RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000622166.1

IGHV3-54-201, Transcript of immunoglobulin heavy variable 3-54 (pseudogene), humanhuman

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Gene IGHV3-54, Length 353 nt, Biotype IG V pseudogene.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGHV3-54-201ENST00000622166 CACNB2Q08289 660 aaPredicted RBP9.58□□□□□ -0.88
IGHV3-54-201ENST00000622166 LCP2Q13094 533 aa9.58□□□□□ -0.88
IGHV3-54-201ENST00000622166 GRB7Q14451 532 aa9.58□□□□□ -0.88
IGHV3-54-201ENST00000622166 INPP5AQ14642 412 aa9.58□□□□□ -0.88
IGHV3-54-201ENST00000622166 PTPRCAPQ14761 206 aa9.58□□□□□ -0.88
IGHV3-54-201ENST00000622166 TAF1AQ15573 450 aaPredicted RBP9.58□□□□□ -0.88
IGHV3-54-201ENST00000622166 KIF19Q2TAC6 998 aa9.58□□□□□ -0.88
IGHV3-54-201ENST00000622166 MAP7D1Q3KQU3 841 aa9.58□□□□□ -0.88
IGHV3-54-201ENST00000622166 LARP7Q4G0J3 582 aaKnown RBP eCLIP9.58□□□□□ -0.88
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IGHV3-54-201ENST00000622166 C10orf120Q5SQS8 335 aa9.58□□□□□ -0.88
IGHV3-54-201ENST00000622166 ANKS6Q68DC2 871 aa9.58□□□□□ -0.88
IGHV3-54-201ENST00000622166 TXNDC11Q6PKC3 985 aa9.58□□□□□ -0.88
IGHV3-54-201ENST00000622166 TRAF7Q6Q0C0 670 aa9.58□□□□□ -0.88
IGHV3-54-201ENST00000622166 BLOC1S3Q6QNY0 202 aa9.58□□□□□ -0.88
IGHV3-54-201ENST00000622166 AFTPHQ6ULP2 937 aa9.58□□□□□ -0.88
IGHV3-54-201ENST00000622166 LAYNQ6UX15 382 aa9.58□□□□□ -0.88
IGHV3-54-201ENST00000622166 SLC24A5Q71RS6 500 aa9.58□□□□□ -0.88
IGHV3-54-201ENST00000622166 ZNF354CQ86Y25 554 aa9.58□□□□□ -0.88
IGHV3-54-201ENST00000622166 BBS5Q8N3I7 341 aa9.58□□□□□ -0.88
IGHV3-54-201ENST00000622166 FBXO39Q8N4B4 442 aa9.58□□□□□ -0.88
IGHV3-54-201ENST00000622166 NKAPQ8N5F7 415 aaKnown RBP9.58□□□□□ -0.88
IGHV3-54-201ENST00000622166 BLOC1S5Q8TDH9 187 aa9.58□□□□□ -0.88
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IGHV3-54-201ENST00000622166 SLC45A3Q96JT2 553 aa9.58□□□□□ -0.88
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IGHV3-54-201ENST00000622166 SLC29A1Q99808 456 aa9.58□□□□□ -0.88
IGHV3-54-201ENST00000622166 ANKRD60Q9BZ19 345 aa9.58□□□□□ -0.88
IGHV3-54-201ENST00000622166 TUBB1Q9H4B7 451 aa9.58□□□□□ -0.88
IGHV3-54-201ENST00000622166 PNPLA3Q9NST1 481 aa9.58□□□□□ -0.88
