RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000437111.1

SHQ1P1-201, Transcript of SHQ1, H/ACA ribonucleoprotein assembly factor pseudogene 1, humanhuman

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Gene SHQ1P1, Length 1,544 nt, Biotype processed pseudogene.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHQ1P1-201ENST00000437111 SORT1Q99523 831 aa6.3□□□□□ -1.4
SHQ1P1-201ENST00000437111 MIPEPQ99797 713 aa6.3□□□□□ -1.4
SHQ1P1-201ENST00000437111 CLSTN3Q9BQT9 956 aa6.3□□□□□ -1.4
SHQ1P1-201ENST00000437111 MCMBPQ9BTE3 642 aa6.3□□□□□ -1.4
SHQ1P1-201ENST00000437111 TTPALQ9BTX7 342 aa6.3□□□□□ -1.4
SHQ1P1-201ENST00000437111 CINPQ9BW66 212 aaPredicted RBP6.3□□□□□ -1.4
SHQ1P1-201ENST00000437111 VCXQ9H320 206 aa6.3□□□□□ -1.4
SHQ1P1-201ENST00000437111 DENND2DQ9H6A0 471 aaPredicted RBP6.3□□□□□ -1.4
SHQ1P1-201ENST00000437111 BRD9Q9H8M2 597 aa6.3□□□□□ -1.4
SHQ1P1-201ENST00000437111 IL21Q9HBE4 155 aa6.3□□□□□ -1.4
SHQ1P1-201ENST00000437111 ZNF334Q9HCZ1 680 aaPredicted RBP6.3□□□□□ -1.4
SHQ1P1-201ENST00000437111 PFDN4Q9NQP4 134 aa6.3□□□□□ -1.4
SHQ1P1-201ENST00000437111 TAS2R1Q9NYW7 299 aa6.3□□□□□ -1.4
SHQ1P1-201ENST00000437111 IL1RAPL1Q9NZN1 696 aa6.3□□□□□ -1.4
SHQ1P1-201ENST00000437111 MPP6Q9NZW5 540 aa6.3□□□□□ -1.4
SHQ1P1-201ENST00000437111 STX18Q9P2W9 335 aaKnown RBP6.3□□□□□ -1.4
SHQ1P1-201ENST00000437111 XPR1Q9UBH6 696 aa6.3□□□□□ -1.4
SHQ1P1-201ENST00000437111 UXTQ9UBK9 157 aaPredicted RBP6.3□□□□□ -1.4
SHQ1P1-201ENST00000437111 SEPT3Q9UH03 358 aa6.3□□□□□ -1.4
SHQ1P1-201ENST00000437111 DNMT3LQ9UJW3 386 aa6.3□□□□□ -1.4
SHQ1P1-201ENST00000437111 FBXO5Q9UKT4 447 aa6.3□□□□□ -1.4
SHQ1P1-201ENST00000437111 TMCO1Q9UM00 188 aa6.3□□□□□ -1.4
SHQ1P1-201ENST00000437111 MRPS23Q9Y3D9 190 aaKnown RBP6.3□□□□□ -1.4
SHQ1P1-201ENST00000437111 L3MBTL1Q9Y468 752 aa6.3□□□□□ -1.4
SHQ1P1-201ENST00000437111 PIAS3Q9Y6X2 628 aa6.3□□□□□ -1.4
SHQ1P1-201ENST00000437111 ADAMTS20P59510 1910 aa6.3□□□□□ -1.4
SHQ1P1-201ENST00000437111 DRGXA6NNA5 263 aa6.3□□□□□ -1.4
SHQ1P1-201ENST00000437111 H0Y3Z8 333 aa6.3□□□□□ -1.4
SHQ1P1-201ENST00000437111 PHGDHO43175 533 aaKnown RBP6.3□□□□□ -1.4
SHQ1P1-201ENST00000437111 ADAM12O43184 909 aa6.3□□□□□ -1.4
SHQ1P1-201ENST00000437111 ITM2AO43736 263 aa6.3□□□□□ -1.4
