RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000293845.7

CCDC42-201, Transcript of coiled-coil domain containing 42, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene CCDC42, Length 1,374 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC42-201ENST00000293845 NUSAP1Q9BXS6 441 aaKnown RBP13.15□□□□□ -0.3
CCDC42-201ENST00000293845 SMOC1Q9H4F8 434 aa13.15□□□□□ -0.3
CCDC42-201ENST00000293845 ERVMER34-1Q9H9K5 563 aa13.15□□□□□ -0.3
CCDC42-201ENST00000293845 EPB41L5Q9HCM4 733 aa13.15□□□□□ -0.3
CCDC42-201ENST00000293845 GDF3Q9NR23 364 aa13.15□□□□□ -0.3
CCDC42-201ENST00000293845 FAM114A2Q9NRY5 505 aa13.15□□□□□ -0.3
CCDC42-201ENST00000293845 SEMA4GQ9NTN9 838 aa13.15□□□□□ -0.3
CCDC42-201ENST00000293845 SAMD15Q9P1V8 674 aa13.15□□□□□ -0.3
CCDC42-201ENST00000293845 SLC2A6Q9UGQ3 507 aa13.15□□□□□ -0.3
CCDC42-201ENST00000293845 CNOT6Q9ULM6 557 aaKnown RBP13.15□□□□□ -0.3
CCDC42-201ENST00000293845 OR1A2Q9Y585 309 aa13.15□□□□□ -0.3
CCDC42-201ENST00000293845 CCDC78A2IDD5 438 aa13.14□□□□□ -0.31
CCDC42-201ENST00000293845 CCL22O00626 93 aa13.14□□□□□ -0.31
CCDC42-201ENST00000293845 ARHGAP33O14559 1287 aa13.14□□□□□ -0.31
CCDC42-201ENST00000293845 FOXD2O60548 495 aaPredicted RBP13.14□□□□□ -0.31
CCDC42-201ENST00000293845 SYPP08247 313 aa13.14□□□□□ -0.31
CCDC42-201ENST00000293845 NMBRP28336 390 aa13.14□□□□□ -0.31
CCDC42-201ENST00000293845 MC4RP32245 332 aa13.14□□□□□ -0.31
CCDC42-201ENST00000293845 PLTPP55058 493 aa13.14□□□□□ -0.31
CCDC42-201ENST00000293845 NFATC2Q13469 925 aa13.14□□□□□ -0.31
CCDC42-201ENST00000293845 FZD2Q14332 565 aa13.14□□□□□ -0.31
CCDC42-201ENST00000293845 ATP13A5Q4VNC0 1218 aa13.14□□□□□ -0.31
CCDC42-201ENST00000293845 TCEAL6Q6IPX3 200 aa13.14□□□□□ -0.31
CCDC42-201ENST00000293845 IL27RAQ6UWB1 636 aa13.14□□□□□ -0.31
CCDC42-201ENST00000293845 SNX20Q7Z614 316 aa13.14□□□□□ -0.31
CCDC42-201ENST00000293845 ZNF398Q8TD17 642 aa13.14□□□□□ -0.31
CCDC42-201ENST00000293845 BTN2A2Q8WVV5 523 aa13.14□□□□□ -0.31
CCDC42-201ENST00000293845 TCEAL3Q969E4 200 aa13.14□□□□□ -0.31
CCDC42-201ENST00000293845 GLYATL1Q969I3 302 aa13.14□□□□□ -0.31
CCDC42-201ENST00000293845 MFSD3Q96ES6 412 aa13.14□□□□□ -0.31
CCDC42-201ENST00000293845 STAMBPL1Q96FJ0 436 aa13.14□□□□□ -0.31
