RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000559861.1

USP3-AS1-204, USP3 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene USP3-AS1, Length 620 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP3-AS1-204ENST00000559861 PPM1DO15297 605 aa8.9□□□□□ -0.98
USP3-AS1-204ENST00000559861 CHRM2P08172 466 aa8.9□□□□□ -0.98
USP3-AS1-204ENST00000559861 CD59P13987 128 aa8.9□□□□□ -0.98
USP3-AS1-204ENST00000559861 DPP6P42658 865 aa8.9□□□□□ -0.98
USP3-AS1-204ENST00000559861 ZXDBP98169 803 aa8.9□□□□□ -0.98
USP3-AS1-204ENST00000559861 E2F2Q14209 437 aa8.9□□□□□ -0.98
USP3-AS1-204ENST00000559861 LYSMD4Q5XG99 296 aa8.9□□□□□ -0.98
USP3-AS1-204ENST00000559861 JADE1Q6IE81 842 aa8.9□□□□□ -0.98
USP3-AS1-204ENST00000559861 RGS7BPQ6MZT1 257 aaPredicted RBP8.9□□□□□ -0.98
USP3-AS1-204ENST00000559861 DTX2Q86UW9 622 aa8.9□□□□□ -0.98
USP3-AS1-204ENST00000559861 EFCAB13Q8IY85 973 aa8.9□□□□□ -0.98
USP3-AS1-204ENST00000559861 CHCHD4Q8N4Q1 142 aa8.9□□□□□ -0.98
USP3-AS1-204ENST00000559861 NECAB1Q8N987 351 aa8.9□□□□□ -0.98
USP3-AS1-204ENST00000559861 IL17RCQ8NAC3 791 aa8.9□□□□□ -0.98
USP3-AS1-204ENST00000559861 CCDC26Q8TAB7 109 aa8.9□□□□□ -0.98
USP3-AS1-204ENST00000559861 ADAMTS14Q8WXS8 1223 aa8.9□□□□□ -0.98
USP3-AS1-204ENST00000559861 TFAP2BQ92481 460 aa8.9□□□□□ -0.98
USP3-AS1-204ENST00000559861 MRPS31Q92665 395 aaKnown RBP8.9□□□□□ -0.98
USP3-AS1-204ENST00000559861 SPSB4Q96A44 273 aa8.9□□□□□ -0.98
USP3-AS1-204ENST00000559861 ALG8Q9BVK2 526 aa8.9□□□□□ -0.98
USP3-AS1-204ENST00000559861 NUSAP1Q9BXS6 441 aaKnown RBP8.9□□□□□ -0.98
USP3-AS1-204ENST00000559861 KRTAP4-2Q9BYR5 136 aa8.9□□□□□ -0.98
USP3-AS1-204ENST00000559861 CXorf36Q9H7Y0 433 aa8.9□□□□□ -0.98
USP3-AS1-204ENST00000559861 FSCN3Q9NQT6 498 aa8.9□□□□□ -0.98
USP3-AS1-204ENST00000559861 DKK4Q9UBT3 224 aa8.9□□□□□ -0.98
USP3-AS1-204ENST00000559861 LRWD1Q9UFC0 647 aa8.9□□□□□ -0.98
USP3-AS1-204ENST00000559861 SERTAD3Q9UJW9 196 aa8.9□□□□□ -0.98
USP3-AS1-204ENST00000559861 CPSF3Q9UKF6 684 aaKnown RBP8.9□□□□□ -0.98
USP3-AS1-204ENST00000559861 ARHGAP26Q9UNA1 814 aa8.9□□□□□ -0.98
USP3-AS1-204ENST00000559861 C2CD2Q9Y426 696 aa8.9□□□□□ -0.98
USP3-AS1-204ENST00000559861 CKAP5Q14008 2032 aa8.9□□□□□ -0.99
USP3-AS1-204ENST00000559861 CCDC151A5D8V7 595 aa8.89□□□□□ -0.99
