RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000288022.1

PDF-201, Transcript of peptide deformylase, mitochondrial, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PDF, Length 1,158 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDF-201ENST00000288022 CCDC89Q8N998 374 aa24.94■■□□□ 1.58
PDF-201ENST00000288022 KYQ8NBH2 561 aa24.94■■□□□ 1.58
PDF-201ENST00000288022 DPEP2Q9H4A9 486 aa24.94■■□□□ 1.58
PDF-201ENST00000288022 LRRC40Q9H9A6 602 aa24.94■■□□□ 1.58
PDF-201ENST00000288022 ARFGAP3Q9NP61 516 aa24.94■■□□□ 1.58
PDF-201ENST00000288022 IL17CQ9P0M4 197 aa24.94■■□□□ 1.58
PDF-201ENST00000288022 VPS18Q9P253 973 aa24.94■■□□□ 1.58
PDF-201ENST00000288022 ZNHIT2Q9UHR6 403 aa24.94■■□□□ 1.58
PDF-201ENST00000288022 PADI4Q9UM07 663 aa24.94■■□□□ 1.58
PDF-201ENST00000288022 SCN8AQ9UQD0 1980 aa24.94■■□□□ 1.58
PDF-201ENST00000288022 FAM149AA5PLN7 773 aa24.93■■□□□ 1.58
PDF-201ENST00000288022 B4DGG1 531 aa24.93■■□□□ 1.58
PDF-201ENST00000288022 STX7O15400 261 aaKnown RBP24.93■■□□□ 1.58
PDF-201ENST00000288022 PSMD3O43242 534 aa24.93■■□□□ 1.58
PDF-201ENST00000288022 KIF5CO60282 957 aa24.93■■□□□ 1.58
PDF-201ENST00000288022 SPAM1P38567 509 aa24.93■■□□□ 1.58
PDF-201ENST00000288022 ADCY8P40145 1251 aa24.93■■□□□ 1.58
PDF-201ENST00000288022 ZDHHC20Q5W0Z9 365 aa24.93■■□□□ 1.58
PDF-201ENST00000288022 PHYKPLQ8IUZ5 450 aa24.93■■□□□ 1.58
PDF-201ENST00000288022 SLC35F6Q8N357 371 aa24.93■■□□□ 1.58
PDF-201ENST00000288022 PDCD7Q8N8D1 485 aaKnown RBP24.93■■□□□ 1.58
PDF-201ENST00000288022 GPBAR1Q8TDU6 330 aa24.93■■□□□ 1.58
PDF-201ENST00000288022 SCARF2Q96GP6 870 aaPredicted RBP24.93■■□□□ 1.58
PDF-201ENST00000288022 ABCG4Q9H172 646 aa24.93■■□□□ 1.58
PDF-201ENST00000288022 ZKSCAN5Q9Y2L8 839 aa24.93■■□□□ 1.58
PDF-201ENST00000288022 ARL5AQ9Y689 179 aa24.93■■□□□ 1.58
PDF-201ENST00000288022 PTPRBP23467 1997 aa24.93■■□□□ 1.58
PDF-201ENST00000288022 EME2A4GXA9 379 aaPredicted RBP24.92■■□□□ 1.58
PDF-201ENST00000288022 C2orf81A6NN90 581 aa24.92■■□□□ 1.58
PDF-201ENST00000288022 GP1BAP07359 652 aa24.92■■□□□ 1.58
PDF-201ENST00000288022 AK4P27144 223 aaPredicted RBP24.92■■□□□ 1.58
PDF-201ENST00000288022 CTBSQ01459 385 aa24.92■■□□□ 1.58
PDF-201ENST00000288022 TAF1AQ15573 450 aaPredicted RBP24.92■■□□□ 1.58
PDF-201ENST00000288022 PYCR3Q53H96 274 aa24.92■■□□□ 1.58
PDF-201ENST00000288022 HES3Q5TGS1 186 aa24.92■■□□□ 1.58
PDF-201ENST00000288022 SLC30A9Q6PML9 568 aa24.92■■□□□ 1.58
PDF-201ENST00000288022 FAM151BQ6UXP7 276 aa24.92■■□□□ 1.58
PDF-201ENST00000288022 TMPRSS12Q86WS5 348 aa24.92■■□□□ 1.58
PDF-201ENST00000288022 MARCH9Q86YJ5 346 aa24.92■■□□□ 1.58
PDF-201ENST00000288022 KLHDC8BQ8IXV7 354 aa24.92■■□□□ 1.58
PDF-201ENST00000288022 NAT6Q93015 286 aa24.92■■□□□ 1.58
PDF-201ENST00000288022 GLYATL1Q969I3 302 aa24.92■■□□□ 1.58
PDF-201ENST00000288022 PRKAB1Q9Y478 270 aa24.92■■□□□ 1.58
PDF-201ENST00000288022 FAM221BA6H8Z2 402 aa24.91■■□□□ 1.58
PDF-201ENST00000288022 PPFIA2O75334 1257 aa24.91■■□□□ 1.58
PDF-201ENST00000288022 CRTAMO95727 393 aa24.91■■□□□ 1.58
PDF-201ENST00000288022 JUPP14923 745 aa24.91■■□□□ 1.58
PDF-201ENST00000288022 LPOP22079 712 aaPredicted RBP24.91■■□□□ 1.58