CCDC42-201ENST00000293845 HIC2Q96JB3 615 aa13.14□□□□□ -0.31
CCDC42-201ENST00000293845 WDR92Q96MX6 357 aa13.14□□□□□ -0.31
CCDC42-201ENST00000293845 PWWP2AQ96N64 755 aa13.14□□□□□ -0.31
CCDC42-201ENST00000293845 NAT9Q9BTE0 207 aa13.14□□□□□ -0.31
CCDC42-201ENST00000293845 LGR4Q9BXB1 951 aa13.14□□□□□ -0.31
CCDC42-201ENST00000293845 FOXP3Q9BZS1 431 aa13.14□□□□□ -0.31
CCDC42-201ENST00000293845 PARD6AQ9NPB6 346 aa13.14□□□□□ -0.31
CCDC42-201ENST00000293845 ZDHHC18Q9NUE0 388 aa13.14□□□□□ -0.31
CCDC42-201ENST00000293845 TMPRSS11EQ9UL52 423 aa13.14□□□□□ -0.31
CCDC42-201ENST00000293845 SNX11Q9Y5W9 270 aa13.14□□□□□ -0.31
CCDC42-201ENST00000293845 GVINP1Q7Z2Y8 2422 aa13.14□□□□□ -0.31
CCDC42-201ENST00000293845 ZFHX2Q9C0A1 2572 aaPredicted RBP13.14□□□□□ -0.31
CCDC42-201ENST00000293845 TRBV5-4A0A0C4DH59 114 aa13.13□□□□□ -0.31
CCDC42-201ENST00000293845 LNP1A1A4G5 178 aa13.13□□□□□ -0.31
CCDC42-201ENST00000293845 CCDC162PA2VCL2 907 aa13.13□□□□□ -0.31
CCDC42-201ENST00000293845 TNFRSF10CO14798 259 aa13.13□□□□□ -0.31
CCDC42-201ENST00000293845 EIF3HO15372 352 aaKnown RBP eCLIP13.13□□□□□ -0.31
CCDC42-201ENST00000293845 USP1O94782 785 aa13.13□□□□□ -0.31
CCDC42-201ENST00000293845 SLU7O95391 586 aaKnown RBP13.13□□□□□ -0.31
CCDC42-201ENST00000293845 PGAM1P18669 254 aa13.13□□□□□ -0.31
CCDC42-201ENST00000293845 ITGALP20701 1170 aa13.13□□□□□ -0.31
CCDC42-201ENST00000293845 FOXN2P32314 431 aa13.13□□□□□ -0.31
CCDC42-201ENST00000293845 TUBB4BP68371 445 aa13.13□□□□□ -0.31
CCDC42-201ENST00000293845 ZNF423Q2M1K9 1284 aa13.13□□□□□ -0.31
CCDC42-201ENST00000293845 BBS9Q3SYG4 887 aa13.13□□□□□ -0.31
CCDC42-201ENST00000293845 GPR33Q49SQ1 333 aa13.13□□□□□ -0.31
CCDC42-201ENST00000293845 KIAA0930Q6ICG6 404 aaPredicted RBP13.13□□□□□ -0.31
CCDC42-201ENST00000293845 CASC4Q6P4E1 433 aa13.13□□□□□ -0.31
CCDC42-201ENST00000293845 AFTPHQ6ULP2 937 aa13.13□□□□□ -0.31
CCDC42-201ENST00000293845 PARGQ86W56 976 aa13.13□□□□□ -0.31
CCDC42-201ENST00000293845 PHYKPLQ8IUZ5 450 aa13.13□□□□□ -0.31
CCDC42-201ENST00000293845 CCNJLQ8IV13 435 aa13.13□□□□□ -0.31
CCDC42-201ENST00000293845 DCLK2Q8N568 766 aa13.13□□□□□ -0.31
CCDC42-201ENST00000293845 OXR1Q8N573 874 aa13.13□□□□□ -0.31
CCDC42-201ENST00000293845 GPR161Q8N6U8 529 aaKnown RBP13.13□□□□□ -0.31
