RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000423112.2

RFX3-AS1-201, RFX3 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene RFX3-AS1, Length 552 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFX3-AS1-201ENST00000423112 HTRA2O43464 458 aaPredicted RBP16.37■□□□□ 0.21
RFX3-AS1-201ENST00000423112 CPP00450 1065 aa16.37■□□□□ 0.21
RFX3-AS1-201ENST00000423112 F3P13726 295 aa16.37■□□□□ 0.21
RFX3-AS1-201ENST00000423112 PRF1P14222 555 aa16.37■□□□□ 0.21
RFX3-AS1-201ENST00000423112 SEPHS1P49903 392 aa16.37■□□□□ 0.21
RFX3-AS1-201ENST00000423112 PAPOLAP51003 745 aaKnown RBP16.37■□□□□ 0.21
RFX3-AS1-201ENST00000423112 GFERP55789 205 aa16.37■□□□□ 0.21
RFX3-AS1-201ENST00000423112 SH3BP2P78314 561 aa16.37■□□□□ 0.21
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RFX3-AS1-201ENST00000423112 SP110Q9HB58 689 aa16.37■□□□□ 0.21
RFX3-AS1-201ENST00000423112 CPNE7Q9UBL6 633 aa16.37■□□□□ 0.21
RFX3-AS1-201ENST00000423112 ZNHIT2Q9UHR6 403 aa16.37■□□□□ 0.21
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RFX3-AS1-201ENST00000423112 SSU72P8A0A1W2PR75 194 aa16.36■□□□□ 0.21
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RFX3-AS1-201ENST00000423112 MMP8P22894 467 aa16.36■□□□□ 0.21
RFX3-AS1-201ENST00000423112 SCYL2Q6P3W7 929 aa16.36■□□□□ 0.21
RFX3-AS1-201ENST00000423112 CHST15Q7LFX5 561 aaPredicted RBP16.36■□□□□ 0.21
RFX3-AS1-201ENST00000423112 TECPR1Q7Z6L1 1165 aa16.36■□□□□ 0.21
RFX3-AS1-201ENST00000423112 NLRP8Q86W28 1048 aa16.36■□□□□ 0.21
RFX3-AS1-201ENST00000423112 ELOA2Q8IYF1 753 aaPredicted RBP16.36■□□□□ 0.21
RFX3-AS1-201ENST00000423112 AP2M1Q96CW1 435 aa16.36■□□□□ 0.21
RFX3-AS1-201ENST00000423112 C19orf60Q96EN9 201 aa16.36■□□□□ 0.21
RFX3-AS1-201ENST00000423112 SCRN2Q96FV2 425 aa16.36■□□□□ 0.21
RFX3-AS1-201ENST00000423112 CELF6Q96J87 481 aaKnown RBP16.36■□□□□ 0.21
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RFX3-AS1-201ENST00000423112 PSKH2Q96QS6 385 aa16.36■□□□□ 0.21
RFX3-AS1-201ENST00000423112 PDE7BQ9NP56 450 aa16.36■□□□□ 0.21
RFX3-AS1-201ENST00000423112 VPS18Q9P253 973 aa16.36■□□□□ 0.21
RFX3-AS1-201ENST00000423112 SETD2Q9BYW2 2564 aaPredicted RBP16.36■□□□□ 0.21
RFX3-AS1-201ENST00000423112 ITPR3Q14573 2671 aa16.35■□□□□ 0.21
RFX3-AS1-201ENST00000423112 HEATR9A2RTY3 570 aa16.35■□□□□ 0.21
RFX3-AS1-201ENST00000423112 KRT86O43790 486 aa16.35■□□□□ 0.21
RFX3-AS1-201ENST00000423112 UBXN7O94888 489 aa16.35■□□□□ 0.21
RFX3-AS1-201ENST00000423112 ASMTLO95671 621 aa16.35■□□□□ 0.21
RFX3-AS1-201ENST00000423112 MMEP08473 750 aa16.35■□□□□ 0.21
RFX3-AS1-201ENST00000423112 AMD1P17707 334 aa16.35■□□□□ 0.21
RFX3-AS1-201ENST00000423112 GPD1P21695 349 aa16.35■□□□□ 0.21
RFX3-AS1-201ENST00000423112 ITGA1P56199 1179 aa16.35■□□□□ 0.21
RFX3-AS1-201ENST00000423112 PER3P56645 1201 aa16.35■□□□□ 0.21
RFX3-AS1-201ENST00000423112 TPI1P60174 286 aa16.35■□□□□ 0.21
