RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000344528.8

SH3BP4-201, Transcript of SH3 domain binding protein 4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SH3BP4, Length 5,044 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4-201ENST00000344528 LRATO95237 230 aa16.26■□□□□ 0.19
SH3BP4-201ENST00000344528 RPIAP49247 311 aa16.26■□□□□ 0.19
SH3BP4-201ENST00000344528 ST13P50502 369 aaKnown RBP16.26■□□□□ 0.19
SH3BP4-201ENST00000344528 CPTPQ5TA50 214 aa16.26■□□□□ 0.19
SH3BP4-201ENST00000344528 METTL21CQ5VZV1 264 aa16.26■□□□□ 0.19
SH3BP4-201ENST00000344528 ESRP1Q6NXG1 681 aaKnown RBP16.26■□□□□ 0.19
SH3BP4-201ENST00000344528 DNAJB7Q7Z6W7 309 aaPredicted RBP16.26■□□□□ 0.19
SH3BP4-201ENST00000344528 C7orf26Q96N11 449 aa16.26■□□□□ 0.19
SH3BP4-201ENST00000344528 CCDC28BQ9BUN5 200 aa16.26■□□□□ 0.19
SH3BP4-201ENST00000344528 SLITRK2Q9H156 845 aa16.26■□□□□ 0.19
SH3BP4-201ENST00000344528 TRIT1Q9H3H1 467 aaKnown RBP16.26■□□□□ 0.19
SH3BP4-201ENST00000344528 FANCEQ9HB96 536 aa16.26■□□□□ 0.19
SH3BP4-201ENST00000344528 LRTM1Q9HBL6 345 aa16.26■□□□□ 0.19
SH3BP4-201ENST00000344528 MPP1Q00013 466 aa16.25■□□□□ 0.19
SH3BP4-201ENST00000344528 STX4Q12846 297 aa16.25■□□□□ 0.19
SH3BP4-201ENST00000344528 SLC35G1Q2M3R5 365 aa16.25■□□□□ 0.19
SH3BP4-201ENST00000344528 RAB11FIP1Q6WKZ4 1283 aaPredicted RBP16.25■□□□□ 0.19
SH3BP4-201ENST00000344528 TDRPQ86YL5 185 aa16.25■□□□□ 0.19
SH3BP4-201ENST00000344528 HERVK_113Q902F9 699 aa16.25■□□□□ 0.19
SH3BP4-201ENST00000344528 SPOCK2Q92563 424 aa16.25■□□□□ 0.19
SH3BP4-201ENST00000344528 C19orf60Q96EN9 201 aa16.25■□□□□ 0.19
SH3BP4-201ENST00000344528 SSU72Q9NP77 194 aaKnown RBP16.25■□□□□ 0.19
SH3BP4-201ENST00000344528 PNPLA8Q9NP80 782 aa16.25■□□□□ 0.19
SH3BP4-201ENST00000344528 ZNF490Q9ULM2 529 aaPredicted RBP16.25■□□□□ 0.19
SH3BP4-201ENST00000344528 ZMYND8Q9ULU4 1186 aaPredicted RBP16.25■□□□□ 0.19
SH3BP4-201ENST00000344528 TSPAN19P0C672 248 aa16.25■□□□□ 0.19
SH3BP4-201ENST00000344528 SLC6A2P23975 617 aa16.25■□□□□ 0.19
SH3BP4-201ENST00000344528 MPSTP25325 297 aa16.25■□□□□ 0.19
SH3BP4-201ENST00000344528 RANBP1P43487 201 aa16.25■□□□□ 0.19
SH3BP4-201ENST00000344528 DLG2Q15700 870 aa16.25■□□□□ 0.19
