RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000435145.6

HLA-DQB2-231, Transcript of major histocompatibility complex, class II, DQ beta 2, human

BASIC

Gene HLA-DQB2, Length 2,026 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
HLA-DQB2-231	ENST00000435145	DNMT3L	Q9UJW3	386 aa		15.99	■□□□□ 0.15
HLA-DQB2-231	ENST00000435145	APPL1	Q9UKG1	709 aa		15.99	■□□□□ 0.15
HLA-DQB2-231	ENST00000435145	RNF112	Q9ULX5	631 aa		15.99	■□□□□ 0.15
HLA-DQB2-231	ENST00000435145	ZFP37	Q9Y6Q3	630 aa	Predicted RBP	15.99	■□□□□ 0.15
HLA-DQB2-231	ENST00000435145	SUPT3H	B4E1H0	165 aa		15.99	■□□□□ 0.15
HLA-DQB2-231	ENST00000435145	SUPT3H	O75486	399 aa		15.99	■□□□□ 0.15
HLA-DQB2-231	ENST00000435145	TSPAN12	O95859	305 aa		15.99	■□□□□ 0.15
HLA-DQB2-231	ENST00000435145	F11	P03951	625 aa		15.99	■□□□□ 0.15
HLA-DQB2-231	ENST00000435145	HGF	P14210	728 aa		15.99	■□□□□ 0.15
HLA-DQB2-231	ENST00000435145	ELN	P15502	786 aa		15.99	■□□□□ 0.15
HLA-DQB2-231	ENST00000435145	FMO4	P31512	558 aa		15.99	■□□□□ 0.15
HLA-DQB2-231	ENST00000435145	SLC11A1	P49279	550 aa		15.99	■□□□□ 0.15
HLA-DQB2-231	ENST00000435145	SH3BGR	P55822	239 aa	Predicted RBP	15.99	■□□□□ 0.15
HLA-DQB2-231	ENST00000435145	BNIP2	Q12982	314 aa		15.99	■□□□□ 0.15
HLA-DQB2-231	ENST00000435145	GRIK2	Q13002	908 aa		15.99	■□□□□ 0.15
HLA-DQB2-231	ENST00000435145	DUSP4	Q13115	394 aa		15.99	■□□□□ 0.15
HLA-DQB2-231	ENST00000435145	VPS26B	Q4G0F5	336 aa		15.99	■□□□□ 0.15
HLA-DQB2-231	ENST00000435145	NADK2	Q4G0N4	442 aa		15.99	■□□□□ 0.15
HLA-DQB2-231	ENST00000435145	PABPC1L	Q4VXU2	614 aa	Known RBP	15.99	■□□□□ 0.15
HLA-DQB2-231	ENST00000435145	PITRM1	Q5JRX3	1037 aa		15.99	■□□□□ 0.15
HLA-DQB2-231	ENST00000435145	RTP2	Q5QGT7	225 aa		15.99	■□□□□ 0.15
HLA-DQB2-231	ENST00000435145	ANKS6	Q68DC2	871 aa		15.99	■□□□□ 0.15
HLA-DQB2-231	ENST00000435145	FUT10	Q6P4F1	479 aa		15.99	■□□□□ 0.15
HLA-DQB2-231	ENST00000435145	ERMP1	Q7Z2K6	904 aa		15.99	■□□□□ 0.15
HLA-DQB2-231	ENST00000435145	SPATA19	Q7Z5L4	167 aa		15.99	■□□□□ 0.15
HLA-DQB2-231	ENST00000435145	DDIAS	Q8IXT1	998 aa		15.99	■□□□□ 0.15
HLA-DQB2-231	ENST00000435145	NKAP	Q8N5F7	415 aa	Known RBP	15.99	■□□□□ 0.15
HLA-DQB2-231	ENST00000435145	SLC43A3	Q8NBI5	491 aa		15.99	■□□□□ 0.15
HLA-DQB2-231	ENST00000435145	CASD1	Q96PB1	797 aa		15.99	■□□□□ 0.15
HLA-DQB2-231	ENST00000435145	SLC29A1	Q99808	456 aa		15.99	■□□□□ 0.15
HLA-DQB2-231	ENST00000435145	SNX13	Q9Y5W8	968 aa		15.99	■□□□□ 0.15