IGHV3-54-201ENST00000622166 AIG1Q9NVV5 245 aa9.58□□□□□ -0.88
IGHV3-54-201ENST00000622166 DUS2Q9NX74 493 aaKnown RBP9.58□□□□□ -0.88
IGHV3-54-201ENST00000622166 CMTM6Q9NX76 183 aa9.58□□□□□ -0.88
IGHV3-54-201ENST00000622166 ACTR3BQ9P1U1 418 aa9.58□□□□□ -0.88
IGHV3-54-201ENST00000622166 SEPT3Q9UH03 358 aa9.58□□□□□ -0.88
IGHV3-54-201ENST00000622166 MED16Q9Y2X0 877 aa9.58□□□□□ -0.88
IGHV3-54-201ENST00000622166 ARIH1Q9Y4X5 557 aaPredicted RBP9.58□□□□□ -0.88
IGHV3-54-201ENST00000622166 PCDHA9Q9Y5H5 950 aa9.58□□□□□ -0.88
IGHV3-54-201ENST00000622166 SNX13Q9Y5W8 968 aa9.58□□□□□ -0.88
IGHV3-54-201ENST00000622166 GPR45Q9Y5Y3 372 aa9.58□□□□□ -0.88
IGHV3-54-201ENST00000622166 OAS3Q9Y6K5 1087 aaKnown RBP9.58□□□□□ -0.88
IGHV3-54-201ENST00000622166 ATP6AP2A0A1C7CYW4 349 aa9.57□□□□□ -0.88
IGHV3-54-201ENST00000622166 GRXCR2A6NFK2 248 aa9.57□□□□□ -0.88
IGHV3-54-201ENST00000622166 SYCE1LA8MT33 242 aa9.57□□□□□ -0.88
IGHV3-54-201ENST00000622166 PPP6CO00743 305 aa9.57□□□□□ -0.88
IGHV3-54-201ENST00000622166 ANGPT2O15123 496 aa9.57□□□□□ -0.88
IGHV3-54-201ENST00000622166 KDELR3O43731 214 aa9.57□□□□□ -0.88
IGHV3-54-201ENST00000622166 ACSL4O60488 711 aa9.57□□□□□ -0.88
IGHV3-54-201ENST00000622166 ECI2O75521 394 aa9.57□□□□□ -0.88
IGHV3-54-201ENST00000622166 ATP6AP2O75787 350 aa9.57□□□□□ -0.88
IGHV3-54-201ENST00000622166 RHOBTB1O94844 696 aa9.57□□□□□ -0.88
IGHV3-54-201ENST00000622166 SIX3O95343 332 aaPredicted RBP9.57□□□□□ -0.88
IGHV3-54-201ENST00000622166 BMP10O95393 424 aa9.57□□□□□ -0.88
IGHV3-54-201ENST00000622166 H6PDO95479 791 aa9.57□□□□□ -0.88
IGHV3-54-201ENST00000622166 TBX18O95935 607 aa9.57□□□□□ -0.88
IGHV3-54-201ENST00000622166 MT-CO1P00395 513 aa9.57□□□□□ -0.88
IGHV3-54-201ENST00000622166 ASLP04424 464 aa9.57□□□□□ -0.88
IGHV3-54-201ENST00000622166 GPIP06744 558 aa9.57□□□□□ -0.88
IGHV3-54-201ENST00000622166 C7P10643 843 aa9.57□□□□□ -0.88
IGHV3-54-201ENST00000622166 CR2P20023 1033 aa9.57□□□□□ -0.88
IGHV3-54-201ENST00000622166 FGFR3P22607 806 aa9.57□□□□□ -0.88
IGHV3-54-201ENST00000622166 SLC6A2P23975 617 aa9.57□□□□□ -0.88
IGHV3-54-201ENST00000622166 EEF1DP29692 281 aaKnown RBP9.57□□□□□ -0.88
IGHV3-54-201ENST00000622166 OR1E1P30953 314 aa9.57□□□□□ -0.88
IGHV3-54-201ENST00000622166 OR1G1P47890 313 aa9.57□□□□□ -0.88
