RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000540101.2

C16orf62-211, Transcript of UPF0505 protein C16orf62, humanhuman

TSL 3

Gene C16orf62, Length 461 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C16orf62-211ENST00000540101 WDR5BQ86VZ2 330 aa7.79□□□□□ -1.16
C16orf62-211ENST00000540101 NLRP8Q86W28 1048 aa7.79□□□□□ -1.16
C16orf62-211ENST00000540101 PIANPQ8IYJ0 282 aa7.79□□□□□ -1.16
C16orf62-211ENST00000540101 NRSN1Q8IZ57 195 aa7.79□□□□□ -1.16
C16orf62-211ENST00000540101 IQCKQ8N0W5 287 aa7.79□□□□□ -1.16
C16orf62-211ENST00000540101 TP53I13Q8NBR0 393 aaPredicted RBP7.79□□□□□ -1.16
C16orf62-211ENST00000540101 GPR150Q8NGU9 434 aa7.79□□□□□ -1.16
C16orf62-211ENST00000540101 SCAMP4Q969E2 229 aa7.79□□□□□ -1.16
C16orf62-211ENST00000540101 HDAC10Q969S8 669 aa7.79□□□□□ -1.16
C16orf62-211ENST00000540101 FUBP1Q96AE4 644 aaKnown RBP7.79□□□□□ -1.16
C16orf62-211ENST00000540101 CENPTQ96BT3 561 aa7.79□□□□□ -1.16
C16orf62-211ENST00000540101 CFAP36Q96G28 342 aa7.79□□□□□ -1.16
C16orf62-211ENST00000540101 TOE1Q96GM8 510 aaKnown RBP7.79□□□□□ -1.16
C16orf62-211ENST00000540101 AGAP2Q99490 1192 aa7.79□□□□□ -1.16
C16orf62-211ENST00000540101 DHRS4Q9BTZ2 278 aa7.79□□□□□ -1.16
C16orf62-211ENST00000540101 BTBD1Q9H0C5 482 aa7.79□□□□□ -1.16
C16orf62-211ENST00000540101 PCED1AQ9H1Q7 454 aa7.79□□□□□ -1.16
C16orf62-211ENST00000540101 ABCG8Q9H221 673 aa7.79□□□□□ -1.16
C16orf62-211ENST00000540101 C6orf106Q9H6K1 298 aaPredicted RBP7.79□□□□□ -1.16
C16orf62-211ENST00000540101 SUDS3Q9H7L9 328 aaPredicted RBP7.79□□□□□ -1.16
C16orf62-211ENST00000540101 EBF2Q9HAK2 575 aa7.79□□□□□ -1.16
C16orf62-211ENST00000540101 BPIFA1Q9NP55 256 aa7.79□□□□□ -1.16
C16orf62-211ENST00000540101 EURLQ9NYK6 297 aa7.79□□□□□ -1.16
C16orf62-211ENST00000540101 IL1RAPL1Q9NZN1 696 aa7.79□□□□□ -1.16
C16orf62-211ENST00000540101 MARCH4Q9P2E8 410 aaPredicted RBP7.79□□□□□ -1.16
C16orf62-211ENST00000540101 SLC17A6Q9P2U8 582 aa7.79□□□□□ -1.16
C16orf62-211ENST00000540101 RABGEF1Q9UJ41 708 aa7.79□□□□□ -1.16
C16orf62-211ENST00000540101 GMEB2Q9UKD1 530 aa7.79□□□□□ -1.16
C16orf62-211ENST00000540101 CYP8B1Q9UNU6 501 aa7.79□□□□□ -1.16
C16orf62-211ENST00000540101 NCKAP1Q9Y2A7 1128 aa7.79□□□□□ -1.16
C16orf62-211ENST00000540101 ZBTB32Q9Y2Y4 487 aaPredicted RBP7.79□□□□□ -1.16
