RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000265339.6

UBE2B-201, Transcript of ubiquitin conjugating enzyme E2 B, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene UBE2B, Length 2,515 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2B-201ENST00000265339 AAR2Q9Y312 384 aaKnown RBP20.28■□□□□ 0.84
UBE2B-201ENST00000265339 SPAG6O75602 509 aa20.28■□□□□ 0.84
UBE2B-201ENST00000265339 KRT37O76014 449 aa20.28■□□□□ 0.84
UBE2B-201ENST00000265339 CTSOP43234 321 aaPredicted RBP20.28■□□□□ 0.84
UBE2B-201ENST00000265339 ADRM1Q16186 407 aa20.28■□□□□ 0.84
UBE2B-201ENST00000265339 ALG1LQ6GMV1 187 aa20.28■□□□□ 0.84
UBE2B-201ENST00000265339 PGM2L1Q6PCE3 622 aa20.28■□□□□ 0.84
UBE2B-201ENST00000265339 SEMA3CQ99985 751 aa20.28■□□□□ 0.84
UBE2B-201ENST00000265339 TRIM56Q9BRZ2 755 aaKnown RBP20.28■□□□□ 0.84
UBE2B-201ENST00000265339 LRRC40Q9H9A6 602 aa20.28■□□□□ 0.84
UBE2B-201ENST00000265339 EPS15L1Q9UBC2 864 aa20.28■□□□□ 0.84
UBE2B-201ENST00000265339 FCF1Q9Y324 198 aaKnown RBP20.28■□□□□ 0.84
UBE2B-201ENST00000265339 K7ERQ8 282 aa20.27■□□□□ 0.84
UBE2B-201ENST00000265339 ECI2O75521 394 aa20.27■□□□□ 0.84
UBE2B-201ENST00000265339 CD86P42081 329 aa20.27■□□□□ 0.84
UBE2B-201ENST00000265339 GEMP55040 296 aa20.27■□□□□ 0.84
UBE2B-201ENST00000265339 KCTD21Q4G0X4 260 aa20.27■□□□□ 0.84
UBE2B-201ENST00000265339 INO80DQ53TQ3 878 aaPredicted RBP20.27■□□□□ 0.84
UBE2B-201ENST00000265339 RETSATQ6NUM9 610 aa20.27■□□□□ 0.84
UBE2B-201ENST00000265339 PACS1Q6VY07 963 aa20.27■□□□□ 0.84
UBE2B-201ENST00000265339 ERI1Q8IV48 349 aaKnown RBP20.27■□□□□ 0.84
UBE2B-201ENST00000265339 YAF2Q8IY57 180 aa20.27■□□□□ 0.84
UBE2B-201ENST00000265339 DEFB107AQ8IZN7 70 aa20.27■□□□□ 0.84
UBE2B-201ENST00000265339 IPMKQ8NFU5 416 aa20.27■□□□□ 0.84
UBE2B-201ENST00000265339 XAB2Q9HCS7 855 aaKnown RBP20.27■□□□□ 0.84
UBE2B-201ENST00000265339 SMYD2Q9NRG4 433 aa20.27■□□□□ 0.84
UBE2B-201ENST00000265339 SDR42E2A6NKP2 422 aa20.27■□□□□ 0.84
UBE2B-201ENST00000265339 PMPCBO75439 489 aa20.27■□□□□ 0.84
UBE2B-201ENST00000265339 FAM58BPP0C7Q3 252 aa20.27■□□□□ 0.84
UBE2B-201ENST00000265339 COL6A2P12110 1019 aa20.27■□□□□ 0.84
UBE2B-201ENST00000265339 ENTPD1P49961 510 aa20.27■□□□□ 0.84
UBE2B-201ENST00000265339 SERPINH1P50454 418 aaKnown RBP20.27■□□□□ 0.84
UBE2B-201ENST00000265339 PSMD7P51665 324 aa20.27■□□□□ 0.84
UBE2B-201ENST00000265339 APOFQ13790 326 aa20.27■□□□□ 0.84
UBE2B-201ENST00000265339 SKIV2LQ15477 1246 aaKnown RBP20.27■□□□□ 0.84
UBE2B-201ENST00000265339 KIAA0907Q7Z7F0 614 aaPredicted RBP20.27■□□□□ 0.84
UBE2B-201ENST00000265339 ADIPOR2Q86V24 386 aa20.27■□□□□ 0.84
UBE2B-201ENST00000265339 NUDCD3Q8IVD9 361 aa20.27■□□□□ 0.84
UBE2B-201ENST00000265339 ETFBKMTQ8IXQ9 262 aa20.27■□□□□ 0.84
UBE2B-201ENST00000265339 ARL10Q8N8L6 244 aa20.27■□□□□ 0.84
UBE2B-201ENST00000265339 GUCD1Q96NT3 240 aa20.27■□□□□ 0.84
UBE2B-201ENST00000265339 PPP1R2P1Q96PQ5 205 aa20.27■□□□□ 0.84
UBE2B-201ENST00000265339 APOL2Q9BQE5 337 aa20.27■□□□□ 0.84
UBE2B-201ENST00000265339 C20orf27Q9GZN8 174 aa20.27■□□□□ 0.84
UBE2B-201ENST00000265339 PLAC1Q9HBJ0 212 aa20.27■□□□□ 0.84
UBE2B-201ENST00000265339 PLGRKTQ9HBL7 147 aa20.27■□□□□ 0.84
UBE2B-201ENST00000265339 RAB26Q9ULW5 256 aa20.27■□□□□ 0.84
UBE2B-201ENST00000265339 DOLKQ9UPQ8 538 aa20.27■□□□□ 0.84
