RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000218364.4

HTATSF1-201, Transcript of HIV-1 Tat specific factor 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HTATSF1, Length 2,775 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTATSF1-201ENST00000218364 EEDO75530 441 aaKnown RBP22.03■■□□□ 1.12
HTATSF1-201ENST00000218364 CPT1AP50416 773 aa22.03■■□□□ 1.12
HTATSF1-201ENST00000218364 SEMA3AQ14563 771 aa22.03■■□□□ 1.12
HTATSF1-201ENST00000218364 FXNQ16595 210 aa22.03■■□□□ 1.12
HTATSF1-201ENST00000218364 RABL3Q5HYI8 236 aa22.03■■□□□ 1.12
HTATSF1-201ENST00000218364 PABPC5Q96DU9 382 aaKnown RBP22.03■■□□□ 1.12
HTATSF1-201ENST00000218364 SLC39A13Q96H72 371 aa22.03■■□□□ 1.12
HTATSF1-201ENST00000218364 KCTD14Q9BQ13 255 aaPredicted RBP22.03■■□□□ 1.12
HTATSF1-201ENST00000218364 TUBA1CQ9BQE3 449 aa22.03■■□□□ 1.12
HTATSF1-201ENST00000218364 AARSD1Q9BTE6 412 aaKnown RBP22.03■■□□□ 1.12
HTATSF1-201ENST00000218364 POLR1BQ9H9Y6 1135 aa22.03■■□□□ 1.12
HTATSF1-201ENST00000218364 SP110Q9HB58 689 aa22.03■■□□□ 1.12
HTATSF1-201ENST00000218364 KERAO60938 352 aa22.03■■□□□ 1.12
HTATSF1-201ENST00000218364 KCNK10P57789 538 aa22.03■■□□□ 1.12
HTATSF1-201ENST00000218364 MRPS6P82932 125 aaKnown RBP22.03■■□□□ 1.12
HTATSF1-201ENST00000218364 GRSF1Q12849 480 aaKnown RBP eCLIP22.03■■□□□ 1.12
HTATSF1-201ENST00000218364 MSANTD2Q6P1R3 559 aa22.03■■□□□ 1.12
HTATSF1-201ENST00000218364 TAF2Q6P1X5 1199 aa22.03■■□□□ 1.12
HTATSF1-201ENST00000218364 PGBD5Q8N414 524 aa22.03■■□□□ 1.12
HTATSF1-201ENST00000218364 DNAJB14Q8TBM8 379 aa22.03■■□□□ 1.12
HTATSF1-201ENST00000218364 KIAA1191Q96A73 305 aa22.03■■□□□ 1.12
HTATSF1-201ENST00000218364 KATNAL1Q9BW62 490 aa22.03■■□□□ 1.12
HTATSF1-201ENST00000218364 TRIM8Q9BZR9 551 aa22.03■■□□□ 1.12
HTATSF1-201ENST00000218364 A0A1B0GTL3 188 aa22.02■■□□□ 1.12
HTATSF1-201ENST00000218364 CYBBP04839 570 aa22.02■■□□□ 1.12
HTATSF1-201ENST00000218364 OGNP20774 298 aaKnown RBP22.02■■□□□ 1.12
HTATSF1-201ENST00000218364 ETFBP38117 255 aa22.02■■□□□ 1.12
HTATSF1-201ENST00000218364 RAB15P59190 212 aa22.02■■□□□ 1.12
HTATSF1-201ENST00000218364 AASDHQ4L235 1098 aaPredicted RBP22.02■■□□□ 1.12
HTATSF1-201ENST00000218364 GPR107Q5VW38 600 aa22.02■■□□□ 1.12
HTATSF1-201ENST00000218364 TFAP2DQ7Z6R9 452 aa22.02■■□□□ 1.12
