RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000562443.1

CFAP20-202, Transcript of cilia and flagella associated protein 20, humanhuman

TSL 5

Gene CFAP20, Length 276 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP20-202ENST00000562443 FAM227BQ96M60 508 aa-0.04□□□□□ -2.42
CFAP20-202ENST00000562443 TEFMQ96QE5 360 aaKnown RBP-0.04□□□□□ -2.42
CFAP20-202ENST00000562443 KRT12Q99456 494 aa-0.04□□□□□ -2.42
CFAP20-202ENST00000562443 DNAJC2Q99543 621 aaKnown RBP-0.04□□□□□ -2.42
CFAP20-202ENST00000562443 MTERF1Q99551 399 aaKnown RBP-0.04□□□□□ -2.42
CFAP20-202ENST00000562443 CADM1Q9BY67 442 aaKnown RBP-0.04□□□□□ -2.42
CFAP20-202ENST00000562443 SPRR2GQ9BYE4 73 aa-0.04□□□□□ -2.42
CFAP20-202ENST00000562443 DPH1Q9BZG8 443 aa-0.04□□□□□ -2.42
CFAP20-202ENST00000562443 XRN2Q9H0D6 950 aaKnown RBP eCLIP-0.04□□□□□ -2.42
CFAP20-202ENST00000562443 PNNQ9H307 717 aaKnown RBP-0.04□□□□□ -2.42
CFAP20-202ENST00000562443 SMURF2Q9HAU4 748 aa-0.04□□□□□ -2.42
CFAP20-202ENST00000562443 ZBTB20Q9HC78 741 aaPredicted RBP-0.04□□□□□ -2.42
CFAP20-202ENST00000562443 Q9N2J8 555 aa-0.04□□□□□ -2.42
CFAP20-202ENST00000562443 WDR6Q9NNW5 1121 aaKnown RBP-0.04□□□□□ -2.42
CFAP20-202ENST00000562443 KCNK9Q9NPC2 374 aa-0.04□□□□□ -2.42
CFAP20-202ENST00000562443 ZDHHC4Q9NPG8 344 aa-0.04□□□□□ -2.42
CFAP20-202ENST00000562443 HEYLQ9NQ87 328 aaPredicted RBP-0.04□□□□□ -2.42
CFAP20-202ENST00000562443 PRDM11Q9NQV5 511 aa-0.04□□□□□ -2.42
CFAP20-202ENST00000562443 INPP5EQ9NRR6 644 aa-0.04□□□□□ -2.42
CFAP20-202ENST00000562443 RXFP3Q9NSD7 469 aa-0.04□□□□□ -2.42
CFAP20-202ENST00000562443 TMEM30AQ9NV96 361 aa-0.04□□□□□ -2.42
CFAP20-202ENST00000562443 FANCLQ9NW38 375 aa-0.04□□□□□ -2.42
CFAP20-202ENST00000562443 ZNF586Q9NXT0 402 aa-0.04□□□□□ -2.42
CFAP20-202ENST00000562443 CISD1Q9NZ45 108 aaKnown RBP-0.04□□□□□ -2.42
CFAP20-202ENST00000562443 TMOD4Q9NZQ9 345 aa-0.04□□□□□ -2.42
CFAP20-202ENST00000562443 ZNF212Q9UDV6 495 aa-0.04□□□□□ -2.42
CFAP20-202ENST00000562443 RAB21Q9UL25 225 aa-0.04□□□□□ -2.42
CFAP20-202ENST00000562443 RAB26Q9ULW5 256 aa-0.04□□□□□ -2.42
CFAP20-202ENST00000562443 DHDHQ9UQ10 334 aa-0.04□□□□□ -2.42
CFAP20-202ENST00000562443 PPP1R3CQ9UQK1 317 aa-0.04□□□□□ -2.42
CFAP20-202ENST00000562443 WDR37Q9Y2I8 494 aa-0.04□□□□□ -2.42
