RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000007722.11

ITGA3-201, Transcript of integrin subunit alpha 3, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene ITGA3, Length 3,665 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA3-201ENST00000007722 PIGVQ9NUD9 493 aa13.07□□□□□ -0.32
ITGA3-201ENST00000007722 DDIT4Q9NX09 232 aa13.07□□□□□ -0.32
ITGA3-201ENST00000007722 TNFSF13BQ9Y275 285 aa13.07□□□□□ -0.32
ITGA3-201ENST00000007722 IFT52Q9Y366 437 aa13.07□□□□□ -0.32
ITGA3-201ENST00000007722 PCDHGA11Q9Y5H2 935 aa13.07□□□□□ -0.32
ITGA3-201ENST00000007722 SHROOM3Q8TF72 1996 aa13.06□□□□□ -0.32
ITGA3-201ENST00000007722 KLRG2A4D1S0 409 aaPredicted RBP13.06□□□□□ -0.32
ITGA3-201ENST00000007722 ERI2A8K979 691 aaKnown RBP13.06□□□□□ -0.32
ITGA3-201ENST00000007722 H0Y626 953 aa13.06□□□□□ -0.32
ITGA3-201ENST00000007722 TRIM16O95361 564 aa13.06□□□□□ -0.32
ITGA3-201ENST00000007722 FTH1P02794 183 aa13.06□□□□□ -0.32
ITGA3-201ENST00000007722 DBTP11182 482 aaKnown RBP13.06□□□□□ -0.32
ITGA3-201ENST00000007722 HSD17B1P14061 328 aa13.06□□□□□ -0.32
ITGA3-201ENST00000007722 ALDH3A2P51648 485 aa13.06□□□□□ -0.32
ITGA3-201ENST00000007722 FKBP1AP62942 108 aaKnown RBP13.06□□□□□ -0.32
ITGA3-201ENST00000007722 CD47Q08722 323 aa13.06□□□□□ -0.32
ITGA3-201ENST00000007722 PLA2G4EQ3MJ16 856 aa13.06□□□□□ -0.32
ITGA3-201ENST00000007722 SLC25A52Q3SY17 297 aa13.06□□□□□ -0.32
ITGA3-201ENST00000007722 FAM98BQ52LJ0 330 aaKnown RBP13.06□□□□□ -0.32
ITGA3-201ENST00000007722 SMUG1Q53HV7 270 aa13.06□□□□□ -0.32
ITGA3-201ENST00000007722 NOL9Q5SY16 702 aaKnown RBP13.06□□□□□ -0.32
ITGA3-201ENST00000007722 CATSPEREQ5SY80 951 aa13.06□□□□□ -0.32
ITGA3-201ENST00000007722 DNERQ8NFT8 737 aa13.06□□□□□ -0.32
ITGA3-201ENST00000007722 ANKRD49Q8WVL7 239 aa13.06□□□□□ -0.32
ITGA3-201ENST00000007722 C17orf80Q9BSJ5 609 aa13.06□□□□□ -0.32
ITGA3-201ENST00000007722 CXCL16Q9H2A7 254 aa13.06□□□□□ -0.32
ITGA3-201ENST00000007722 TRIM39Q9HCM9 518 aa13.06□□□□□ -0.32
ITGA3-201ENST00000007722 CNGB3Q9NQW8 809 aa13.06□□□□□ -0.32
ITGA3-201ENST00000007722 COL16A1Q07092 1604 aaPredicted RBP13.06□□□□□ -0.32
ITGA3-201ENST00000007722 ARID2Q68CP9 1835 aa13.06□□□□□ -0.32
ITGA3-201ENST00000007722 FXYD1O00168 92 aa13.06□□□□□ -0.32
