RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000535976.1

CLIP1-AS1-201, CLIP1 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene CLIP1-AS1, Length 1,745 nt, Biotype lincRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 KRT222Q8N1A0 295 aa5.66□□□□□ -1.5
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 ZCCHC9Q8N567 271 aaKnown RBP5.66□□□□□ -1.5
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 NAT16Q8N8M0 369 aa5.66□□□□□ -1.5
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 DCAF4L2Q8NA75 395 aa5.66□□□□□ -1.5
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 PYROXD1Q8WU10 500 aa5.66□□□□□ -1.5
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 ANKRD7Q92527 254 aa5.66□□□□□ -1.5
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 CAVIN3Q969G5 261 aa5.66□□□□□ -1.5
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 ISL2Q96A47 359 aa5.66□□□□□ -1.5
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 MOGAT1Q96PD6 335 aa5.66□□□□□ -1.5
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 FERD3LQ96RJ6 166 aa5.66□□□□□ -1.5
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 IL12RB2Q99665 862 aa5.66□□□□□ -1.5
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 TRMT61BQ9BVS5 477 aaKnown RBP5.66□□□□□ -1.5
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 FSD1LQ9BXM9 530 aa5.66□□□□□ -1.5
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 ACE2Q9BYF1 805 aaPredicted RBP5.66□□□□□ -1.5
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 SLC25A51Q9H1U9 297 aa5.66□□□□□ -1.5
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 GBA3Q9H227 469 aa5.66□□□□□ -1.5
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 LINC00597Q9H2U6 94 aa5.66□□□□□ -1.5
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 UBE2ZQ9H832 354 aaPredicted RBP5.66□□□□□ -1.5
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 BRD9Q9H8M2 597 aa5.66□□□□□ -1.5
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 LRRC40Q9H9A6 602 aa5.66□□□□□ -1.5
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 SSU72Q9NP77 194 aaKnown RBP5.66□□□□□ -1.5
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 SAYSD1Q9NPB0 183 aa5.66□□□□□ -1.5
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 EIF2B3Q9NR50 452 aaKnown RBP5.66□□□□□ -1.5
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 DNAJC17Q9NVM6 304 aaKnown RBP5.66□□□□□ -1.5
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 GRHL1Q9NZI5 618 aa5.66□□□□□ -1.5
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 SAMD15Q9P1V8 674 aa5.66□□□□□ -1.5
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 DEC1Q9P2X7 70 aa5.66□□□□□ -1.5
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 FAM153AQ9UHL3 310 aa5.66□□□□□ -1.5
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 GGA2Q9UJY4 613 aa5.66□□□□□ -1.5
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 GTF2A1LQ9UNN4 478 aa5.66□□□□□ -1.5
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 PLAAQ9Y263 795 aa5.66□□□□□ -1.5
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 A0A0D9SEW6 157 aa5.65□□□□□ -1.5
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 GOLGA6L10A6NI86 522 aa5.65□□□□□ -1.5
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 GOLGA8MH3BSY2 632 aa5.65□□□□□ -1.5
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 MUSKO15146 869 aa5.65□□□□□ -1.5
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 IGSF6O95976 241 aa5.65□□□□□ -1.5
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 PENKP01210 267 aaPredicted RBP5.65□□□□□ -1.5
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 SERPINF2P08697 491 aa5.65□□□□□ -1.5
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 PABPC1P11940 636 aaKnown RBP5.65□□□□□ -1.5
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 MLNP12872 115 aa5.65□□□□□ -1.5
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 H2AFXP16104 143 aaPredicted RBP5.65□□□□□ -1.5
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 CD9P21926 228 aa5.65□□□□□ -1.5
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 KCNA5P22460 613 aa5.65□□□□□ -1.5
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 NFKBIAP25963 317 aa5.65□□□□□ -1.5
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 GDI1P31150 447 aa5.65□□□□□ -1.5
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 RECQLP46063 649 aaPredicted RBP5.65□□□□□ -1.5
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 NPY2RP49146 381 aa5.65□□□□□ -1.5
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 PLK1P53350 603 aa5.65□□□□□ -1.5
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 PMS2P54278 862 aa5.65□□□□□ -1.5
