RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000295797.4

PRKCI-201, Transcript of protein kinase C iota, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PRKCI, Length 4,950 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCI-201ENST00000295797 CLEC4CQ8WTT0 213 aa18.61■□□□□ 0.57
PRKCI-201ENST00000295797 GBA3Q9H227 469 aa18.61■□□□□ 0.57
PRKCI-201ENST00000295797 MOV10Q9HCE1 1003 aaKnown RBP18.61■□□□□ 0.57
PRKCI-201ENST00000295797 DNAAF2Q9NVR5 837 aaKnown RBP18.61■□□□□ 0.57
PRKCI-201ENST00000295797 NRCAMQ92823 1304 aa18.6■□□□□ 0.57
PRKCI-201ENST00000295797 SUV39H1O43463 412 aa18.6■□□□□ 0.57
PRKCI-201ENST00000295797 CATP04040 527 aaKnown RBP18.6■□□□□ 0.57
PRKCI-201ENST00000295797 ALDH2P05091 517 aa18.6■□□□□ 0.57
PRKCI-201ENST00000295797 GPIP06744 558 aa18.6■□□□□ 0.57
PRKCI-201ENST00000295797 PRG2P13727 222 aa18.6■□□□□ 0.57
PRKCI-201ENST00000295797 MTA1Q13330 715 aa18.6■□□□□ 0.57
PRKCI-201ENST00000295797 PSMD5Q16401 504 aa18.6■□□□□ 0.57
PRKCI-201ENST00000295797 NADK2Q4G0N4 442 aa18.6■□□□□ 0.57
PRKCI-201ENST00000295797 TWIST2Q8WVJ9 160 aa18.6■□□□□ 0.57
PRKCI-201ENST00000295797 LINGO1Q96FE5 620 aa18.6■□□□□ 0.57
PRKCI-201ENST00000295797 MUC13Q9H3R2 512 aa18.6■□□□□ 0.57
PRKCI-201ENST00000295797 CORO2BQ9UQ03 480 aa18.6■□□□□ 0.57
PRKCI-201ENST00000295797 GPD2P43304 727 aa18.6■□□□□ 0.57
PRKCI-201ENST00000295797 TTPAP49638 278 aa18.6■□□□□ 0.57
PRKCI-201ENST00000295797 COPZ1P61923 177 aa18.6■□□□□ 0.57
PRKCI-201ENST00000295797 FRMD7Q6ZUT3 714 aa18.6■□□□□ 0.57
PRKCI-201ENST00000295797 FAM20CQ8IXL6 584 aa18.6■□□□□ 0.57
PRKCI-201ENST00000295797 RAB2BQ8WUD1 216 aa18.6■□□□□ 0.57
PRKCI-201ENST00000295797 ITCHQ96J02 903 aa18.6■□□□□ 0.57
PRKCI-201ENST00000295797 OR52B2Q96RD2 323 aa18.6■□□□□ 0.57
PRKCI-201ENST00000295797 PDZD7Q9H5P4 517 aa18.6■□□□□ 0.57
PRKCI-201ENST00000295797 PGRMC2O15173 223 aa18.6■□□□□ 0.57
PRKCI-201ENST00000295797 SMIM10L2AP0DMW4 78 aa18.6■□□□□ 0.57
PRKCI-201ENST00000295797 SMIM10L2BP0DMW5 78 aa18.6■□□□□ 0.57
PRKCI-201ENST00000295797 CKMT2P17540 419 aa18.6■□□□□ 0.57
PRKCI-201ENST00000295797 IGFBP5P24593 272 aa18.6■□□□□ 0.57
PRKCI-201ENST00000295797 PTPN3P26045 913 aa18.6■□□□□ 0.57
PRKCI-201ENST00000295797 CTSKP43235 329 aa18.6■□□□□ 0.57
PRKCI-201ENST00000295797 UGT2B15P54855 530 aa18.6■□□□□ 0.57
PRKCI-201ENST00000295797 PRAMEF19Q5SWL8 479 aa18.6■□□□□ 0.57
PRKCI-201ENST00000295797 AFTPHQ6ULP2 937 aa18.6■□□□□ 0.57
PRKCI-201ENST00000295797 SMYD1Q8NB12 490 aa18.6■□□□□ 0.57
PRKCI-201ENST00000295797 C1GALT1C1Q96EU7 318 aa18.6■□□□□ 0.57
PRKCI-201ENST00000295797 STOML2Q9UJZ1 356 aa18.6■□□□□ 0.57
PRKCI-201ENST00000295797 STX16-NPEPL1H3BU86 382 aa18.6■□□□□ 0.57
PRKCI-201ENST00000295797 LRATO95237 230 aa18.6■□□□□ 0.57
PRKCI-201ENST00000295797 POU5F1Q01860 360 aaKnown RBP18.6■□□□□ 0.57
PRKCI-201ENST00000295797 RHBDF2Q6PJF5 856 aa18.6■□□□□ 0.57
PRKCI-201ENST00000295797 PNPT1Q8TCS8 783 aaKnown RBP18.6■□□□□ 0.57
PRKCI-201ENST00000295797 BORCS6Q96GS4 357 aa18.6■□□□□ 0.57
PRKCI-201ENST00000295797 ADAM2Q99965 735 aa18.6■□□□□ 0.57
PRKCI-201ENST00000295797 TDRD1Q9BXT4 1180 aaKnown RBP18.6■□□□□ 0.57
PRKCI-201ENST00000295797 AAASQ9NRG9 546 aa18.6■□□□□ 0.57
PRKCI-201ENST00000295797 SNX10Q9Y5X0 201 aa18.6■□□□□ 0.57
