RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000393537.4

ANKRD39-201, Transcript of ankyrin repeat domain 39, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ANKRD39, Length 976 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD39-201ENST00000393537 SRPK1Q96SB4 655 aaKnown RBP20.08■□□□□ 0.81
ANKRD39-201ENST00000393537 SPATA16Q9BXB7 569 aa20.08■□□□□ 0.81
ANKRD39-201ENST00000393537 RAD18Q9NS91 495 aa20.08■□□□□ 0.81
ANKRD39-201ENST00000393537 VPS18Q9P253 973 aa20.08■□□□□ 0.81
ANKRD39-201ENST00000393537 LRIT1Q9P2V4 623 aa20.08■□□□□ 0.81
ANKRD39-201ENST00000393537 A0A1W2PQM1 296 aa20.07■□□□□ 0.8
ANKRD39-201ENST00000393537 AURKAO14965 403 aa20.07■□□□□ 0.8
ANKRD39-201ENST00000393537 EPOP01588 193 aa20.07■□□□□ 0.8
ANKRD39-201ENST00000393537 RBP3P10745 1247 aa20.07■□□□□ 0.8
ANKRD39-201ENST00000393537 CHRNA4P43681 627 aa20.07■□□□□ 0.8
ANKRD39-201ENST00000393537 MAZP56270 477 aaKnown RBP20.07■□□□□ 0.8
ANKRD39-201ENST00000393537 DCDC1P59894 354 aa20.07■□□□□ 0.8
ANKRD39-201ENST00000393537 MPP3Q13368 585 aa20.07■□□□□ 0.8
ANKRD39-201ENST00000393537 SIRPB2Q5JXA9 342 aa20.07■□□□□ 0.8
ANKRD39-201ENST00000393537 C19orf48Q6RUI8 117 aa20.07■□□□□ 0.8
ANKRD39-201ENST00000393537 CCNJLQ8IV13 435 aa20.07■□□□□ 0.8
ANKRD39-201ENST00000393537 GRAMD1AQ96CP6 724 aa20.07■□□□□ 0.8
ANKRD39-201ENST00000393537 DCBLD2Q96PD2 775 aa20.07■□□□□ 0.8
ANKRD39-201ENST00000393537 FERMT1Q9BQL6 677 aa20.07■□□□□ 0.8
ANKRD39-201ENST00000393537 GBA3Q9H227 469 aa20.07■□□□□ 0.8
ANKRD39-201ENST00000393537 LRRN3Q9H3W5 708 aa20.07■□□□□ 0.8
ANKRD39-201ENST00000393537 NFKBIL1Q9UBC1 381 aaPredicted RBP20.07■□□□□ 0.8
ANKRD39-201ENST00000393537 ZNHIT2Q9UHR6 403 aa20.07■□□□□ 0.8
ANKRD39-201ENST00000393537 APPL1Q9UKG1 709 aa20.07■□□□□ 0.8
ANKRD39-201ENST00000393537 PRKAB1Q9Y478 270 aa20.07■□□□□ 0.8
ANKRD39-201ENST00000393537 UNC13CQ8NB66 2214 aa20.07■□□□□ 0.8
ANKRD39-201ENST00000393537 ADAMTS20P59510 1910 aa20.06■□□□□ 0.8
ANKRD39-201ENST00000393537 MIF4GDA9UHW6 222 aaKnown RBP20.06■□□□□ 0.8
ANKRD39-201ENST00000393537 TLX3O43711 291 aaPredicted RBP20.06■□□□□ 0.8
ANKRD39-201ENST00000393537 NUDT21O43809 227 aaKnown RBP20.06■□□□□ 0.8
ANKRD39-201ENST00000393537 DNAJC6O75061 913 aa20.06■□□□□ 0.8