HLA-DQB2-231	ENST00000435145	UBA6	A0AVT1	1052 aa	Predicted RBP	15.98	■□□□□ 0.15
HLA-DQB2-231	ENST00000435145	ZNF839	A8K0R7	811 aa		15.98	■□□□□ 0.15
HLA-DQB2-231	ENST00000435145	SYCE1L	A8MT33	242 aa		15.98	■□□□□ 0.15
HLA-DQB2-231	ENST00000435145	LINC00032	P0C843	101 aa		15.98	■□□□□ 0.15
HLA-DQB2-231	ENST00000435145	PSMC3	P17980	439 aa		15.98	■□□□□ 0.15
HLA-DQB2-231	ENST00000435145	CES1	P23141	567 aa		15.98	■□□□□ 0.15
HLA-DQB2-231	ENST00000435145	SLC6A2	P23975	617 aa		15.98	■□□□□ 0.15
HLA-DQB2-231	ENST00000435145	OXCT1	P55809	520 aa		15.98	■□□□□ 0.15
HLA-DQB2-231	ENST00000435145	TSN	Q15631	228 aa	Known RBP	15.98	■□□□□ 0.15
HLA-DQB2-231	ENST00000435145	NRF1	Q16656	503 aa		15.98	■□□□□ 0.15
HLA-DQB2-231	ENST00000435145	SLC5A9	Q2M3M2	681 aa		15.98	■□□□□ 0.15
HLA-DQB2-231	ENST00000435145	XKR7	Q5GH72	579 aa		15.98	■□□□□ 0.15
HLA-DQB2-231	ENST00000435145	IL31	Q6EBC2	164 aa		15.98	■□□□□ 0.15
HLA-DQB2-231	ENST00000435145	LCN8	Q6JVE9	175 aa		15.98	■□□□□ 0.15
HLA-DQB2-231	ENST00000435145	PPP4R4	Q6NUP7	873 aa		15.98	■□□□□ 0.15
HLA-DQB2-231	ENST00000435145	BORA	Q6PGQ7	559 aa		15.98	■□□□□ 0.15
HLA-DQB2-231	ENST00000435145	GLT6D1	Q7Z4J2	308 aa		15.98	■□□□□ 0.15
HLA-DQB2-231	ENST00000435145	GIPC2	Q8TF65	315 aa		15.98	■□□□□ 0.15
HLA-DQB2-231	ENST00000435145	DDI1	Q8WTU0	396 aa		15.98	■□□□□ 0.15
HLA-DQB2-231	ENST00000435145	CANT1	Q8WVQ1	401 aa		15.98	■□□□□ 0.15
HLA-DQB2-231	ENST00000435145	TUBGCP3	Q96CW5	907 aa		15.98	■□□□□ 0.15
HLA-DQB2-231	ENST00000435145	ZIC5	Q96T25	663 aa		15.98	■□□□□ 0.15
HLA-DQB2-231	ENST00000435145	GPR21	Q99679	349 aa		15.98	■□□□□ 0.15
HLA-DQB2-231	ENST00000435145	CMTM6	Q9NX76	183 aa		15.98	■□□□□ 0.15
HLA-DQB2-231	ENST00000435145	FAM50B	Q9Y247	325 aa		15.98	■□□□□ 0.15
HLA-DQB2-231	ENST00000435145	AK5	Q9Y6K8	562 aa		15.98	■□□□□ 0.15
HLA-DQB2-231	ENST00000435145	GBF1	Q92538	1859 aa		15.98	■□□□□ 0.15
HLA-DQB2-231	ENST00000435145	ILVBL	A1L0T0	632 aa		15.97	■□□□□ 0.15
HLA-DQB2-231	ENST00000435145		H7C4K7	107 aa		15.97	■□□□□ 0.15
HLA-DQB2-231	ENST00000435145	CDC7	O00311	574 aa		15.97	■□□□□ 0.15
HLA-DQB2-231	ENST00000435145	ANGPT2	O15123	496 aa		15.97	■□□□□ 0.15
HLA-DQB2-231	ENST00000435145	NDUFS3	O75489	264 aa		15.97	■□□□□ 0.15
HLA-DQB2-231	ENST00000435145	ETS2	P15036	469 aa		15.97	■□□□□ 0.15
HLA-DQB2-231	ENST00000435145	ATP5C1	P36542	298 aa	Known RBP	15.97	■□□□□ 0.15
HLA-DQB2-231	ENST00000435145	ZFP36L2	P47974	494 aa	Known RBP	15.97	■□□□□ 0.15