CCDC42-201ENST00000293845 DDHD1Q8NEL9 900 aa13.13□□□□□ -0.31
CCDC42-201ENST00000293845 HDAC10Q969S8 669 aa13.13□□□□□ -0.31
CCDC42-201ENST00000293845 EBNA1BP2Q99848 306 aaKnown RBP13.13□□□□□ -0.31
CCDC42-201ENST00000293845 HINFPQ9BQA5 517 aa13.13□□□□□ -0.31
CCDC42-201ENST00000293845 WDR83Q9BRX9 315 aaKnown RBP13.13□□□□□ -0.31
CCDC42-201ENST00000293845 ASB8Q9H765 288 aa13.13□□□□□ -0.31
CCDC42-201ENST00000293845 SUDS3Q9H7L9 328 aaPredicted RBP13.13□□□□□ -0.31
CCDC42-201ENST00000293845 SLC17A4Q9Y2C5 497 aa13.13□□□□□ -0.31
CCDC42-201ENST00000293845 FNDC3AQ9Y2H6 1198 aaKnown RBP13.13□□□□□ -0.31
CCDC42-201ENST00000293845 MAD1L1Q9Y6D9 718 aa13.13□□□□□ -0.31
CCDC42-201ENST00000293845 TEX264Q9Y6I9 313 aa13.13□□□□□ -0.31
CCDC42-201ENST00000293845 SLC30A1Q9Y6M5 507 aa13.13□□□□□ -0.31
CCDC42-201ENST00000293845 ASCC3Q8N3C0 2202 aaKnown RBP13.13□□□□□ -0.31
CCDC42-201ENST00000293845 ARID1BQ8NFD5 2236 aaPredicted RBP13.12□□□□□ -0.31
CCDC42-201ENST00000293845 ZCWPW2A0A1B0GU75 182 aa13.12□□□□□ -0.31
CCDC42-201ENST00000293845 TMEM202A6NGA9 273 aa13.12□□□□□ -0.31
CCDC42-201ENST00000293845 INPP4BO15327 924 aa13.12□□□□□ -0.31
CCDC42-201ENST00000293845 GPR39O43194 453 aa13.12□□□□□ -0.31
CCDC42-201ENST00000293845 DFNA5O60443 496 aa13.12□□□□□ -0.31
CCDC42-201ENST00000293845 BANF1O75531 89 aa13.12□□□□□ -0.31
CCDC42-201ENST00000293845 TTC4O95801 387 aa13.12□□□□□ -0.31
CCDC42-201ENST00000293845 GOT2P00505 430 aaKnown RBP13.12□□□□□ -0.31
CCDC42-201ENST00000293845 ENGP17813 658 aa13.12□□□□□ -0.31
CCDC42-201ENST00000293845 ARNTP27540 789 aa13.12□□□□□ -0.31
CCDC42-201ENST00000293845 ECHS1P30084 290 aa13.12□□□□□ -0.31
CCDC42-201ENST00000293845 CA5AP35218 305 aa13.12□□□□□ -0.31
CCDC42-201ENST00000293845 RXRGP48443 463 aa13.12□□□□□ -0.31
CCDC42-201ENST00000293845 PRAMEP78395 509 aa13.12□□□□□ -0.31
CCDC42-201ENST00000293845 CACNG1Q06432 222 aa13.12□□□□□ -0.31
CCDC42-201ENST00000293845 PDIA2Q13087 525 aaKnown RBP13.12□□□□□ -0.31
CCDC42-201ENST00000293845 EIF2B5Q13144 721 aaKnown RBP13.12□□□□□ -0.31
CCDC42-201ENST00000293845 CUL1Q13616 776 aa13.12□□□□□ -0.31
CCDC42-201ENST00000293845 SF3A2Q15428 464 aaKnown RBP13.12□□□□□ -0.31
CCDC42-201ENST00000293845 ANKRD20A4Q4UJ75 823 aa13.12□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.8 ms