PRKCI-201ENST00000295797 SMIM28A0A1B0GU29 152 aa18.59■□□□□ 0.57
PRKCI-201ENST00000295797 CASKO14936 926 aa18.59■□□□□ 0.57
PRKCI-201ENST00000295797 DHX15O43143 795 aaKnown RBP18.59■□□□□ 0.57
PRKCI-201ENST00000295797 RAB27AP51159 221 aa18.59■□□□□ 0.57
PRKCI-201ENST00000295797 LIPEQ05469 1076 aa18.59■□□□□ 0.57
PRKCI-201ENST00000295797 BCL2L1Q07817 233 aa18.59■□□□□ 0.57
PRKCI-201ENST00000295797 SLC39A4Q6P5W5 647 aa18.59■□□□□ 0.57
PRKCI-201ENST00000295797 ZSCAN2Q7Z7L9 614 aaPredicted RBP18.59■□□□□ 0.57
PRKCI-201ENST00000295797 HEXDCQ8WVB3 486 aa18.59■□□□□ 0.57
PRKCI-201ENST00000295797 PIH1D2Q8WWB5 315 aa18.59■□□□□ 0.57
PRKCI-201ENST00000295797 ERLEC1Q96DZ1 483 aa18.59■□□□□ 0.57
PRKCI-201ENST00000295797 SAMD4AQ9UPU9 718 aaKnown RBP18.59■□□□□ 0.57
PRKCI-201ENST00000295797 PLK4O00444 970 aa18.59■□□□□ 0.57
PRKCI-201ENST00000295797 NCK1P16333 377 aa18.59■□□□□ 0.57
PRKCI-201ENST00000295797 TREML2Q5T2D2 321 aa18.59■□□□□ 0.57
PRKCI-201ENST00000295797 PIK3C3Q8NEB9 887 aa18.59■□□□□ 0.57
PRKCI-201ENST00000295797 LMO3Q8TAP4 145 aa18.59■□□□□ 0.57
PRKCI-201ENST00000295797 C17orf50Q8WW18 174 aa18.59■□□□□ 0.57
PRKCI-201ENST00000295797 LPIN3Q9BQK8 851 aa18.59■□□□□ 0.57
PRKCI-201ENST00000295797 ZNF541Q9H0D2 1346 aa18.59■□□□□ 0.57
PRKCI-201ENST00000295797 TTLL13PA6NNM8 815 aa18.59■□□□□ 0.57
PRKCI-201ENST00000295797 STK25O00506 426 aa18.59■□□□□ 0.57
PRKCI-201ENST00000295797 TYROBPO43914 113 aa18.59■□□□□ 0.57
PRKCI-201ENST00000295797 UMPSP11172 480 aa18.59■□□□□ 0.57
PRKCI-201ENST00000295797 MYL9P24844 172 aa18.59■□□□□ 0.57
PRKCI-201ENST00000295797 WEE1P30291 646 aa18.59■□□□□ 0.57
PRKCI-201ENST00000295797 TAS2R39P59534 338 aa18.59■□□□□ 0.57
PRKCI-201ENST00000295797 PGBD3Q8N328 593 aa18.59■□□□□ 0.57
PRKCI-201ENST00000295797 PHTF2Q8N3S3 785 aa18.59■□□□□ 0.57
PRKCI-201ENST00000295797 CLHC1Q8NHS4 586 aa18.59■□□□□ 0.57
PRKCI-201ENST00000295797 USP7Q93009 1102 aa18.59■□□□□ 0.57
PRKCI-201ENST00000295797 FBXL18Q96ME1 805 aa18.59■□□□□ 0.57
PRKCI-201ENST00000295797 MLPHQ9BV36 600 aaPredicted RBP18.59■□□□□ 0.57
PRKCI-201ENST00000295797 TMPRSS4Q9NRS4 437 aa18.59■□□□□ 0.57
PRKCI-201ENST00000295797 KAT6AQ92794 2004 aa18.59■□□□□ 0.57
PRKCI-201ENST00000295797 NEMP2A6NFY4 417 aa18.59■□□□□ 0.57
PRKCI-201ENST00000295797 GUCY1B2O75343 617 aa18.59■□□□□ 0.57
PRKCI-201ENST00000295797 NDUFV1P49821 464 aa18.59■□□□□ 0.57
PRKCI-201ENST00000295797 PRKAG1P54619 331 aa18.59■□□□□ 0.57
PRKCI-201ENST00000295797 CXXC5Q7LFL8 322 aaKnown RBP18.59■□□□□ 0.57
PRKCI-201ENST00000295797 RNF180Q86T96 592 aa18.59■□□□□ 0.57
PRKCI-201ENST00000295797 CDK5RAP1Q96SZ6 601 aaKnown RBP18.59■□□□□ 0.57
PRKCI-201ENST00000295797 PDCD10Q9BUL8 212 aa18.59■□□□□ 0.57
PRKCI-201ENST00000295797 GPR88Q9GZN0 384 aa18.59■□□□□ 0.57
PRKCI-201ENST00000295797 TEX264Q9Y6I9 313 aa18.59■□□□□ 0.57
PRKCI-201ENST00000295797 SCN1BQ07699 218 aa18.58■□□□□ 0.57
PRKCI-201ENST00000295797 TRIM32Q13049 653 aa18.58■□□□□ 0.57
PRKCI-201ENST00000295797 ARHGAP15Q53QZ3 475 aa18.58■□□□□ 0.57
PRKCI-201ENST00000295797 SPATA19Q7Z5L4 167 aa18.58■□□□□ 0.57
PRKCI-201ENST00000295797 ERI1Q8IV48 349 aaKnown RBP18.58■□□□□ 0.57
PRKCI-201ENST00000295797 AHI1Q8N157 1196 aa18.58■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 156.1 ms