ANKRD39-201ENST00000393537 ECEL1O95672 775 aa20.06■□□□□ 0.8
ANKRD39-201ENST00000393537 BPIP17213 487 aa20.06■□□□□ 0.8
ANKRD39-201ENST00000393537 PDX1P52945 283 aa20.06■□□□□ 0.8
ANKRD39-201ENST00000393537 GSDMDP57764 484 aa20.06■□□□□ 0.8
ANKRD39-201ENST00000393537 PEX6Q13608 980 aa20.06■□□□□ 0.8
ANKRD39-201ENST00000393537 C3orf38Q5JPI3 329 aa20.06■□□□□ 0.8
ANKRD39-201ENST00000393537 ZNF569Q5MCW4 686 aa20.06■□□□□ 0.8
ANKRD39-201ENST00000393537 ITPRIPL1Q6GPH6 555 aa20.06■□□□□ 0.8
ANKRD39-201ENST00000393537 DARS2Q6PI48 645 aaKnown RBP20.06■□□□□ 0.8
ANKRD39-201ENST00000393537 C17orf82Q86X59 251 aaPredicted RBP20.06■□□□□ 0.8
ANKRD39-201ENST00000393537 TRAM1L1Q8N609 369 aa20.06■□□□□ 0.8
ANKRD39-201ENST00000393537 PATE1Q8WXA2 126 aa20.06■□□□□ 0.8
ANKRD39-201ENST00000393537 ZSCAN5AQ9BUG6 496 aa20.06■□□□□ 0.8
ANKRD39-201ENST00000393537 FSD1LQ9BXM9 530 aa20.06■□□□□ 0.8
ANKRD39-201ENST00000393537 POLR1BQ9H9Y6 1135 aa20.06■□□□□ 0.8
ANKRD39-201ENST00000393537 BPIFA1Q9NP55 256 aa20.06■□□□□ 0.8
ANKRD39-201ENST00000393537 ARFGAP3Q9NP61 516 aa20.06■□□□□ 0.8
ANKRD39-201ENST00000393537 SATB2Q9UPW6 733 aa20.06■□□□□ 0.8
ANKRD39-201ENST00000393537 PCYT1BQ9Y5K3 369 aaPredicted RBP20.06■□□□□ 0.8
ANKRD39-201ENST00000393537 CAPN6Q9Y6Q1 641 aa20.06■□□□□ 0.8
ANKRD39-201ENST00000393537 DMXL2Q8TDJ6 3036 aa20.05■□□□□ 0.8
ANKRD39-201ENST00000393537 D6RAR5 112 aa20.05■□□□□ 0.8
ANKRD39-201ENST00000393537 DDX3YO15523 660 aaKnown RBP20.05■□□□□ 0.8
ANKRD39-201ENST00000393537 KCNN4O15554 427 aa20.05■□□□□ 0.8
ANKRD39-201ENST00000393537 STK10O94804 968 aaKnown RBP20.05■□□□□ 0.8
ANKRD39-201ENST00000393537 PTMAP06454 111 aaKnown RBP20.05■□□□□ 0.8
ANKRD39-201ENST00000393537 PNLIPP16233 465 aa20.05■□□□□ 0.8
ANKRD39-201ENST00000393537 ACTN2P35609 894 aa20.05■□□□□ 0.8
ANKRD39-201ENST00000393537 LSSP48449 732 aa20.05■□□□□ 0.8
ANKRD39-201ENST00000393537 LRP8Q14114 963 aa20.05■□□□□ 0.8
ANKRD39-201ENST00000393537 SLC1A5Q15758 541 aa20.05■□□□□ 0.8
ANKRD39-201ENST00000393537 TBC1D25Q3MII6 688 aa20.05■□□□□ 0.8
ANKRD39-201ENST00000393537 SPRED1Q7Z699 444 aa20.05■□□□□ 0.8
ANKRD39-201ENST00000393537 NAGSQ8N159 534 aa20.05■□□□□ 0.8
ANKRD39-201ENST00000393537 ARL14Q8N4G2 192 aa20.05■□□□□ 0.8
