RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000556467.5

CASC1-211, Transcript of cancer susceptibility 1, humanhuman

TSL 5

Gene CASC1, Length 563 nt, Biotype nonsense mediated decay.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASC1-211ENST00000556467 ZNF578Q96N58 590 aaPredicted RBP7.13□□□□□ -1.27
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CASC1-211ENST00000556467 OLFM3Q96PB7 478 aa7.12□□□□□ -1.27
CASC1-211ENST00000556467 FRMD8Q9BZ67 464 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
CASC1-211ENST00000556467 ABCG8Q9H221 673 aa7.12□□□□□ -1.27
CASC1-211ENST00000556467 FAM83DQ9H4H8 585 aa7.12□□□□□ -1.27
CASC1-211ENST00000556467 SYNDIG1Q9H7V2 258 aa7.12□□□□□ -1.27
CASC1-211ENST00000556467 RMI1Q9H9A7 625 aa7.12□□□□□ -1.27
CASC1-211ENST00000556467 ZFYVE1Q9HBF4 777 aa7.12□□□□□ -1.27
CASC1-211ENST00000556467 MAGEE1Q9HCI5 957 aa7.12□□□□□ -1.27
CASC1-211ENST00000556467 MRPL40Q9NQ50 206 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
CASC1-211ENST00000556467 IGF2BP1Q9NZI8 577 aaKnown RBP eCLIP7.12□□□□□ -1.27
CASC1-211ENST00000556467 AKAP7Q9P0M2 348 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
CASC1-211ENST00000556467 VPS18Q9P253 973 aa7.12□□□□□ -1.27
CASC1-211ENST00000556467 LRIT1Q9P2V4 623 aa7.12□□□□□ -1.27
CASC1-211ENST00000556467 CD84Q9UIB8 345 aa7.12□□□□□ -1.27
CASC1-211ENST00000556467 APPL1Q9UKG1 709 aa7.12□□□□□ -1.27
CASC1-211ENST00000556467 PNMA8BQ9ULN7 279 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
CASC1-211ENST00000556467 SLC17A4Q9Y2C5 497 aa7.12□□□□□ -1.27
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CASC1-211ENST00000556467 COL27A1Q8IZC6 1860 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
CASC1-211ENST00000556467 ASPMQ8IZT6 3477 aa7.11□□□□□ -1.27
CASC1-211ENST00000556467 CCDC187A0A096LP49 1063 aa7.11□□□□□ -1.27
CASC1-211ENST00000556467 CCDC66A2RUB6 948 aa7.11□□□□□ -1.27
CASC1-211ENST00000556467 RHPN2P1A8MT19 583 aa7.11□□□□□ -1.27
CASC1-211ENST00000556467 BTNL10A8MVZ5 291 aa7.11□□□□□ -1.27
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