UBE2B-201ENST00000265339 RFPL1O75677 317 aa20.26■□□□□ 0.83
UBE2B-201ENST00000265339 CPA3P15088 417 aa20.26■□□□□ 0.83
UBE2B-201ENST00000265339 HALP42357 657 aa20.26■□□□□ 0.83
UBE2B-201ENST00000265339 GEN1Q17RS7 908 aa20.26■□□□□ 0.83
UBE2B-201ENST00000265339 C6orf52Q5T4I8 152 aa20.26■□□□□ 0.83
UBE2B-201ENST00000265339 TMEM215Q68D42 235 aa20.26■□□□□ 0.83
UBE2B-201ENST00000265339 TMEM53Q6P2H8 277 aa20.26■□□□□ 0.83
UBE2B-201ENST00000265339 KDELC1Q6UW63 502 aa20.26■□□□□ 0.83
UBE2B-201ENST00000265339 RNF135Q8IUD6 432 aa20.26■□□□□ 0.83
UBE2B-201ENST00000265339 PQLC1Q8N2U9 271 aa20.26■□□□□ 0.83
UBE2B-201ENST00000265339 OR52K1Q8NGK4 314 aa20.26■□□□□ 0.83
UBE2B-201ENST00000265339 TADA1Q96BN2 335 aa20.26■□□□□ 0.83
UBE2B-201ENST00000265339 MRGPRX2Q96LB1 330 aa20.26■□□□□ 0.83
UBE2B-201ENST00000265339 LHX3Q9UBR4 397 aa20.26■□□□□ 0.83
UBE2B-201ENST00000265339 KIAA1549LQ6ZVL6 1849 aa20.26■□□□□ 0.83
UBE2B-201ENST00000265339 HTR3EA5X5Y0 456 aa20.26■□□□□ 0.83
UBE2B-201ENST00000265339 SMAD6O43541 496 aaKnown RBP20.26■□□□□ 0.83
UBE2B-201ENST00000265339 CBFA2T3O75081 653 aa20.26■□□□□ 0.83
UBE2B-201ENST00000265339 TULP3O75386 442 aa20.26■□□□□ 0.83
UBE2B-201ENST00000265339 TFPTP0C1Z6 253 aa20.26■□□□□ 0.83
UBE2B-201ENST00000265339 CISD3P0C7P0 127 aa20.26■□□□□ 0.83
UBE2B-201ENST00000265339 MLNP12872 115 aa20.26■□□□□ 0.83
UBE2B-201ENST00000265339 CR2P20023 1033 aa20.26■□□□□ 0.83
UBE2B-201ENST00000265339 DGKGP49619 791 aa20.26■□□□□ 0.83
UBE2B-201ENST00000265339 STK19P49842 368 aaPredicted RBP20.26■□□□□ 0.83
UBE2B-201ENST00000265339 DNAJC14Q6Y2X3 702 aaPredicted RBP20.26■□□□□ 0.83
UBE2B-201ENST00000265339 MTSS1LQ765P7 747 aa20.26■□□□□ 0.83
UBE2B-201ENST00000265339 KBTBD6Q86V97 674 aa20.26■□□□□ 0.83
UBE2B-201ENST00000265339 HOMEZQ8IX15 550 aa20.26■□□□□ 0.83
UBE2B-201ENST00000265339 RAB3IL1Q8TBN0 382 aa20.26■□□□□ 0.83
UBE2B-201ENST00000265339 ACTRT2Q8TDY3 377 aa20.26■□□□□ 0.83
UBE2B-201ENST00000265339 RPL10LQ96L21 214 aaKnown RBP20.26■□□□□ 0.83
UBE2B-201ENST00000265339 GTSE1Q9NYZ3 720 aa20.26■□□□□ 0.83
UBE2B-201ENST00000265339 PSMD3O43242 534 aa20.25■□□□□ 0.83
UBE2B-201ENST00000265339 SERPINB7O75635 380 aa20.25■□□□□ 0.83
UBE2B-201ENST00000265339 GDI1P31150 447 aa20.25■□□□□ 0.83
UBE2B-201ENST00000265339 ADRA1AP35348 466 aa20.25■□□□□ 0.83
UBE2B-201ENST00000265339 RELAQ04206 551 aa20.25■□□□□ 0.83
UBE2B-201ENST00000265339 CBLBQ13191 982 aa20.25■□□□□ 0.83
UBE2B-201ENST00000265339 SMAD4Q13485 552 aaKnown RBP20.25■□□□□ 0.83
UBE2B-201ENST00000265339 PEX6Q13608 980 aa20.25■□□□□ 0.83
UBE2B-201ENST00000265339 HTR4Q13639 388 aa20.25■□□□□ 0.83
UBE2B-201ENST00000265339 RUNX3Q13761 415 aa20.25■□□□□ 0.83
UBE2B-201ENST00000265339 PDCD4Q53EL6 469 aaKnown RBP20.25■□□□□ 0.83
UBE2B-201ENST00000265339 ZCCHC23Q6ZST2 131 aa20.25■□□□□ 0.83
UBE2B-201ENST00000265339 MPP5Q8N3R9 675 aa20.25■□□□□ 0.83
UBE2B-201ENST00000265339 NSMCE3Q96MG7 304 aa20.25■□□□□ 0.83
UBE2B-201ENST00000265339 TBL1YQ9BQ87 522 aa20.25■□□□□ 0.83
UBE2B-201ENST00000265339 FICDQ9BVA6 458 aa20.25■□□□□ 0.83
UBE2B-201ENST00000265339 CASS4Q9NQ75 786 aa20.25■□□□□ 0.83
UBE2B-201ENST00000265339 MIA3Q5JRA6 1907 aa20.25■□□□□ 0.83
UBE2B-201ENST00000265339 A0A1B0GTW7 788 aa20.25■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.6 ms