RFX3-AS1-201ENST00000423112 PDE1BQ01064 536 aa16.35■□□□□ 0.21
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RFX3-AS1-201ENST00000423112 ZNF765Q7L2R6 523 aa16.35■□□□□ 0.21
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RFX3-AS1-201ENST00000423112 SLC39A8Q9C0K1 460 aa16.35■□□□□ 0.21
RFX3-AS1-201ENST00000423112 GDPD2Q9HCC8 539 aa16.35■□□□□ 0.21
RFX3-AS1-201ENST00000423112 ASF1BQ9NVP2 202 aa16.35■□□□□ 0.21
RFX3-AS1-201ENST00000423112 TMEM63CQ9P1W3 806 aa16.35■□□□□ 0.21
RFX3-AS1-201ENST00000423112 FZD10Q9ULW2 581 aa16.35■□□□□ 0.21
RFX3-AS1-201ENST00000423112 ZDHHC9Q9Y397 364 aa16.35■□□□□ 0.21
RFX3-AS1-201ENST00000423112 PCDHGC4Q9Y5F7 938 aa16.35■□□□□ 0.21
RFX3-AS1-201ENST00000423112 NPIPB15A6NHN6 443 aaPredicted RBP16.34■□□□□ 0.21
RFX3-AS1-201ENST00000423112 SNX2O60749 519 aa16.34■□□□□ 0.21
RFX3-AS1-201ENST00000423112 RFC1P35251 1148 aaPredicted RBP16.34■□□□□ 0.21
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RFX3-AS1-201ENST00000423112 ZNF677Q86XU0 584 aa16.34■□□□□ 0.21
RFX3-AS1-201ENST00000423112 FDCSPQ8NFU4 85 aa16.34■□□□□ 0.21
RFX3-AS1-201ENST00000423112 KLHL6Q8WZ60 621 aa16.34■□□□□ 0.21
RFX3-AS1-201ENST00000423112 COX14Q96I36 57 aa16.34■□□□□ 0.21
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RFX3-AS1-201ENST00000423112 ABCG8Q9H221 673 aa16.34■□□□□ 0.21
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RFX3-AS1-201ENST00000423112 GPR83Q9NYM4 423 aa16.34■□□□□ 0.21
RFX3-AS1-201ENST00000423112 OGFRQ9NZT2 677 aa16.34■□□□□ 0.21
RFX3-AS1-201ENST00000423112 CD84Q9UIB8 345 aa16.34■□□□□ 0.21
RFX3-AS1-201ENST00000423112 RARRES3Q9UL19 164 aa16.34■□□□□ 0.21
RFX3-AS1-201ENST00000423112 KCNK6Q9Y257 313 aa16.34■□□□□ 0.21
RFX3-AS1-201ENST00000423112 FARSAQ9Y285 508 aaKnown RBP16.34■□□□□ 0.21
RFX3-AS1-201ENST00000423112 DNAJC6O75061 913 aa16.33■□□□□ 0.2
RFX3-AS1-201ENST00000423112 TYRP1P17643 537 aa16.33■□□□□ 0.2
RFX3-AS1-201ENST00000423112 HSPA9P38646 679 aaKnown RBP16.33■□□□□ 0.2
RFX3-AS1-201ENST00000423112 PTGIRP43119 386 aa16.33■□□□□ 0.2
RFX3-AS1-201ENST00000423112 UBE2IP63279 158 aaKnown RBP16.33■□□□□ 0.2
RFX3-AS1-201ENST00000423112 IL10RAQ13651 578 aa16.33■□□□□ 0.2
RFX3-AS1-201ENST00000423112 ZXDCQ2QGD7 858 aaPredicted RBP16.33■□□□□ 0.2
RFX3-AS1-201ENST00000423112 TMCO4Q5TGY1 634 aa16.33■□□□□ 0.2
RFX3-AS1-201ENST00000423112 TMEM26Q6ZUK4 368 aa16.33■□□□□ 0.2
RFX3-AS1-201ENST00000423112 PHYKPLQ8IUZ5 450 aa16.33■□□□□ 0.2
RFX3-AS1-201ENST00000423112 MCEMP1Q8IX19 187 aa16.33■□□□□ 0.2
RFX3-AS1-201ENST00000423112 NDUFAF2Q8N183 169 aa16.33■□□□□ 0.2
RFX3-AS1-201ENST00000423112 EPS8L1Q8TE68 723 aa16.33■□□□□ 0.2
RFX3-AS1-201ENST00000423112 ZDHHC12Q96GR4 267 aa16.33■□□□□ 0.2
RFX3-AS1-201ENST00000423112 NSMCE3Q96MG7 304 aa16.33■□□□□ 0.2
RFX3-AS1-201ENST00000423112 MCCC1Q96RQ3 725 aaPredicted RBP16.33■□□□□ 0.2
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