SHQ1P1-201ENST00000437111 PRAMEF11O60813 436 aa6.3□□□□□ -1.4
SHQ1P1-201ENST00000437111 CLDN11O75508 207 aa6.3□□□□□ -1.4
SHQ1P1-201ENST00000437111 LYPLA1O75608 230 aaPredicted RBP6.3□□□□□ -1.4
SHQ1P1-201ENST00000437111 RPP40O75818 363 aaKnown RBP6.3□□□□□ -1.4
SHQ1P1-201ENST00000437111 PIGNO95427 931 aa6.3□□□□□ -1.4
SHQ1P1-201ENST00000437111 LATS1O95835 1130 aa6.3□□□□□ -1.4
SHQ1P1-201ENST00000437111 CEBPBP17676 345 aa6.3□□□□□ -1.4
SHQ1P1-201ENST00000437111 ATP6V1C1P21283 382 aa6.3□□□□□ -1.4
SHQ1P1-201ENST00000437111 TACR2P21452 398 aa6.3□□□□□ -1.4
SHQ1P1-201ENST00000437111 HOXA6P31267 233 aa6.3□□□□□ -1.4
SHQ1P1-201ENST00000437111 GCKP35557 465 aa6.3□□□□□ -1.4
SHQ1P1-201ENST00000437111 MPLP40238 635 aa6.3□□□□□ -1.4
SHQ1P1-201ENST00000437111 ARCN1P48444 511 aaKnown RBP6.3□□□□□ -1.4
SHQ1P1-201ENST00000437111 PTDSS1P48651 473 aaKnown RBP6.3□□□□□ -1.4
SHQ1P1-201ENST00000437111 CDH4P55283 916 aa6.3□□□□□ -1.4
SHQ1P1-201ENST00000437111 STX1BP61266 288 aa6.3□□□□□ -1.4
SHQ1P1-201ENST00000437111 MRPS35P82673 323 aaKnown RBP6.3□□□□□ -1.4
SHQ1P1-201ENST00000437111 IRF9Q00978 393 aa6.3□□□□□ -1.4
SHQ1P1-201ENST00000437111 NSUN2Q08J23 767 aaKnown RBP eCLIP6.3□□□□□ -1.4
SHQ1P1-201ENST00000437111 TAF10Q12962 218 aa6.3□□□□□ -1.4
SHQ1P1-201ENST00000437111 PLD1Q13393 1074 aa6.3□□□□□ -1.4
SHQ1P1-201ENST00000437111 SERINC3Q13530 473 aa6.3□□□□□ -1.4
SHQ1P1-201ENST00000437111 CUL3Q13618 768 aa6.3□□□□□ -1.4
SHQ1P1-201ENST00000437111 UBAP2LQ14157 1087 aaKnown RBP6.3□□□□□ -1.4
SHQ1P1-201ENST00000437111 MRPL58Q14197 206 aaKnown RBP6.3□□□□□ -1.4
SHQ1P1-201ENST00000437111 KPNB1Q14974 876 aaKnown RBP6.3□□□□□ -1.4
SHQ1P1-201ENST00000437111 ACAP2Q15057 778 aa6.3□□□□□ -1.4
SHQ1P1-201ENST00000437111 SMAD1Q15797 465 aaKnown RBP6.3□□□□□ -1.4
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SHQ1P1-201ENST00000437111 KIAA1211LQ6NV74 962 aa6.3□□□□□ -1.4
SHQ1P1-201ENST00000437111 AFTPHQ6ULP2 937 aa6.3□□□□□ -1.4
SHQ1P1-201ENST00000437111 KDELC1Q6UW63 502 aa6.3□□□□□ -1.4
SHQ1P1-201ENST00000437111 ZNF783Q6ZMS7 281 aa6.3□□□□□ -1.4
SHQ1P1-201ENST00000437111 LRRC74BQ6ZQY2 392 aa6.3□□□□□ -1.4
SHQ1P1-201ENST00000437111 ARHGAP36Q6ZRI8 547 aa6.3□□□□□ -1.4