HTATSF1-201ENST00000218364 OFCC1Q8IZS5 231 aa22.02■■□□□ 1.12
HTATSF1-201ENST00000218364 PNPT1Q8TCS8 783 aaKnown RBP22.02■■□□□ 1.12
HTATSF1-201ENST00000218364 ZYG11BQ9C0D3 744 aa22.02■■□□□ 1.12
HTATSF1-201ENST00000218364 TLR6Q9Y2C9 796 aa22.02■■□□□ 1.12
HTATSF1-201ENST00000218364 B3GAT3O94766 335 aa22.02■■□□□ 1.12
HTATSF1-201ENST00000218364 HNRNPCP07910 306 aaKnown RBP eCLIP22.02■■□□□ 1.12
HTATSF1-201ENST00000218364 ZNF865P0CJ78 1059 aaPredicted RBP22.02■■□□□ 1.12
HTATSF1-201ENST00000218364 EEF1DP29692 281 aaKnown RBP22.02■■□□□ 1.12
HTATSF1-201ENST00000218364 HLCSP50747 726 aa22.02■■□□□ 1.12
HTATSF1-201ENST00000218364 ZNF829Q3KNS6 432 aaPredicted RBP22.02■■□□□ 1.12
HTATSF1-201ENST00000218364 PAGE3Q5JUK9 113 aa22.02■■□□□ 1.12
HTATSF1-201ENST00000218364 KCTD8Q6ZWB6 473 aa22.02■■□□□ 1.12
HTATSF1-201ENST00000218364 MRPL10Q7Z7H8 261 aaKnown RBP22.02■■□□□ 1.12
HTATSF1-201ENST00000218364 LEMD2Q8NC56 503 aa22.02■■□□□ 1.12
HTATSF1-201ENST00000218364 TBC1D15Q8TC07 691 aa22.02■■□□□ 1.12
HTATSF1-201ENST00000218364 PSMG2Q969U7 264 aa22.02■■□□□ 1.12
HTATSF1-201ENST00000218364 THAP11Q96EK4 314 aa22.02■■□□□ 1.12
HTATSF1-201ENST00000218364 SLC30A3Q99726 388 aa22.02■■□□□ 1.12
HTATSF1-201ENST00000218364 NUSAP1Q9BXS6 441 aaKnown RBP22.02■■□□□ 1.12
HTATSF1-201ENST00000218364 TMEM9Q9P0T7 183 aa22.02■■□□□ 1.12
HTATSF1-201ENST00000218364 A0A1W2PQH9 124 aa22.01■■□□□ 1.11
HTATSF1-201ENST00000218364 CCDC162PA2VCL2 907 aa22.01■■□□□ 1.11
HTATSF1-201ENST00000218364 H0YAE9 185 aa22.01■■□□□ 1.11
HTATSF1-201ENST00000218364 RPP40O75818 363 aaKnown RBP22.01■■□□□ 1.11
HTATSF1-201ENST00000218364 LDLRP01130 860 aa22.01■■□□□ 1.11
HTATSF1-201ENST00000218364 PAN2Q504Q3 1202 aaKnown RBP22.01■■□□□ 1.11
HTATSF1-201ENST00000218364 CCNYL2Q5T2Q4 361 aa22.01■■□□□ 1.11
HTATSF1-201ENST00000218364 STAG3L4Q8TBR4 150 aa22.01■■□□□ 1.11
HTATSF1-201ENST00000218364 BORCS5Q969J3 196 aa22.01■■□□□ 1.11
HTATSF1-201ENST00000218364 TEX37Q96LM6 180 aa22.01■■□□□ 1.11
HTATSF1-201ENST00000218364 ZNF599Q96NL3 588 aa22.01■■□□□ 1.11
HTATSF1-201ENST00000218364 BRINP2Q9C0B6 783 aa22.01■■□□□ 1.11
HTATSF1-201ENST00000218364 IGF2BP1Q9NZI8 577 aaKnown RBP eCLIP22.01■■□□□ 1.11
HTATSF1-201ENST00000218364 PKD2L2Q9NZM6 624 aa22.01■■□□□ 1.11