USP3-AS1-204ENST00000559861 SGK1O00141 431 aa8.89□□□□□ -0.99
USP3-AS1-204ENST00000559861 FOXN3O00409 490 aaPredicted RBP8.89□□□□□ -0.99
USP3-AS1-204ENST00000559861 OGTO15294 1046 aa8.89□□□□□ -0.99
USP3-AS1-204ENST00000559861 NFATC1O95644 943 aa8.89□□□□□ -0.99
USP3-AS1-204ENST00000559861 OLFM2O95897 454 aa8.89□□□□□ -0.99
USP3-AS1-204ENST00000559861 KRT18P05783 430 aaKnown RBP8.89□□□□□ -0.99
USP3-AS1-204ENST00000559861 CSH1P0DML2 217 aa8.89□□□□□ -0.99
USP3-AS1-204ENST00000559861 CSH2P0DML3 217 aa8.89□□□□□ -0.99
USP3-AS1-204ENST00000559861 EIF2DP41214 584 aaKnown RBP8.89□□□□□ -0.99
USP3-AS1-204ENST00000559861 IFNAR2P48551 515 aa8.89□□□□□ -0.99
USP3-AS1-204ENST00000559861 TRAPPC10P48553 1259 aa8.89□□□□□ -0.99
USP3-AS1-204ENST00000559861 PDIA5Q14554 519 aa8.89□□□□□ -0.99
USP3-AS1-204ENST00000559861 TMEM132DQ14C87 1099 aa8.89□□□□□ -0.99
USP3-AS1-204ENST00000559861 IL17AQ16552 155 aa8.89□□□□□ -0.99
USP3-AS1-204ENST00000559861 KYAT1Q16773 422 aa8.89□□□□□ -0.99
USP3-AS1-204ENST00000559861 CCDC142Q17RM4 750 aa8.89□□□□□ -0.99
USP3-AS1-204ENST00000559861 ZC2HC1CQ53FD0 456 aaPredicted RBP8.89□□□□□ -0.99
USP3-AS1-204ENST00000559861 HYIQ5T013 277 aa8.89□□□□□ -0.99
USP3-AS1-204ENST00000559861 WSCD1Q658N2 575 aa8.89□□□□□ -0.99
USP3-AS1-204ENST00000559861 C19orf48Q6RUI8 117 aa8.89□□□□□ -0.99
USP3-AS1-204ENST00000559861 OLFML1Q6UWY5 402 aa8.89□□□□□ -0.99
USP3-AS1-204ENST00000559861 ZDHHC24Q6UX98 284 aa8.89□□□□□ -0.99
USP3-AS1-204ENST00000559861 CCNI2Q6ZMN8 369 aaPredicted RBP8.89□□□□□ -0.99
USP3-AS1-204ENST00000559861 LPCAT2Q7L5N7 544 aa8.89□□□□□ -0.99
USP3-AS1-204ENST00000559861 MINDY1Q8N5J2 469 aa8.89□□□□□ -0.99
USP3-AS1-204ENST00000559861 ALLCQ8N6M5 410 aa8.89□□□□□ -0.99
USP3-AS1-204ENST00000559861 RLN3Q8WXF3 142 aa8.89□□□□□ -0.99
USP3-AS1-204ENST00000559861 FIZ1Q96SL8 496 aa8.89□□□□□ -0.99
USP3-AS1-204ENST00000559861 UNKQ9C0B0 810 aaKnown RBP8.89□□□□□ -0.99
USP3-AS1-204ENST00000559861 ARNT2Q9HBZ2 717 aa8.89□□□□□ -0.99
USP3-AS1-204ENST00000559861 UXTQ9UBK9 157 aaPredicted RBP8.89□□□□□ -0.99
USP3-AS1-204ENST00000559861 DERAQ9Y315 318 aa8.89□□□□□ -0.99
USP3-AS1-204ENST00000559861 TRAV19A0A0A6YYK7 116 aa8.88□□□□□ -0.99
USP3-AS1-204ENST00000559861 HNRNPDLO14979 420 aaKnown RBP8.88□□□□□ -0.99
