RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000262460.4

GINS1-201, Transcript of GINS complex subunit 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene GINS1, Length 3,249 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GINS1-201ENST00000262460 KRT80Q6KB66 452 aa8.63□□□□□ -1.03
GINS1-201ENST00000262460 TBPL2Q6SJ96 375 aa8.63□□□□□ -1.03
GINS1-201ENST00000262460 MRPL10Q7Z7H8 261 aaKnown RBP8.63□□□□□ -1.03
GINS1-201ENST00000262460 COLGALT2Q8IYK4 626 aa8.63□□□□□ -1.03
GINS1-201ENST00000262460 TRIML2Q8N7C3 387 aa8.63□□□□□ -1.03
GINS1-201ENST00000262460 DBF4BQ8NFT6 615 aa8.63□□□□□ -1.03
GINS1-201ENST00000262460 ASB9Q96DX5 294 aa8.63□□□□□ -1.03
GINS1-201ENST00000262460 ITCHQ96J02 903 aa8.63□□□□□ -1.03
GINS1-201ENST00000262460 PLEKHG4BQ96PX9 1271 aa8.63□□□□□ -1.03
GINS1-201ENST00000262460 TRAPPC9Q96Q05 1148 aa8.63□□□□□ -1.03
GINS1-201ENST00000262460 SLC22A12Q96S37 553 aa8.63□□□□□ -1.03
GINS1-201ENST00000262460 ERVK-6Q9BXR3 956 aa8.63□□□□□ -1.03
GINS1-201ENST00000262460 NAA50Q9GZZ1 169 aaKnown RBP8.63□□□□□ -1.03
GINS1-201ENST00000262460 RNF38Q9H0F5 515 aa8.63□□□□□ -1.03
GINS1-201ENST00000262460 UNC93B1Q9H1C4 597 aa8.63□□□□□ -1.03
GINS1-201ENST00000262460 VCX3BQ9H321 246 aa8.63□□□□□ -1.03
GINS1-201ENST00000262460 MTPAPQ9NVV4 582 aaKnown RBP eCLIP8.63□□□□□ -1.03
GINS1-201ENST00000262460 AFF4Q9UHB7 1163 aaKnown RBP8.63□□□□□ -1.03
GINS1-201ENST00000262460 ZNHIT2Q9UHR6 403 aa8.63□□□□□ -1.03
GINS1-201ENST00000262460 MID2Q9UJV3 735 aa8.63□□□□□ -1.03
GINS1-201ENST00000262460 SQORQ9Y6N5 450 aa8.63□□□□□ -1.03
GINS1-201ENST00000262460 TRPM7Q96QT4 1865 aa8.62□□□□□ -1.03
GINS1-201ENST00000262460 FXYD1O00168 92 aa8.62□□□□□ -1.03
GINS1-201ENST00000262460 ANGPT2O15123 496 aa8.62□□□□□ -1.03
GINS1-201ENST00000262460 MAN1A2O60476 641 aa8.62□□□□□ -1.03
GINS1-201ENST00000262460 H2AFYO75367 372 aaKnown RBP8.62□□□□□ -1.03
GINS1-201ENST00000262460 RSL1D1O76021 490 aaKnown RBP8.62□□□□□ -1.03
GINS1-201ENST00000262460 CYP11A1P05108 521 aa8.62□□□□□ -1.03
GINS1-201ENST00000262460 TFPTP0C1Z6 253 aa8.62□□□□□ -1.03
GINS1-201ENST00000262460 ATF6P18850 670 aa8.62□□□□□ -1.03
GINS1-201ENST00000262460 TACR2P21452 398 aa8.62□□□□□ -1.03
GINS1-201ENST00000262460 MZF1P28698 734 aaPredicted RBP8.62□□□□□ -1.03
GINS1-201ENST00000262460 CLCN5P51795 746 aa8.62□□□□□ -1.03
GINS1-201ENST00000262460 ATN1P54259 1190 aaPredicted RBP8.62□□□□□ -1.03
GINS1-201ENST00000262460 STX1BP61266 288 aa8.62□□□□□ -1.03
GINS1-201ENST00000262460 CTBSQ01459 385 aa8.62□□□□□ -1.03
GINS1-201ENST00000262460 SQLEQ14534 574 aa8.62□□□□□ -1.03
GINS1-201ENST00000262460 CYP51A1Q16850 503 aa8.62□□□□□ -1.03
GINS1-201ENST00000262460 TMEM214Q6NUQ4 689 aaKnown RBP8.62□□□□□ -1.03
GINS1-201ENST00000262460 MSANTD2Q6P1R3 559 aa8.62□□□□□ -1.03
GINS1-201ENST00000262460 LCA5Q86VQ0 697 aa8.62□□□□□ -1.03
GINS1-201ENST00000262460 TICAM1Q8IUC6 712 aa8.62□□□□□ -1.03
GINS1-201ENST00000262460 CMTR2Q8IYT2 770 aaKnown RBP8.62□□□□□ -1.03
GINS1-201ENST00000262460 UMODL1-AS1Q8N2C9 162 aa8.62□□□□□ -1.03
GINS1-201ENST00000262460 FBXO39Q8N4B4 442 aa8.62□□□□□ -1.03
GINS1-201ENST00000262460 RNF175Q8N4F7 328 aa8.62□□□□□ -1.03
GINS1-201ENST00000262460 MAGEE2Q8TD90 523 aaPredicted RBP8.62□□□□□ -1.03
