RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000637175.1

ATRX-223, Transcript of ATRX, chromatin remodeler, human

TSL 5

Gene ATRX, Length 100 nt, Biotype processed transcript.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ATRX-223	ENST00000637175	ATP13A5	Q4VNC0	1218 aa		3.09	□□□□□ -1.91
ATRX-223	ENST00000637175	ZNF805	Q5CZA5	627 aa		3.09	□□□□□ -1.91
ATRX-223	ENST00000637175	LRCH2	Q5VUJ6	765 aa		3.09	□□□□□ -1.91
ATRX-223	ENST00000637175	LCN10	Q6JVE6	187 aa		3.09	□□□□□ -1.91
ATRX-223	ENST00000637175	PDXDC1	Q6P996	788 aa		3.09	□□□□□ -1.91
ATRX-223	ENST00000637175	FJX1	Q86VR8	437 aa		3.09	□□□□□ -1.91
ATRX-223	ENST00000637175	PGBD5	Q8N414	524 aa		3.09	□□□□□ -1.91
ATRX-223	ENST00000637175	SRBD1	Q8N5C6	995 aa	Known RBP	3.09	□□□□□ -1.91
ATRX-223	ENST00000637175	PCDH20	Q8N6Y1	951 aa	Known RBP	3.09	□□□□□ -1.91
ATRX-223	ENST00000637175	SPATA22	Q8NHS9	363 aa		3.09	□□□□□ -1.91
ATRX-223	ENST00000637175	WASF1	Q92558	559 aa		3.09	□□□□□ -1.91
ATRX-223	ENST00000637175	RND1	Q92730	232 aa		3.09	□□□□□ -1.91
ATRX-223	ENST00000637175	APBB2	Q92870	758 aa		3.09	□□□□□ -1.91
ATRX-223	ENST00000637175	GRAMD2B	Q96HH9	432 aa		3.09	□□□□□ -1.91
ATRX-223	ENST00000637175	SRSF8	Q9BRL6	282 aa	Known RBP	3.09	□□□□□ -1.91
ATRX-223	ENST00000637175	NTPCR	Q9BSD7	190 aa	Known RBP	3.09	□□□□□ -1.91
ATRX-223	ENST00000637175	PLK3	Q9H4B4	646 aa		3.09	□□□□□ -1.91
ATRX-223	ENST00000637175	PCDH9	Q9HC56	1237 aa		3.09	□□□□□ -1.91
ATRX-223	ENST00000637175	MCM9	Q9NXL9	1143 aa		3.09	□□□□□ -1.91
ATRX-223	ENST00000637175	COPG2	Q9UBF2	871 aa		3.09	□□□□□ -1.91
ATRX-223	ENST00000637175	KANSL1L	A0AUZ9	987 aa		3.08	□□□□□ -1.92
ATRX-223	ENST00000637175	hDV102S1	A0JD36	115 aa		3.08	□□□□□ -1.92
ATRX-223	ENST00000637175		M0QZ24	198 aa		3.08	□□□□□ -1.92
ATRX-223	ENST00000637175	MAP2K7	O14733	419 aa		3.08	□□□□□ -1.92
ATRX-223	ENST00000637175	OGG1	O15527	345 aa		3.08	□□□□□ -1.92
ATRX-223	ENST00000637175	PAPSS1	O43252	624 aa	Predicted RBP	3.08	□□□□□ -1.92
ATRX-223	ENST00000637175	HS6ST1	O60243	411 aa		3.08	□□□□□ -1.92
ATRX-223	ENST00000637175	TSPAN9	O75954	239 aa		3.08	□□□□□ -1.92
ATRX-223	ENST00000637175	TPPP	O94811	219 aa		3.08	□□□□□ -1.92
ATRX-223	ENST00000637175	EGF	P01133	1207 aa		3.08	□□□□□ -1.92
ATRX-223	ENST00000637175	ICAM1	P05362	532 aa		3.08	□□□□□ -1.92
ATRX-223	ENST00000637175	PRSS2	P07478	247 aa		3.08	□□□□□ -1.92
