RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000255304.8

USPL1-201, Transcript of ubiquitin specific peptidase like 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene USPL1, Length 3,814 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USPL1-201ENST00000255304 DAB2P98082 770 aa7.6□□□□□ -1.19
USPL1-201ENST00000255304 TLE2Q04725 743 aa7.6□□□□□ -1.19
USPL1-201ENST00000255304 PRKAA1Q13131 559 aa7.6□□□□□ -1.19
USPL1-201ENST00000255304 PLCL1Q15111 1095 aa7.6□□□□□ -1.19
USPL1-201ENST00000255304 FGD3Q5JSP0 725 aa7.6□□□□□ -1.19
USPL1-201ENST00000255304 RBM20Q5T481 1227 aaKnown RBP7.6□□□□□ -1.19
USPL1-201ENST00000255304 TRAPPC5Q8IUR0 188 aa7.6□□□□□ -1.19
USPL1-201ENST00000255304 C3orf58Q8NDZ4 430 aa7.6□□□□□ -1.19
USPL1-201ENST00000255304 GPR156Q8NFN8 814 aa7.6□□□□□ -1.19
USPL1-201ENST00000255304 NCSTNQ92542 709 aa7.6□□□□□ -1.19
USPL1-201ENST00000255304 CDK15Q96Q40 435 aa7.6□□□□□ -1.19
USPL1-201ENST00000255304 SMIM14Q96QK8 99 aa7.6□□□□□ -1.19
USPL1-201ENST00000255304 BBS2Q9BXC9 721 aa7.6□□□□□ -1.19
USPL1-201ENST00000255304 ADGRE3Q9BY15 652 aa7.6□□□□□ -1.19
USPL1-201ENST00000255304 PCDHAC1Q9H158 963 aa7.6□□□□□ -1.19
USPL1-201ENST00000255304 TIMMDC1Q9NPL8 285 aa7.6□□□□□ -1.19
USPL1-201ENST00000255304 RNF186Q9NXI6 227 aa7.6□□□□□ -1.19
USPL1-201ENST00000255304 ARL15Q9NXU5 204 aa7.6□□□□□ -1.19
USPL1-201ENST00000255304 SEPT3Q9UH03 358 aa7.6□□□□□ -1.19
USPL1-201ENST00000255304 GTF2IRD1Q9UHL9 959 aa7.6□□□□□ -1.19
USPL1-201ENST00000255304 U3KQV3 271 aa7.6□□□□□ -1.19
USPL1-201ENST00000255304 TRBV23OR9-2A0A075B6M9 112 aa7.59□□□□□ -1.19
USPL1-201ENST00000255304 F8W8V4 182 aa7.59□□□□□ -1.19
USPL1-201ENST00000255304 H7C4K7 107 aa7.59□□□□□ -1.19
USPL1-201ENST00000255304 CLASP2O75122 1294 aaKnown RBP7.59□□□□□ -1.19
USPL1-201ENST00000255304 SEC22BO75396 215 aa7.59□□□□□ -1.19
USPL1-201ENST00000255304 SERPINB7O75635 380 aa7.59□□□□□ -1.19
USPL1-201ENST00000255304 GSNP06396 782 aa7.59□□□□□ -1.19
USPL1-201ENST00000255304 ALDH4A1P30038 563 aa7.59□□□□□ -1.19
USPL1-201ENST00000255304 NPY2RP49146 381 aa7.59□□□□□ -1.19
USPL1-201ENST00000255304 BCAP31P51572 246 aa7.59□□□□□ -1.19
USPL1-201ENST00000255304 RAB10P61026 200 aa7.59□□□□□ -1.19
USPL1-201ENST00000255304 CCDC157Q569K6 752 aa7.59□□□□□ -1.19
USPL1-201ENST00000255304 CMPK2Q5EBM0 449 aa7.59□□□□□ -1.19
USPL1-201ENST00000255304 SMYD5Q6GMV2 418 aa7.59□□□□□ -1.19
USPL1-201ENST00000255304 RETSATQ6NUM9 610 aa7.59□□□□□ -1.19
USPL1-201ENST00000255304 ADGRD1Q6QNK2 874 aa7.59□□□□□ -1.19
USPL1-201ENST00000255304 C16orf89Q6UX73 402 aa7.59□□□□□ -1.19
USPL1-201ENST00000255304 TMC5Q6UXY8 1006 aa7.59□□□□□ -1.19
USPL1-201ENST00000255304 C4orf22Q6V702 233 aa7.59□□□□□ -1.19
USPL1-201ENST00000255304 FAM126BQ8IXS8 530 aa7.59□□□□□ -1.19
USPL1-201ENST00000255304 PLD6Q8N2A8 252 aaKnown RBP7.59□□□□□ -1.19
USPL1-201ENST00000255304 FSTL5Q8N475 847 aaPredicted RBP7.59□□□□□ -1.19
USPL1-201ENST00000255304 C12orf50Q8NA57 414 aaPredicted RBP7.59□□□□□ -1.19
USPL1-201ENST00000255304 HTRA1Q92743 480 aa7.59□□□□□ -1.19
USPL1-201ENST00000255304 C12orf43Q96C57 262 aaKnown RBP7.59□□□□□ -1.19
USPL1-201ENST00000255304 PLEKHA8Q96JA3 519 aa7.59□□□□□ -1.19
USPL1-201ENST00000255304 RNF145Q96MT1 663 aa7.59□□□□□ -1.19
USPL1-201ENST00000255304 LENG8Q96PV6 779 aaPredicted RBP7.59□□□□□ -1.19
