RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000429174.6

DYSF-211, Transcript of dysferlin, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene DYSF, Length 6,739 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DYSF-211ENST00000429174 NT5C1B-RDH14C9J2C7 533 aa15.6■□□□□ 0.09
DYSF-211ENST00000429174 NOBOXO60393 691 aa15.6■□□□□ 0.09
DYSF-211ENST00000429174 THRBP10828 461 aa15.6■□□□□ 0.09
DYSF-211ENST00000429174 CCNHP51946 323 aaPredicted RBP15.6■□□□□ 0.09
DYSF-211ENST00000429174 MAZP56270 477 aaKnown RBP15.6■□□□□ 0.09
DYSF-211ENST00000429174 MTA1Q13330 715 aa15.6■□□□□ 0.09
DYSF-211ENST00000429174 MAGEL2Q9UJ55 1249 aa15.6■□□□□ 0.09
DYSF-211ENST00000429174 MID1O15344 667 aa15.6■□□□□ 0.09
DYSF-211ENST00000429174 B4GALT5O43286 388 aa15.6■□□□□ 0.09
DYSF-211ENST00000429174 PLIN3O60664 434 aa15.6■□□□□ 0.09
DYSF-211ENST00000429174 EDF1O60869 148 aaKnown RBP15.6■□□□□ 0.09
DYSF-211ENST00000429174 DDNO94850 711 aaPredicted RBP15.6■□□□□ 0.09
DYSF-211ENST00000429174 SLC35G4P0C7Q5 338 aa15.6■□□□□ 0.09
DYSF-211ENST00000429174 COL6A1P12109 1028 aa15.6■□□□□ 0.09
DYSF-211ENST00000429174 CASP9P55211 416 aa15.6■□□□□ 0.09
DYSF-211ENST00000429174 SLC1A5Q15758 541 aa15.6■□□□□ 0.09
DYSF-211ENST00000429174 TYSND1Q2T9J0 566 aa15.6■□□□□ 0.09
DYSF-211ENST00000429174 ADAMTSL2Q86TH1 951 aa15.6■□□□□ 0.09
DYSF-211ENST00000429174 FAM71AQ8IYT1 594 aa15.6■□□□□ 0.09
DYSF-211ENST00000429174 JOSD2Q8TAC2 188 aa15.6■□□□□ 0.09
DYSF-211ENST00000429174 NAT14Q8WUY8 206 aa15.6■□□□□ 0.09
DYSF-211ENST00000429174 TEFMQ96QE5 360 aaKnown RBP15.6■□□□□ 0.09
DYSF-211ENST00000429174 FBXO5Q9UKT4 447 aa15.6■□□□□ 0.09
DYSF-211ENST00000429174 CXCR3P49682 368 aa15.6■□□□□ 0.09
DYSF-211ENST00000429174 KLF10Q13118 480 aa15.6■□□□□ 0.09
DYSF-211ENST00000429174 TARBP2Q15633 366 aaKnown RBP15.6■□□□□ 0.09
DYSF-211ENST00000429174 LYPLAL1Q5VWZ2 237 aa15.6■□□□□ 0.09
DYSF-211ENST00000429174 TBC1D17Q9HA65 648 aa15.6■□□□□ 0.09
DYSF-211ENST00000429174 PLK2Q9NYY3 685 aa15.6■□□□□ 0.09
DYSF-211ENST00000429174 VWA7Q9Y334 891 aa15.6■□□□□ 0.09
DYSF-211ENST00000429174 GTF3C5Q9Y5Q8 519 aaPredicted RBP15.6■□□□□ 0.09
DYSF-211ENST00000429174 RSL1D1O76021 490 aaKnown RBP15.6■□□□□ 0.09
DYSF-211ENST00000429174 FABP3P05413 133 aa15.6■□□□□ 0.09
DYSF-211ENST00000429174 RAB25P57735 213 aa15.6■□□□□ 0.09
DYSF-211ENST00000429174 PITRM1Q5JRX3 1037 aa15.6■□□□□ 0.09
DYSF-211ENST00000429174 BICRALQ6AI39 1079 aa15.6■□□□□ 0.09
DYSF-211ENST00000429174 FAM13CQ8NE31 585 aa15.6■□□□□ 0.09
DYSF-211ENST00000429174 RDH11Q8TC12 318 aa15.6■□□□□ 0.09
DYSF-211ENST00000429174 PMEPA1Q969W9 287 aa15.6■□□□□ 0.09
DYSF-211ENST00000429174 CKLFQ9UBR5 152 aa15.6■□□□□ 0.09
DYSF-211ENST00000429174 MDM4O15151 490 aa15.59■□□□□ 0.09
DYSF-211ENST00000429174 CDH5P33151 784 aaPredicted RBP15.59■□□□□ 0.09
DYSF-211ENST00000429174 SSR2P43308 183 aa15.59■□□□□ 0.09
DYSF-211ENST00000429174 SMARCB1Q12824 385 aa15.59■□□□□ 0.09
DYSF-211ENST00000429174 FASTKD3Q14CZ7 662 aaKnown RBP15.59■□□□□ 0.09
DYSF-211ENST00000429174 GPR158Q5T848 1215 aa15.59■□□□□ 0.09
DYSF-211ENST00000429174 HECTD2Q5U5R9 776 aa15.59■□□□□ 0.09
DYSF-211ENST00000429174 OR2T34Q8NGX1 318 aa15.59■□□□□ 0.09
DYSF-211ENST00000429174 OR2T3Q8NH03 318 aa15.59■□□□□ 0.09
