RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000229304.4

APOBEC1-201, Transcript of apolipoprotein B mRNA editing enzyme catalytic subunit 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene APOBEC1, Length 879 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC1-201ENST00000229304 DKK3Q9UBP4 350 aa9.49□□□□□ -0.89
APOBEC1-201ENST00000229304 DCTN4Q9UJW0 460 aa9.49□□□□□ -0.89
APOBEC1-201ENST00000229304 CDH7Q9ULB5 785 aa9.49□□□□□ -0.89
APOBEC1-201ENST00000229304 SORCS3Q9UPU3 1222 aa9.49□□□□□ -0.89
APOBEC1-201ENST00000229304 EPB41L3Q9Y2J2 1087 aaPredicted RBP9.49□□□□□ -0.89
APOBEC1-201ENST00000229304 CRYL1Q9Y2S2 319 aa9.49□□□□□ -0.89
APOBEC1-201ENST00000229304 MED16Q9Y2X0 877 aa9.49□□□□□ -0.89
APOBEC1-201ENST00000229304 SLC30A1Q9Y6M5 507 aa9.49□□□□□ -0.89
APOBEC1-201ENST00000229304 C1orf232A0A0U1RR37 186 aa9.48□□□□□ -0.89
APOBEC1-201ENST00000229304 HEPACAM2A8MVW5 462 aa9.48□□□□□ -0.89
APOBEC1-201ENST00000229304 SLCO1B7G3V0H7 640 aa9.48□□□□□ -0.89
APOBEC1-201ENST00000229304 H3BMM5 538 aa9.48□□□□□ -0.89
APOBEC1-201ENST00000229304 MYO1CO00159 1063 aa9.48□□□□□ -0.89
APOBEC1-201ENST00000229304 GAPDHSO14556 408 aaPredicted RBP9.48□□□□□ -0.89
APOBEC1-201ENST00000229304 PRMT5O14744 637 aaPredicted RBP9.48□□□□□ -0.89
APOBEC1-201ENST00000229304 HNRNPCL1O60812 293 aaKnown RBP9.48□□□□□ -0.89
APOBEC1-201ENST00000229304 TULP3O75386 442 aa9.48□□□□□ -0.89
APOBEC1-201ENST00000229304 RHOBTB1O94844 696 aa9.48□□□□□ -0.89
APOBEC1-201ENST00000229304 PRSS56P0CW18 603 aa9.48□□□□□ -0.89
APOBEC1-201ENST00000229304 CD1DP15813 335 aa9.48□□□□□ -0.89
APOBEC1-201ENST00000229304 BPIP17213 487 aa9.48□□□□□ -0.89
APOBEC1-201ENST00000229304 ITGALP20701 1170 aa9.48□□□□□ -0.89
APOBEC1-201ENST00000229304 FCARP24071 287 aa9.48□□□□□ -0.89
APOBEC1-201ENST00000229304 NFKBIAP25963 317 aa9.48□□□□□ -0.89
APOBEC1-201ENST00000229304 ARRB2P32121 409 aa9.48□□□□□ -0.89
APOBEC1-201ENST00000229304 BMP8BP34820 402 aa9.48□□□□□ -0.89
APOBEC1-201ENST00000229304 SPAM1P38567 509 aa9.48□□□□□ -0.89
APOBEC1-201ENST00000229304 GLRBP48167 497 aa9.48□□□□□ -0.89
APOBEC1-201ENST00000229304 PGGT1BP53609 377 aa9.48□□□□□ -0.89
APOBEC1-201ENST00000229304 FCHO2Q0JRZ9 810 aa9.48□□□□□ -0.89
APOBEC1-201ENST00000229304 GALNT1Q10472 559 aaPredicted RBP9.48□□□□□ -0.89