HTATSF1-201ENST00000218364 CCL15-CCL14A0A0B4J2E2 113 aa22.01■■□□□ 1.11
HTATSF1-201ENST00000218364 TMX2-CTNND1H3BSU7 103 aa22.01■■□□□ 1.11
HTATSF1-201ENST00000218364 RPS17P08708 135 aaKnown RBP22.01■■□□□ 1.11
HTATSF1-201ENST00000218364 INHBBP09529 407 aa22.01■■□□□ 1.11
HTATSF1-201ENST00000218364 HTR1EP28566 365 aa22.01■■□□□ 1.11
HTATSF1-201ENST00000218364 CCL15Q16663 113 aa22.01■■□□□ 1.11
HTATSF1-201ENST00000218364 ANKRD23Q86SG2 305 aa22.01■■□□□ 1.11
HTATSF1-201ENST00000218364 IFNEQ86WN2 208 aa22.01■■□□□ 1.11
HTATSF1-201ENST00000218364 TMEM199Q8N511 208 aa22.01■■□□□ 1.11
HTATSF1-201ENST00000218364 MAGEE2Q8TD90 523 aaPredicted RBP22.01■■□□□ 1.11
HTATSF1-201ENST00000218364 OSCP1Q8WVF1 389 aa22.01■■□□□ 1.11
HTATSF1-201ENST00000218364 VPS33AQ96AX1 596 aa22.01■■□□□ 1.11
HTATSF1-201ENST00000218364 DERL2Q9GZP9 239 aa22.01■■□□□ 1.11
HTATSF1-201ENST00000218364 SYTL2Q9HCH5 934 aa22.01■■□□□ 1.11
HTATSF1-201ENST00000218364 NMRK2Q9NPI5 230 aa22.01■■□□□ 1.11
HTATSF1-201ENST00000218364 LEF1Q9UJU2 399 aaPredicted RBP22.01■■□□□ 1.11
HTATSF1-201ENST00000218364 RIMKLBQ9ULI2 386 aa22.01■■□□□ 1.11
HTATSF1-201ENST00000218364 TRPV2Q9Y5S1 764 aa22.01■■□□□ 1.11
HTATSF1-201ENST00000218364 CPNE6O95741 557 aa22■■□□□ 1.11
HTATSF1-201ENST00000218364 NCK1P16333 377 aa22■■□□□ 1.11
HTATSF1-201ENST00000218364 GRIK1P39086 918 aa22■■□□□ 1.11
HTATSF1-201ENST00000218364 NAA20P61599 178 aa22■■□□□ 1.11
HTATSF1-201ENST00000218364 BEX3Q00994 111 aa22■■□□□ 1.11
HTATSF1-201ENST00000218364 TYSND1Q2T9J0 566 aa22■■□□□ 1.11
HTATSF1-201ENST00000218364 XKR7Q5GH72 579 aa22■■□□□ 1.11
HTATSF1-201ENST00000218364 AARS2Q5JTZ9 985 aaKnown RBP22■■□□□ 1.11
HTATSF1-201ENST00000218364 ANKS6Q68DC2 871 aa22■■□□□ 1.11
HTATSF1-201ENST00000218364 IL31Q6EBC2 164 aa22■■□□□ 1.11
HTATSF1-201ENST00000218364 OVOS1Q6IE37 1185 aa22■■□□□ 1.11
HTATSF1-201ENST00000218364 TMEM26Q6ZUK4 368 aa22■■□□□ 1.11
HTATSF1-201ENST00000218364 KIAA2013Q8IYS2 634 aa22■■□□□ 1.11
HTATSF1-201ENST00000218364 FBXO39Q8N4B4 442 aa22■■□□□ 1.11
HTATSF1-201ENST00000218364 KLHL23Q8NBE8 558 aa22■■□□□ 1.11
HTATSF1-201ENST00000218364 C1QTNF3Q9BXJ4 246 aa22■■□□□ 1.11
HTATSF1-201ENST00000218364 PTPRDP23468 1912 aa22■■□□□ 1.11
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