ITGA3-201ENST00000007722 AZIN1O14977 448 aa13.06□□□□□ -0.32
ITGA3-201ENST00000007722 CST1P01037 141 aa13.06□□□□□ -0.32
ITGA3-201ENST00000007722 TXNP10599 105 aaKnown RBP13.06□□□□□ -0.32
ITGA3-201ENST00000007722 HNRNPFP52597 415 aaKnown RBP13.06□□□□□ -0.32
ITGA3-201ENST00000007722 TNFAIP2Q03169 654 aa13.06□□□□□ -0.32
ITGA3-201ENST00000007722 TRIP4Q15650 581 aaPredicted RBP13.06□□□□□ -0.32
ITGA3-201ENST00000007722 RBM48Q5RL73 367 aaKnown RBP13.06□□□□□ -0.32
ITGA3-201ENST00000007722 GTF2IRD2BQ6EKJ0 949 aa13.06□□□□□ -0.32
ITGA3-201ENST00000007722 HACD2Q6Y1H2 254 aa13.06□□□□□ -0.32
ITGA3-201ENST00000007722 HFE2Q6ZVN8 426 aa13.06□□□□□ -0.32
ITGA3-201ENST00000007722 STRADAQ7RTN6 431 aa13.06□□□□□ -0.32
ITGA3-201ENST00000007722 GTF2IRD2Q86UP8 949 aa13.06□□□□□ -0.32
ITGA3-201ENST00000007722 P2RY8Q86VZ1 359 aa13.06□□□□□ -0.32
ITGA3-201ENST00000007722 ZDHHC17Q8IUH5 632 aa13.06□□□□□ -0.32
ITGA3-201ENST00000007722 EDEM1Q92611 657 aa13.06□□□□□ -0.32
ITGA3-201ENST00000007722 C18orf25Q96B23 403 aaPredicted RBP13.06□□□□□ -0.32
ITGA3-201ENST00000007722 ZNF277Q9NRM2 450 aaPredicted RBP13.06□□□□□ -0.32
ITGA3-201ENST00000007722 IGSF5Q9NSI5 407 aa13.06□□□□□ -0.32
ITGA3-201ENST00000007722 INVSQ9Y283 1065 aa13.06□□□□□ -0.32
ITGA3-201ENST00000007722 ORC6Q9Y5N6 252 aa13.06□□□□□ -0.32
ITGA3-201ENST00000007722 DNAJC15Q9Y5T4 150 aa13.06□□□□□ -0.32
ITGA3-201ENST00000007722 AHDC1Q5TGY3 1603 aaPredicted RBP13.06□□□□□ -0.32
ITGA3-201ENST00000007722 APBA3O96018 575 aa13.06□□□□□ -0.32
ITGA3-201ENST00000007722 INCA1Q0VD86 236 aa13.06□□□□□ -0.32
ITGA3-201ENST00000007722 KCNAB2Q13303 367 aa13.06□□□□□ -0.32
ITGA3-201ENST00000007722 SIM2Q14190 667 aaPredicted RBP13.06□□□□□ -0.32
ITGA3-201ENST00000007722 ADPRMQ3LIE5 342 aa13.06□□□□□ -0.32
ITGA3-201ENST00000007722 SLC16A12Q6ZSM3 486 aa13.06□□□□□ -0.32
ITGA3-201ENST00000007722 SLC22A9Q8IVM8 553 aa13.06□□□□□ -0.32
ITGA3-201ENST00000007722 MINDY2Q8NBR6 621 aa13.06□□□□□ -0.32
ITGA3-201ENST00000007722 OR10Q1Q8NGQ4 319 aa13.06□□□□□ -0.32
ITGA3-201ENST00000007722 RPL3LQ92901 407 aaKnown RBP13.06□□□□□ -0.32
ITGA3-201ENST00000007722 TMEM125Q96AQ2 219 aa13.06□□□□□ -0.32
ITGA3-201ENST00000007722 HBEGFQ99075 208 aa13.06□□□□□ -0.32