ANKRD39-201ENST00000393537 HNRNPLLQ8WVV9 542 aaKnown RBP20.05■□□□□ 0.8
ANKRD39-201ENST00000393537 RMI1Q9H9A7 625 aa20.05■□□□□ 0.8
ANKRD39-201ENST00000393537 ADGRG1Q9Y653 693 aa20.05■□□□□ 0.8
ANKRD39-201ENST00000393537 PKD1L2Q7Z442 2459 aa20.04■□□□□ 0.8
ANKRD39-201ENST00000393537 ANKRD11Q6UB99 2663 aaPredicted RBP20.04■□□□□ 0.8
ANKRD39-201ENST00000393537 A0A1W2PNU3 283 aaPredicted RBP20.04■□□□□ 0.8
ANKRD39-201ENST00000393537 RHPN2P1A8MT19 583 aa20.04■□□□□ 0.8
ANKRD39-201ENST00000393537 SLC25A14O95258 325 aaPredicted RBP20.04■□□□□ 0.8
ANKRD39-201ENST00000393537 HLA-DPA1P20036 260 aa20.04■□□□□ 0.8
ANKRD39-201ENST00000393537 HMGCLP35914 325 aa20.04■□□□□ 0.8
ANKRD39-201ENST00000393537 GEMP55040 296 aa20.04■□□□□ 0.8
ANKRD39-201ENST00000393537 BIRC2Q13490 618 aa20.04■□□□□ 0.8
ANKRD39-201ENST00000393537 ANKRD20A2Q5SQ80 823 aa20.04■□□□□ 0.8
ANKRD39-201ENST00000393537 ZNF648Q5T619 568 aaPredicted RBP20.04■□□□□ 0.8
ANKRD39-201ENST00000393537 ANKRD20A1Q5TYW2 823 aa20.04■□□□□ 0.8
ANKRD39-201ENST00000393537 ANKRD20A3Q5VUR7 823 aa20.04■□□□□ 0.8
ANKRD39-201ENST00000393537 PDPK2PQ6A1A2 396 aa20.04■□□□□ 0.8
ANKRD39-201ENST00000393537 CHST15Q7LFX5 561 aaPredicted RBP20.04■□□□□ 0.8
ANKRD39-201ENST00000393537 B3GNT8Q7Z7M8 397 aa20.04■□□□□ 0.8
ANKRD39-201ENST00000393537 LSMEM2Q8N112 164 aa20.04■□□□□ 0.8
ANKRD39-201ENST00000393537 TTC30BQ8N4P2 665 aa20.04■□□□□ 0.8
ANKRD39-201ENST00000393537 SNIP1Q8TAD8 396 aaKnown RBP20.04■□□□□ 0.8
ANKRD39-201ENST00000393537 BLOC1S5Q8TDH9 187 aa20.04■□□□□ 0.8
ANKRD39-201ENST00000393537 FGF11Q92914 225 aa20.04■□□□□ 0.8
ANKRD39-201ENST00000393537 GORASP1Q9BQQ3 440 aa20.04■□□□□ 0.8
ANKRD39-201ENST00000393537 FOXP3Q9BZS1 431 aa20.04■□□□□ 0.8
ANKRD39-201ENST00000393537 OR2AG1Q9H205 316 aa20.04■□□□□ 0.8
ANKRD39-201ENST00000393537 TRABDQ9H4I3 376 aa20.04■□□□□ 0.8
ANKRD39-201ENST00000393537 HACD3Q9P035 362 aa20.04■□□□□ 0.8
ANKRD39-201ENST00000393537 ATXN10Q9UBB4 475 aa20.04■□□□□ 0.8
ANKRD39-201ENST00000393537 ATXN7L1Q9ULK2 861 aaPredicted RBP20.04■□□□□ 0.8
ANKRD39-201ENST00000393537 FREM2Q5SZK8 3169 aa20.04■□□□□ 0.8
ANKRD39-201ENST00000393537 A0A087WV48 116 aa20.03■□□□□ 0.8
ANKRD39-201ENST00000393537 GOLGA6L9A6NEM1 432 aa20.03■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 49.2 ms