RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000438356.1

RBM33-208, Transcript of RNA binding motif protein 33, human

TSL 4

Gene RBM33, Length 547 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RBM33-208	ENST00000438356	SNX1	Q13596	522 aa		11.99	□□□□□ -0.49
RBM33-208	ENST00000438356	TCEA2	Q15560	299 aa		11.99	□□□□□ -0.49
RBM33-208	ENST00000438356	CCNG2	Q16589	344 aa		11.99	□□□□□ -0.49
RBM33-208	ENST00000438356	ALG11	Q2TAA5	492 aa		11.99	□□□□□ -0.49
RBM33-208	ENST00000438356	ALS2CL	Q60I27	953 aa		11.99	□□□□□ -0.49
RBM33-208	ENST00000438356	ZCCHC8	Q6NZY4	707 aa	Known RBP	11.99	□□□□□ -0.49
RBM33-208	ENST00000438356	DOK6	Q6PKX4	331 aa		11.99	□□□□□ -0.49
RBM33-208	ENST00000438356	GLT6D1	Q7Z4J2	308 aa		11.99	□□□□□ -0.49
RBM33-208	ENST00000438356	TAF8	Q7Z7C8	310 aa		11.99	□□□□□ -0.49
RBM33-208	ENST00000438356	REXO1L1P	Q8IX06	675 aa		11.99	□□□□□ -0.49
RBM33-208	ENST00000438356	HIC2	Q96JB3	615 aa		11.99	□□□□□ -0.49
RBM33-208	ENST00000438356	APOLD1	Q96LR9	279 aa		11.99	□□□□□ -0.49
RBM33-208	ENST00000438356	BBC3	Q96PG8	261 aa	Predicted RBP	11.99	□□□□□ -0.49
RBM33-208	ENST00000438356	ZSCAN5A	Q9BUG6	496 aa		11.99	□□□□□ -0.49
RBM33-208	ENST00000438356	TEX101	Q9BY14	249 aa		11.99	□□□□□ -0.49
RBM33-208	ENST00000438356	KCNF1	Q9H3M0	494 aa		11.99	□□□□□ -0.49
RBM33-208	ENST00000438356	SUDS3	Q9H7L9	328 aa	Predicted RBP	11.99	□□□□□ -0.49
RBM33-208	ENST00000438356	LRRC40	Q9H9A6	602 aa		11.99	□□□□□ -0.49
RBM33-208	ENST00000438356	CARS2	Q9HA77	564 aa	Known RBP	11.99	□□□□□ -0.49
RBM33-208	ENST00000438356	CYP4F12	Q9HCS2	524 aa		11.99	□□□□□ -0.49
RBM33-208	ENST00000438356	IGF2BP1	Q9NZI8	577 aa	Known RBP eCLIP	11.99	□□□□□ -0.49
RBM33-208	ENST00000438356	DGKB	Q9Y6T7	804 aa		11.99	□□□□□ -0.49
RBM33-208	ENST00000438356	TMEM202	A6NGA9	273 aa		11.98	□□□□□ -0.49
RBM33-208	ENST00000438356	LMO7DN	F2Z398	122 aa		11.98	□□□□□ -0.49
RBM33-208	ENST00000438356	INPP4B	O15327	924 aa		11.98	□□□□□ -0.49
RBM33-208	ENST00000438356	STX7	O15400	261 aa	Known RBP	11.98	□□□□□ -0.49
RBM33-208	ENST00000438356	PPFIA2	O75334	1257 aa		11.98	□□□□□ -0.49
RBM33-208	ENST00000438356	CRTAM	O95727	393 aa		11.98	□□□□□ -0.49
RBM33-208	ENST00000438356	AGT	P01019	485 aa		11.98	□□□□□ -0.49
RBM33-208	ENST00000438356	CELA2B	P08218	269 aa	Predicted RBP	11.98	□□□□□ -0.49
RBM33-208	ENST00000438356	CXCR5	P32302	372 aa		11.98	□□□□□ -0.49