DYSF-211ENST00000429174 TWIST2Q8WVJ9 160 aa15.59■□□□□ 0.09
DYSF-211ENST00000429174 LPGAT1Q92604 370 aa15.59■□□□□ 0.09
DYSF-211ENST00000429174 EXOSC8Q96B26 276 aaKnown RBP15.59■□□□□ 0.09
DYSF-211ENST00000429174 CDCA5Q96FF9 252 aa15.59■□□□□ 0.09
DYSF-211ENST00000429174 ST3GAL5Q9UNP4 418 aa15.59■□□□□ 0.09
DYSF-211ENST00000429174 TNFRSF11BO00300 401 aa15.59■□□□□ 0.09
DYSF-211ENST00000429174 S100A1P23297 94 aa15.59■□□□□ 0.09
DYSF-211ENST00000429174 CBX2Q14781 532 aaPredicted RBP15.59■□□□□ 0.09
DYSF-211ENST00000429174 HOMEZQ8IX15 550 aa15.59■□□□□ 0.09
DYSF-211ENST00000429174 AKAP7Q9P0M2 348 aaPredicted RBP15.59■□□□□ 0.09
DYSF-211ENST00000429174 SAMD4AQ9UPU9 718 aaKnown RBP15.59■□□□□ 0.09
DYSF-211ENST00000429174 NEDD8-MDP1E9PL57 170 aa15.59■□□□□ 0.09
DYSF-211ENST00000429174 CCL22O00626 93 aa15.59■□□□□ 0.09
DYSF-211ENST00000429174 HCN1O60741 890 aa15.59■□□□□ 0.09
DYSF-211ENST00000429174 MATN4O95460 622 aa15.59■□□□□ 0.09
DYSF-211ENST00000429174 HOXB8P17481 243 aaPredicted RBP15.59■□□□□ 0.09
DYSF-211ENST00000429174 CCNYL2Q5T2Q4 361 aa15.59■□□□□ 0.09
DYSF-211ENST00000429174 RNASEH2BQ5TBB1 312 aaKnown RBP15.59■□□□□ 0.09
DYSF-211ENST00000429174 AAGABQ6PD74 315 aa15.59■□□□□ 0.09
DYSF-211ENST00000429174 CXCL17Q6UXB2 119 aa15.59■□□□□ 0.09
DYSF-211ENST00000429174 FRMD7Q6ZUT3 714 aa15.59■□□□□ 0.09
DYSF-211ENST00000429174 TRABD2AQ86V40 505 aa15.59■□□□□ 0.09
DYSF-211ENST00000429174 ZNF398Q8TD17 642 aa15.59■□□□□ 0.09
DYSF-211ENST00000429174 TNFAIP8L1Q8WVP5 186 aa15.59■□□□□ 0.09
DYSF-211ENST00000429174 FEM1AQ9BSK4 669 aa15.59■□□□□ 0.09
DYSF-211ENST00000429174 CCNB1IP1Q9NPC3 277 aa15.59■□□□□ 0.09
DYSF-211ENST00000429174 MAFFQ9ULX9 164 aa15.59■□□□□ 0.09
DYSF-211ENST00000429174 BAIAP2Q9UQB8 552 aa15.59■□□□□ 0.09
DYSF-211ENST00000429174 A0A1W2PQ67 120 aa15.59■□□□□ 0.09
DYSF-211ENST00000429174 URADA6NGE7 173 aa15.59■□□□□ 0.09
DYSF-211ENST00000429174 ZNF460Q14592 562 aa15.59■□□□□ 0.09
DYSF-211ENST00000429174 PLEKHG4Q58EX7 1191 aa15.59■□□□□ 0.09
DYSF-211ENST00000429174 MAP1SQ66K74 1059 aaPredicted RBP15.59■□□□□ 0.09
DYSF-211ENST00000429174 FAM110BQ8TC76 370 aa15.59■□□□□ 0.09
DYSF-211ENST00000429174 SKA1Q96BD8 255 aa15.59■□□□□ 0.09
DYSF-211ENST00000429174 ACO2Q99798 780 aaKnown RBP15.59■□□□□ 0.09
DYSF-211ENST00000429174 ACSS3Q9H6R3 686 aa15.59■□□□□ 0.09
DYSF-211ENST00000429174 DPP7Q9UHL4 492 aa15.59■□□□□ 0.09
DYSF-211ENST00000429174 SYNPO2Q9UMS6 1093 aa15.59■□□□□ 0.09
DYSF-211ENST00000429174 GNALP38405 381 aa15.59■□□□□ 0.09
DYSF-211ENST00000429174 SF1Q15637 639 aaKnown RBP15.59■□□□□ 0.09
DYSF-211ENST00000429174 LCN1P1Q5VSP4 162 aa15.59■□□□□ 0.09
DYSF-211ENST00000429174 TMPRSS11AQ6ZMR5 421 aa15.59■□□□□ 0.09
DYSF-211ENST00000429174 HJURPQ8NCD3 748 aaPredicted RBP15.59■□□□□ 0.09
DYSF-211ENST00000429174 OR2L3Q8NG85 312 aa15.59■□□□□ 0.09
DYSF-211ENST00000429174 HAVCR1Q96D42 359 aa15.59■□□□□ 0.09
DYSF-211ENST00000429174 P2RY11Q96G91 374 aa15.59■□□□□ 0.09
DYSF-211ENST00000429174 CNTNAP4Q9C0A0 1308 aa15.59■□□□□ 0.09
DYSF-211ENST00000429174 SMAD9O15198 467 aaKnown RBP15.58■□□□□ 0.09
DYSF-211ENST00000429174 UBA1P22314 1058 aaKnown RBP15.58■□□□□ 0.09
DYSF-211ENST00000429174 RPL3P39023 403 aaKnown RBP15.58■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.7 ms