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 RHOAP61586 193 aa5.65□□□□□ -1.5
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 SNRPD1P62314 119 aaKnown RBP5.65□□□□□ -1.5
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 DLX2Q07687 328 aaPredicted RBP5.65□□□□□ -1.5
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 LMAN2Q12907 356 aa5.65□□□□□ -1.5
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 PDIA2Q13087 525 aaKnown RBP5.65□□□□□ -1.5
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 ZBTB17Q13105 803 aa5.65□□□□□ -1.5
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 SMAD4Q13485 552 aaKnown RBP5.65□□□□□ -1.5
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 LAMB3Q13751 1172 aa5.65□□□□□ -1.5
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 RUNX3Q13761 415 aa5.65□□□□□ -1.5
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 KCNJ11Q14654 390 aa5.65□□□□□ -1.5
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 ITPRIPL2Q3MIP1 535 aa5.65□□□□□ -1.5
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 BBS9Q3SYG4 887 aa5.65□□□□□ -1.5
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 KBTBD12Q3ZCT8 623 aa5.65□□□□□ -1.5
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 ACCSLQ4AC99 568 aa5.65□□□□□ -1.5
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 RALGPS1Q5JS13 557 aa5.65□□□□□ -1.5
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 RNASEH2BQ5TBB1 312 aaKnown RBP5.65□□□□□ -1.5
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 FAXCQ5TGI0 409 aa5.65□□□□□ -1.5
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 ALS2CLQ60I27 953 aa5.65□□□□□ -1.5
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 DENND2CQ68D51 928 aa5.65□□□□□ -1.5
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 GRAMD4Q6IC98 578 aa5.65□□□□□ -1.5
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 CXorf57Q6NSI4 855 aaKnown RBP5.65□□□□□ -1.5
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 CASC4Q6P4E1 433 aa5.65□□□□□ -1.5
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 FBXO38Q6PIJ6 1188 aa5.65□□□□□ -1.5
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 RHBDF2Q6PJF5 856 aa5.65□□□□□ -1.5
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 LRFN4Q6PJG9 635 aa5.65□□□□□ -1.5
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 MILR1Q7Z6M3 343 aa5.65□□□□□ -1.5
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 CROCCP2Q86T23 111 aa5.65□□□□□ -1.5
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 C12orf40Q86WS4 652 aa5.65□□□□□ -1.5
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 TP53INP2Q8IXH6 220 aa5.65□□□□□ -1.5
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 GSPT2Q8IYD1 628 aaKnown RBP5.65□□□□□ -1.5
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 RYBPQ8N488 228 aaPredicted RBP5.65□□□□□ -1.5
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 TEX26Q8N6G2 289 aa5.65□□□□□ -1.5
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 NAT8LQ8N9F0 302 aa5.65□□□□□ -1.5
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 ATP11CQ8NB49 1132 aa5.65□□□□□ -1.5
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 GLIS1Q8NBF1 620 aa5.65□□□□□ -1.5
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 SMRP1Q8NCR6 262 aa5.65□□□□□ -1.5
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 MCUQ8NE86 351 aa5.65□□□□□ -1.5
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 AENQ8WTP8 325 aaKnown RBP5.65□□□□□ -1.5
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 GATAD2BQ8WXI9 593 aa5.65□□□□□ -1.5
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 MYLIPQ8WY64 445 aa5.65□□□□□ -1.5
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 CPT1BQ92523 772 aa5.65□□□□□ -1.5
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 LRRC39Q96DD0 335 aa5.65□□□□□ -1.5
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 MYEOVQ96EZ4 313 aa5.65□□□□□ -1.5
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 MSLNLQ96KJ4 702 aa5.65□□□□□ -1.5
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 FCRL5Q96RD9 977 aa5.65□□□□□ -1.5
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 MYADMQ96S97 322 aa5.65□□□□□ -1.5
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 RBM15Q96T37 977 aaKnown RBP eCLIP5.65□□□□□ -1.5
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 TBL1YQ9BQ87 522 aa5.65□□□□□ -1.5
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 KXD1Q9BQD3 176 aa5.65□□□□□ -1.5
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 KRTAP9-8Q9BYQ0 159 aa5.65□□□□□ -1.5
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 MIR1-1HGQ9H1L0 117 aa5.65□□□□□ -1.5
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37.9 ms