RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000289865.12

USP21-201, Transcript of ubiquitin specific peptidase 21, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene USP21, Length 2,195 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP21-201ENST00000289865 RPL26P61254 145 aaKnown RBP19.13■□□□□ 0.65
USP21-201ENST00000289865 LCP2Q13094 533 aa19.13■□□□□ 0.65
USP21-201ENST00000289865 PDK3Q15120 406 aa19.13■□□□□ 0.65
USP21-201ENST00000289865 SIDT2Q8NBJ9 832 aaKnown RBP19.13■□□□□ 0.65
USP21-201ENST00000289865 ATP6V1E2Q96A05 226 aa19.13■□□□□ 0.65
USP21-201ENST00000289865 FUBP1Q96AE4 644 aaKnown RBP19.13■□□□□ 0.65
USP21-201ENST00000289865 A0A0J9YYE9 177 aa19.12■□□□□ 0.65
USP21-201ENST00000289865 SYCE1LA8MT33 242 aa19.12■□□□□ 0.65
USP21-201ENST00000289865 NR5A2O00482 541 aa19.12■□□□□ 0.65
USP21-201ENST00000289865 STX7O15400 261 aaKnown RBP19.12■□□□□ 0.65
USP21-201ENST00000289865 VPS26AO75436 327 aa19.12■□□□□ 0.65
USP21-201ENST00000289865 LINC00032P0C843 101 aa19.12■□□□□ 0.65
USP21-201ENST00000289865 PKMP14618 531 aaKnown RBP19.12■□□□□ 0.65
USP21-201ENST00000289865 CTSL3PQ5NE16 218 aa19.12■□□□□ 0.65
USP21-201ENST00000289865 ANKS6Q68DC2 871 aa19.12■□□□□ 0.65
USP21-201ENST00000289865 DEFB128Q7Z7B8 93 aa19.12■□□□□ 0.65
USP21-201ENST00000289865 PHYKPLQ8IUZ5 450 aa19.12■□□□□ 0.65
USP21-201ENST00000289865 CARNMT1Q8N4J0 409 aa19.12■□□□□ 0.65
USP21-201ENST00000289865 NKAPQ8N5F7 415 aaKnown RBP19.12■□□□□ 0.65
USP21-201ENST00000289865 CATSPER1Q8NEC5 780 aa19.12■□□□□ 0.65
USP21-201ENST00000289865 IGSF21Q96ID5 467 aa19.12■□□□□ 0.65
USP21-201ENST00000289865 GBP5Q96PP8 586 aa19.12■□□□□ 0.65
USP21-201ENST00000289865 SLC39A3Q9BRY0 314 aa19.12■□□□□ 0.65
USP21-201ENST00000289865 TRMT6Q9UJA5 497 aaKnown RBP19.12■□□□□ 0.65
USP21-201ENST00000289865 VPS9D1Q9Y2B5 631 aa19.12■□□□□ 0.65
USP21-201ENST00000289865 YIPF1Q9Y548 306 aa19.12■□□□□ 0.65
USP21-201ENST00000289865 CRCPO75575 148 aa19.12■□□□□ 0.65
USP21-201ENST00000289865 MZF1P28698 734 aaPredicted RBP19.12■□□□□ 0.65
USP21-201ENST00000289865 TTPAP49638 278 aa19.12■□□□□ 0.65
USP21-201ENST00000289865 IL23RQ5VWK5 629 aa19.12■□□□□ 0.65
USP21-201ENST00000289865 HACD2Q6Y1H2 254 aa19.12■□□□□ 0.65
USP21-201ENST00000289865 LIN28BQ6ZN17 250 aaKnown RBP eCLIP19.12■□□□□ 0.65
USP21-201ENST00000289865 ADCY4Q8NFM4 1077 aa19.12■□□□□ 0.65
USP21-201ENST00000289865 ZNF461Q8TAF7 563 aa19.12■□□□□ 0.65
USP21-201ENST00000289865 TUBGCP3Q96CW5 907 aa19.12■□□□□ 0.65
USP21-201ENST00000289865 MYRFLQ96LU7 910 aa19.12■□□□□ 0.65
USP21-201ENST00000289865 TMEM181Q9P2C4 612 aa19.12■□□□□ 0.65
USP21-201ENST00000289865 CD300AQ9UGN4 299 aa19.12■□□□□ 0.65
USP21-201ENST00000289865 POLG2Q9UHN1 485 aa19.12■□□□□ 0.65
USP21-201ENST00000289865 MICAL3Q7RTP6 2002 aa19.11■□□□□ 0.65
USP21-201ENST00000289865 H0Y626 953 aa19.11■□□□□ 0.65
USP21-201ENST00000289865 TBL1XO60907 577 aa19.11■□□□□ 0.65
USP21-201ENST00000289865 RNASEH2AO75792 299 aaKnown RBP19.11■□□□□ 0.65
USP21-201ENST00000289865 RPS17P08708 135 aaKnown RBP19.11■□□□□ 0.65
USP21-201ENST00000289865 AGTR2P50052 363 aa19.11■□□□□ 0.65
USP21-201ENST00000289865 ECT2LQ008S8 904 aa19.11■□□□□ 0.65
USP21-201ENST00000289865 TWF1Q12792 350 aa19.11■□□□□ 0.65
USP21-201ENST00000289865 TLR1Q15399 786 aa19.11■□□□□ 0.65
