ50 206 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
GNB1-204ENST00000439272 UCKL1Q9NWZ5 548 aa9.5□□□□□ -0.89
GNB1-204ENST00000439272 IGF2BP1Q9NZI8 577 aaKnown RBP eCLIP9.5□□□□□ -0.895e-7■■■■□ 23.7
GNB1-204ENST00000439272 IL17CQ9P0M4 197 aa9.5□□□□□ -0.89
GNB1-204ENST00000439272 NFKBIL1Q9UBC1 381 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
GNB1-204ENST00000439272 SPASTQ9UBP0 616 aa9.5□□□□□ -0.89
GNB1-204ENST00000439272 PNMA8BQ9ULN7 279 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
GNB1-204ENST00000439272 BTBD3Q9Y2F9 522 aa9.5□□□□□ -0.89
GNB1-204ENST00000439272 ARL5AQ9Y689 179 aa9.5□□□□□ -0.89
GNB1-204ENST00000439272 CEP295Q9C0D2 2601 aa9.49□□□□□ -0.89
GNB1-204ENST00000439272 PRSS38A1L453 326 aa9.49□□□□□ -0.89
GNB1-204ENST00000439272 NEMP2A6NFY4 417 aa9.49□□□□□ -0.89
GNB1-204ENST00000439272 TNFRSF10CO14798 259 aa9.49□□□□□ -0.89
GNB1-204ENST00000439272 FFAR2O15552 330 aa9.49□□□□□ -0.89
GNB1-204ENST00000439272 PPFIA2O75334 1257 aa9.49□□□□□ -0.89
GNB1-204ENST00000439272 SUN1O94901 812 aa9.49□□□□□ -0.89
GNB1-204ENST00000439272 ASMTLO95671 621 aa9.49□□□□□ -0.89
GNB1-204ENST00000439272 ECEL1O95672 775 aa9.49□□□□□ -0.89
GNB1-204ENST00000439272 TNFP01375 233 aa9.49□□□□□ -0.89
GNB1-204ENST00000439272 CTSEP14091 401 aa9.49□□□□□ -0.89
GNB1-204ENST00000439272 CD46P15529 392 aa9.49□□□□□ -0.89
GNB1-204ENST00000439272 SPAM1P38567 509 aa9.49□□□□□ -0.89
GNB1-204ENST00000439272 NOVA1P51513 510 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
GNB1-204ENST00000439272 HK3P52790 923 aa9.49□□□□□ -0.89
GNB1-204ENST00000439272 PDE1BQ01064 536 aa9.49□□□□□ -0.89
GNB1-204ENST00000439272 CDH17Q12864 832 aa9.49□□□□□ -0.89
GNB1-204ENST00000439272 PTPRCAPQ14761 206 aa9.49□□□□□ -0.89
GNB1-204ENST00000439272 PPP1R7Q15435 360 aa9.49□□□□□ -0.89
GNB1-204ENST00000439272 PRRT3Q5FWE3 981 aa9.49□□□□□ -0.89
GNB1-204ENST00000439272 ZDHHC20Q5W0Z9 365 aa9.49□□□□□ -0.89
GNB1-204ENST00000439272 PDPK2PQ6A1A2 396 aa9.49□□□□□ -0.89
GNB1-204ENST00000439272 PSAPL1Q6NUJ1 521 aa9.49□□□□□ -0.89
GNB1-204ENST00000439272 FAM151BQ6UXP7 276 aa9.49□□□□□ -0.89
GNB1-204ENST00000439272 NYAP1Q6ZVC0 841 aa9.49□□□□□ -0.89
GNB1-204ENST00000439272 KANSL1Q7Z3B3 1105 aa9.49□□□□□ -0.89
GNB1-204ENST00000439272 KLHL7Q8IXQ5 586 aa9.49□□□□□ -0.89
GNB1-204ENST00000439272 SLC25A45Q8N413 288 aa9.49□□□□□ -0.89
GNB1-204ENST00000439272 TRAM1L1Q8N609 369 aa9.49□□□□□ -0.89
GNB1-204ENST00000439272 OR1E3Q8WZA6 343 aa9.49□□□□□ -0.89
GNB1-204ENST00000439272 LRRC61Q9BV99 259 aa9.49□□□□□ -0.89
GNB1-204ENST00000439272 CARS2Q9HA77 564 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
GNB1-204ENST00000439272 IL26Q9NPH9 171 aa9.49□□□□□ -0.89
GNB1-204ENST00000439272 EIF2B3Q9NR50 452 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
GNB1-204ENST00000439272 RNF14Q9UBS8 474 aa9.49□□□□□ -0.89
GNB1-204ENST00000439272 PCOLCE2Q9UKZ9 415 aa9.49□□□□□ -0.89
GNB1-204ENST00000439272 KCTD3Q9Y597 815 aa9.49□□□□□ -0.89
GNB1-204ENST00000439272 ACACAQ13085 2346 aa9.49□□□□□ -0.89
GNB1-204ENST00000439272 TRBV21OR9-2A0A075B6F4 123 aaPredicted RBP9.48□□□□□ -0.89
GNB1-204ENST00000439272 GLYATL1P3A0A0U1RQE8 302 aa9.48□□□□□ -0.89
GNB1-204ENST00000439272 CCDC188H7C350 402 aa9.48□□□□□ -0.89
GNB1-204ENST00000439272 GIPC1O14908 333 aa9.48□□□□□ -0.89
GNB1-204ENST00000439272 AQP9O43315 295 aa9.48□□□□□ -0.89
GNB1-204ENST00000439272 SLC25A14O95258 325 aaPredicted RBP9.48□□□□□ -0.89
GNB1-204ENST00000439272 KCNK5O95279 499 aa9.48□□□□□ -0.89
GNB1-204ENST00000439272 CEACAM5P06731 702 aa9.48□□□□□ -0.89
GNB1-204ENST00000439272 ALPPL2P10696 532 aa9.48□□□□□ -0.89
GNB1-204ENST00000439272 CEACAM1P13688 526 aa9.48□□□□□ -0.89
GNB1-204ENST00000439272 TPSB2P20231 275 aa9.48□□□□□ -0.89
GNB1-204ENST00000439272 GRIA1P42261 906 aa9.48□□□□□ -0.89
GNB1-204ENST00000439272 GNPDA1P46926 289 aa9.48□□□□□ -0.89
GNB1-204ENST00000439272 POLD2P49005 469 aa9.48□□□□□ -0.89
GNB1-204ENST00000439272 ZNF140P52738 457 aaPredicted RBP9.48□□□□□ -0.89
GNB1-204ENST00000439272 TMPRSS15P98073 1019 aa9.48□□□□□ -0.89
GNB1-204ENST00000439272 MSLNQ13421 630 aaPredicted RBP9.48□□□□□ -0.89
GNB1-204ENST00000439272 C1orf61Q13536 156 aa9.48□□□□□ -0.89
GNB1-204ENST00000439272 TPSAB1Q15661 275 aa9.48□□□□□ -0.89
GNB1-204ENST00000439272 CHRNA6Q15825 494 aa9.48□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.3 ms