RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000547298.5

CS-208, Transcript of citrate synthase, human

TSL 3

Gene CS, Length 656 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CS-208	ENST00000547298	B3GNT3	Q9Y2A9	372 aa		11.17	□□□□□ -0.62
CS-208	ENST00000547298	COPG1	Q9Y678	874 aa	Known RBP	11.17	□□□□□ -0.62
CS-208	ENST00000547298	RASA4B	C9J798	803 aa		11.16	□□□□□ -0.62
CS-208	ENST00000547298	TOX3	O15405	576 aa	Predicted RBP	11.16	□□□□□ -0.62
CS-208	ENST00000547298	RASA4	O43374	803 aa		11.16	□□□□□ -0.62
CS-208	ENST00000547298	KIF1C	O43896	1103 aa	Known RBP	11.16	□□□□□ -0.62
CS-208	ENST00000547298	TMEM63A	O94886	807 aa		11.16	□□□□□ -0.62
CS-208	ENST00000547298	SCNN1A	P37088	669 aa		11.16	□□□□□ -0.62
CS-208	ENST00000547298	ETV3	P41162	512 aa		11.16	□□□□□ -0.62
CS-208	ENST00000547298	GABRB2	P47870	512 aa		11.16	□□□□□ -0.62
CS-208	ENST00000547298	NDUFA8	P51970	172 aa		11.16	□□□□□ -0.62
CS-208	ENST00000547298	ART3	Q13508	389 aa		11.16	□□□□□ -0.62
CS-208	ENST00000547298	CFAP58	Q5T655	872 aa		11.16	□□□□□ -0.62
CS-208	ENST00000547298	FAM69B	Q5VUD6	431 aa		11.16	□□□□□ -0.62
CS-208	ENST00000547298	HSD11B1L	Q7Z5J1	315 aa		11.16	□□□□□ -0.62
CS-208	ENST00000547298	SRL	Q86TD4	932 aa		11.16	□□□□□ -0.62
CS-208	ENST00000547298	KCNMB4	Q86W47	210 aa		11.16	□□□□□ -0.62
CS-208	ENST00000547298	PPP1R3B	Q86XI6	285 aa		11.16	□□□□□ -0.62
CS-208	ENST00000547298	KLHL6	Q8WZ60	621 aa		11.16	□□□□□ -0.62
CS-208	ENST00000547298	TBC1D31	Q96DN5	1066 aa		11.16	□□□□□ -0.62
CS-208	ENST00000547298	DTD2	Q96FN9	168 aa		11.16	□□□□□ -0.62
CS-208	ENST00000547298	GPR83	Q9NYM4	423 aa		11.16	□□□□□ -0.62
CS-208	ENST00000547298	C5AR2	Q9P296	337 aa		11.16	□□□□□ -0.62
CS-208	ENST00000547298	COPG2	Q9UBF2	871 aa		11.16	□□□□□ -0.62
CS-208	ENST00000547298	PCDHGA10	Q9Y5H3	936 aa		11.16	□□□□□ -0.62
CS-208	ENST00000547298	KLF2	Q9Y5W3	355 aa	Predicted RBP	11.16	□□□□□ -0.62
CS-208	ENST00000547298	SLC30A1	Q9Y6M5	507 aa		11.16	□□□□□ -0.62
CS-208	ENST00000547298	DCHS2	Q6V1P9	2916 aa		11.16	□□□□□ -0.62
CS-208	ENST00000547298	LILRA5	A6NI73	299 aa		11.15	□□□□□ -0.62
CS-208	ENST00000547298	PPP1R3G	B7ZBB8	358 aa		11.15	□□□□□ -0.62
CS-208	ENST00000547298		F5H423	210 aa	Predicted RBP	11.15	□□□□□ -0.62
CS-208	ENST00000547298		J3KR12	359 aa		11.15	□□□□□ -0.62