SH3BP4-201ENST00000344528 DGKKQ5KSL6 1271 aa16.25■□□□□ 0.19
SH3BP4-201ENST00000344528 KIAA0930Q6ICG6 404 aaPredicted RBP16.25■□□□□ 0.19
SH3BP4-201ENST00000344528 FOXR1Q6PIV2 292 aa16.25■□□□□ 0.19
SH3BP4-201ENST00000344528 ALYREFQ86V81 257 aaKnown RBP16.25■□□□□ 0.19
SH3BP4-201ENST00000344528 MPP5Q8N3R9 675 aa16.25■□□□□ 0.19
SH3BP4-201ENST00000344528 CLEC4CQ8WTT0 213 aa16.25■□□□□ 0.19
SH3BP4-201ENST00000344528 NMD3Q96D46 503 aaKnown RBP16.25■□□□□ 0.19
SH3BP4-201ENST00000344528 APOLD1Q96LR9 279 aa16.25■□□□□ 0.19
SH3BP4-201ENST00000344528 RNF39Q9H2S5 420 aa16.25■□□□□ 0.19
SH3BP4-201ENST00000344528 SEMA3GQ9NS98 782 aa16.25■□□□□ 0.19
SH3BP4-201ENST00000344528 HMGXB4Q9UGU5 601 aa16.25■□□□□ 0.19
SH3BP4-201ENST00000344528 FAM25AB3EWG3 89 aa16.25■□□□□ 0.19
SH3BP4-201ENST00000344528 FAM25CB3EWG5 89 aa16.25■□□□□ 0.19
SH3BP4-201ENST00000344528 FAM25GB3EWG6 89 aa16.25■□□□□ 0.19
SH3BP4-201ENST00000344528 FAM155BO75949 473 aa16.25■□□□□ 0.19
SH3BP4-201ENST00000344528 NAE1Q13564 534 aa16.25■□□□□ 0.19
SH3BP4-201ENST00000344528 FASTKD3Q14CZ7 662 aaKnown RBP16.25■□□□□ 0.19
SH3BP4-201ENST00000344528 NRF1Q16656 503 aa16.25■□□□□ 0.19
SH3BP4-201ENST00000344528 NEK10Q6ZWH5 1172 aa16.25■□□□□ 0.19
SH3BP4-201ENST00000344528 ZNF599Q96NL3 588 aa16.25■□□□□ 0.19
SH3BP4-201ENST00000344528 TSSK3Q96PN8 268 aa16.25■□□□□ 0.19
SH3BP4-201ENST00000344528 OSBPL2Q9H1P3 480 aa16.25■□□□□ 0.19
SH3BP4-201ENST00000344528 ABCG8Q9H221 673 aa16.25■□□□□ 0.19
SH3BP4-201ENST00000344528 FNIP2Q9P278 1114 aa16.25■□□□□ 0.19
SH3BP4-201ENST00000344528 SMIM31A0A1B0GVY4 71 aa16.25■□□□□ 0.19
SH3BP4-201ENST00000344528 DHRS12A0PJE2 317 aa16.25■□□□□ 0.19
SH3BP4-201ENST00000344528 SLC7A2P52569 658 aa16.25■□□□□ 0.19
SH3BP4-201ENST00000344528 MANFP55145 182 aaKnown RBP16.25■□□□□ 0.19
SH3BP4-201ENST00000344528 ATP13A5Q4VNC0 1218 aa16.25■□□□□ 0.19
SH3BP4-201ENST00000344528 ZYG11AQ6WRX3 759 aa16.25■□□□□ 0.19
SH3BP4-201ENST00000344528 BNIPLQ7Z465 357 aa16.25■□□□□ 0.19
SH3BP4-201ENST00000344528 SERPINA9Q86WD7 417 aa16.25■□□□□ 0.19
SH3BP4-201ENST00000344528 ANKRD49Q8WVL7 239 aa16.25■□□□□ 0.19
SH3BP4-201ENST00000344528 FCRL5Q96RD9 977 aa16.25■□□□□ 0.19
SH3BP4-201ENST00000344528 GDAP2Q9NXN4 497 aa16.25■□□□□ 0.19
SH3BP4-201ENST00000344528 MAGEL2Q9UJ55 1249 aa16.25■□□□□ 0.19
