RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000214204.1

Chrna3-202, Transcript of Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-3, mousemouse

TSL 1 (best) BASIC

Gene Chrna3, Length 2,414 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chrna3-202ENSMUST00000214204 Phf10Q9D8M7 497 aa14.64□□□□□ -0.07
Chrna3-202ENSMUST00000214204 Cmtm7Q9ESD6 167 aa14.64□□□□□ -0.07
Chrna3-202ENSMUST00000214204 Clcn5Q9WVD4 746 aa14.64□□□□□ -0.07
Chrna3-202ENSMUST00000214204 Zfp811A0A0J9YU71 552 aa14.64□□□□□ -0.07
Chrna3-202ENSMUST00000214204 Speer4f2E9Q366 295 aa14.64□□□□□ -0.07
Chrna3-202ENSMUST00000214204 Vmn2r21K7N6Y7 853 aa14.64□□□□□ -0.07
Chrna3-202ENSMUST00000214204 Vmn2r20L7N2B1 853 aa14.64□□□□□ -0.07
Chrna3-202ENSMUST00000214204 Gm3488M0QW81 238 aa14.64□□□□□ -0.07
Chrna3-202ENSMUST00000214204 GlulP15105 373 aa14.64□□□□□ -0.07
Chrna3-202ENSMUST00000214204 PtpaP58389 323 aa14.64□□□□□ -0.07
Chrna3-202ENSMUST00000214204 Brsk2Q69Z98 735 aa14.64□□□□□ -0.07
Chrna3-202ENSMUST00000214204 Fam126aQ6P9N1 521 aa14.64□□□□□ -0.07
Chrna3-202ENSMUST00000214204 Olfr1355Q7TQU9 310 aa14.64□□□□□ -0.07
Chrna3-202ENSMUST00000214204 Tmcc2Q80W04 706 aa14.64□□□□□ -0.07
Chrna3-202ENSMUST00000214204 Q8BGA7 448 aa14.64□□□□□ -0.07
Chrna3-202ENSMUST00000214204 SgtaQ8BJU0 315 aa14.64□□□□□ -0.07
Chrna3-202ENSMUST00000214204 Abcf3Q8K268 709 aa14.64□□□□□ -0.07
Chrna3-202ENSMUST00000214204 Vmn1r214Q8R279 367 aa14.64□□□□□ -0.07
Chrna3-202ENSMUST00000214204 Tmem168Q91VX9 697 aa14.64□□□□□ -0.07
Chrna3-202ENSMUST00000214204 Mapk8Q91Y86 384 aa14.64□□□□□ -0.07
Chrna3-202ENSMUST00000214204 Mta3Q924K8 591 aa14.64□□□□□ -0.07
Chrna3-202ENSMUST00000214204 Homer3Q99JP6 356 aa14.64□□□□□ -0.07
Chrna3-202ENSMUST00000214204 Tex46Q9CPU3 165 aa14.64□□□□□ -0.07
Chrna3-202ENSMUST00000214204 Gkap1Q9JMB0 366 aa14.64□□□□□ -0.07
Chrna3-202ENSMUST00000214204 CpqQ9WVJ3 470 aa14.64□□□□□ -0.07
Chrna3-202ENSMUST00000214204 Col12a1Q60847 3120 aa14.64□□□□□ -0.07
Chrna3-202ENSMUST00000214204 Col4a4Q9QZR9 1682 aa14.64□□□□□ -0.07
Chrna3-202ENSMUST00000214204 Dcpp2E9PYC2 171 aa14.63□□□□□ -0.07
Chrna3-202ENSMUST00000214204 Nccrp1G3X9C2 266 aa14.63□□□□□ -0.07
Chrna3-202ENSMUST00000214204 Dcpp1L7N1X9 171 aa14.63□□□□□ -0.07
Chrna3-202ENSMUST00000214204 Ltb4rO88855 351 aa14.63□□□□□ -0.07
Chrna3-202ENSMUST00000214204 Kcnc1P15388 511 aa14.63□□□□□ -0.07