APOBEC1-201ENST00000229304 PRKAA1Q13131 559 aa9.48□□□□□ -0.89
APOBEC1-201ENST00000229304 RCN2Q14257 317 aa9.48□□□□□ -0.89
APOBEC1-201ENST00000229304 KRT72Q14CN4 511 aa9.48□□□□□ -0.89
APOBEC1-201ENST00000229304 PTPRRQ15256 657 aa9.48□□□□□ -0.89
APOBEC1-201ENST00000229304 PTPRNQ16849 979 aa9.48□□□□□ -0.89
APOBEC1-201ENST00000229304 SPRED3Q2MJR0 410 aa9.48□□□□□ -0.89
APOBEC1-201ENST00000229304 GAB4Q2WGN9 574 aa9.48□□□□□ -0.89
APOBEC1-201ENST00000229304 ACCSLQ4AC99 568 aa9.48□□□□□ -0.89
APOBEC1-201ENST00000229304 ZRANB3Q5FWF4 1079 aa9.48□□□□□ -0.89
APOBEC1-201ENST00000229304 PSAPL1Q6NUJ1 521 aa9.48□□□□□ -0.89
APOBEC1-201ENST00000229304 SYCE2Q6PIF2 218 aa9.48□□□□□ -0.89
APOBEC1-201ENST00000229304 GDPD4Q6W3E5 623 aa9.48□□□□□ -0.89
APOBEC1-201ENST00000229304 NAPRTQ6XQN6 538 aa9.48□□□□□ -0.89
APOBEC1-201ENST00000229304 Q6ZVU0 165 aa9.48□□□□□ -0.89
APOBEC1-201ENST00000229304 ISCA2Q86U28 154 aa9.48□□□□□ -0.89
APOBEC1-201ENST00000229304 NKAPQ8N5F7 415 aaKnown RBP9.48□□□□□ -0.89
APOBEC1-201ENST00000229304 ANKRD49Q8WVL7 239 aa9.48□□□□□ -0.89
APOBEC1-201ENST00000229304 HPS1Q92902 700 aa9.48□□□□□ -0.89
APOBEC1-201ENST00000229304 SKA1Q96BD8 255 aa9.48□□□□□ -0.89
APOBEC1-201ENST00000229304 ERP27Q96DN0 273 aa9.48□□□□□ -0.89
APOBEC1-201ENST00000229304 ASIC4Q96FT7 647 aa9.48□□□□□ -0.89
APOBEC1-201ENST00000229304 THOC1Q96FV9 657 aaKnown RBP9.48□□□□□ -0.89
APOBEC1-201ENST00000229304 CNDP1Q96KN2 507 aa9.48□□□□□ -0.89
APOBEC1-201ENST00000229304 TRMOQ9BU70 441 aa9.48□□□□□ -0.89
APOBEC1-201ENST00000229304 DERL2Q9GZP9 239 aa9.48□□□□□ -0.89
APOBEC1-201ENST00000229304 ILKAPQ9H0C8 392 aaPredicted RBP9.48□□□□□ -0.89
APOBEC1-201ENST00000229304 NSUN3Q9H649 340 aaKnown RBP9.48□□□□□ -0.89
APOBEC1-201ENST00000229304 BRD9Q9H8M2 597 aa9.48□□□□□ -0.89
APOBEC1-201ENST00000229304 BPIFA1Q9NP55 256 aa9.48□□□□□ -0.89
APOBEC1-201ENST00000229304 IL26Q9NPH9 171 aa9.48□□□□□ -0.89
APOBEC1-201ENST00000229304 TXLNGQ9NUQ3 528 aa9.48□□□□□ -0.89
APOBEC1-201ENST00000229304 DNAJC28Q9NX36 388 aa9.48□□□□□ -0.89
APOBEC1-201ENST00000229304 ELOVL2Q9NXB9 296 aa9.48□□□□□ -0.89
APOBEC1-201ENST00000229304 KLHL42Q9P2K6 505 aa9.48□□□□□ -0.89
APOBEC1-201ENST00000229304 NFKBIL1Q9UBC1 381 aaPredicted RBP9.48□□□□□ -0.89