CFAP20-202ENST00000562443 RABGAP1Q9Y3P9 1069 aa-0.04□□□□□ -2.42
CFAP20-202ENST00000562443 NAALAD2Q9Y3Q0 740 aa-0.04□□□□□ -2.42
CFAP20-202ENST00000562443 SAMHD1Q9Y3Z3 626 aaKnown RBP-0.04□□□□□ -2.42
CFAP20-202ENST00000562443 PKP3Q9Y446 797 aa-0.04□□□□□ -2.42
CFAP20-202ENST00000562443 PCDHGB5Q9Y5G0 923 aa-0.04□□□□□ -2.42
CFAP20-202ENST00000562443 STYXL1Q9Y6J8 313 aa-0.04□□□□□ -2.42
CFAP20-202ENST00000562443 MORC2Q9Y6X9 1032 aaPredicted RBP-0.04□□□□□ -2.42
CFAP20-202ENST00000562443 MST1RQ04912 1400 aa-0.04□□□□□ -2.42
CFAP20-202ENST00000562443 SEC16AO15027 2179 aa-0.05□□□□□ -2.42
CFAP20-202ENST00000562443 FLT1P17948 1338 aa-0.05□□□□□ -2.42
CFAP20-202ENST00000562443 SYNE2Q8WXH0 6885 aaKnown RBP-0.05□□□□□ -2.42
CFAP20-202ENST00000562443 A0A087X0B3 334 aa-0.05□□□□□ -2.42
CFAP20-202ENST00000562443 IGKV3D-11A0A0A0MRZ8 115 aa-0.05□□□□□ -2.42
CFAP20-202ENST00000562443 SHTN1A0MZ66 631 aa-0.05□□□□□ -2.42
CFAP20-202ENST00000562443 TYW5A2RUC4 315 aaKnown RBP-0.05□□□□□ -2.42
CFAP20-202ENST00000562443 PINLYPA6NC86 204 aa-0.05□□□□□ -2.42
CFAP20-202ENST00000562443 TRIM49D1C9J1S8 452 aa-0.05□□□□□ -2.42
CFAP20-202ENST00000562443 FAM157AC9JC47 383 aa-0.05□□□□□ -2.42
CFAP20-202ENST00000562443 E9PAM4 449 aa-0.05□□□□□ -2.42
CFAP20-202ENST00000562443 J3QKU1 62 aa-0.05□□□□□ -2.42
CFAP20-202ENST00000562443 M0QYT0 321 aa-0.05□□□□□ -2.42
CFAP20-202ENST00000562443 TNFSF11O14788 317 aa-0.05□□□□□ -2.42
CFAP20-202ENST00000562443 WNT9BO14905 357 aa-0.05□□□□□ -2.42
CFAP20-202ENST00000562443 SLC22A2O15244 555 aa-0.05□□□□□ -2.42
CFAP20-202ENST00000562443 EIF3DO15371 548 aaKnown RBP eCLIP-0.05□□□□□ -2.42
CFAP20-202ENST00000562443 NCAM2O15394 837 aa-0.05□□□□□ -2.42
CFAP20-202ENST00000562443 GPR39O43194 453 aa-0.05□□□□□ -2.42
CFAP20-202ENST00000562443 HNRNPRO43390 633 aaKnown RBP-0.05□□□□□ -2.42
CFAP20-202ENST00000562443 SLC25A17O43808 307 aa-0.05□□□□□ -2.42
CFAP20-202ENST00000562443 COQ9O75208 318 aa-0.05□□□□□ -2.42
CFAP20-202ENST00000562443 SH3BGRLO75368 114 aa-0.05□□□□□ -2.42
CFAP20-202ENST00000562443 CDC45O75419 566 aa-0.05□□□□□ -2.42
CFAP20-202ENST00000562443 STAM2O75886 525 aa-0.05□□□□□ -2.42
CFAP20-202ENST00000562443 MTA2O94776 668 aa-0.05□□□□□ -2.42
CFAP20-202ENST00000562443 NDUFB4O95168 129 aa-0.05□□□□□ -2.42