ATRX-223	ENST00000637175	NGFR	P08138	427 aa		3.08	□□□□□ -1.92
ATRX-223	ENST00000637175	ACAA1	P09110	424 aa	Predicted RBP	3.08	□□□□□ -1.92
ATRX-223	ENST00000637175	CLTB	P09497	229 aa		3.08	□□□□□ -1.92
ATRX-223	ENST00000637175	FCGR1A	P12314	374 aa		3.08	□□□□□ -1.92
ATRX-223	ENST00000637175	ACTN1	P12814	892 aa		3.08	□□□□□ -1.92
ATRX-223	ENST00000637175	RRM1	P23921	792 aa		3.08	□□□□□ -1.92
ATRX-223	ENST00000637175	APOBEC1	P41238	236 aa	Known RBP	3.08	□□□□□ -1.92
ATRX-223	ENST00000637175	CLCNKA	P51800	687 aa		3.08	□□□□□ -1.92
ATRX-223	ENST00000637175	GPR143	P51810	404 aa		3.08	□□□□□ -1.92
ATRX-223	ENST00000637175	KRTAP10-11	P60412	298 aa		3.08	□□□□□ -1.92
ATRX-223	ENST00000637175	SEC61A1	P61619	476 aa	Known RBP	3.08	□□□□□ -1.92
ATRX-223	ENST00000637175	CSNK2A1	P68400	391 aa	Predicted RBP	3.08	□□□□□ -1.92
ATRX-223	ENST00000637175	SPOCK1	Q08629	439 aa		3.08	□□□□□ -1.92
ATRX-223	ENST00000637175	SREBF2	Q12772	1141 aa		3.08	□□□□□ -1.92
ATRX-223	ENST00000637175	KIF5A	Q12840	1032 aa		3.08	□□□□□ -1.92
ATRX-223	ENST00000637175	LRMP	Q12912	555 aa		3.08	□□□□□ -1.92
ATRX-223	ENST00000637175	CHAF1B	Q13112	559 aa		3.08	□□□□□ -1.92
ATRX-223	ENST00000637175	IK	Q13123	557 aa	Predicted RBP	3.08	□□□□□ -1.92
ATRX-223	ENST00000637175	HLF	Q16534	295 aa		3.08	□□□□□ -1.92
ATRX-223	ENST00000637175	PNLIPRP3	Q17RR3	467 aa		3.08	□□□□□ -1.92
ATRX-223	ENST00000637175	XKR9	Q5GH70	373 aa		3.08	□□□□□ -1.92
ATRX-223	ENST00000637175	RARS2	Q5T160	578 aa	Known RBP	3.08	□□□□□ -1.92
ATRX-223	ENST00000637175	DCST1	Q5T197	706 aa		3.08	□□□□□ -1.92
ATRX-223	ENST00000637175	SLC36A4	Q6YBV0	504 aa		3.08	□□□□□ -1.92
ATRX-223	ENST00000637175	RBM23	Q86U06	439 aa	Known RBP	3.08	□□□□□ -1.92
ATRX-223	ENST00000637175	ZDHHC17	Q8IUH5	632 aa		3.08	□□□□□ -1.92
ATRX-223	ENST00000637175	CSNK2A3	Q8NEV1	391 aa		3.08	□□□□□ -1.92
ATRX-223	ENST00000637175	MAGEC3	Q8TD91	643 aa		3.08	□□□□□ -1.92
ATRX-223	ENST00000637175	TAAR8	Q969N4	342 aa		3.08	□□□□□ -1.92
ATRX-223	ENST00000637175	LYZL4	Q96KX0	146 aa		3.08	□□□□□ -1.92
ATRX-223	ENST00000637175	FIZ1	Q96SL8	496 aa		3.08	□□□□□ -1.92
ATRX-223	ENST00000637175	KXD1	Q9BQD3	176 aa		3.08	□□□□□ -1.92
ATRX-223	ENST00000637175	TMEM204	Q9BSN7	226 aa		3.08	□□□□□ -1.92
ATRX-223	ENST00000637175	SEZ6L	Q9BYH1	1024 aa		3.08	□□□□□ -1.92
