RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000435535.1

RPS3AP54-201, Transcript of ribosomal protein S3a pseudogene 54, humanhuman

BASIC

Gene RPS3AP54, Length 734 nt, Biotype processed pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS3AP54-201ENST00000435535 CHST2Q9Y4C5 530 aa4.59□□□□□ -1.67
RPS3AP54-201ENST00000435535 RAD54BQ9Y620 910 aa4.59□□□□□ -1.67
RPS3AP54-201ENST00000435535 USP24Q9UPU5 2620 aa4.59□□□□□ -1.68
RPS3AP54-201ENST00000435535 AHRRA9YTQ3 701 aa4.58□□□□□ -1.68
RPS3AP54-201ENST00000435535 F8W8V4 182 aa4.58□□□□□ -1.68
RPS3AP54-201ENST00000435535 K7EQS6 105 aa4.58□□□□□ -1.68
RPS3AP54-201ENST00000435535 M0QYG6 137 aa4.58□□□□□ -1.68
RPS3AP54-201ENST00000435535 SGK1O00141 431 aa4.58□□□□□ -1.68
RPS3AP54-201ENST00000435535 O00370 1275 aa4.58□□□□□ -1.68
RPS3AP54-201ENST00000435535 BTN3A1O00481 513 aa4.58□□□□□ -1.68
RPS3AP54-201ENST00000435535 PES1O00541 588 aaKnown RBP4.58□□□□□ -1.68
RPS3AP54-201ENST00000435535 SLC9A3R1O14745 358 aaPredicted RBP4.58□□□□□ -1.68
RPS3AP54-201ENST00000435535 KPNA5O15131 536 aa4.58□□□□□ -1.68
RPS3AP54-201ENST00000435535 STX10O60499 249 aa4.58□□□□□ -1.68
RPS3AP54-201ENST00000435535 FOXD2O60548 495 aaPredicted RBP4.58□□□□□ -1.68
RPS3AP54-201ENST00000435535 TSPAN3O60637 253 aa4.58□□□□□ -1.68
RPS3AP54-201ENST00000435535 TULP3O75386 442 aa4.58□□□□□ -1.68
RPS3AP54-201ENST00000435535 UNC5CO95185 931 aa4.58□□□□□ -1.68
RPS3AP54-201ENST00000435535 PAPSS2O95340 614 aaPredicted RBP4.58□□□□□ -1.68
RPS3AP54-201ENST00000435535 ELANEP08246 267 aa4.58□□□□□ -1.68
RPS3AP54-201ENST00000435535 ZDHHC11BP0C7U3 371 aa4.58□□□□□ -1.68
RPS3AP54-201ENST00000435535 RALAP11233 206 aa4.58□□□□□ -1.68
RPS3AP54-201ENST00000435535 HOXB2P14652 356 aa4.58□□□□□ -1.68
RPS3AP54-201ENST00000435535 ACRV1P26436 265 aa4.58□□□□□ -1.68
RPS3AP54-201ENST00000435535 SERPINB3P29508 390 aa4.58□□□□□ -1.68
RPS3AP54-201ENST00000435535 GTF2H1P32780 548 aa4.58□□□□□ -1.68
RPS3AP54-201ENST00000435535 ATP5C1P36542 298 aaKnown RBP4.58□□□□□ -1.68
RPS3AP54-201ENST00000435535 ANP32AP39687 249 aaKnown RBP4.58□□□□□ -1.68
RPS3AP54-201ENST00000435535 MPLP40238 635 aa4.58□□□□□ -1.68
RPS3AP54-201ENST00000435535 USP8P40818 1118 aa4.58□□□□□ -1.68
RPS3AP54-201ENST00000435535 PPP3CCP48454 512 aa4.58□□□□□ -1.68