IGHV3-54-201ENST00000622166 ZNF157P51786 506 aaPredicted RBP9.57□□□□□ -0.88
IGHV3-54-201ENST00000622166 FOXA1P55317 472 aa9.57□□□□□ -0.88
IGHV3-54-201ENST00000622166 EEFSECP57772 596 aaKnown RBP9.57□□□□□ -0.88
IGHV3-54-201ENST00000622166 GNA12Q03113 381 aa9.57□□□□□ -0.88
IGHV3-54-201ENST00000622166 SMARCB1Q12824 385 aa9.57□□□□□ -0.88
IGHV3-54-201ENST00000622166 TAF10Q12962 218 aa9.57□□□□□ -0.88
IGHV3-54-201ENST00000622166 PFKFB4Q16877 469 aa9.57□□□□□ -0.88
IGHV3-54-201ENST00000622166 KCTD21Q4G0X4 260 aa9.57□□□□□ -0.88
IGHV3-54-201ENST00000622166 PDCD4Q53EL6 469 aaKnown RBP9.57□□□□□ -0.88
IGHV3-54-201ENST00000622166 XKR7Q5GH72 579 aa9.57□□□□□ -0.88
IGHV3-54-201ENST00000622166 MTX3Q5HYI7 312 aa9.57□□□□□ -0.88
IGHV3-54-201ENST00000622166 NHSL2Q5HYW2 709 aa9.57□□□□□ -0.88
IGHV3-54-201ENST00000622166 PAQR3Q6TCH7 311 aa9.57□□□□□ -0.88
IGHV3-54-201ENST00000622166 CYP2R1Q6VVX0 501 aa9.57□□□□□ -0.88
IGHV3-54-201ENST00000622166 ZBTB49Q6ZSB9 765 aa9.57□□□□□ -0.88
IGHV3-54-201ENST00000622166 EP400NLQ6ZTU2 488 aa9.57□□□□□ -0.88
IGHV3-54-201ENST00000622166 SPRED1Q7Z699 444 aa9.57□□□□□ -0.88
IGHV3-54-201ENST00000622166 AMIGO2Q86SJ2 522 aa9.57□□□□□ -0.88
IGHV3-54-201ENST00000622166 CIR1Q86X95 450 aaPredicted RBP9.57□□□□□ -0.88
IGHV3-54-201ENST00000622166 PTRH1Q86Y79 214 aaKnown RBP9.57□□□□□ -0.88
IGHV3-54-201ENST00000622166 ADGRG5Q8IZF4 528 aa9.57□□□□□ -0.88
IGHV3-54-201ENST00000622166 LGI2Q8N0V4 545 aa9.57□□□□□ -0.88
IGHV3-54-201ENST00000622166 RYBPQ8N488 228 aaPredicted RBP9.57□□□□□ -0.88
IGHV3-54-201ENST00000622166 SNX31Q8N9S9 440 aa9.57□□□□□ -0.88
IGHV3-54-201ENST00000622166 PAPD5Q8NDF8 572 aaKnown RBP9.57□□□□□ -0.88
IGHV3-54-201ENST00000622166 TSPAN14Q8NG11 270 aa9.57□□□□□ -0.88
IGHV3-54-201ENST00000622166 ZFP28Q8NHY6 868 aa9.57□□□□□ -0.88
IGHV3-54-201ENST00000622166 CANT1Q8WVQ1 401 aa9.57□□□□□ -0.88
IGHV3-54-201ENST00000622166 EXT2Q93063 718 aa9.57□□□□□ -0.88
IGHV3-54-201ENST00000622166 TMEM125Q96AQ2 219 aa9.57□□□□□ -0.88
IGHV3-54-201ENST00000622166 LRRC58Q96CX6 371 aa9.57□□□□□ -0.88
IGHV3-54-201ENST00000622166 NMD3Q96D46 503 aaKnown RBP9.57□□□□□ -0.88
IGHV3-54-201ENST00000622166 MYEOVQ96EZ4 313 aa9.57□□□□□ -0.88
IGHV3-54-201ENST00000622166 NSUN5Q96P11 429 aaKnown RBP9.57□□□□□ -0.88
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