ITGA3-201ENST00000007722 PSD2Q9BQI7 771 aa13.06□□□□□ -0.32
ITGA3-201ENST00000007722 ALOXE3Q9BYJ1 711 aa13.06□□□□□ -0.32
ITGA3-201ENST00000007722 GSTO2Q9H4Y5 243 aa13.06□□□□□ -0.32
ITGA3-201ENST00000007722 GIMAP4Q9NUV9 329 aa13.06□□□□□ -0.32
ITGA3-201ENST00000007722 HACD3Q9P035 362 aa13.06□□□□□ -0.32
ITGA3-201ENST00000007722 SLCO3A1Q9UIG8 710 aa13.06□□□□□ -0.32
ITGA3-201ENST00000007722 SUPT3HB4E1H0 165 aa13.05□□□□□ -0.32
ITGA3-201ENST00000007722 ITGB6P18564 788 aa13.05□□□□□ -0.32
ITGA3-201ENST00000007722 CD40LGP29965 261 aa13.05□□□□□ -0.32
ITGA3-201ENST00000007722 PIGAP37287 484 aa13.05□□□□□ -0.32
ITGA3-201ENST00000007722 UFM1P61960 85 aa13.05□□□□□ -0.32
ITGA3-201ENST00000007722 SH3BP2P78314 561 aa13.05□□□□□ -0.32
ITGA3-201ENST00000007722 MBTD1Q05BQ5 628 aa13.05□□□□□ -0.32
ITGA3-201ENST00000007722 LAPTM4AQ15012 233 aa13.05□□□□□ -0.32
ITGA3-201ENST00000007722 ARHGAP36Q6ZRI8 547 aa13.05□□□□□ -0.32
ITGA3-201ENST00000007722 SPATC1Q76KD6 591 aa13.05□□□□□ -0.32
ITGA3-201ENST00000007722 MINDY1Q8N5J2 469 aa13.05□□□□□ -0.32
ITGA3-201ENST00000007722 CHDHQ8NE62 594 aaPredicted RBP13.05□□□□□ -0.32
ITGA3-201ENST00000007722 ZHX1-C8orf76Q96EF9 292 aa13.05□□□□□ -0.32
ITGA3-201ENST00000007722 FAM167AQ96KS9 214 aa13.05□□□□□ -0.32
ITGA3-201ENST00000007722 ERVK-18Q9QC07 812 aa13.05□□□□□ -0.32
ITGA3-201ENST00000007722 H0YAE9 185 aa13.05□□□□□ -0.32
ITGA3-201ENST00000007722 UBXN8O00124 270 aa13.05□□□□□ -0.32
ITGA3-201ENST00000007722 UGT2B11O75310 529 aa13.05□□□□□ -0.32
ITGA3-201ENST00000007722 CYP2C8P10632 490 aa13.05□□□□□ -0.32
ITGA3-201ENST00000007722 UGT3A2Q3SY77 523 aa13.05□□□□□ -0.32
ITGA3-201ENST00000007722 NLGN1Q8N2Q7 840 aa13.05□□□□□ -0.32
ITGA3-201ENST00000007722 GAD1Q99259 594 aa13.05□□□□□ -0.32
ITGA3-201ENST00000007722 FZD8Q9H461 694 aa13.05□□□□□ -0.32
ITGA3-201ENST00000007722 RIBC2Q9H4K1 309 aa13.05□□□□□ -0.32
ITGA3-201ENST00000007722 FAM118AQ9NWS6 357 aa13.05□□□□□ -0.32
ITGA3-201ENST00000007722 BOLA1Q9Y3E2 137 aa13.05□□□□□ -0.32
ITGA3-201ENST00000007722 CCRL2O00421 344 aa13.04□□□□□ -0.32
ITGA3-201ENST00000007722 RFPL2O75678 378 aa13.04□□□□□ -0.32
ITGA3-201ENST00000007722 JUNBP17275 347 aaPredicted RBP13.04□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 41.9 ms