RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000551137.5

CS-223, Transcript of citrate synthase, human

TSL 3

Gene CS, Length 903 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CS-223	ENST00000551137	RIOK2	Q9BVS4	552 aa	Known RBP	11.42	□□□□□ -0.58
CS-223	ENST00000551137	GOLPH3	Q9H4A6	298 aa		11.42	□□□□□ -0.58
CS-223	ENST00000551137	FAM83D	Q9H4H8	585 aa		11.42	□□□□□ -0.58
CS-223	ENST00000551137	ASCL3	Q9NQ33	180 aa		11.42	□□□□□ -0.58
CS-223	ENST00000551137	SPATS2L	Q9NUQ6	558 aa	Known RBP	11.42	□□□□□ -0.58
CS-223	ENST00000551137	PKD2L2	Q9NZM6	624 aa		11.42	□□□□□ -0.58
CS-223	ENST00000551137	SAE1	Q9UBE0	346 aa	Predicted RBP	11.42	□□□□□ -0.58
CS-223	ENST00000551137	CD84	Q9UIB8	345 aa		11.42	□□□□□ -0.58
CS-223	ENST00000551137	MOSPD1	Q9UJG1	213 aa		11.42	□□□□□ -0.58
CS-223	ENST00000551137	CNOT6	Q9ULM6	557 aa	Known RBP	11.42	□□□□□ -0.58
CS-223	ENST00000551137	REXO2	Q9Y3B8	237 aa	Known RBP	11.42	□□□□□ -0.58
CS-223	ENST00000551137	PCDHA3	Q9Y5H8	950 aa		11.42	□□□□□ -0.58
CS-223	ENST00000551137	ST14	Q9Y5Y6	855 aa		11.42	□□□□□ -0.58
CS-223	ENST00000551137	LOC400499	M0QZD8	3231 aa		11.42	□□□□□ -0.58
CS-223	ENST00000551137	ATRX	P46100	2492 aa		11.41	□□□□□ -0.58
CS-223	ENST00000551137	LOC285095	A0A1B0GVY8	99 aa		11.41	□□□□□ -0.58
CS-223	ENST00000551137	SOWAHD	A6NJG2	315 aa		11.41	□□□□□ -0.58
CS-223	ENST00000551137	HACD1	B0YJ81	288 aa		11.41	□□□□□ -0.58
CS-223	ENST00000551137	GPR89A	B7ZAQ6	455 aa		11.41	□□□□□ -0.58
CS-223	ENST00000551137		D6RAR5	112 aa		11.41	□□□□□ -0.58
CS-223	ENST00000551137	APOC4-APOC2	K7ER74	178 aa		11.41	□□□□□ -0.58
CS-223	ENST00000551137	RRP8	O43159	456 aa	Known RBP	11.41	□□□□□ -0.58
CS-223	ENST00000551137	IPO7	O95373	1038 aa	Known RBP	11.41	□□□□□ -0.58
CS-223	ENST00000551137	NDST3	O95803	873 aa		11.41	□□□□□ -0.58
CS-223	ENST00000551137	APOC2	P02655	101 aa		11.41	□□□□□ -0.58
CS-223	ENST00000551137	MPO	P05164	745 aa		11.41	□□□□□ -0.58
CS-223	ENST00000551137	FGF1	P05230	155 aa		11.41	□□□□□ -0.58
CS-223	ENST00000551137	GPR89B	P0CG08	455 aa		11.41	□□□□□ -0.58
CS-223	ENST00000551137	TNNT1	P13805	278 aa		11.41	□□□□□ -0.58
CS-223	ENST00000551137	PECAM1	P16284	738 aa	Predicted RBP	11.41	□□□□□ -0.58
CS-223	ENST00000551137	CCKBR	P32239	447 aa		11.41	□□□□□ -0.58