GINS1-201ENST00000262460 RANBP9Q96S59 729 aa8.62□□□□□ -1.03
GINS1-201ENST00000262460 TBCDQ9BTW9 1192 aa8.62□□□□□ -1.03
GINS1-201ENST00000262460 CCDC28BQ9BUN5 200 aa8.62□□□□□ -1.03
GINS1-201ENST00000262460 SPC25Q9HBM1 224 aa8.62□□□□□ -1.03
GINS1-201ENST00000262460 RHBDL2Q9NX52 303 aa8.62□□□□□ -1.03
GINS1-201ENST00000262460 NSMCE4AQ9NXX6 385 aa8.62□□□□□ -1.03
GINS1-201ENST00000262460 RRN3Q9NYV6 651 aa8.62□□□□□ -1.03
GINS1-201ENST00000262460 TMEM88BA6NKF7 163 aa8.62□□□□□ -1.03
GINS1-201ENST00000262460 NDUFS3O75489 264 aa8.62□□□□□ -1.03
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GINS1-201ENST00000262460 GJA1P17302 382 aa8.62□□□□□ -1.03
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GINS1-201ENST00000262460 CCL23P55773 120 aa8.62□□□□□ -1.03
GINS1-201ENST00000262460 NFYCQ13952 458 aa8.62□□□□□ -1.03
GINS1-201ENST00000262460 GRM2Q14416 872 aa8.62□□□□□ -1.03
GINS1-201ENST00000262460 FAM151BQ6UXP7 276 aa8.62□□□□□ -1.03
GINS1-201ENST00000262460 DEFB128Q7Z7B8 93 aa8.62□□□□□ -1.03
GINS1-201ENST00000262460 GALNT10Q86SR1 603 aa8.62□□□□□ -1.03
GINS1-201ENST00000262460 FAM86B1Q8N7N1 296 aa8.62□□□□□ -1.03
GINS1-201ENST00000262460 WFDC5Q8TCV5 224 aa8.62□□□□□ -1.03
GINS1-201ENST00000262460 SNRNP27Q8WVK2 155 aaKnown RBP8.62□□□□□ -1.03
GINS1-201ENST00000262460 EID2BQ96D98 161 aa8.62□□□□□ -1.03
GINS1-201ENST00000262460 LINGO1Q96FE5 620 aa8.62□□□□□ -1.03
GINS1-201ENST00000262460 VPS50Q96JG6 964 aa8.62□□□□□ -1.03
GINS1-201ENST00000262460 POLR1EQ9GZS1 481 aaKnown RBP8.62□□□□□ -1.03
GINS1-201ENST00000262460 EML4Q9HC35 981 aaKnown RBP8.62□□□□□ -1.03
GINS1-201ENST00000262460 ZFP14Q9HCL3 533 aa8.62□□□□□ -1.03
GINS1-201ENST00000262460 SMOXQ9NWM0 555 aa8.62□□□□□ -1.03
GINS1-201ENST00000262460 CD274Q9NZQ7 290 aa8.62□□□□□ -1.03
GINS1-201ENST00000262460 EBF1Q9UH73 591 aa8.62□□□□□ -1.03
GINS1-201ENST00000262460 CDC14AQ9UNH5 594 aa8.62□□□□□ -1.03
GINS1-201ENST00000262460 SLC45A1Q9Y2W3 748 aa8.62□□□□□ -1.03
GINS1-201ENST00000262460 PCDHB9Q9Y5E1 797 aa8.62□□□□□ -1.03
GINS1-201ENST00000262460 PCDHB5Q9Y5E4 795 aa8.62□□□□□ -1.03
GINS1-201ENST00000262460 MTMR11A4FU01 709 aa8.61□□□□□ -1.03
GINS1-201ENST00000262460 EI24O14681 340 aa8.61□□□□□ -1.03
GINS1-201ENST00000262460 HTRA2O43464 458 aaPredicted RBP8.61□□□□□ -1.03
GINS1-201ENST00000262460 AOC2O75106 756 aa8.61□□□□□ -1.03
GINS1-201ENST00000262460 PRLP01236 227 aa8.61□□□□□ -1.03
GINS1-201ENST00000262460 PYGLP06737 847 aa8.61□□□□□ -1.03
GINS1-201ENST00000262460 PABPC4LP0CB38 370 aaKnown RBP8.61□□□□□ -1.03
GINS1-201ENST00000262460 COL6A2P12110 1019 aa8.61□□□□□ -1.03
GINS1-201ENST00000262460 SLC6A2P23975 617 aa8.61□□□□□ -1.03
GINS1-201ENST00000262460 HOXD9P28356 352 aaPredicted RBP8.61□□□□□ -1.03
GINS1-201ENST00000262460 MC4RP32245 332 aa8.61□□□□□ -1.03
GINS1-201ENST00000262460 SLC11A1P49279 550 aa8.61□□□□□ -1.03
GINS1-201ENST00000262460 GALK1P51570 392 aa8.61□□□□□ -1.03
GINS1-201ENST00000262460 OR4D2P58180 307 aa8.61□□□□□ -1.03
GINS1-201ENST00000262460 HMGCS1Q01581 520 aa8.61□□□□□ -1.03
GINS1-201ENST00000262460 RHDQ02161 417 aa8.61□□□□□ -1.03
GINS1-201ENST00000262460 STX5Q13190 355 aa8.61□□□□□ -1.03
GINS1-201ENST00000262460 RFLNAQ6ZTI6 216 aa8.61□□□□□ -1.03
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