Chrna3-202ENSMUST00000214204 RxraP28700 467 aa14.63□□□□□ -0.07
Chrna3-202ENSMUST00000214204 Atp5bP56480 529 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
Chrna3-202ENSMUST00000214204 SbplQ3TUY3 232 aa14.63□□□□□ -0.07
Chrna3-202ENSMUST00000214204 MregQ6NVG5 214 aa14.63□□□□□ -0.07
Chrna3-202ENSMUST00000214204 Rps27lQ6ZWY3 84 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
Chrna3-202ENSMUST00000214204 Man2a2Q8BRK9 1152 aa14.63□□□□□ -0.07
Chrna3-202ENSMUST00000214204 Nox1Q8CIZ9 591 aa14.63□□□□□ -0.07
Chrna3-202ENSMUST00000214204 Olfr96Q8VFE3 313 aa14.63□□□□□ -0.07
Chrna3-202ENSMUST00000214204 Pcdhga10Q91XY9 930 aa14.63□□□□□ -0.07
Chrna3-202ENSMUST00000214204 Glod4Q9CPV4 298 aa14.63□□□□□ -0.07
Chrna3-202ENSMUST00000214204 Ebag9Q9D0V7 213 aa14.63□□□□□ -0.07
Chrna3-202ENSMUST00000214204 Capn7Q9R1S8 813 aa14.63□□□□□ -0.07
Chrna3-202ENSMUST00000214204 Ern2Q9Z2E3 911 aa14.63□□□□□ -0.07
Chrna3-202ENSMUST00000214204 Apba1B2RUJ5 842 aa14.63□□□□□ -0.07
Chrna3-202ENSMUST00000214204 Kpna7C0LLJ0 499 aa14.63□□□□□ -0.07
Chrna3-202ENSMUST00000214204 Slc4a5E9Q3M5 1116 aa14.63□□□□□ -0.07
Chrna3-202ENSMUST00000214204 Top3aO70157 1003 aa14.63□□□□□ -0.07
Chrna3-202ENSMUST00000214204 Pde8aO88502 823 aa14.63□□□□□ -0.07
Chrna3-202ENSMUST00000214204 BpgmP15327 259 aa14.63□□□□□ -0.07
Chrna3-202ENSMUST00000214204 Alox15P39654 663 aa14.63□□□□□ -0.07
Chrna3-202ENSMUST00000214204 CtscP97821 462 aa14.63□□□□□ -0.07
Chrna3-202ENSMUST00000214204 Hsdl2Q2TPA8 490 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
Chrna3-202ENSMUST00000214204 Ankrd34bQ3UUF8 508 aa14.63□□□□□ -0.07
Chrna3-202ENSMUST00000214204 Fam91a1Q3UVG3 837 aa14.63□□□□□ -0.07
Chrna3-202ENSMUST00000214204 Rmdn2Q8BSE0 410 aa14.63□□□□□ -0.07
Chrna3-202ENSMUST00000214204 Insl5Q9WUG6 135 aa14.63□□□□□ -0.07
Chrna3-202ENSMUST00000214204 DmdP11531 3678 aa14.63□□□□□ -0.07
Chrna3-202ENSMUST00000214204 Tmem235B1AQL3 211 aa14.62□□□□□ -0.07
Chrna3-202ENSMUST00000214204 Tmem45a2B7ZWJ5 289 aa14.62□□□□□ -0.07
Chrna3-202ENSMUST00000214204 Catsperg2C6KI89 1145 aa14.62□□□□□ -0.07
Chrna3-202ENSMUST00000214204 Vmn2r24D3YUI0 854 aa14.62□□□□□ -0.07
Chrna3-202ENSMUST00000214204 Fbrsl1E9Q9T0 1031 aa14.62□□□□□ -0.07
Chrna3-202ENSMUST00000214204 Hrh1P70174 488 aa14.62□□□□□ -0.07
Chrna3-202ENSMUST00000214204 Aup1P70295 410 aa14.62□□□□□ -0.07