RPS3AP54-201ENST00000435535 DHPSP49366 369 aaPredicted RBP4.58□□□□□ -1.68
RPS3AP54-201ENST00000435535 PRIM2P49643 509 aa4.58□□□□□ -1.68
RPS3AP54-201ENST00000435535 TUBP50607 506 aa4.58□□□□□ -1.68
RPS3AP54-201ENST00000435535 SGSHP51688 502 aa4.58□□□□□ -1.68
RPS3AP54-201ENST00000435535 YWHAGP61981 247 aaKnown RBP eCLIP4.58□□□□□ -1.68
RPS3AP54-201ENST00000435535 CREB5Q02930 508 aa4.58□□□□□ -1.68
RPS3AP54-201ENST00000435535 BST2Q10589 180 aaKnown RBP4.58□□□□□ -1.68
RPS3AP54-201ENST00000435535 SLC13A2Q13183 592 aa4.58□□□□□ -1.68
RPS3AP54-201ENST00000435535 MORC3Q14149 939 aa4.58□□□□□ -1.68
RPS3AP54-201ENST00000435535 BRD3Q15059 726 aa4.58□□□□□ -1.68
RPS3AP54-201ENST00000435535 PRKD1Q15139 912 aaPredicted RBP4.58□□□□□ -1.68
RPS3AP54-201ENST00000435535 DPCR1Q3MIW9 517 aa4.58□□□□□ -1.68
RPS3AP54-201ENST00000435535 C3orf38Q5JPI3 329 aa4.58□□□□□ -1.68
RPS3AP54-201ENST00000435535 GJB7Q6PEY0 223 aa4.58□□□□□ -1.68
RPS3AP54-201ENST00000435535 RHBDF2Q6PJF5 856 aa4.58□□□□□ -1.68
RPS3AP54-201ENST00000435535 KIAA1324Q6UXG2 1013 aaKnown RBP4.58□□□□□ -1.68
RPS3AP54-201ENST00000435535 ZNF783Q6ZMS7 281 aa4.58□□□□□ -1.68
RPS3AP54-201ENST00000435535 SYT13Q7L8C5 426 aa4.58□□□□□ -1.68
RPS3AP54-201ENST00000435535 BHLHA9Q7RTU4 235 aa4.58□□□□□ -1.68
RPS3AP54-201ENST00000435535 CCDC186Q7Z3E2 898 aa4.58□□□□□ -1.68
RPS3AP54-201ENST00000435535 PPP1R32Q7Z5V6 425 aa4.58□□□□□ -1.68
RPS3AP54-201ENST00000435535 SCD5Q86SK9 330 aa4.58□□□□□ -1.68
RPS3AP54-201ENST00000435535 TMEM25Q86YD3 366 aa4.58□□□□□ -1.68
RPS3AP54-201ENST00000435535 PALM2Q8IXS6 379 aa4.58□□□□□ -1.68
RPS3AP54-201ENST00000435535 ZC3H3Q8IXZ2 948 aaKnown RBP4.58□□□□□ -1.68
RPS3AP54-201ENST00000435535 CFAP52Q8N1V2 620 aa4.58□□□□□ -1.68
RPS3AP54-201ENST00000435535 DEFB119Q8N690 84 aa4.58□□□□□ -1.68
RPS3AP54-201ENST00000435535 ZNF366Q8N895 744 aa4.58□□□□□ -1.68
RPS3AP54-201ENST00000435535 IL17RCQ8NAC3 791 aa4.58□□□□□ -1.68
RPS3AP54-201ENST00000435535 OR56A1Q8NGH5 318 aa4.58□□□□□ -1.68
RPS3AP54-201ENST00000435535 SPATA20Q8TB22 786 aa4.58□□□□□ -1.68
RPS3AP54-201ENST00000435535 OVCA2Q8WZ82 227 aa4.58□□□□□ -1.68
RPS3AP54-201ENST00000435535 TFAP2BQ92481 460 aa4.58□□□□□ -1.68
RPS3AP54-201ENST00000435535 EXOC4Q96A65 974 aa4.58□□□□□ -1.68
RPS3AP54-201ENST00000435535 NMD3Q96D46 503 aaKnown RBP4.58□□□□□ -1.68
