RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000321556.4

PINK1-201, Transcript of PTEN induced putative kinase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PINK1, Length 2,660 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PINK1-201ENST00000321556 TFAP2CQ92754 450 aa23.51■■□□□ 1.35
PINK1-201ENST00000321556 PREBQ9HCU5 417 aa23.51■■□□□ 1.35
PINK1-201ENST00000321556 PNPLA3Q9NST1 481 aa23.51■■□□□ 1.35
PINK1-201ENST00000321556 ASPDHA6ND91 283 aa23.51■■□□□ 1.35
PINK1-201ENST00000321556 TMX2-CTNND1H3BSU7 103 aa23.51■■□□□ 1.35
PINK1-201ENST00000321556 SCNN1BP51168 640 aa23.51■■□□□ 1.35
PINK1-201ENST00000321556 IL10RBQ08334 325 aa23.51■■□□□ 1.35
PINK1-201ENST00000321556 AAK1Q2M2I8 961 aa23.51■■□□□ 1.35
PINK1-201ENST00000321556 CPNE9Q8IYJ1 553 aa23.51■■□□□ 1.35
PINK1-201ENST00000321556 ANKFN1Q8N957 763 aa23.51■■□□□ 1.35
PINK1-201ENST00000321556 SEPT5Q99719 369 aaPredicted RBP23.51■■□□□ 1.35
PINK1-201ENST00000321556 ZNF225Q9UK10 706 aa23.51■■□□□ 1.35
PINK1-201ENST00000321556 TYMPP19971 482 aa23.5■■□□□ 1.35
PINK1-201ENST00000321556 CREB5Q02930 508 aa23.5■■□□□ 1.35
PINK1-201ENST00000321556 NFYCQ13952 458 aa23.5■■□□□ 1.35
PINK1-201ENST00000321556 CYP51A1Q16850 503 aa23.5■■□□□ 1.35
PINK1-201ENST00000321556 GIPC2Q8TF65 315 aa23.5■■□□□ 1.35
PINK1-201ENST00000321556 TADA1Q96BN2 335 aa23.5■■□□□ 1.35
PINK1-201ENST00000321556 SEPHS2Q99611 448 aa23.5■■□□□ 1.35
PINK1-201ENST00000321556 SARS2Q9NP81 518 aaKnown RBP23.5■■□□□ 1.35
PINK1-201ENST00000321556 HCSTQ9UBK5 93 aa23.5■■□□□ 1.35
PINK1-201ENST00000321556 RSL24D1Q9UHA3 163 aaKnown RBP23.5■■□□□ 1.35
PINK1-201ENST00000321556 BTN3A1O00481 513 aa23.5■■□□□ 1.35
PINK1-201ENST00000321556 BMP2P12643 396 aa23.5■■□□□ 1.35
PINK1-201ENST00000321556 ARL1P40616 181 aaPredicted RBP23.5■■□□□ 1.35
PINK1-201ENST00000321556 ATP4BP51164 291 aa23.5■■□□□ 1.35
PINK1-201ENST00000321556 CLLU1OSQ5K130 101 aa23.5■■□□□ 1.35
PINK1-201ENST00000321556 VARS2Q5ST30 1063 aaKnown RBP23.5■■□□□ 1.35
PINK1-201ENST00000321556 LGI2Q8N0V4 545 aa23.5■■□□□ 1.35
PINK1-201ENST00000321556 BRSK1Q8TDC3 778 aa23.5■■□□□ 1.35
PINK1-201ENST00000321556 DUS3LQ96G46 650 aaKnown RBP23.5■■□□□ 1.35
PINK1-201ENST00000321556 HAUS8Q9BT25 410 aa23.5■■□□□ 1.35
PINK1-201ENST00000321556 ANKRD60Q9BZ19 345 aa23.5■■□□□ 1.35
PINK1-201ENST00000321556 ARMC1Q9NVT9 282 aa23.5■■□□□ 1.35
PINK1-201ENST00000321556 IGLV3-10A0A075B6K4 115 aa23.49■■□□□ 1.35
PINK1-201ENST00000321556 FOXD2O60548 495 aaPredicted RBP23.49■■□□□ 1.35
PINK1-201ENST00000321556 TMCC1O94876 653 aa23.49■■□□□ 1.35
PINK1-201ENST00000321556 FGF4P08620 206 aa23.49■■□□□ 1.35
PINK1-201ENST00000321556 SYVN1Q86TM6 617 aa23.49■■□□□ 1.35
PINK1-201ENST00000321556 RIN3Q8TB24 985 aa23.49■■□□□ 1.35
PINK1-201ENST00000321556 TRIB2Q92519 343 aa23.49■■□□□ 1.35
PINK1-201ENST00000321556 SDR39U1Q9NRG7 319 aaPredicted RBP23.49■■□□□ 1.35
PINK1-201ENST00000321556 MTPAPQ9NVV4 582 aaKnown RBP eCLIP23.49■■□□□ 1.35
PINK1-201ENST00000321556 ABCD2Q9UBJ2 740 aa23.49■■□□□ 1.35
PINK1-201ENST00000321556 NIPSNAP2O75323 286 aa23.49■■□□□ 1.35
PINK1-201ENST00000321556 PBX3P40426 434 aa23.49■■□□□ 1.35
PINK1-201ENST00000321556 SLC26A3P40879 764 aa23.49■■□□□ 1.35
PINK1-201ENST00000321556 KCNA10Q16322 511 aa23.49■■□□□ 1.35
PINK1-201ENST00000321556 TIGD2Q4W5G0 525 aa23.49■■□□□ 1.35