USPL1-201ENST00000255304 MRPS26Q9BYN8 205 aaKnown RBP7.59□□□□□ -1.19
USPL1-201ENST00000255304 TRIM39Q9HCM9 518 aa7.59□□□□□ -1.19
USPL1-201ENST00000255304 COPG2Q9UBF2 871 aa7.59□□□□□ -1.19
USPL1-201ENST00000255304 AGO1Q9UL18 857 aaKnown RBP7.59□□□□□ -1.19
USPL1-201ENST00000255304 FZD10Q9ULW2 581 aa7.59□□□□□ -1.19
USPL1-201ENST00000255304 ZFP37Q9Y6Q3 630 aaPredicted RBP7.59□□□□□ -1.19
USPL1-201ENST00000255304 TRIP11Q15643 1979 aa7.59□□□□□ -1.19
USPL1-201ENST00000255304 SIP14410 1827 aa7.59□□□□□ -1.19
USPL1-201ENST00000255304 OR2AG2A6NM03 316 aa7.59□□□□□ -1.19
USPL1-201ENST00000255304 HACD1B0YJ81 288 aa7.59□□□□□ -1.19
USPL1-201ENST00000255304 EIF3FO00303 357 aaPredicted RBP7.59□□□□□ -1.19
USPL1-201ENST00000255304 PTGESO14684 152 aa7.59□□□□□ -1.19
USPL1-201ENST00000255304 FFAR2O15552 330 aa7.59□□□□□ -1.19
USPL1-201ENST00000255304 HLA-DQB2P05538 268 aa7.59□□□□□ -1.19
USPL1-201ENST00000255304 CD247P20963 164 aa7.59□□□□□ -1.19
USPL1-201ENST00000255304 MC4RP32245 332 aa7.59□□□□□ -1.19
USPL1-201ENST00000255304 HADHBP55084 474 aaKnown RBP7.59□□□□□ -1.19
USPL1-201ENST00000255304 GRB14Q14449 540 aa7.59□□□□□ -1.19
USPL1-201ENST00000255304 PRKD1Q15139 912 aaPredicted RBP7.59□□□□□ -1.19
USPL1-201ENST00000255304 ALFQ53S48 1182 aa7.59□□□□□ -1.19
USPL1-201ENST00000255304 ANKS6Q68DC2 871 aa7.59□□□□□ -1.19
USPL1-201ENST00000255304 C15orf39Q6ZRI6 1047 aa7.59□□□□□ -1.19
USPL1-201ENST00000255304 CAMK1DQ8IU85 385 aa7.59□□□□□ -1.19
USPL1-201ENST00000255304 BPIFB6Q8NFQ5 453 aa7.59□□□□□ -1.19
USPL1-201ENST00000255304 OR10T2Q8NGX3 314 aa7.59□□□□□ -1.19
USPL1-201ENST00000255304 FBXO30Q8TB52 745 aa7.59□□□□□ -1.19
USPL1-201ENST00000255304 ACTRT2Q8TDY3 377 aa7.59□□□□□ -1.19
USPL1-201ENST00000255304 TAMM41Q96BW9 452 aa7.59□□□□□ -1.19
USPL1-201ENST00000255304 QKIQ96PU8 341 aaKnown RBP eCLIP7.59□□□□□ -1.19
USPL1-201ENST00000255304 OSBPL10Q9BXB5 764 aa7.59□□□□□ -1.19
USPL1-201ENST00000255304 SLC4A5Q9BY07 1137 aa7.59□□□□□ -1.19
USPL1-201ENST00000255304 BCO2Q9BYV7 579 aa7.59□□□□□ -1.19
USPL1-201ENST00000255304 ATG10Q9H0Y0 220 aa7.59□□□□□ -1.19
USPL1-201ENST00000255304 ELOVL6Q9H5J4 265 aa7.59□□□□□ -1.19
USPL1-201ENST00000255304 COQ10BQ9H8M1 238 aa7.59□□□□□ -1.19
USPL1-201ENST00000255304 WDR41Q9HAD4 459 aa7.59□□□□□ -1.19
USPL1-201ENST00000255304 PDLIM7Q9NR12 457 aa7.59□□□□□ -1.19
USPL1-201ENST00000255304 DDX28Q9NUL7 540 aaKnown RBP7.59□□□□□ -1.19
USPL1-201ENST00000255304 TMLHEQ9NVH6 421 aa7.59□□□□□ -1.19
USPL1-201ENST00000255304 GID8Q9NWU2 228 aa7.59□□□□□ -1.19
USPL1-201ENST00000255304 CFAP97Q9P2B7 532 aa7.59□□□□□ -1.19
USPL1-201ENST00000255304 DNMT3LQ9UJW3 386 aa7.59□□□□□ -1.19
USPL1-201ENST00000255304 ADAMTS5Q9UNA0 930 aa7.59□□□□□ -1.19
USPL1-201ENST00000255304 VWA7Q9Y334 891 aa7.59□□□□□ -1.19
USPL1-201ENST00000255304 PCDHB12Q9Y5F1 795 aa7.59□□□□□ -1.19
USPL1-201ENST00000255304 A0A0D9SEW6 157 aa7.59□□□□□ -1.19
USPL1-201ENST00000255304 TRPC5OSA6NMA1 111 aa7.59□□□□□ -1.19
USPL1-201ENST00000255304 UBXN8O00124 270 aa7.59□□□□□ -1.19
USPL1-201ENST00000255304 PDLIM1O00151 329 aa7.59□□□□□ -1.19
USPL1-201ENST00000255304 PLOD2O00469 737 aa7.59□□□□□ -1.19
USPL1-201ENST00000255304 KPNA6O60684 536 aa7.59□□□□□ -1.19
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34 ms