RPS3AP54-201ENST00000435535 P2RY11Q96G91 374 aa4.58□□□□□ -1.68
RPS3AP54-201ENST00000435535 LRIG1Q96JA1 1093 aa4.58□□□□□ -1.68
RPS3AP54-201ENST00000435535 CEP295NLQ96MC4 621 aa4.58□□□□□ -1.68
RPS3AP54-201ENST00000435535 TIGD1Q96MW7 591 aa4.58□□□□□ -1.68
RPS3AP54-201ENST00000435535 DCLRE1CQ96SD1 692 aaKnown RBP4.58□□□□□ -1.68
RPS3AP54-201ENST00000435535 ACOX2Q99424 681 aa4.58□□□□□ -1.68
RPS3AP54-201ENST00000435535 HNRNPABQ99729 332 aaKnown RBP4.58□□□□□ -1.68
RPS3AP54-201ENST00000435535 ELAC2Q9BQ52 826 aaKnown RBP4.58□□□□□ -1.68
RPS3AP54-201ENST00000435535 ZSWIM1Q9BR11 485 aa4.58□□□□□ -1.68
RPS3AP54-201ENST00000435535 CRACR2AQ9BSW2 395 aa4.58□□□□□ -1.68
RPS3AP54-201ENST00000435535 EDEM2Q9BV94 578 aa4.58□□□□□ -1.68
RPS3AP54-201ENST00000435535 DUSP16Q9BY84 665 aa4.58□□□□□ -1.68
RPS3AP54-201ENST00000435535 KRTAP3-1Q9BYR8 98 aa4.58□□□□□ -1.68
RPS3AP54-201ENST00000435535 REXO4Q9GZR2 422 aaKnown RBP4.58□□□□□ -1.68
RPS3AP54-201ENST00000435535 MIS12Q9H081 205 aa4.58□□□□□ -1.68
RPS3AP54-201ENST00000435535 KLC2Q9H0B6 622 aa4.58□□□□□ -1.68
RPS3AP54-201ENST00000435535 INTS2Q9H0H0 1204 aaKnown RBP4.58□□□□□ -1.68
RPS3AP54-201ENST00000435535 ZNF768Q9H5H4 540 aaKnown RBP4.58□□□□□ -1.68
RPS3AP54-201ENST00000435535 ACP6Q9NPH0 428 aa4.58□□□□□ -1.68
RPS3AP54-201ENST00000435535 FSCN3Q9NQT6 498 aa4.58□□□□□ -1.68
RPS3AP54-201ENST00000435535 SPHK2Q9NRA0 654 aa4.58□□□□□ -1.68
RPS3AP54-201ENST00000435535 RXFP3Q9NSD7 469 aa4.58□□□□□ -1.68
RPS3AP54-201ENST00000435535 SEMA4GQ9NTN9 838 aa4.58□□□□□ -1.68
RPS3AP54-201ENST00000435535 HESX1Q9UBX0 185 aa4.58□□□□□ -1.68
RPS3AP54-201ENST00000435535 EIF2B4Q9UI10 523 aaKnown RBP4.58□□□□□ -1.68
RPS3AP54-201ENST00000435535 MMP17Q9ULZ9 603 aa4.58□□□□□ -1.68
RPS3AP54-201ENST00000435535 SCML2Q9UQR0 700 aa4.58□□□□□ -1.68
RPS3AP54-201ENST00000435535 CDYLQ9Y232 598 aa4.58□□□□□ -1.68
RPS3AP54-201ENST00000435535 SNX13Q9Y5W8 968 aa4.58□□□□□ -1.68
RPS3AP54-201ENST00000435535 ZFHX4Q86UP3 3567 aa4.58□□□□□ -1.68
RPS3AP54-201ENST00000435535 TRPM6Q9BX84 2022 aa4.58□□□□□ -1.68
RPS3AP54-201ENST00000435535 LRP4O75096 1905 aa4.58□□□□□ -1.68
RPS3AP54-201ENST00000435535 LAMA5O15230 3695 aa4.58□□□□□ -1.68
RPS3AP54-201ENST00000435535 EPG5Q9HCE0 2579 aa4.58□□□□□ -1.68
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38.2 ms