PDF-201ENST00000288022 LMAN1P49257 510 aa24.91■■□□□ 1.58
PDF-201ENST00000288022 ZNF648Q5T619 568 aaPredicted RBP24.91■■□□□ 1.58
PDF-201ENST00000288022 KCTD11Q693B1 232 aa24.91■■□□□ 1.58
PDF-201ENST00000288022 DENND5AQ6IQ26 1287 aa24.91■■□□□ 1.58
PDF-201ENST00000288022 GSTA5Q7RTV2 222 aa24.91■■□□□ 1.58
PDF-201ENST00000288022 NRROSQ86YC3 692 aa24.91■■□□□ 1.58
PDF-201ENST00000288022 GDAP1Q8TB36 358 aa24.91■■□□□ 1.58
PDF-201ENST00000288022 MAPK15Q8TD08 544 aa24.91■■□□□ 1.58
PDF-201ENST00000288022 PBKQ96KB5 322 aa24.91■■□□□ 1.58
PDF-201ENST00000288022 CNTNAP3BQ96NU0 1288 aa24.91■■□□□ 1.58
PDF-201ENST00000288022 CNTNAP3Q9BZ76 1288 aa24.91■■□□□ 1.58
PDF-201ENST00000288022 OR2AG1Q9H205 316 aa24.91■■□□□ 1.58
PDF-201ENST00000288022 ARNT2Q9HBZ2 717 aa24.91■■□□□ 1.58
PDF-201ENST00000288022 IL26Q9NPH9 171 aa24.91■■□□□ 1.58
PDF-201ENST00000288022 IGF2BP1Q9NZI8 577 aaKnown RBP eCLIP24.91■■□□□ 1.58
PDF-201ENST00000288022 TAAR2Q9P1P5 351 aa24.91■■□□□ 1.58
PDF-201ENST00000288022 FEZ2Q9UHY8 353 aaPredicted RBP24.91■■□□□ 1.58
PDF-201ENST00000288022 PLEKHM1Q9Y4G2 1056 aa24.91■■□□□ 1.58
PDF-201ENST00000288022 GLYATL1P3A0A0U1RQE8 302 aa24.9■■□□□ 1.58
PDF-201ENST00000288022 E7EVH7 732 aa24.9■■□□□ 1.58
PDF-201ENST00000288022 DNAJC6O75061 913 aa24.9■■□□□ 1.58
PDF-201ENST00000288022 AP2A1O95782 977 aa24.9■■□□□ 1.58
PDF-201ENST00000288022 ETS1P14921 441 aa24.9■■□□□ 1.58
PDF-201ENST00000288022 FDFT1P37268 417 aa24.9■■□□□ 1.58
PDF-201ENST00000288022 ACTR1BP42025 376 aa24.9■■□□□ 1.58
PDF-201ENST00000288022 ACTR1AP61163 376 aa24.9■■□□□ 1.58
PDF-201ENST00000288022 INSM1Q01101 510 aaPredicted RBP24.9■■□□□ 1.58
PDF-201ENST00000288022 PTPRCAPQ14761 206 aa24.9■■□□□ 1.58
PDF-201ENST00000288022 ATP13A5Q4VNC0 1218 aa24.9■■□□□ 1.58
PDF-201ENST00000288022 PERM1Q5SV97 790 aa24.9■■□□□ 1.58
PDF-201ENST00000288022 CCNI2Q6ZMN8 369 aaPredicted RBP24.9■■□□□ 1.58
PDF-201ENST00000288022 PRUNE1Q86TP1 453 aa24.9■■□□□ 1.58
PDF-201ENST00000288022 BRSK1Q8TDC3 778 aa24.9■■□□□ 1.58
PDF-201ENST00000288022 RMI1Q9H9A7 625 aa24.9■■□□□ 1.58
PDF-201ENST00000288022 ETNK1Q9HBU6 452 aa24.9■■□□□ 1.58
PDF-201ENST00000288022 TRIM39Q9HCM9 518 aa24.9■■□□□ 1.58
PDF-201ENST00000288022 SPATS2LQ9NUQ6 558 aaKnown RBP24.9■■□□□ 1.58
PDF-201ENST00000288022 ATXN10Q9UBB4 475 aa24.9■■□□□ 1.58
PDF-201ENST00000288022 OPA1O60313 960 aa24.89■■□□□ 1.58
PDF-201ENST00000288022 PEX6Q13608 980 aa24.89■■□□□ 1.58
PDF-201ENST00000288022 LRP8Q14114 963 aa24.89■■□□□ 1.58
PDF-201ENST00000288022 CHRNA6Q15825 494 aa24.89■■□□□ 1.58
PDF-201ENST00000288022 DRICH1Q6PGQ1 229 aaPredicted RBP24.89■■□□□ 1.58
PDF-201ENST00000288022 CHST15Q7LFX5 561 aaPredicted RBP24.89■■□□□ 1.58
PDF-201ENST00000288022 OR4K2Q8NGD2 314 aa24.89■■□□□ 1.58
PDF-201ENST00000288022 ZDHHC1Q8WTX9 485 aa24.89■■□□□ 1.58
PDF-201ENST00000288022 RAB6BQ9NRW1 208 aa24.89■■□□□ 1.58
PDF-201ENST00000288022 HOMER3Q9NSC5 361 aa24.89■■□□□ 1.58
PDF-201ENST00000288022 PAK5Q9P286 719 aa24.89■■□□□ 1.58
PDF-201ENST00000288022 DRG1Q9Y295 367 aaKnown RBP24.89■■□□□ 1.58
PDF-201ENST00000288022 KCTD3Q9Y597 815 aa24.89■■□□□ 1.58
PDF-201ENST00000288022 USP27XA6NNY8 438 aa24.88■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 42.5 ms