RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000623253.4_PAR_Y

CD99-211, Transcript of CD99 molecule (Xg blood group), humanhuman

TSL 1 (best)

Gene CD99, Length 573 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y PSTKQ8IV42 348 aaKnown RBP16.1■□□□□ 0.17
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CD99-211ENST00000623253_PAR_Y C9orf43Q8TAL5 461 aaPredicted RBP16.1■□□□□ 0.17
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CD99-211ENST00000623253_PAR_Y HSPH1Q92598 858 aa16.1■□□□□ 0.17
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y SCAMP4Q969E2 229 aa16.1■□□□□ 0.17
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CD99-211ENST00000623253_PAR_Y ATP1A3P13637 1013 aa16.08■□□□□ 0.16
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CD99-211ENST00000623253_PAR_Y EPHB1P54762 984 aa16.08■□□□□ 0.16
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y CDH6P55285 790 aa16.08■□□□□ 0.16
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CD99-211ENST00000623253_PAR_Y HHEXQ03014 270 aa16.08■□□□□ 0.16
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CD99-211ENST00000623253_PAR_Y RIOK2Q9BVS4 552 aaKnown RBP16.08■□□□□ 0.16
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CD99-211ENST00000623253_PAR_Y NT5MQ9NPB1 228 aa16.08■□□□□ 0.16
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y STAU2Q9NUL3 570 aaKnown RBP eCLIP16.08■□□□□ 0.16
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CD99-211ENST00000623253_PAR_Y ASIC2Q16515 512 aa16.07■□□□□ 0.16
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y RALGPS1Q5JS13 557 aa16.07■□□□□ 0.16
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CD99-211ENST00000623253_PAR_Y EXD1Q8NHP7 514 aa16.07■□□□□ 0.16
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CD99-211ENST00000623253_PAR_Y BPIFA3Q9BQP9 254 aa16.07■□□□□ 0.16
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y SYT11Q9BT88 431 aa16.07■□□□□ 0.16
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y HAUS4Q9H6D7 363 aa16.07■□□□□ 0.16
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y APMAPQ9HDC9 416 aa16.07■□□□□ 0.16
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y TMEM63CQ9P1W3 806 aa16.07■□□□□ 0.16
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y MYO6Q9UM54 1294 aa16.07■□□□□ 0.16
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y SCINQ9Y6U3 715 aa16.07■□□□□ 0.16
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y COL12A1Q99715 3063 aa16.06■□□□□ 0.16
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CD99-211ENST00000623253_PAR_Y PYGLP06737 847 aa16.06■□□□□ 0.16
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y TCF4P15884 667 aa16.06■□□□□ 0.16
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y TCN2P20062 427 aa16.06■□□□□ 0.16
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y OAS2P29728 719 aaKnown RBP16.06■□□□□ 0.16
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y SEPT6Q14141 434 aa16.06■□□□□ 0.16
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y DPYSL2Q16555 572 aa16.06■□□□□ 0.16
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y ANO6Q4KMQ2 910 aa16.06■□□□□ 0.16
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y BOLA3Q53S33 107 aa16.06■□□□□ 0.16
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y CHCHD2P9Q5T1J5 151 aaPredicted RBP16.06■□□□□ 0.16
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y ATP1A1-AS1Q5TC04 95 aa16.06■□□□□ 0.16
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y ARHGAP22Q7Z5H3 698 aa16.06■□□□□ 0.16
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y STARD8Q92502 1023 aa16.06■□□□□ 0.16
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y SH3KBP1Q96B97 665 aa16.06■□□□□ 0.16
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y RNF31Q96EP0 1072 aa16.06■□□□□ 0.16
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