CS-223	ENST00000551137	CD68	P34810	354 aa	Predicted RBP	11.41	□□□□□ -0.58
CS-223	ENST00000551137	GPR3	P46089	330 aa		11.41	□□□□□ -0.58
CS-223	ENST00000551137	POLD2	P49005	469 aa		11.41	□□□□□ -0.58
CS-223	ENST00000551137	MARCKSL1	P49006	195 aa		11.41	□□□□□ -0.58
CS-223	ENST00000551137	DYNLT1	P63172	113 aa		11.41	□□□□□ -0.58
CS-223	ENST00000551137	GABRE	P78334	506 aa		11.41	□□□□□ -0.58
CS-223	ENST00000551137	CCL7	P80098	99 aa		11.41	□□□□□ -0.58
CS-223	ENST00000551137	B4GALNT1	Q00973	533 aa		11.41	□□□□□ -0.58
CS-223	ENST00000551137	CTBS	Q01459	385 aa		11.41	□□□□□ -0.58
CS-223	ENST00000551137	ZFP36L1	Q07352	338 aa	Known RBP	11.41	□□□□□ -0.58
CS-223	ENST00000551137	SQSTM1	Q13501	440 aa		11.41	□□□□□ -0.58
CS-223	ENST00000551137	PDPK2P	Q6A1A2	396 aa		11.41	□□□□□ -0.58
CS-223	ENST00000551137	SPRED1	Q7Z699	444 aa		11.41	□□□□□ -0.58
CS-223	ENST00000551137	DAAM2	Q86T65	1068 aa		11.41	□□□□□ -0.58
CS-223	ENST00000551137	WDR36	Q8NI36	951 aa	Known RBP	11.41	□□□□□ -0.58
CS-223	ENST00000551137	DTX3L	Q8TDB6	740 aa		11.41	□□□□□ -0.58
CS-223	ENST00000551137	KRT35	Q92764	455 aa		11.41	□□□□□ -0.58
CS-223	ENST00000551137	PRR11	Q96HE9	360 aa	Predicted RBP	11.41	□□□□□ -0.58
CS-223	ENST00000551137	GFM1	Q96RP9	751 aa	Known RBP	11.41	□□□□□ -0.58
CS-223	ENST00000551137	CEP41	Q9BYV8	373 aa		11.41	□□□□□ -0.58
CS-223	ENST00000551137	LRRN3	Q9H3W5	708 aa		11.41	□□□□□ -0.58
CS-223	ENST00000551137	DPEP2	Q9H4A9	486 aa		11.41	□□□□□ -0.58
CS-223	ENST00000551137	RMI1	Q9H9A7	625 aa		11.41	□□□□□ -0.58
CS-223	ENST00000551137	ZFYVE1	Q9HBF4	777 aa		11.41	□□□□□ -0.58
CS-223	ENST00000551137	TAAR2	Q9P1P5	351 aa		11.41	□□□□□ -0.58
CS-223	ENST00000551137	SIRPG	Q9P1W8	387 aa		11.41	□□□□□ -0.58
CS-223	ENST00000551137	LRIT1	Q9P2V4	623 aa		11.41	□□□□□ -0.58
CS-223	ENST00000551137	TRHDE	Q9UKU6	1024 aa		11.41	□□□□□ -0.58
CS-223	ENST00000551137	TFR2	Q9UP52	801 aa		11.41	□□□□□ -0.58
CS-223	ENST00000551137	SSUH2	Q9Y2M2	353 aa		11.41	□□□□□ -0.58
CS-223	ENST00000551137	MGA	Q8IWI9	3026 aa		11.41	□□□□□ -0.58
CS-223	ENST00000551137	CCDC187	A0A096LP49	1063 aa		11.4	□□□□□ -0.58
CS-223	ENST00000551137	CCDC66	A2RUB6	948 aa		11.4	□□□□□ -0.58
CS-223	ENST00000551137	FADS2P1	A8MWK0	482 aa		11.4	□□□□□ -0.58
CS-223	ENST00000551137	CDRT15L2	A8MXV6	281 aa		11.4	□□□□□ -0.58