SHQ1P1-201ENST00000437111 FSTL5Q8N475 847 aaPredicted RBP6.3□□□□□ -1.4
SHQ1P1-201ENST00000437111 ZC3H8Q8N5P1 291 aaKnown RBP eCLIP6.3□□□□□ -1.4
SHQ1P1-201ENST00000437111 ZNF781Q8N8C0 355 aa6.3□□□□□ -1.4
SHQ1P1-201ENST00000437111 OR6Y1Q8NGX8 325 aa6.3□□□□□ -1.4
SHQ1P1-201ENST00000437111 RP9Q8TA86 221 aaKnown RBP6.3□□□□□ -1.4
SHQ1P1-201ENST00000437111 ZSCAN18Q8TBC5 510 aaPredicted RBP6.3□□□□□ -1.4
SHQ1P1-201ENST00000437111 KCTD4Q8WVF5 259 aa6.3□□□□□ -1.4
SHQ1P1-201ENST00000437111 GAB3Q8WWW8 586 aa6.3□□□□□ -1.4
SHQ1P1-201ENST00000437111 DNAJC9Q8WXX5 260 aa6.3□□□□□ -1.4
SHQ1P1-201ENST00000437111 TBRG4Q969Z0 631 aaKnown RBP eCLIP6.3□□□□□ -1.4
SHQ1P1-201ENST00000437111 AZIN2Q96A70 460 aa6.3□□□□□ -1.4
SHQ1P1-201ENST00000437111 NAF1Q96HR8 494 aaKnown RBP6.3□□□□□ -1.4
SHQ1P1-201ENST00000437111 PGLYRP2Q96PD5 576 aa6.3□□□□□ -1.4
SHQ1P1-201ENST00000437111 BBC3Q96PG8 261 aaPredicted RBP6.3□□□□□ -1.4
SHQ1P1-201ENST00000437111 EBF4Q9BQW3 602 aa6.3□□□□□ -1.4
SHQ1P1-201ENST00000437111 THTPAQ9BU02 230 aa6.3□□□□□ -1.4
SHQ1P1-201ENST00000437111 EDEM2Q9BV94 578 aa6.3□□□□□ -1.4
SHQ1P1-201ENST00000437111 TRMT61BQ9BVS5 477 aaKnown RBP6.3□□□□□ -1.4
SHQ1P1-201ENST00000437111 TTLL2Q9BWV7 592 aa6.3□□□□□ -1.4
SHQ1P1-201ENST00000437111 COG4Q9H9E3 785 aa6.3□□□□□ -1.4
SHQ1P1-201ENST00000437111 CAB39LQ9H9S4 337 aa6.3□□□□□ -1.4
SHQ1P1-201ENST00000437111 SYTL2Q9HCH5 934 aa6.3□□□□□ -1.4
SHQ1P1-201ENST00000437111 ATP13A1Q9HD20 1204 aa6.3□□□□□ -1.4
SHQ1P1-201ENST00000437111 TRPV5Q9NQA5 729 aa6.3□□□□□ -1.4
SHQ1P1-201ENST00000437111 CATSPERZQ9NTU4 200 aa6.3□□□□□ -1.4
SHQ1P1-201ENST00000437111 INTS10Q9NVR2 710 aaKnown RBP6.3□□□□□ -1.4
SHQ1P1-201ENST00000437111 GTSE1Q9NYZ3 720 aa6.3□□□□□ -1.4
SHQ1P1-201ENST00000437111 GDE1Q9NZC3 331 aa6.3□□□□□ -1.4
SHQ1P1-201ENST00000437111 IGF2BP1Q9NZI8 577 aaKnown RBP eCLIP6.3□□□□□ -1.4
SHQ1P1-201ENST00000437111 PLA2G2EQ9NZK7 142 aa6.3□□□□□ -1.4
SHQ1P1-201ENST00000437111 CPSF2Q9P2I0 782 aaKnown RBP6.3□□□□□ -1.4
SHQ1P1-201ENST00000437111 UBA2Q9UBT2 640 aaPredicted RBP6.3□□□□□ -1.4
SHQ1P1-201ENST00000437111 RUVBL2Q9Y230 463 aaKnown RBP6.3□□□□□ -1.4
SHQ1P1-201ENST00000437111 LRCH1Q9Y2L9 728 aa6.3□□□□□ -1.4
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