RBM33-208	ENST00000438356	FDFT1	P37268	417 aa		11.98	□□□□□ -0.49
RBM33-208	ENST00000438356	PDE1B	Q01064	536 aa		11.98	□□□□□ -0.49
RBM33-208	ENST00000438356	ILF3	Q12906	894 aa	Known RBP eCLIP	11.98	□□□□□ -0.49
RBM33-208	ENST00000438356	COL9A2	Q14055	689 aa	Predicted RBP	11.98	□□□□□ -0.49
RBM33-208	ENST00000438356	DEFB133	Q30KQ1	61 aa		11.98	□□□□□ -0.49
RBM33-208	ENST00000438356	PDPK2P	Q6A1A2	396 aa		11.98	□□□□□ -0.49
RBM33-208	ENST00000438356	LVRN	Q6Q4G3	990 aa		11.98	□□□□□ -0.49
RBM33-208	ENST00000438356	RFLNA	Q6ZTI6	216 aa		11.98	□□□□□ -0.49
RBM33-208	ENST00000438356	TMC3	Q7Z5M5	1100 aa		11.98	□□□□□ -0.49
RBM33-208	ENST00000438356	LINC00523	Q86TU6	105 aa		11.98	□□□□□ -0.49
RBM33-208	ENST00000438356	SLC35F6	Q8N357	371 aa		11.98	□□□□□ -0.49
RBM33-208	ENST00000438356	OR1E3	Q8WZA6	343 aa		11.98	□□□□□ -0.49
RBM33-208	ENST00000438356	NXPE2	Q96DL1	559 aa		11.98	□□□□□ -0.49
RBM33-208	ENST00000438356	TBL1Y	Q9BQ87	522 aa		11.98	□□□□□ -0.49
RBM33-208	ENST00000438356	LRRC61	Q9BV99	259 aa		11.98	□□□□□ -0.49
RBM33-208	ENST00000438356	FGF22	Q9HCT0	170 aa		11.98	□□□□□ -0.49
RBM33-208	ENST00000438356	PAK5	Q9P286	719 aa		11.98	□□□□□ -0.49
RBM33-208	ENST00000438356	CLCA2	Q9UQC9	943 aa		11.98	□□□□□ -0.49
RBM33-208	ENST00000438356	AK5	Q9Y6K8	562 aa		11.98	□□□□□ -0.49
RBM33-208	ENST00000438356	ASXL3	Q9C0F0	2248 aa		11.97	□□□□□ -0.49
RBM33-208	ENST00000438356	GOLGA6L10	A0A0M3HER8	536 aa		11.97	□□□□□ -0.49
RBM33-208	ENST00000438356	PRSS38	A1L453	326 aa		11.97	□□□□□ -0.49
RBM33-208	ENST00000438356	ERI2	A8K979	691 aa	Known RBP	11.97	□□□□□ -0.49
RBM33-208	ENST00000438356	BRINP1	O60477	761 aa		11.97	□□□□□ -0.49
RBM33-208	ENST00000438356	MT-CO3	P00414	261 aa		11.97	□□□□□ -0.49
RBM33-208	ENST00000438356	CKMT1A	P12532	417 aa		11.97	□□□□□ -0.49
RBM33-208	ENST00000438356	HMGCL	P35914	325 aa		11.97	□□□□□ -0.49
RBM33-208	ENST00000438356	SPAM1	P38567	509 aa		11.97	□□□□□ -0.49
RBM33-208	ENST00000438356	CHRNA4	P43681	627 aa		11.97	□□□□□ -0.49
RBM33-208	ENST00000438356	GNPDA1	P46926	289 aa		11.97	□□□□□ -0.49
RBM33-208	ENST00000438356	DCDC1	P59894	354 aa		11.97	□□□□□ -0.49
RBM33-208	ENST00000438356	ILK	Q13418	452 aa		11.97	□□□□□ -0.49
RBM33-208	ENST00000438356	BIRC2	Q13490	618 aa		11.97	□□□□□ -0.49
RBM33-208	ENST00000438356	NR0B2	Q15466	257 aa		11.97	□□□□□ -0.49
RBM33-208	ENST00000438356	CDKN3	Q16667	212 aa		11.97	□□□□□ -0.49
RBM33-208	ENST00000438356	SOWAHC	Q53LP3	525 aa	Predicted RBP	11.97	□□□□□ -0.49
