RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000263897.9

USE1-201, Transcript of unconventional SNARE in the ER 1, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene USE1, Length 843 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USE1-201ENST00000263897 ACTR1BP42025 376 aa15.95■□□□□ 0.14
USE1-201ENST00000263897 MLLT3P42568 568 aaPredicted RBP15.95■□□□□ 0.14
USE1-201ENST00000263897 INHBCP55103 352 aa15.95■□□□□ 0.14
USE1-201ENST00000263897 ACTR1AP61163 376 aa15.95■□□□□ 0.14
USE1-201ENST00000263897 COPS2P61201 443 aa15.95■□□□□ 0.14
USE1-201ENST00000263897 LRP8Q14114 963 aa15.95■□□□□ 0.14
USE1-201ENST00000263897 PPP2R5EQ16537 467 aa15.95■□□□□ 0.14
USE1-201ENST00000263897 FOXR1Q6PIV2 292 aa15.95■□□□□ 0.14
USE1-201ENST00000263897 BBS12Q6ZW61 710 aa15.95■□□□□ 0.14
USE1-201ENST00000263897 PID1Q7Z2X4 250 aa15.95■□□□□ 0.14
USE1-201ENST00000263897 ZNF438Q7Z4V0 828 aa15.95■□□□□ 0.14
USE1-201ENST00000263897 GALNT13Q8IUC8 556 aa15.95■□□□□ 0.14
USE1-201ENST00000263897 GPR26Q8NDV2 337 aa15.95■□□□□ 0.14
USE1-201ENST00000263897 PATE1Q8WXA2 126 aa15.95■□□□□ 0.14
USE1-201ENST00000263897 TMEM74Q96NL1 305 aa15.95■□□□□ 0.14
USE1-201ENST00000263897 SRPK1Q96SB4 655 aaKnown RBP15.95■□□□□ 0.14
USE1-201ENST00000263897 GPR63Q9BZJ6 419 aa15.95■□□□□ 0.14
USE1-201ENST00000263897 FOXP3Q9BZS1 431 aa15.95■□□□□ 0.14
USE1-201ENST00000263897 STRADBQ9C0K7 418 aa15.95■□□□□ 0.14
USE1-201ENST00000263897 LACRTQ9GZZ8 138 aa15.95■□□□□ 0.14
USE1-201ENST00000263897 EPB41L5Q9HCM4 733 aa15.95■□□□□ 0.14
USE1-201ENST00000263897 RAD18Q9NS91 495 aa15.95■□□□□ 0.14
USE1-201ENST00000263897 FAM153AQ9UHL3 310 aa15.95■□□□□ 0.14
USE1-201ENST00000263897 ATXN7L1Q9ULK2 861 aaPredicted RBP15.95■□□□□ 0.14
USE1-201ENST00000263897 OAS3Q9Y6K5 1087 aaKnown RBP15.95■□□□□ 0.14
USE1-201ENST00000263897 LOC285095A0A1B0GVY8 99 aa15.94■□□□□ 0.14
USE1-201ENST00000263897 RHPN2P1A8MT19 583 aa15.94■□□□□ 0.14
USE1-201ENST00000263897 CDRT15L2A8MXV6 281 aa15.94■□□□□ 0.14
USE1-201ENST00000263897 HACD1B0YJ81 288 aa15.94■□□□□ 0.14
USE1-201ENST00000263897 TNFSF15O95150 251 aa15.94■□□□□ 0.14
USE1-201ENST00000263897 EPOP01588 193 aa15.94■□□□□ 0.14
USE1-201ENST00000263897 NFKB1P19838 968 aa15.94■□□□□ 0.14
USE1-201ENST00000263897 ALDH4A1P30038 563 aa15.94■□□□□ 0.14
USE1-201ENST00000263897 CTNNA1P35221 906 aaKnown RBP15.94■□□□□ 0.14
USE1-201ENST00000263897 NAP1L1P55209 391 aaKnown RBP15.94■□□□□ 0.14
USE1-201ENST00000263897 ZFP36L1Q07352 338 aaKnown RBP15.94■□□□□ 0.14
USE1-201ENST00000263897 EIF3IQ13347 325 aaKnown RBP15.94■□□□□ 0.14
USE1-201ENST00000263897 XRCC4Q13426 336 aa15.94■□□□□ 0.14
USE1-201ENST00000263897 NR1D2Q14995 579 aa15.94■□□□□ 0.14
USE1-201ENST00000263897 KDELC1Q6UW63 502 aa15.94■□□□□ 0.14
USE1-201ENST00000263897 RAB11FIP2Q7L804 512 aa15.94■□□□□ 0.14
USE1-201ENST00000263897 SPACA3Q8IXA5 215 aa15.94■□□□□ 0.14
USE1-201ENST00000263897 ZNF567Q8N184 647 aa15.94■□□□□ 0.14
USE1-201ENST00000263897 HTR3CQ8WXA8 447 aa15.94■□□□□ 0.14
USE1-201ENST00000263897 HAUS1Q96CS2 278 aa15.94■□□□□ 0.14
USE1-201ENST00000263897 FCRL5Q96RD9 977 aa15.94■□□□□ 0.14
USE1-201ENST00000263897 SPATA16Q9BXB7 569 aa15.94■□□□□ 0.14
USE1-201ENST00000263897 RMI1Q9H9A7 625 aa15.94■□□□□ 0.14