CFAP20-202ENST00000562443 PIGNO95427 931 aa-0.05□□□□□ -2.42
CFAP20-202ENST00000562443 POP4O95707 220 aaKnown RBP-0.05□□□□□ -2.42
CFAP20-202ENST00000562443 VIPP01282 170 aa-0.05□□□□□ -2.42
CFAP20-202ENST00000562443 IL1AP01583 271 aa-0.05□□□□□ -2.42
CFAP20-202ENST00000562443 TXNP10599 105 aaKnown RBP-0.05□□□□□ -2.42
CFAP20-202ENST00000562443 NR2C1P13056 603 aa-0.05□□□□□ -2.42
CFAP20-202ENST00000562443 IL1R1P14778 569 aa-0.05□□□□□ -2.42
CFAP20-202ENST00000562443 LIFP15018 202 aa-0.05□□□□□ -2.42
CFAP20-202ENST00000562443 CD1EP15812 388 aa-0.05□□□□□ -2.42
CFAP20-202ENST00000562443 ZNF823P16415 610 aa-0.05□□□□□ -2.42
CFAP20-202ENST00000562443 IGFBP2P18065 325 aa-0.05□□□□□ -2.42
CFAP20-202ENST00000562443 MSH3P20585 1137 aa-0.05□□□□□ -2.42
CFAP20-202ENST00000562443 UGT1A1P22309 533 aa-0.05□□□□□ -2.42
CFAP20-202ENST00000562443 PRKACGP22612 351 aa-0.05□□□□□ -2.42
CFAP20-202ENST00000562443 MCCP23508 829 aa-0.05□□□□□ -2.42
CFAP20-202ENST00000562443 RRM1P23921 792 aa-0.05□□□□□ -2.42
CFAP20-202ENST00000562443 AKAP5P24588 427 aa-0.05□□□□□ -2.42
CFAP20-202ENST00000562443 GIFP27352 417 aa-0.05□□□□□ -2.42
CFAP20-202ENST00000562443 EPHA2P29317 976 aa-0.05□□□□□ -2.42
CFAP20-202ENST00000562443 OAS2P29728 719 aaKnown RBP-0.05□□□□□ -2.42
CFAP20-202ENST00000562443 AXLP30530 894 aa-0.05□□□□□ -2.42
CFAP20-202ENST00000562443 EIF2S3P41091 472 aaKnown RBP-0.05□□□□□ -2.42
CFAP20-202ENST00000562443 MAGEA11P43364 429 aa-0.05□□□□□ -2.42
CFAP20-202ENST00000562443 LEPRP48357 1165 aaKnown RBP-0.05□□□□□ -2.42
CFAP20-202ENST00000562443 ZNF136P52737 540 aa-0.05□□□□□ -2.42
CFAP20-202ENST00000562443 CRISP1P54107 249 aa-0.05□□□□□ -2.42
CFAP20-202ENST00000562443 TMEM50BP56557 158 aa-0.05□□□□□ -2.42
CFAP20-202ENST00000562443 WNT4P56705 351 aa-0.05□□□□□ -2.42
CFAP20-202ENST00000562443 GSDMDP57764 484 aa-0.05□□□□□ -2.42
CFAP20-202ENST00000562443 B3GALT5-AS1P59052 145 aa-0.05□□□□□ -2.42
CFAP20-202ENST00000562443 PPIAP62937 165 aaKnown RBP-0.05□□□□□ -2.42
CFAP20-202ENST00000562443 CYCSP99999 105 aaKnown RBP-0.05□□□□□ -2.42
CFAP20-202ENST00000562443 CDR2Q01850 454 aa-0.05□□□□□ -2.42
CFAP20-202ENST00000562443 ZNF33BQ06732 778 aa-0.05□□□□□ -2.42
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.1 ms