CS-208	ENST00000547298	PRICKLE3	O43900	615 aa	Predicted RBP	11.15	□□□□□ -0.62
CS-208	ENST00000547298	HEXIM1	O94992	359 aa	Known RBP	11.15	□□□□□ -0.62
CS-208	ENST00000547298	SNRPB2	P08579	225 aa	Known RBP	11.15	□□□□□ -0.62
CS-208	ENST00000547298	TNFAIP3	P21580	790 aa		11.15	□□□□□ -0.62
CS-208	ENST00000547298	LHCGR	P22888	699 aa		11.15	□□□□□ -0.62
CS-208	ENST00000547298	CA5A	P35218	305 aa		11.15	□□□□□ -0.62
CS-208	ENST00000547298	CSNK1D	P48730	415 aa		11.15	□□□□□ -0.62
CS-208	ENST00000547298	APBA1	Q02410	837 aa		11.15	□□□□□ -0.62
CS-208	ENST00000547298	RAPSN	Q13702	412 aa		11.15	□□□□□ -0.62
CS-208	ENST00000547298	LRP8	Q14114	963 aa		11.15	□□□□□ -0.62
CS-208	ENST00000547298	PTPRR	Q15256	657 aa		11.15	□□□□□ -0.62
CS-208	ENST00000547298	ANO6	Q4KMQ2	910 aa		11.15	□□□□□ -0.62
CS-208	ENST00000547298	C2CD6	Q53TS8	623 aa		11.15	□□□□□ -0.62
CS-208	ENST00000547298	FAM102A	Q5T9C2	384 aa	Predicted RBP	11.15	□□□□□ -0.62
CS-208	ENST00000547298	LCN10	Q6JVE6	187 aa		11.15	□□□□□ -0.62
CS-208	ENST00000547298	IGFL3	Q6UXB1	125 aa		11.15	□□□□□ -0.62
CS-208	ENST00000547298	KRBA2	Q6ZNG9	492 aa		11.15	□□□□□ -0.62
CS-208	ENST00000547298	RFLNA	Q6ZTI6	216 aa		11.15	□□□□□ -0.62
CS-208	ENST00000547298		Q6ZVL8	140 aa		11.15	□□□□□ -0.62
CS-208	ENST00000547298	MARK2	Q7KZI7	788 aa	Known RBP	11.15	□□□□□ -0.62
CS-208	ENST00000547298	SLC9B2	Q86UD5	537 aa		11.15	□□□□□ -0.62
CS-208	ENST00000547298	CUZD1	Q86UP6	607 aa		11.15	□□□□□ -0.62
CS-208	ENST00000547298	TRIM74	Q86UV6	250 aa		11.15	□□□□□ -0.62
CS-208	ENST00000547298	ZNF354C	Q86Y25	554 aa		11.15	□□□□□ -0.62
CS-208	ENST00000547298	ZBTB2	Q8N680	514 aa		11.15	□□□□□ -0.62
CS-208	ENST00000547298	RTL3	Q8N8U3	475 aa	Known RBP	11.15	□□□□□ -0.62
CS-208	ENST00000547298	TSEN2	Q8NCE0	465 aa	Known RBP	11.15	□□□□□ -0.62
CS-208	ENST00000547298	SH3KBP1	Q96B97	665 aa		11.15	□□□□□ -0.62
CS-208	ENST00000547298	TGM7	Q96PF1	710 aa		11.15	□□□□□ -0.62
CS-208	ENST00000547298	TSG101	Q99816	390 aa		11.15	□□□□□ -0.62
CS-208	ENST00000547298	EPB41L1	Q9H4G0	881 aa		11.15	□□□□□ -0.62
CS-208	ENST00000547298	ZNF469	Q96JG9	3925 aa	Predicted RBP	11.15	□□□□□ -0.62
CS-208	ENST00000547298	SPG11	Q96JI7	2443 aa		11.14	□□□□□ -0.63
CS-208	ENST00000547298	FAM170A	A1A519	330 aa		11.14	□□□□□ -0.63