USP3-AS1-204ENST00000559861 SERPINF2P08697 491 aa8.88□□□□□ -0.99
USP3-AS1-204ENST00000559861 CXCR5P32302 372 aa8.88□□□□□ -0.99
USP3-AS1-204ENST00000559861 TAF6P49848 677 aa8.88□□□□□ -0.99
USP3-AS1-204ENST00000559861 MAPK10P53779 464 aa8.88□□□□□ -0.99
USP3-AS1-204ENST00000559861 SLC12A3P55017 1021 aa8.88□□□□□ -0.99
USP3-AS1-204ENST00000559861 MRPS21P82921 87 aaKnown RBP8.88□□□□□ -0.99
USP3-AS1-204ENST00000559861 HNRNPDQ14103 355 aaKnown RBP8.88□□□□□ -0.99
USP3-AS1-204ENST00000559861 CFAP221Q4G0U5 840 aa8.88□□□□□ -0.99
USP3-AS1-204ENST00000559861 SDHAF4Q5VUM1 108 aa8.88□□□□□ -0.99
USP3-AS1-204ENST00000559861 GLRX5Q86SX6 157 aa8.88□□□□□ -0.99
USP3-AS1-204ENST00000559861 CD302Q8IX05 232 aa8.88□□□□□ -0.99
USP3-AS1-204ENST00000559861 RFKQ969G6 155 aa8.88□□□□□ -0.99
USP3-AS1-204ENST00000559861 PBKQ96KB5 322 aa8.88□□□□□ -0.99
USP3-AS1-204ENST00000559861 PYM1Q9BRP8 204 aaKnown RBP8.88□□□□□ -0.99
USP3-AS1-204ENST00000559861 FOXP1Q9H334 677 aaPredicted RBP8.88□□□□□ -0.99
USP3-AS1-204ENST00000559861 KCND2Q9NZV8 630 aa8.88□□□□□ -0.99
USP3-AS1-204ENST00000559861 COL5A1P20908 1838 aaPredicted RBP8.88□□□□□ -0.99
USP3-AS1-204ENST00000559861 HECTD1Q9ULT8 2610 aa8.88□□□□□ -0.99
USP3-AS1-204ENST00000559861 URB1O60287 2271 aaKnown RBP8.87□□□□□ -0.99
USP3-AS1-204ENST00000559861 PTPN13Q12923 2485 aa8.87□□□□□ -0.99
USP3-AS1-204ENST00000559861 MYH10P35580 1976 aa8.87□□□□□ -0.99
USP3-AS1-204ENST00000559861 SHROOM3Q8TF72 1996 aa8.87□□□□□ -0.99
USP3-AS1-204ENST00000559861 RHPN2P1A8MT19 583 aa8.87□□□□□ -0.99
USP3-AS1-204ENST00000559861 CYB561D2O14569 222 aa8.87□□□□□ -0.99
USP3-AS1-204ENST00000559861 PMM2O15305 246 aa8.87□□□□□ -0.99
USP3-AS1-204ENST00000559861 CBFA2T3O75081 653 aa8.87□□□□□ -0.99
USP3-AS1-204ENST00000559861 C1QL1O75973 258 aa8.87□□□□□ -0.99
USP3-AS1-204ENST00000559861 PDHA1P08559 390 aa8.87□□□□□ -0.99
USP3-AS1-204ENST00000559861 SCP2P22307 547 aa8.87□□□□□ -0.99
USP3-AS1-204ENST00000559861 GRIA3P42263 894 aa8.87□□□□□ -0.99
USP3-AS1-204ENST00000559861 PIK3CBP42338 1070 aa8.87□□□□□ -0.99
USP3-AS1-204ENST00000559861 ZNF131P52739 623 aa8.87□□□□□ -0.99
USP3-AS1-204ENST00000559861 SLC14A1Q13336 389 aa8.87□□□□□ -0.99
USP3-AS1-204ENST00000559861 TRIM29Q14134 588 aa8.87□□□□□ -0.99
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.4 ms