C16orf62-211ENST00000540101 NFS1Q9Y697 457 aa7.79□□□□□ -1.16
C16orf62-211ENST00000540101 SHROOM3Q8TF72 1996 aa7.79□□□□□ -1.16
C16orf62-211ENST00000540101 IGLV3-16A0A075B6K0 115 aa7.78□□□□□ -1.16
C16orf62-211ENST00000540101 GLYATL1P3A0A0U1RQE8 302 aa7.78□□□□□ -1.16
C16orf62-211ENST00000540101 LRRC72A6NJI9 287 aa7.78□□□□□ -1.16
C16orf62-211ENST00000540101 FADS2P1A8MWK0 482 aa7.78□□□□□ -1.16
C16orf62-211ENST00000540101 CXorf49A8MYA2 514 aaPredicted RBP7.78□□□□□ -1.16
C16orf62-211ENST00000540101 K7ESM1 405 aa7.78□□□□□ -1.16
C16orf62-211ENST00000540101 NEMP1O14524 444 aa7.78□□□□□ -1.16
C16orf62-211ENST00000540101 HRO43593 1189 aa7.78□□□□□ -1.16
C16orf62-211ENST00000540101 PIAS1O75925 651 aa7.78□□□□□ -1.16
C16orf62-211ENST00000540101 SRP72O76094 671 aaKnown RBP7.78□□□□□ -1.16
C16orf62-211ENST00000540101 PRAMEF1O95521 474 aa7.78□□□□□ -1.16
C16orf62-211ENST00000540101 GOT2P00505 430 aaKnown RBP7.78□□□□□ -1.16
C16orf62-211ENST00000540101 SHBGP04278 402 aa7.78□□□□□ -1.16
C16orf62-211ENST00000540101 PRSS56P0CW18 603 aa7.78□□□□□ -1.16
C16orf62-211ENST00000540101 ERVK-10P10266 1014 aa7.78□□□□□ -1.16
C16orf62-211ENST00000540101 BCKDHBP21953 392 aa7.78□□□□□ -1.16
C16orf62-211ENST00000540101 GABRB3P28472 473 aa7.78□□□□□ -1.16
C16orf62-211ENST00000540101 GCAP28676 217 aa7.78□□□□□ -1.16
C16orf62-211ENST00000540101 STX2P32856 288 aa7.78□□□□□ -1.16
C16orf62-211ENST00000540101 SPAM1P38567 509 aa7.78□□□□□ -1.16
C16orf62-211ENST00000540101 HADHAP40939 763 aa7.78□□□□□ -1.16
C16orf62-211ENST00000540101 FNTBP49356 437 aa7.78□□□□□ -1.16
C16orf62-211ENST00000540101 TMPRSS15P98073 1019 aa7.78□□□□□ -1.16
C16orf62-211ENST00000540101 MGAT5Q09328 741 aa7.78□□□□□ -1.16
C16orf62-211ENST00000540101 SPEM2Q0P670 501 aa7.78□□□□□ -1.16
C16orf62-211ENST00000540101 NFATC2Q13469 925 aa7.78□□□□□ -1.16
C16orf62-211ENST00000540101 SLC29A2Q14542 456 aa7.78□□□□□ -1.16
C16orf62-211ENST00000540101 EFTUD2Q15029 972 aaKnown RBP eCLIP7.78□□□□□ -1.16
C16orf62-211ENST00000540101 CHRNA6Q15825 494 aa7.78□□□□□ -1.16
C16orf62-211ENST00000540101 MAP9Q49MG5 647 aa7.78□□□□□ -1.16
C16orf62-211ENST00000540101 ZDHHC20Q5W0Z9 365 aa7.78□□□□□ -1.16
C16orf62-211ENST00000540101 KIAA0895LQ68EN5 471 aa7.78□□□□□ -1.16
C16orf62-211ENST00000540101 PDPK2PQ6A1A2 396 aa7.78□□□□□ -1.16