RBM33-208	ENST00000438356	KCTD16	Q68DU8	428 aa		11.97	□□□□□ -0.49
RBM33-208	ENST00000438356	C4orf22	Q6V702	233 aa		11.97	□□□□□ -0.49
RBM33-208	ENST00000438356	GALNT13	Q8IUC8	556 aa		11.97	□□□□□ -0.49
RBM33-208	ENST00000438356	TAB3	Q8N5C8	712 aa	Predicted RBP	11.97	□□□□□ -0.49
RBM33-208	ENST00000438356	TRAM1L1	Q8N609	369 aa		11.97	□□□□□ -0.49
RBM33-208	ENST00000438356	DCBLD1	Q8N8Z6	715 aa		11.97	□□□□□ -0.49
RBM33-208	ENST00000438356	GDAP1	Q8TB36	358 aa		11.97	□□□□□ -0.49
RBM33-208	ENST00000438356	PDXP	Q96GD0	296 aa		11.97	□□□□□ -0.49
RBM33-208	ENST00000438356	APOL2	Q9BQE5	337 aa		11.97	□□□□□ -0.49
RBM33-208	ENST00000438356	LGR4	Q9BXB1	951 aa		11.97	□□□□□ -0.49
RBM33-208	ENST00000438356	GSDMC	Q9BYG8	508 aa		11.97	□□□□□ -0.49
RBM33-208	ENST00000438356	BPIFA1	Q9NP55	256 aa		11.97	□□□□□ -0.49
RBM33-208	ENST00000438356	GULP1	Q9UBP9	304 aa		11.97	□□□□□ -0.49
RBM33-208	ENST00000438356	GPR34	Q9UPC5	381 aa		11.97	□□□□□ -0.49
RBM33-208	ENST00000438356	DRG1	Q9Y295	367 aa	Known RBP	11.97	□□□□□ -0.49
RBM33-208	ENST00000438356	COL27A1	Q8IZC6	1860 aa	Predicted RBP	11.96	□□□□□ -0.49
RBM33-208	ENST00000438356		A0A087WV48	116 aa		11.96	□□□□□ -0.49
RBM33-208	ENST00000438356	YY2	O15391	372 aa		11.96	□□□□□ -0.49
RBM33-208	ENST00000438356	SLC25A14	O95258	325 aa	Predicted RBP	11.96	□□□□□ -0.49
RBM33-208	ENST00000438356	IVL	P07476	585 aa		11.96	□□□□□ -0.49
RBM33-208	ENST00000438356	LPO	P22079	712 aa	Predicted RBP	11.96	□□□□□ -0.49
RBM33-208	ENST00000438356	GDF10	P55107	478 aa		11.96	□□□□□ -0.49
RBM33-208	ENST00000438356	GNG11	P61952	73 aa		11.96	□□□□□ -0.49
RBM33-208	ENST00000438356	E2F1	Q01094	437 aa		11.96	□□□□□ -0.49
RBM33-208	ENST00000438356	GTF2H3	Q13889	308 aa		11.96	□□□□□ -0.49
RBM33-208	ENST00000438356	SPARCL1	Q14515	664 aa		11.96	□□□□□ -0.49
RBM33-208	ENST00000438356	TAF1A	Q15573	450 aa	Predicted RBP	11.96	□□□□□ -0.49
RBM33-208	ENST00000438356	OASL	Q15646	514 aa	Known RBP	11.96	□□□□□ -0.49
RBM33-208	ENST00000438356	C6orf132	Q5T0Z8	1188 aa		11.96	□□□□□ -0.49
RBM33-208	ENST00000438356	HENMT1	Q5T8I9	393 aa	Known RBP	11.96	□□□□□ -0.49
RBM33-208	ENST00000438356	GUSBP11	Q6P575	273 aa		11.96	□□□□□ -0.49
RBM33-208	ENST00000438356	DRICH1	Q6PGQ1	229 aa	Predicted RBP	11.96	□□□□□ -0.49
RBM33-208	ENST00000438356	RANBP10	Q6VN20	620 aa		11.96	□□□□□ -0.49

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