Chrna3-202ENSMUST00000214204 Spag6Q3V0U9 509 aa14.62□□□□□ -0.07
Chrna3-202ENSMUST00000214204 Cyp1b1Q64429 543 aa14.62□□□□□ -0.07
Chrna3-202ENSMUST00000214204 Stx3Q64704 289 aa14.62□□□□□ -0.07
Chrna3-202ENSMUST00000214204 Mppe1Q80XL7 396 aa14.62□□□□□ -0.07
Chrna3-202ENSMUST00000214204 Ddhd1Q80YA3 547 aa14.62□□□□□ -0.07
Chrna3-202ENSMUST00000214204 Serpinb9dQ8BMT0 377 aa14.62□□□□□ -0.07
Chrna3-202ENSMUST00000214204 Plin5Q8BVZ1 463 aa14.62□□□□□ -0.07
Chrna3-202ENSMUST00000214204 Adam32Q8K410 754 aa14.62□□□□□ -0.07
Chrna3-202ENSMUST00000214204 Trim7Q923T7 510 aa14.62□□□□□ -0.07
Chrna3-202ENSMUST00000214204 Mrpl14Q9D1I6 145 aa14.62□□□□□ -0.07
Chrna3-202ENSMUST00000214204 Nsmce1Q9D720 266 aa14.62□□□□□ -0.07
Chrna3-202ENSMUST00000214204 Tnfaip8l2Q9D8Y7 184 aa14.62□□□□□ -0.07
Chrna3-202ENSMUST00000214204 Med20Q9R0X0 212 aa14.62□□□□□ -0.07
Chrna3-202ENSMUST00000214204 Wdfy3Q6VNB8 3508 aa14.62□□□□□ -0.07
Chrna3-202ENSMUST00000214204 Kcna10B2RQA1 511 aa14.62□□□□□ -0.07
Chrna3-202ENSMUST00000214204 Lrrc10bG3XA50 292 aa14.62□□□□□ -0.07
Chrna3-202ENSMUST00000214204 Hs3st1O35310 311 aa14.62□□□□□ -0.07
Chrna3-202ENSMUST00000214204 HmgclP38060 325 aa14.62□□□□□ -0.07
Chrna3-202ENSMUST00000214204 Rpl26P61255 145 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
Chrna3-202ENSMUST00000214204 Pde7aP70453 456 aa14.62□□□□□ -0.07
Chrna3-202ENSMUST00000214204 Fpr-rs6Q3SXG2 339 aa14.62□□□□□ -0.07
Chrna3-202ENSMUST00000214204 Abhd10Q6PE15 297 aa14.62□□□□□ -0.07
Chrna3-202ENSMUST00000214204 Fam107aQ78TU8 144 aa14.62□□□□□ -0.07
Chrna3-202ENSMUST00000214204 DdnQ80TS7 710 aa14.62□□□□□ -0.07
Chrna3-202ENSMUST00000214204 Kxd1Q80XH1 177 aa14.62□□□□□ -0.07
Chrna3-202ENSMUST00000214204 Wasf2Q8BH43 497 aa14.62□□□□□ -0.07
Chrna3-202ENSMUST00000214204 NemfQ8CCP0 1064 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
Chrna3-202ENSMUST00000214204 Cog4Q8R1U1 785 aa14.62□□□□□ -0.07
Chrna3-202ENSMUST00000214204 Gramd1aQ8VEF1 722 aa14.62□□□□□ -0.07
Chrna3-202ENSMUST00000214204 AmotQ8VHG2 1126 aa14.62□□□□□ -0.07
Chrna3-202ENSMUST00000214204 Tcam1Q99NB3 548 aa14.62□□□□□ -0.07
Chrna3-202ENSMUST00000214204 Trap1Q9CQN1 706 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
Chrna3-202ENSMUST00000214204 Olfr706Q9EPF8 316 aa14.62□□□□□ -0.07
Chrna3-202ENSMUST00000214204 RalbQ9JIW9 206 aa14.62□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 17.6 ms