RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000377244.7

SNX15-202, Transcript of sorting nexin 15, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SNX15, Length 1,939 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX15-202ENST00000377244 CYP2U1Q7Z449 544 aa25.24■■□□□ 1.63
SNX15-202ENST00000377244 SDCCAG8Q86SQ7 713 aaPredicted RBP25.24■■□□□ 1.63
SNX15-202ENST00000377244 SERPINA9Q86WD7 417 aa25.24■■□□□ 1.63
SNX15-202ENST00000377244 LMNTD2Q8IXW0 634 aa25.24■■□□□ 1.63
SNX15-202ENST00000377244 GOLGA6L1Q8N7Z2 621 aa25.24■■□□□ 1.63
SNX15-202ENST00000377244 MZB1Q8WU39 189 aa25.24■■□□□ 1.63
SNX15-202ENST00000377244 VPS39Q96JC1 886 aa25.24■■□□□ 1.63
SNX15-202ENST00000377244 NFKBIL1Q9UBC1 381 aaPredicted RBP25.24■■□□□ 1.63
SNX15-202ENST00000377244 CRLS1Q9UJA2 301 aa25.24■■□□□ 1.63
SNX15-202ENST00000377244 ITGA2BP08514 1039 aa25.24■■□□□ 1.63
SNX15-202ENST00000377244 PTPN5P54829 565 aa25.24■■□□□ 1.63
SNX15-202ENST00000377244 DBN1Q16643 649 aa25.24■■□□□ 1.63
SNX15-202ENST00000377244 GRTP1Q5TC63 336 aa25.24■■□□□ 1.63
SNX15-202ENST00000377244 KDM7AQ6ZMT4 941 aa25.24■■□□□ 1.63
SNX15-202ENST00000377244 NRSN1Q8IZ57 195 aa25.24■■□□□ 1.63
SNX15-202ENST00000377244 FAM160A2Q8N612 972 aaPredicted RBP25.24■■□□□ 1.63
SNX15-202ENST00000377244 PGM2Q96G03 612 aa25.24■■□□□ 1.63
SNX15-202ENST00000377244 BTBD1Q9H0C5 482 aa25.24■■□□□ 1.63
SNX15-202ENST00000377244 TRBV5-4A0A0C4DH59 114 aa25.23■■□□□ 1.63
SNX15-202ENST00000377244 RGSL1A5PLK6 1076 aa25.23■■□□□ 1.63
SNX15-202ENST00000377244 TRIM49D1C9J1S8 452 aa25.23■■□□□ 1.63
SNX15-202ENST00000377244 APBB3O95704 486 aa25.23■■□□□ 1.63
SNX15-202ENST00000377244 CD151P48509 253 aa25.23■■□□□ 1.63
SNX15-202ENST00000377244 PGGT1BP53609 377 aa25.23■■□□□ 1.63
SNX15-202ENST00000377244 LIMK2P53671 638 aa25.23■■□□□ 1.63
SNX15-202ENST00000377244 CSE1LP55060 971 aaKnown RBP25.23■■□□□ 1.63
SNX15-202ENST00000377244 ZNF284Q2VY69 593 aa25.23■■□□□ 1.63
SNX15-202ENST00000377244 TMEM259Q4ZIN3 620 aa25.23■■□□□ 1.63
SNX15-202ENST00000377244 CROCCP2Q86T23 111 aa25.23■■□□□ 1.63
SNX15-202ENST00000377244 SPNS2Q8IVW8 549 aa25.23■■□□□ 1.63
SNX15-202ENST00000377244 GABPB2Q8TAK5 448 aaPredicted RBP25.23■■□□□ 1.63
SNX15-202ENST00000377244 NDNQ99608 321 aa25.23■■□□□ 1.63
SNX15-202ENST00000377244 RHOJQ9H4E5 214 aa25.23■■□□□ 1.63
SNX15-202ENST00000377244 MTO1Q9Y2Z2 717 aaKnown RBP25.23■■□□□ 1.63
SNX15-202ENST00000377244 ZDBF2Q9HCK1 2354 aa25.22■■□□□ 1.63
SNX15-202ENST00000377244 A0A1W2PPM1 405 aa25.22■■□□□ 1.63
SNX15-202ENST00000377244 UBA6A0AVT1 1052 aaPredicted RBP25.22■■□□□ 1.63
SNX15-202ENST00000377244 PAK4O96013 591 aaPredicted RBP25.22■■□□□ 1.63
SNX15-202ENST00000377244 SOD1P00441 154 aa25.22■■□□□ 1.63
SNX15-202ENST00000377244 KRT15P19012 456 aa25.22■■□□□ 1.63
SNX15-202ENST00000377244 RPS21P63220 83 aaKnown RBP25.22■■□□□ 1.63
SNX15-202ENST00000377244 SFSWAPQ12872 951 aaKnown RBP25.22■■□□□ 1.63
SNX15-202ENST00000377244 RBM20Q5T481 1227 aaKnown RBP25.22■■□□□ 1.63
SNX15-202ENST00000377244 TRAM1L1Q8N609 369 aa25.22■■□□□ 1.63
SNX15-202ENST00000377244 BOCQ9BWV1 1114 aa25.22■■□□□ 1.63
SNX15-202ENST00000377244 PREBQ9HCU5 417 aa25.22■■□□□ 1.63
SNX15-202ENST00000377244 RAD18Q9NS91 495 aa25.22■■□□□ 1.63
SNX15-202ENST00000377244 NOVA2Q9UNW9 492 aaKnown RBP25.22■■□□□ 1.63