CS-208	ENST00000547298	WASH4P	A8MWX3	477 aa		11.14	□□□□□ -0.63
CS-208	ENST00000547298	DNAJC6	O75061	913 aa		11.14	□□□□□ -0.63
CS-208	ENST00000547298	STS	P08842	583 aa		11.14	□□□□□ -0.63
CS-208	ENST00000547298	FOLR1	P15328	257 aa		11.14	□□□□□ -0.63
CS-208	ENST00000547298	TYRP1	P17643	537 aa		11.14	□□□□□ -0.63
CS-208	ENST00000547298	SERPINA4	P29622	427 aa		11.14	□□□□□ -0.63
CS-208	ENST00000547298	SYK	P43405	635 aa		11.14	□□□□□ -0.63
CS-208	ENST00000547298	RPS15	P62841	145 aa	Known RBP	11.14	□□□□□ -0.63
CS-208	ENST00000547298	UBE2I	P63279	158 aa	Known RBP	11.14	□□□□□ -0.63
CS-208	ENST00000547298	ATP11A	P98196	1134 aa		11.14	□□□□□ -0.63
CS-208	ENST00000547298	LRRC63	Q05C16	580 aa		11.14	□□□□□ -0.63
CS-208	ENST00000547298	CETN1	Q12798	172 aa		11.14	□□□□□ -0.63
CS-208	ENST00000547298	C15orf59	Q2T9L4	293 aa	Predicted RBP	11.14	□□□□□ -0.63
CS-208	ENST00000547298	VWA5B1	Q5TIE3	1220 aa		11.14	□□□□□ -0.63
CS-208	ENST00000547298	IZUMO3	Q5VZ72	239 aa		11.14	□□□□□ -0.63
CS-208	ENST00000547298	RAET1G	Q6H3X3	334 aa		11.14	□□□□□ -0.63
CS-208	ENST00000547298		Q6ZS92	163 aa		11.14	□□□□□ -0.63
CS-208	ENST00000547298	PRSS42	Q7Z5A4	293 aa		11.14	□□□□□ -0.63
CS-208	ENST00000547298	TECPR1	Q7Z6L1	1165 aa		11.14	□□□□□ -0.63
CS-208	ENST00000547298	CCDC185	Q8N715	623 aa		11.14	□□□□□ -0.63
CS-208	ENST00000547298	ITLN2	Q8WWU7	325 aa	Predicted RBP	11.14	□□□□□ -0.63
CS-208	ENST00000547298	SHC3	Q92529	594 aa		11.14	□□□□□ -0.63
CS-208	ENST00000547298	SPOCK2	Q92563	424 aa		11.14	□□□□□ -0.63
CS-208	ENST00000547298	LDHAL6B	Q9BYZ2	381 aa	Predicted RBP	11.14	□□□□□ -0.63
CS-208	ENST00000547298	SYNC	Q9H7C4	482 aa		11.14	□□□□□ -0.63
CS-208	ENST00000547298	ATP13A3	Q9H7F0	1226 aa		11.14	□□□□□ -0.63
CS-208	ENST00000547298	CPNE7	Q9UBL6	633 aa		11.14	□□□□□ -0.63
CS-208	ENST00000547298	UBA2	Q9UBT2	640 aa	Predicted RBP	11.14	□□□□□ -0.63
CS-208	ENST00000547298	AJAP1	Q9UKB5	411 aa	Predicted RBP	11.14	□□□□□ -0.63
CS-208	ENST00000547298	PRKAB1	Q9Y478	270 aa		11.14	□□□□□ -0.63
CS-208	ENST00000547298		A0A0U1RQS6	177 aa		11.13	□□□□□ -0.63
CS-208	ENST00000547298	NEFL	P07196	543 aa		11.13	□□□□□ -0.63
CS-208	ENST00000547298	BPI	P17213	487 aa		11.13	□□□□□ -0.63
CS-208	ENST00000547298	NELFE	P18615	380 aa	Known RBP	11.13	□□□□□ -0.63

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