RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000311626.8

HOXB3-201, Transcript of homeobox B3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HOXB3, Length 2,642 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB3-201ENST00000311626 HBEGFQ99075 208 aa25.21■■□□□ 1.63
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HOXB3-201ENST00000311626 TSPAN3O60637 253 aa25.2■■□□□ 1.63
HOXB3-201ENST00000311626 SERPINF2P08697 491 aa25.2■■□□□ 1.63
HOXB3-201ENST00000311626 HLA-DPA1P20036 260 aa25.2■■□□□ 1.63
HOXB3-201ENST00000311626 SLC26A3P40879 764 aa25.2■■□□□ 1.63
HOXB3-201ENST00000311626 ATP4BP51164 291 aa25.2■■□□□ 1.63
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HOXB3-201ENST00000311626 DHRS12A0PJE2 317 aa25.2■■□□□ 1.62
HOXB3-201ENST00000311626 BTN3A1O00481 513 aa25.2■■□□□ 1.62
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HOXB3-201ENST00000311626 FGF4P08620 206 aa25.2■■□□□ 1.62
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HOXB3-201ENST00000311626 PARP15Q460N3 678 aa25.2■■□□□ 1.62
HOXB3-201ENST00000311626 NHSL2Q5HYW2 709 aa25.2■■□□□ 1.62
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HOXB3-201ENST00000311626 UHRF1Q96T88 793 aaPredicted RBP25.2■■□□□ 1.62
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HOXB3-201ENST00000311626 DSC1Q08554 894 aa25.19■■□□□ 1.62
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HOXB3-201ENST00000311626 USP41Q3LFD5 358 aa25.19■■□□□ 1.62
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HOXB3-201ENST00000311626 FAM193BQ96PV7 902 aaPredicted RBP25.19■■□□□ 1.62
HOXB3-201ENST00000311626 ASPDHA6ND91 283 aa25.19■■□□□ 1.62
HOXB3-201ENST00000311626 H3BNH8 94 aa25.19■■□□□ 1.62
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HOXB3-201ENST00000311626 MBTPS1Q14703 1052 aa25.19■■□□□ 1.62
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HOXB3-201ENST00000311626 RNF19BQ6ZMZ0 732 aa25.19■■□□□ 1.62
HOXB3-201ENST00000311626 EFHBQ8N7U6 833 aa25.19■■□□□ 1.62
HOXB3-201ENST00000311626 TCF12Q99081 682 aa25.19■■□□□ 1.62
HOXB3-201ENST00000311626 SOX17Q9H6I2 414 aaPredicted RBP25.19■■□□□ 1.62
HOXB3-201ENST00000311626 CCM2LQ9NUG4 571 aaPredicted RBP25.19■■□□□ 1.62
HOXB3-201ENST00000311626 SMOXQ9NWM0 555 aa25.19■■□□□ 1.62
HOXB3-201ENST00000311626 GREB1Q4ZG55 1949 aa25.19■■□□□ 1.62
HOXB3-201ENST00000311626 IQCF5A8MTL0 148 aa25.18■■□□□ 1.62
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HOXB3-201ENST00000311626 ARPC2O15144 300 aa25.18■■□□□ 1.62
HOXB3-201ENST00000311626 TLR5O60602 858 aa25.18■■□□□ 1.62
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HOXB3-201ENST00000311626 RBBP7Q16576 425 aa25.18■■□□□ 1.62
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HOXB3-201ENST00000311626 GLT6D1Q7Z4J2 308 aa25.18■■□□□ 1.62
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HOXB3-201ENST00000311626 DDI1Q8WTU0 396 aa25.18■■□□□ 1.62
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HOXB3-201ENST00000311626 TFB2MQ9H5Q4 396 aaKnown RBP25.18■■□□□ 1.62
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HOXB3-201ENST00000311626 TLR8Q9NR97 1041 aaKnown RBP25.18■■□□□ 1.62
HOXB3-201ENST00000311626 HSFX1Q9UBD0 423 aa25.18■■□□□ 1.62
HOXB3-201ENST00000311626 MYRFQ9Y2G1 1151 aa25.18■■□□□ 1.62
HOXB3-201ENST00000311626 hCG_2014768A0A024R1R8 64 aa25.18■■□□□ 1.62
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HOXB3-201ENST00000311626 CDH2P19022 906 aaPredicted RBP25.18■■□□□ 1.62
HOXB3-201ENST00000311626 HOXD9P28356 352 aaPredicted RBP25.18■■□□□ 1.62
HOXB3-201ENST00000311626 ARL1P40616 181 aaPredicted RBP25.18■■□□□ 1.62
HOXB3-201ENST00000311626 SUOXP51687 545 aa25.18■■□□□ 1.62
HOXB3-201ENST00000311626 LCP2Q13094 533 aa25.18■■□□□ 1.62
HOXB3-201ENST00000311626 C18orf21Q32NC0 220 aaPredicted RBP25.18■■□□□ 1.62
HOXB3-201ENST00000311626 ARHGAP22Q7Z5H3 698 aa25.18■■□□□ 1.62
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HOXB3-201ENST00000311626 STAG3L4Q8TBR4 150 aa25.18■■□□□ 1.62
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HOXB3-201ENST00000311626 KIAA1191Q96A73 305 aa25.18■■□□□ 1.62
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HOXB3-201ENST00000311626 ZFP37Q9Y6Q3 630 aaPredicted RBP25.18■■□□□ 1.62
HOXB3-201ENST00000311626 KERAO60938 352 aa25.17■■□□□ 1.62
HOXB3-201ENST00000311626 NDST3O95803 873 aa25.17■■□□□ 1.62
HOXB3-201ENST00000311626 AAK1Q2M2I8 961 aa25.17■■□□□ 1.62
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HOXB3-201ENST00000311626 ANKFN1Q8N957 763 aa25.17■■□□□ 1.62
HOXB3-201ENST00000311626 LPCAT1Q8NF37 534 aa25.17■■□□□ 1.62
HOXB3-201ENST00000311626 OR2T11Q8NH01 316 aa25.17■■□□□ 1.62
HOXB3-201ENST00000311626 FATE1Q969F0 183 aa25.17■■□□□ 1.62
HOXB3-201ENST00000311626 FUBP1Q96AE4 644 aaKnown RBP25.17■■□□□ 1.62
HOXB3-201ENST00000311626 DUS3LQ96G46 650 aaKnown RBP25.17■■□□□ 1.62
HOXB3-201ENST00000311626 FUBP3Q96I24 572 aaKnown RBP eCLIP25.17■■□□□ 1.62
HOXB3-201ENST00000311626 TRIB3Q96RU7 358 aa25.17■■□□□ 1.62
HOXB3-201ENST00000311626 GPR45Q9Y5Y3 372 aa25.17■■□□□ 1.62
HOXB3-201ENST00000311626 SQORQ9Y6N5 450 aa25.17■■□□□ 1.62
HOXB3-201ENST00000311626 VNN2O95498 520 aa25.17■■□□□ 1.62
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