HLA-DQB2-231	ENST00000435145	SLC11A2	P49281	568 aa		15.97	■□□□□ 0.15
HLA-DQB2-231	ENST00000435145	RBBP5	Q15291	538 aa	Known RBP	15.97	■□□□□ 0.15
HLA-DQB2-231	ENST00000435145	CYTH1	Q15438	398 aa		15.97	■□□□□ 0.15
HLA-DQB2-231	ENST00000435145	ADRM1	Q16186	407 aa		15.97	■□□□□ 0.15
HLA-DQB2-231	ENST00000435145	GEN1	Q17RS7	908 aa		15.97	■□□□□ 0.15
HLA-DQB2-231	ENST00000435145	MAP7D1	Q3KQU3	841 aa		15.97	■□□□□ 0.15
HLA-DQB2-231	ENST00000435145	IYD	Q6PHW0	289 aa		15.97	■□□□□ 0.15
HLA-DQB2-231	ENST00000435145	TXNDC11	Q6PKC3	985 aa		15.97	■□□□□ 0.15
HLA-DQB2-231	ENST00000435145	CEP295NL	Q96MC4	621 aa		15.97	■□□□□ 0.15
HLA-DQB2-231	ENST00000435145	PRPF18	Q99633	342 aa	Known RBP	15.97	■□□□□ 0.15
HLA-DQB2-231	ENST00000435145	ZBED2	Q9BTP6	218 aa		15.97	■□□□□ 0.15
HLA-DQB2-231	ENST00000435145	CCDC68	Q9H2F9	335 aa		15.97	■□□□□ 0.15
HLA-DQB2-231	ENST00000435145	GID8	Q9NWU2	228 aa		15.97	■□□□□ 0.15
HLA-DQB2-231	ENST00000435145	PTTG2	Q9NZH5	202 aa		15.97	■□□□□ 0.15
HLA-DQB2-231	ENST00000435145	PCTP	Q9UKL6	214 aa		15.97	■□□□□ 0.15
HLA-DQB2-231	ENST00000435145	BTRC	Q9Y297	605 aa		15.97	■□□□□ 0.15
HLA-DQB2-231	ENST00000435145	VPS9D1	Q9Y2B5	631 aa		15.97	■□□□□ 0.15
HLA-DQB2-231	ENST00000435145	PCDHA9	Q9Y5H5	950 aa		15.97	■□□□□ 0.15
HLA-DQB2-231	ENST00000435145	C2orf81	A6NN90	581 aa		15.97	■□□□□ 0.15
HLA-DQB2-231	ENST00000435145	CLDN11	O75508	207 aa		15.97	■□□□□ 0.15
HLA-DQB2-231	ENST00000435145	STAMBP	O95630	424 aa		15.97	■□□□□ 0.15
HLA-DQB2-231	ENST00000435145	ESRRB	O95718	433 aa		15.97	■□□□□ 0.15
HLA-DQB2-231	ENST00000435145	ALDH2	P05091	517 aa		15.97	■□□□□ 0.15
HLA-DQB2-231	ENST00000435145	PYGL	P06737	847 aa		15.97	■□□□□ 0.15
HLA-DQB2-231	ENST00000435145	LPO	P22079	712 aa	Predicted RBP	15.97	■□□□□ 0.15
HLA-DQB2-231	ENST00000435145	GRIA3	P42263	894 aa		15.97	■□□□□ 0.15
HLA-DQB2-231	ENST00000435145	SCNN1B	P51168	640 aa		15.97	■□□□□ 0.15
HLA-DQB2-231	ENST00000435145	NME5	P56597	212 aa		15.97	■□□□□ 0.15
HLA-DQB2-231	ENST00000435145	RPS24	P62847	133 aa	Known RBP	15.97	■□□□□ 0.15
HLA-DQB2-231	ENST00000435145	ELAVL2	Q12926	359 aa	Known RBP	15.97	■□□□□ 0.15
HLA-DQB2-231	ENST00000435145	RCAN2	Q14206	197 aa		15.97	■□□□□ 0.15
HLA-DQB2-231	ENST00000435145	PTPRN	Q16849	979 aa		15.97	■□□□□ 0.15
HLA-DQB2-231	ENST00000435145	KLHDC10	Q6PID8	442 aa		15.97	■□□□□ 0.15
HLA-DQB2-231	ENST00000435145	RBM44	Q6ZP01	1051 aa	Known RBP	15.97	■□□□□ 0.15

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19.7 ms