ATRX-223	ENST00000637175	PIGM	Q9H3S5	423 aa		3.08	□□□□□ -1.92
ATRX-223	ENST00000637175	SMARCAD1	Q9H4L7	1026 aa		3.08	□□□□□ -1.92
ATRX-223	ENST00000637175	GAREM1	Q9H706	876 aa		3.08	□□□□□ -1.92
ATRX-223	ENST00000637175	WSB2	Q9NYS7	404 aa	Predicted RBP	3.08	□□□□□ -1.92
ATRX-223	ENST00000637175	OR14J1	Q9UGF5	321 aa		3.08	□□□□□ -1.92
ATRX-223	ENST00000637175	SEC63	Q9UGP8	760 aa	Known RBP	3.08	□□□□□ -1.92
ATRX-223	ENST00000637175	PADI3	Q9ULW8	664 aa		3.08	□□□□□ -1.92
ATRX-223	ENST00000637175	TMEM184B	Q9Y519	407 aa	Predicted RBP	3.08	□□□□□ -1.92
ATRX-223	ENST00000637175	PASK	Q96RG2	1323 aa		3.08	□□□□□ -1.92
ATRX-223	ENST00000637175	IGLV5-37	A0A075B6J1	123 aa		3.07	□□□□□ -1.92
ATRX-223	ENST00000637175		A0A1W2PQ09	198 aa		3.07	□□□□□ -1.92
ATRX-223	ENST00000637175	OR2A25	A4D2G3	310 aa		3.07	□□□□□ -1.92
ATRX-223	ENST00000637175	SMAD9	O15198	467 aa	Known RBP	3.07	□□□□□ -1.92
ATRX-223	ENST00000637175	MID1	O15344	667 aa		3.07	□□□□□ -1.92
ATRX-223	ENST00000637175	SPINT2	O43291	252 aa		3.07	□□□□□ -1.92
ATRX-223	ENST00000637175	KCNAB3	O43448	404 aa		3.07	□□□□□ -1.92
ATRX-223	ENST00000637175	HIST1H2AB	P04908	130 aa		3.07	□□□□□ -1.92
ATRX-223	ENST00000637175	TUBB	P07437	444 aa		3.07	□□□□□ -1.92
ATRX-223	ENST00000637175	LINC00271	P0C7V0	271 aa		3.07	□□□□□ -1.92
ATRX-223	ENST00000637175	ANXA7	P20073	488 aa	Known RBP	3.07	□□□□□ -1.92
ATRX-223	ENST00000637175	HIST1H2AD	P20671	130 aa		3.07	□□□□□ -1.92
ATRX-223	ENST00000637175	BDKRB2	P30411	391 aa		3.07	□□□□□ -1.92
ATRX-223	ENST00000637175	ACTN2	P35609	894 aa		3.07	□□□□□ -1.92
ATRX-223	ENST00000637175	CDKN2A	P42771	156 aa	Known RBP	3.07	□□□□□ -1.92
ATRX-223	ENST00000637175	TAS2R38	P59533	333 aa		3.07	□□□□□ -1.92
ATRX-223	ENST00000637175	FOXM1	Q08050	763 aa		3.07	□□□□□ -1.92
ATRX-223	ENST00000637175	DDR1	Q08345	913 aa		3.07	□□□□□ -1.92
ATRX-223	ENST00000637175	ZNF155	Q12901	538 aa	Predicted RBP	3.07	□□□□□ -1.92
ATRX-223	ENST00000637175	DLG1	Q12959	904 aa		3.07	□□□□□ -1.92
ATRX-223	ENST00000637175	CTF1	Q16619	201 aa		3.07	□□□□□ -1.92
ATRX-223	ENST00000637175	ZSCAN23	Q3MJ62	389 aa		3.07	□□□□□ -1.92
ATRX-223	ENST00000637175	RILPL1	Q5EBL4	403 aa		3.07	□□□□□ -1.92
ATRX-223	ENST00000637175	DUS1L	Q6P1R4	473 aa	Known RBP	3.07	□□□□□ -1.92
ATRX-223	ENST00000637175	WDR73	Q6P4I2	378 aa		3.07	□□□□□ -1.92

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