SH3BP4-201ENST00000344528 DUOX1Q9NRD9 1551 aa16.25■□□□□ 0.19
SH3BP4-201ENST00000344528 CLDN9O95484 217 aa16.24■□□□□ 0.19
SH3BP4-201ENST00000344528 TRBC1P01850 177 aa16.24■□□□□ 0.19
SH3BP4-201ENST00000344528 KIR3DL1P43629 444 aa16.24■□□□□ 0.19
SH3BP4-201ENST00000344528 LCP2Q13094 533 aa16.24■□□□□ 0.19
SH3BP4-201ENST00000344528 TAF1AQ15573 450 aaPredicted RBP16.24■□□□□ 0.19
SH3BP4-201ENST00000344528 CYP1B1Q16678 543 aa16.24■□□□□ 0.19
SH3BP4-201ENST00000344528 ADGRF1Q5T601 910 aa16.24■□□□□ 0.19
SH3BP4-201ENST00000344528 PARGQ86W56 976 aa16.24■□□□□ 0.19
SH3BP4-201ENST00000344528 ARMC8Q8IUR7 673 aa16.24■□□□□ 0.19
SH3BP4-201ENST00000344528 DEPDC4Q8N2C3 294 aa16.24■□□□□ 0.19
SH3BP4-201ENST00000344528 HSD3B7Q9H2F3 369 aa16.24■□□□□ 0.19
SH3BP4-201ENST00000344528 SERHL2Q9H4I8 314 aa16.24■□□□□ 0.19
SH3BP4-201ENST00000344528 SERHLQ9NQF3 203 aa16.24■□□□□ 0.19
SH3BP4-201ENST00000344528 EXD2Q9NVH0 621 aa16.24■□□□□ 0.19
SH3BP4-201ENST00000344528 LGALS13Q9UHV8 139 aa16.24■□□□□ 0.19
SH3BP4-201ENST00000344528 A0A0J9YYE9 177 aa16.24■□□□□ 0.19
SH3BP4-201ENST00000344528 MED26O95402 600 aa16.24■□□□□ 0.19
SH3BP4-201ENST00000344528 GOT2P00505 430 aaKnown RBP16.24■□□□□ 0.19
SH3BP4-201ENST00000344528 TTKP33981 857 aa16.24■□□□□ 0.19
SH3BP4-201ENST00000344528 PTGIRP43119 386 aa16.24■□□□□ 0.19
SH3BP4-201ENST00000344528 C19orf18Q8NEA5 215 aa16.24■□□□□ 0.19
SH3BP4-201ENST00000344528 CMASQ8NFW8 434 aaPredicted RBP16.24■□□□□ 0.19
SH3BP4-201ENST00000344528 RTKNQ9BST9 563 aa16.24■□□□□ 0.19
SH3BP4-201ENST00000344528 IPPKQ9H8X2 491 aa16.24■□□□□ 0.19
SH3BP4-201ENST00000344528 COL1A1P02452 1464 aaPredicted RBP16.24■□□□□ 0.19
SH3BP4-201ENST00000344528 FGFR3P22607 806 aa16.24■□□□□ 0.19
SH3BP4-201ENST00000344528 NSG1P42857 185 aa16.24■□□□□ 0.19
SH3BP4-201ENST00000344528 CYP4F8P98187 520 aa16.24■□□□□ 0.19
SH3BP4-201ENST00000344528 TOMM20Q15388 145 aa16.24■□□□□ 0.19
SH3BP4-201ENST00000344528 CA9Q16790 459 aa16.24■□□□□ 0.19
SH3BP4-201ENST00000344528 PRR23CQ6ZRP0 262 aa16.24■□□□□ 0.19
SH3BP4-201ENST00000344528 LDB1Q86U70 411 aaPredicted RBP16.24■□□□□ 0.19
SH3BP4-201ENST00000344528 PROSER1Q86XN7 944 aa16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23 ms