SNX15-202ENST00000377244 CACNA1IQ9P0X4 2223 aa25.22■■□□□ 1.63
SNX15-202ENST00000377244 IQANK1A0A1B0GTG1 560 aa25.22■■□□□ 1.63
SNX15-202ENST00000377244 AGAP14A8MT82 685 aa25.22■■□□□ 1.63
SNX15-202ENST00000377244 NDUFS3O75489 264 aa25.22■■□□□ 1.63
SNX15-202ENST00000377244 KRT38O76015 456 aa25.22■■□□□ 1.63
SNX15-202ENST00000377244 ACRV1P26436 265 aa25.22■■□□□ 1.63
SNX15-202ENST00000377244 SPRP35270 261 aaPredicted RBP25.22■■□□□ 1.63
SNX15-202ENST00000377244 CXCL12P48061 93 aa25.22■■□□□ 1.63
SNX15-202ENST00000377244 TTPAP49638 278 aa25.22■■□□□ 1.63
SNX15-202ENST00000377244 SERPINB9P50453 376 aa25.22■■□□□ 1.63
SNX15-202ENST00000377244 SETMARQ53H47 684 aaPredicted RBP25.22■■□□□ 1.63
SNX15-202ENST00000377244 HORMAD1Q86X24 394 aa25.22■■□□□ 1.63
SNX15-202ENST00000377244 NXPE1Q8N323 547 aa25.22■■□□□ 1.63
SNX15-202ENST00000377244 PLA2G15Q8NCC3 412 aa25.22■■□□□ 1.63
SNX15-202ENST00000377244 LPGAT1Q92604 370 aa25.22■■□□□ 1.63
SNX15-202ENST00000377244 TBRG4Q969Z0 631 aaKnown RBP eCLIP25.22■■□□□ 1.63
SNX15-202ENST00000377244 ZSCAN5AQ9BUG6 496 aa25.22■■□□□ 1.63
SNX15-202ENST00000377244 KRT37O76014 449 aa25.21■■□□□ 1.63
SNX15-202ENST00000377244 SNRPAP09012 282 aaKnown RBP25.21■■□□□ 1.63
SNX15-202ENST00000377244 AOC1P19801 751 aa25.21■■□□□ 1.63
SNX15-202ENST00000377244 ITGA9Q13797 1035 aa25.21■■□□□ 1.63
SNX15-202ENST00000377244 GPR33Q49SQ1 333 aa25.21■■□□□ 1.63
SNX15-202ENST00000377244 TNFAIP8L3Q5GJ75 292 aa25.21■■□□□ 1.63
SNX15-202ENST00000377244 AARS2Q5JTZ9 985 aaKnown RBP25.21■■□□□ 1.63
SNX15-202ENST00000377244 KIAA1161Q6NSJ0 714 aa25.21■■□□□ 1.63
SNX15-202ENST00000377244 DCLK2Q8N568 766 aa25.21■■□□□ 1.63
SNX15-202ENST00000377244 TOE1Q96GM8 510 aaKnown RBP25.21■■□□□ 1.63
SNX15-202ENST00000377244 KLF6Q99612 283 aaPredicted RBP25.21■■□□□ 1.63
SNX15-202ENST00000377244 CDH19Q9H159 772 aa25.21■■□□□ 1.63
SNX15-202ENST00000377244 CAB39LQ9H9S4 337 aa25.21■■□□□ 1.63
SNX15-202ENST00000377244 TMEM221A6NGB7 291 aa25.2■■□□□ 1.62
SNX15-202ENST00000377244 M0R296 226 aa25.2■■□□□ 1.62
SNX15-202ENST00000377244 INPP4BO15327 924 aa25.2■■□□□ 1.62
SNX15-202ENST00000377244 MTX2O75431 263 aa25.2■■□□□ 1.62
SNX15-202ENST00000377244 IGLV3-19P01714 112 aa25.2■■□□□ 1.62
SNX15-202ENST00000377244 SAT1P21673 171 aa25.2■■□□□ 1.62
SNX15-202ENST00000377244 WSCD2Q2TBF2 565 aa25.2■■□□□ 1.62
SNX15-202ENST00000377244 RAET1GQ6H3X3 334 aa25.2■■□□□ 1.62
SNX15-202ENST00000377244 GALNT7Q86SF2 657 aa25.2■■□□□ 1.62
SNX15-202ENST00000377244 GPATCH11Q8N954 259 aa25.2■■□□□ 1.62
SNX15-202ENST00000377244 ATP6V1G3Q96LB4 118 aa25.2■■□□□ 1.62
SNX15-202ENST00000377244 MYOCQ99972 504 aa25.2■■□□□ 1.62
SNX15-202ENST00000377244 C1QTNF2Q9BXJ5 285 aa25.2■■□□□ 1.62
SNX15-202ENST00000377244 FZD3Q9NPG1 666 aa25.2■■□□□ 1.62
SNX15-202ENST00000377244 MBNL1Q9NR56 388 aaKnown RBP25.2■■□□□ 1.62
SNX15-202ENST00000377244 INTS10Q9NVR2 710 aaKnown RBP25.2■■□□□ 1.62
SNX15-202ENST00000377244 K7ESF4 209 aa25.2■■□□□ 1.62
SNX15-202ENST00000377244 SEMA4FO95754 770 aa25.2■■□□□ 1.62
SNX15-202ENST00000377244 PCCBP05166 539 aa25.2■■□□□ 1.62
SNX15-202ENST00000377244 CREB1P16220 341 aa25.2■■□□□ 1.62
SNX15-202ENST00000377244 HSP90B2PQ58FF3 399 aa25.2■■□□□ 1.62
SNX15-202ENST00000377244 ZNF648Q5T619 568 aaPredicted RBP25.2■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.7 ms