PINK1-201ENST00000321556 FAM43BQ6ZT52 329 aaPredicted RBP23.49■■□□□ 1.35
PINK1-201ENST00000321556 GALNT7Q86SF2 657 aa23.49■■□□□ 1.35
PINK1-201ENST00000321556 SIDT2Q8NBJ9 832 aaKnown RBP23.49■■□□□ 1.35
PINK1-201ENST00000321556 MDGA1Q8NFP4 955 aa23.49■■□□□ 1.35
PINK1-201ENST00000321556 OR2T11Q8NH01 316 aa23.49■■□□□ 1.35
PINK1-201ENST00000321556 FBXO44Q9H4M3 255 aa23.49■■□□□ 1.35
PINK1-201ENST00000321556 INTS7Q9NVH2 962 aaKnown RBP23.49■■□□□ 1.35
PINK1-201ENST00000321556 VWA8A3KMH1 1905 aa23.49■■□□□ 1.35
PINK1-201ENST00000321556 PSMA4P25789 261 aaKnown RBP23.48■■□□□ 1.35
PINK1-201ENST00000321556 GSK3BP49841 420 aa23.48■■□□□ 1.35
PINK1-201ENST00000321556 LCP2Q13094 533 aa23.48■■□□□ 1.35
PINK1-201ENST00000321556 RBBP7Q16576 425 aa23.48■■□□□ 1.35
PINK1-201ENST00000321556 PTPRNQ16849 979 aa23.48■■□□□ 1.35
PINK1-201ENST00000321556 C18orf21Q32NC0 220 aaPredicted RBP23.48■■□□□ 1.35
PINK1-201ENST00000321556 CST9Q5W186 159 aa23.48■■□□□ 1.35
PINK1-201ENST00000321556 TTC33Q6PID6 262 aaPredicted RBP23.48■■□□□ 1.35
PINK1-201ENST00000321556 BLOC1S3Q6QNY0 202 aa23.48■■□□□ 1.35
PINK1-201ENST00000321556 C17orf99Q6UX52 265 aa23.48■■□□□ 1.35
PINK1-201ENST00000321556 CHST15Q7LFX5 561 aaPredicted RBP23.48■■□□□ 1.35
PINK1-201ENST00000321556 ZNF598Q86UK7 904 aaKnown RBP23.48■■□□□ 1.35
PINK1-201ENST00000321556 PIANPQ8IYJ0 282 aa23.48■■□□□ 1.35
PINK1-201ENST00000321556 ADGRG5Q8IZF4 528 aa23.48■■□□□ 1.35
PINK1-201ENST00000321556 HOPXQ9BPY8 73 aaPredicted RBP23.48■■□□□ 1.35
PINK1-201ENST00000321556 CLK4Q9HAZ1 481 aaKnown RBP23.48■■□□□ 1.35
PINK1-201ENST00000321556 SLC52A3Q9NQ40 469 aa23.48■■□□□ 1.35
PINK1-201ENST00000321556 EBF1Q9UH73 591 aa23.48■■□□□ 1.35
PINK1-201ENST00000321556 GABRQQ9UN88 632 aa23.48■■□□□ 1.35
PINK1-201ENST00000321556 GPR45Q9Y5Y3 372 aa23.48■■□□□ 1.35
PINK1-201ENST00000321556 IQCF5A8MTL0 148 aa23.48■■□□□ 1.35
PINK1-201ENST00000321556 SCAMP3O14828 347 aaKnown RBP23.48■■□□□ 1.35
PINK1-201ENST00000321556 PRAMEF11O60813 436 aa23.48■■□□□ 1.35
PINK1-201ENST00000321556 FGF1P05230 155 aa23.48■■□□□ 1.35
PINK1-201ENST00000321556 PYGLP06737 847 aa23.48■■□□□ 1.35
PINK1-201ENST00000321556 SERPINF2P08697 491 aa23.48■■□□□ 1.35
PINK1-201ENST00000321556 ATP6V0D1P61421 351 aa23.48■■□□□ 1.35
PINK1-201ENST00000321556 ACVR1Q04771 509 aa23.48■■□□□ 1.35
PINK1-201ENST00000321556 CTXN3Q4LDR2 81 aa23.48■■□□□ 1.35
PINK1-201ENST00000321556 DCP1BQ8IZD4 617 aaKnown RBP23.48■■□□□ 1.35
PINK1-201ENST00000321556 ADI1Q9BV57 179 aa23.48■■□□□ 1.35
PINK1-201ENST00000321556 AGPAT4Q9NRZ5 378 aa23.48■■□□□ 1.35
PINK1-201ENST00000321556 EVLQ9UI08 416 aaPredicted RBP23.48■■□□□ 1.35
PINK1-201ENST00000321556 H0YJX3 145 aa23.47■■□□□ 1.35
PINK1-201ENST00000321556 EI24O14681 340 aa23.47■■□□□ 1.35
PINK1-201ENST00000321556 IL10P22301 178 aa23.47■■□□□ 1.35
PINK1-201ENST00000321556 YAP1P46937 504 aaKnown RBP23.47■■□□□ 1.35
PINK1-201ENST00000321556 ALDH3B2P48448 385 aa23.47■■□□□ 1.35
PINK1-201ENST00000321556 CTBSQ01459 385 aa23.47■■□□□ 1.35
PINK1-201ENST00000321556 TRIP4Q15650 581 aaPredicted RBP23.47■■□□□ 1.35
PINK1-201ENST00000321556 TMEM259Q4ZIN3 620 aa23.47■■□□□ 1.35
PINK1-201ENST00000321556 PSAPL1Q6NUJ1 521 aa23.47■■□□□ 1.35
PINK1-201ENST00000321556 MINDY1Q8N5J2 469 aa23.47■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.6 ms