USP21-201ENST00000289865 C8orf82Q6P1X6 216 aaPredicted RBP19.11■□□□□ 0.65
USP21-201ENST00000289865 NCEH1Q6PIU2 408 aa19.11■□□□□ 0.65
USP21-201ENST00000289865 RETREG3Q86VR2 466 aa19.11■□□□□ 0.65
USP21-201ENST00000289865 TICAM1Q8IUC6 712 aa19.11■□□□□ 0.65
USP21-201ENST00000289865 RNF168Q8IYW5 571 aaPredicted RBP19.11■□□□□ 0.65
USP21-201ENST00000289865 MIER2Q8N344 545 aa19.11■□□□□ 0.65
USP21-201ENST00000289865 TTC30BQ8N4P2 665 aa19.11■□□□□ 0.65
USP21-201ENST00000289865 TOP1MTQ969P6 601 aa19.11■□□□□ 0.65
USP21-201ENST00000289865 SLC24A3Q9HC58 644 aa19.11■□□□□ 0.65
USP21-201ENST00000289865 PFDN6O15212 129 aa19.1■□□□□ 0.65
USP21-201ENST00000289865 DNAJA2O60884 412 aa19.1■□□□□ 0.65
USP21-201ENST00000289865 C8BP07358 591 aa19.1■□□□□ 0.65
USP21-201ENST00000289865 MBL2P11226 248 aaPredicted RBP19.1■□□□□ 0.65
USP21-201ENST00000289865 LBPP18428 481 aa19.1■□□□□ 0.65
USP21-201ENST00000289865 SLC7A2P52569 658 aa19.1■□□□□ 0.65
USP21-201ENST00000289865 SAMD4BQ5PRF9 694 aaKnown RBP19.1■□□□□ 0.65
USP21-201ENST00000289865 HERC6Q8IVU3 1022 aa19.1■□□□□ 0.65
USP21-201ENST00000289865 ST13P4Q8IZP2 240 aaPredicted RBP19.1■□□□□ 0.65
USP21-201ENST00000289865 TMEM102Q8N9M5 508 aaPredicted RBP19.1■□□□□ 0.65
USP21-201ENST00000289865 TRAPPC9Q96Q05 1148 aa19.1■□□□□ 0.65
USP21-201ENST00000289865 LHX3Q9UBR4 397 aa19.1■□□□□ 0.65
USP21-201ENST00000289865 TIMM22Q9Y584 194 aa19.1■□□□□ 0.65
USP21-201ENST00000289865 BBIP1A8MTZ0 92 aa19.1■□□□□ 0.65
USP21-201ENST00000289865 C9JVG2 144 aa19.1■□□□□ 0.65
USP21-201ENST00000289865 ABLIM3O94929 683 aa19.1■□□□□ 0.65
USP21-201ENST00000289865 TSPAN12O95859 305 aa19.1■□□□□ 0.65
USP21-201ENST00000289865 MYCP01106 439 aaPredicted RBP19.1■□□□□ 0.65
USP21-201ENST00000289865 PIM1P11309 404 aaPredicted RBP19.1■□□□□ 0.65
USP21-201ENST00000289865 HGFP14210 728 aa19.1■□□□□ 0.65
USP21-201ENST00000289865 CCNHP51946 323 aaPredicted RBP19.1■□□□□ 0.65
USP21-201ENST00000289865 TRAP1Q12931 704 aaKnown RBP19.1■□□□□ 0.65
USP21-201ENST00000289865 CYP2R1Q6VVX0 501 aa19.1■□□□□ 0.65
USP21-201ENST00000289865 TAS2R42Q7RTR8 314 aa19.1■□□□□ 0.65
USP21-201ENST00000289865 PCYOX1LQ8NBM8 494 aa19.1■□□□□ 0.65
USP21-201ENST00000289865 EEF1AKMT1Q8WVE0 214 aa19.1■□□□□ 0.65
USP21-201ENST00000289865 ROPN1LQ96C74 230 aa19.1■□□□□ 0.65
USP21-201ENST00000289865 LINGO1Q96FE5 620 aa19.1■□□□□ 0.65
USP21-201ENST00000289865 SEZ6LQ9BYH1 1024 aa19.1■□□□□ 0.65
USP21-201ENST00000289865 IL1RL2Q9HB29 575 aa19.1■□□□□ 0.65
USP21-201ENST00000289865 SARS2Q9NP81 518 aaKnown RBP19.1■□□□□ 0.65
USP21-201ENST00000289865 FCF1Q9Y324 198 aaKnown RBP19.1■□□□□ 0.65
USP21-201ENST00000289865 TANC1Q9C0D5 1861 aa19.1■□□□□ 0.65
USP21-201ENST00000289865 GPR39O43194 453 aa19.09■□□□□ 0.65
USP21-201ENST00000289865 GNRH1P01148 92 aa19.09■□□□□ 0.65
USP21-201ENST00000289865 CHN2P52757 468 aa19.09■□□□□ 0.65
USP21-201ENST00000289865 DEFB115Q30KQ5 88 aa19.09■□□□□ 0.65
USP21-201ENST00000289865 VPS26BQ4G0F5 336 aa19.09■□□□□ 0.65
USP21-201ENST00000289865 PITRM1Q5JRX3 1037 aa19.09■□□□□ 0.65
USP21-201ENST00000289865 C6orf10Q5SRN2 563 aa19.09■□□□□ 0.65
USP21-201ENST00000289865 ATXN7L2Q5T6C5 722 aaPredicted RBP19.09■□□□□ 0.65
USP21-201ENST00000289865 UGT2A3Q6UWM9 527 aa19.09■□□□□ 0.65
USP21-201ENST00000289865 CD200R1Q8TD46 325 aa19.09■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39.5 ms