USE1-201ENST00000263897 EFR3BQ9Y2G0 817 aa15.94■□□□□ 0.14
USE1-201ENST00000263897 ZNF711Q9Y462 761 aa15.94■□□□□ 0.14
USE1-201ENST00000263897 AHCTF1Q8WYP5 2266 aa15.93■□□□□ 0.14
USE1-201ENST00000263897 APOC4-APOC2K7ER74 178 aa15.93■□□□□ 0.14
USE1-201ENST00000263897 PLD2O14939 933 aa15.93■□□□□ 0.14
USE1-201ENST00000263897 PPM1DO15297 605 aa15.93■□□□□ 0.14
USE1-201ENST00000263897 PJA2O43164 708 aa15.93■□□□□ 0.14
USE1-201ENST00000263897 ZW10O43264 779 aa15.93■□□□□ 0.14
USE1-201ENST00000263897 APOC2P02655 101 aa15.93■□□□□ 0.14
USE1-201ENST00000263897 GPR3P46089 330 aa15.93■□□□□ 0.14
USE1-201ENST00000263897 WNT3AP56704 352 aa15.93■□□□□ 0.14
USE1-201ENST00000263897 OR1D5P58170 312 aa15.93■□□□□ 0.14
USE1-201ENST00000263897 DCDC1P59894 354 aa15.93■□□□□ 0.14
USE1-201ENST00000263897 TLE3Q04726 772 aa15.93■□□□□ 0.14
USE1-201ENST00000263897 BIRC2Q13490 618 aa15.93■□□□□ 0.14
USE1-201ENST00000263897 CHST15Q7LFX5 561 aaPredicted RBP15.93■□□□□ 0.14
USE1-201ENST00000263897 TMPRSS9Q7Z410 1059 aa15.93■□□□□ 0.14
USE1-201ENST00000263897 PIM3Q86V86 326 aa15.93■□□□□ 0.14
USE1-201ENST00000263897 FBXO39Q8N4B4 442 aa15.93■□□□□ 0.14
USE1-201ENST00000263897 NAF1Q96HR8 494 aaKnown RBP15.93■□□□□ 0.14
USE1-201ENST00000263897 QKIQ96PU8 341 aaKnown RBP eCLIP15.93■□□□□ 0.14
USE1-201ENST00000263897 BAG1Q99933 345 aaPredicted RBP15.93■□□□□ 0.14
USE1-201ENST00000263897 ZSCAN5AQ9BUG6 496 aa15.93■□□□□ 0.14
USE1-201ENST00000263897 PRORYQ9H606 182 aa15.93■□□□□ 0.14
USE1-201ENST00000263897 KLHL8Q9P2G9 620 aaPredicted RBP15.93■□□□□ 0.14
USE1-201ENST00000263897 NFKBIL1Q9UBC1 381 aaPredicted RBP15.93■□□□□ 0.14
USE1-201ENST00000263897 TRHDEQ9UKU6 1024 aa15.93■□□□□ 0.14
USE1-201ENST00000263897 PRKAB1Q9Y478 270 aa15.93■□□□□ 0.14
USE1-201ENST00000263897 SPO11Q9Y5K1 396 aa15.93■□□□□ 0.14
USE1-201ENST00000263897 PCYT1BQ9Y5K3 369 aaPredicted RBP15.93■□□□□ 0.14
USE1-201ENST00000263897 CCDC66A2RUB6 948 aa15.92■□□□□ 0.14
USE1-201ENST00000263897 AURKAO14965 403 aa15.92■□□□□ 0.14
USE1-201ENST00000263897 NUAK1O60285 661 aa15.92■□□□□ 0.14
USE1-201ENST00000263897 SLC25A14O95258 325 aaPredicted RBP15.92■□□□□ 0.14
USE1-201ENST00000263897 CPNE6O95741 557 aa15.92■□□□□ 0.14
USE1-201ENST00000263897 ITGA2BP08514 1039 aa15.92■□□□□ 0.14
USE1-201ENST00000263897 BPIP17213 487 aa15.92■□□□□ 0.14
USE1-201ENST00000263897 CTNNA2P26232 953 aa15.92■□□□□ 0.14
USE1-201ENST00000263897 UGT1A5P35504 534 aa15.92■□□□□ 0.14
USE1-201ENST00000263897 VAV2P52735 878 aa15.92■□□□□ 0.14
USE1-201ENST00000263897 AMZ1Q400G9 498 aa15.92■□□□□ 0.14
USE1-201ENST00000263897 ALS2CLQ60I27 953 aa15.92■□□□□ 0.14
USE1-201ENST00000263897 USP53Q70EK8 1073 aa15.92■□□□□ 0.14
USE1-201ENST00000263897 CLEC14AQ86T13 490 aa15.92■□□□□ 0.14
USE1-201ENST00000263897 TRAM1L1Q8N609 369 aa15.92■□□□□ 0.14
USE1-201ENST00000263897 ACRBPQ8NEB7 543 aa15.92■□□□□ 0.14
USE1-201ENST00000263897 KCNE4Q8WWG9 221 aa15.92■□□□□ 0.14
USE1-201ENST00000263897 OXNAD1Q96HP4 312 aaPredicted RBP15.92■□□□□ 0.14
USE1-201ENST00000263897 MRGPRX2Q96LB1 330 aa15.92■□□□□ 0.14
USE1-201ENST00000263897 HERPUD2Q9BSE4 406 aa15.92■□□□□ 0.14
USE1-201ENST00000263897 OSBPL8Q9BZF1 889 aa15.92■□□□□ 0.14
USE1-201ENST00000263897 DPH1Q9BZG8 443 aa15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38.9 ms