C16orf62-211ENST00000540101 LAIR1Q6GTX8 287 aa7.78□□□□□ -1.16
C16orf62-211ENST00000540101 AFTPHQ6ULP2 937 aa7.78□□□□□ -1.16
C16orf62-211ENST00000540101 FAM151BQ6UXP7 276 aa7.78□□□□□ -1.16
C16orf62-211ENST00000540101 KDM7AQ6ZMT4 941 aa7.78□□□□□ -1.16
C16orf62-211ENST00000540101 PRR23BQ6ZRT6 265 aa7.78□□□□□ -1.16
C16orf62-211ENST00000540101 CAPN12Q6ZSI9 719 aa7.78□□□□□ -1.16
C16orf62-211ENST00000540101 C3orf62Q6ZUJ4 267 aa7.78□□□□□ -1.16
C16orf62-211ENST00000540101 KCNMB4Q86W47 210 aa7.78□□□□□ -1.16
C16orf62-211ENST00000540101 PGBD3Q8N328 593 aa7.78□□□□□ -1.16
C16orf62-211ENST00000540101 TRAM1L1Q8N609 369 aa7.78□□□□□ -1.16
C16orf62-211ENST00000540101 PAF1Q8N7H5 531 aa7.78□□□□□ -1.16
C16orf62-211ENST00000540101 PNPLA1Q8N8W4 532 aa7.78□□□□□ -1.16
C16orf62-211ENST00000540101 TMEM145Q8NBT3 493 aa7.78□□□□□ -1.16
C16orf62-211ENST00000540101 PLA2G15Q8NCC3 412 aa7.78□□□□□ -1.16
C16orf62-211ENST00000540101 CADM4Q8NFZ8 388 aa7.78□□□□□ -1.16
C16orf62-211ENST00000540101 CXorf40AQ8TE69 158 aa7.78□□□□□ -1.16
C16orf62-211ENST00000540101 FBF1Q8TES7 1133 aa7.78□□□□□ -1.16
C16orf62-211ENST00000540101 GANCQ8TET4 914 aa7.78□□□□□ -1.16
C16orf62-211ENST00000540101 BIRC7Q96CA5 298 aa7.78□□□□□ -1.16
C16orf62-211ENST00000540101 NUS1Q96E22 293 aa7.78□□□□□ -1.16
C16orf62-211ENST00000540101 CCDC97Q96F63 343 aaPredicted RBP7.78□□□□□ -1.16
C16orf62-211ENST00000540101 RIOK2Q9BVS4 552 aaKnown RBP7.78□□□□□ -1.16
C16orf62-211ENST00000540101 SLC17A9Q9BYT1 436 aa7.78□□□□□ -1.16
C16orf62-211ENST00000540101 FAM83DQ9H4H8 585 aa7.78□□□□□ -1.16
C16orf62-211ENST00000540101 MBNL1Q9NR56 388 aaKnown RBP7.78□□□□□ -1.16
C16orf62-211ENST00000540101 GPR27Q9NS67 375 aa7.78□□□□□ -1.16
C16orf62-211ENST00000540101 RAD18Q9NS91 495 aa7.78□□□□□ -1.16
C16orf62-211ENST00000540101 ZNF446Q9NWS9 450 aa7.78□□□□□ -1.16
C16orf62-211ENST00000540101 PKD2L2Q9NZM6 624 aa7.78□□□□□ -1.16
C16orf62-211ENST00000540101 CDV3Q9UKY7 258 aaKnown RBP7.78□□□□□ -1.16
C16orf62-211ENST00000540101 RAB23Q9ULC3 237 aa7.78□□□□□ -1.16
C16orf62-211ENST00000540101 CNOT6Q9ULM6 557 aaKnown RBP7.78□□□□□ -1.16
C16orf62-211ENST00000540101 COQ6Q9Y2Z9 468 aa7.78□□□□□ -1.16
C16orf62-211ENST00000540101 PKP3Q9Y446 797 aa7.78□□□□□ -1.16
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 268.6 ms