CS-223	ENST00000551137	CASC3	O15234	703 aa	Known RBP	11.4	□□□□□ -0.58
CS-223	ENST00000551137	DNAJC6	O75061	913 aa		11.4	□□□□□ -0.58
CS-223	ENST00000551137	RPLP0	P05388	317 aa	Known RBP	11.4	□□□□□ -0.58
CS-223	ENST00000551137	CTNNA2	P26232	953 aa		11.4	□□□□□ -0.58
CS-223	ENST00000551137	CDC25B	P30305	580 aa		11.4	□□□□□ -0.58
CS-223	ENST00000551137	HMGCL	P35914	325 aa		11.4	□□□□□ -0.58
CS-223	ENST00000551137	ABCG1	P45844	678 aa		11.4	□□□□□ -0.58
CS-223	ENST00000551137	GNPDA1	P46926	289 aa		11.4	□□□□□ -0.58
CS-223	ENST00000551137	COL28A1	Q2UY09	1125 aa		11.4	□□□□□ -0.58
CS-223	ENST00000551137	CCDC70	Q6NSX1	233 aa		11.4	□□□□□ -0.58
CS-223	ENST00000551137	C19orf48	Q6RUI8	117 aa		11.4	□□□□□ -0.58
CS-223	ENST00000551137	KDELC1	Q6UW63	502 aa		11.4	□□□□□ -0.58
CS-223	ENST00000551137	RAD9B	Q6WBX8	426 aa		11.4	□□□□□ -0.58
CS-223	ENST00000551137	LRRC69	Q6ZNQ3	347 aa		11.4	□□□□□ -0.58
CS-223	ENST00000551137	LYSMD3	Q7Z3D4	306 aa		11.4	□□□□□ -0.58
CS-223	ENST00000551137	CLEC14A	Q86T13	490 aa		11.4	□□□□□ -0.58
CS-223	ENST00000551137	CCNJL	Q8IV13	435 aa		11.4	□□□□□ -0.58
CS-223	ENST00000551137	TMEM139	Q8IV31	216 aa		11.4	□□□□□ -0.58
CS-223	ENST00000551137	SFTPA2	Q8IWL1	248 aa		11.4	□□□□□ -0.58
CS-223	ENST00000551137	NAGS	Q8N159	534 aa		11.4	□□□□□ -0.58
CS-223	ENST00000551137	ARL14	Q8N4G2	192 aa		11.4	□□□□□ -0.58
CS-223	ENST00000551137	LRRC57	Q8N9N7	239 aa		11.4	□□□□□ -0.58
CS-223	ENST00000551137	ZNF248	Q8NDW4	579 aa		11.4	□□□□□ -0.58
CS-223	ENST00000551137	SPATA22	Q8NHS9	363 aa		11.4	□□□□□ -0.58
CS-223	ENST00000551137	ZDHHC1	Q8WTX9	485 aa		11.4	□□□□□ -0.58
CS-223	ENST00000551137	HTR3C	Q8WXA8	447 aa		11.4	□□□□□ -0.58
CS-223	ENST00000551137	TMEM159	Q96B96	161 aa		11.4	□□□□□ -0.58
CS-223	ENST00000551137	TMEM74	Q96NL1	305 aa		11.4	□□□□□ -0.58
CS-223	ENST00000551137	QKI	Q96PU8	341 aa	Known RBP eCLIP	11.4	□□□□□ -0.58
CS-223	ENST00000551137	OR2M4	Q96R27	311 aa		11.4	□□□□□ -0.58
CS-223	ENST00000551137	FCRL5	Q96RD9	977 aa		11.4	□□□□□ -0.58
CS-223	ENST00000551137	ZSCAN5A	Q9BUG6	496 aa		11.4	□□□□□ -0.58
CS-223	ENST00000551137	LACRT	Q9GZZ8	138 aa		11.4	□□□□□ -0.58
CS-223	ENST00000551137	TRABD	Q9H4I3	376 aa		11.4	□□□□□ -0.58

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.1 ms