APOBEC1-201ENST00000229304 DNAJC16Q9Y2G8 782 aa9.48□□□□□ -0.89
APOBEC1-201ENST00000229304 RAP2CQ9Y3L5 183 aa9.48□□□□□ -0.89
APOBEC1-201ENST00000229304 MTCL1Q9Y4B5 1905 aaKnown RBP9.48□□□□□ -0.89
APOBEC1-201ENST00000229304 GLYATL1P3A0A0U1RQE8 302 aa9.47□□□□□ -0.89
APOBEC1-201ENST00000229304 UBA6A0AVT1 1052 aaPredicted RBP9.47□□□□□ -0.89
APOBEC1-201ENST00000229304 RGSL1A5PLK6 1076 aa9.47□□□□□ -0.89
APOBEC1-201ENST00000229304 CFAP73A6NFT4 308 aa9.47□□□□□ -0.89
APOBEC1-201ENST00000229304 NPIPB15A6NHN6 443 aaPredicted RBP9.47□□□□□ -0.89
APOBEC1-201ENST00000229304 TTC34A8MYJ7 566 aa9.47□□□□□ -0.89
APOBEC1-201ENST00000229304 ZNF195O14628 629 aa9.47□□□□□ -0.89
APOBEC1-201ENST00000229304 TRIM24O15164 1050 aa9.47□□□□□ -0.89
APOBEC1-201ENST00000229304 CCDC22O60826 627 aa9.47□□□□□ -0.89
APOBEC1-201ENST00000229304 VPS26AO75436 327 aa9.47□□□□□ -0.89
APOBEC1-201ENST00000229304 LYPLA1O75608 230 aaPredicted RBP9.47□□□□□ -0.89
APOBEC1-201ENST00000229304 IPO13O94829 963 aaKnown RBP9.47□□□□□ -0.89
APOBEC1-201ENST00000229304 UNC5CO95185 931 aa9.47□□□□□ -0.89
APOBEC1-201ENST00000229304 CLDN7O95471 211 aa9.47□□□□□ -0.89
APOBEC1-201ENST00000229304 PRAMEF1O95521 474 aa9.47□□□□□ -0.89
APOBEC1-201ENST00000229304 SLC4A1P02730 911 aa9.47□□□□□ -0.89
APOBEC1-201ENST00000229304 CYP2A6P11509 494 aaPredicted RBP9.47□□□□□ -0.89
APOBEC1-201ENST00000229304 ARSAP15289 507 aa9.47□□□□□ -0.89
APOBEC1-201ENST00000229304 ZNF30P17039 623 aa9.47□□□□□ -0.89
APOBEC1-201ENST00000229304 ZNF7P17097 686 aaPredicted RBP9.47□□□□□ -0.89
APOBEC1-201ENST00000229304 TFEBP19484 476 aa9.47□□□□□ -0.89
APOBEC1-201ENST00000229304 FMO4P31512 558 aa9.47□□□□□ -0.89
APOBEC1-201ENST00000229304 EIF2DP41214 584 aaKnown RBP9.47□□□□□ -0.89
APOBEC1-201ENST00000229304 MAGEA9P43362 315 aa9.47□□□□□ -0.89
APOBEC1-201ENST00000229304 CDKN1CP49918 316 aaPredicted RBP9.47□□□□□ -0.89
APOBEC1-201ENST00000229304 NAGLUP54802 743 aa9.47□□□□□ -0.89
APOBEC1-201ENST00000229304 AQP5P55064 265 aa9.47□□□□□ -0.89
APOBEC1-201ENST00000229304 NAA20P61599 178 aa9.47□□□□□ -0.89
APOBEC1-201ENST00000229304 ST8SIA6P61647 398 aa9.47□□□□□ -0.89
APOBEC1-201ENST00000229304 HYAL1Q12794 435 aa9.47□□□□□ -0.89
APOBEC1-201ENST00000229304 NFATC2Q13469 925 aa9.47□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 70.7 ms