RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000532457.5

PACSIN3-209, Transcript of protein kinase C and casein kinase substrate in neurons 3, humanhuman

TSL 5

Gene PACSIN3, Length 1,845 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACSIN3-209ENST00000532457 UGT1A6P19224 532 aa21.86■■□□□ 1.09
PACSIN3-209ENST00000532457 UGT1A1P22309 533 aa21.86■■□□□ 1.09
PACSIN3-209ENST00000532457 UGT1A4P22310 534 aa21.86■■□□□ 1.09
PACSIN3-209ENST00000532457 UGT1A3P35503 534 aa21.86■■□□□ 1.09
PACSIN3-209ENST00000532457 UGT1A5P35504 534 aa21.86■■□□□ 1.09
PACSIN3-209ENST00000532457 MMP12P39900 470 aa21.86■■□□□ 1.09
PACSIN3-209ENST00000532457 MAGEA12P43365 314 aa21.86■■□□□ 1.09
PACSIN3-209ENST00000532457 CSRP3P50461 194 aa21.86■■□□□ 1.09
PACSIN3-209ENST00000532457 COPAP53621 1224 aa21.86■■□□□ 1.09
PACSIN3-209ENST00000532457 GUCY1A3Q02108 690 aa21.86■■□□□ 1.09
PACSIN3-209ENST00000532457 DNAJC3Q13217 504 aa21.86■■□□□ 1.09
PACSIN3-209ENST00000532457 PDE1CQ14123 709 aaPredicted RBP21.86■■□□□ 1.09
PACSIN3-209ENST00000532457 TYSND1Q2T9J0 566 aa21.86■■□□□ 1.09
PACSIN3-209ENST00000532457 ZRANB3Q5FWF4 1079 aa21.86■■□□□ 1.09
PACSIN3-209ENST00000532457 DPPA4Q7L190 304 aa21.86■■□□□ 1.09
PACSIN3-209ENST00000532457 GALNT7Q86SF2 657 aa21.86■■□□□ 1.09
PACSIN3-209ENST00000532457 SLC41A1Q8IVJ1 513 aa21.86■■□□□ 1.09
PACSIN3-209ENST00000532457 ISL2Q96A47 359 aa21.86■■□□□ 1.09
PACSIN3-209ENST00000532457 CCDC97Q96F63 343 aaPredicted RBP21.86■■□□□ 1.09
PACSIN3-209ENST00000532457 CD248Q9HCU0 757 aa21.86■■□□□ 1.09
PACSIN3-209ENST00000532457 SLC39A10Q9ULF5 831 aa21.86■■□□□ 1.09
PACSIN3-209ENST00000532457 CHURC1-FNTBB4DL54 471 aa21.85■■□□□ 1.09
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PACSIN3-209ENST00000532457 CYP2A6P11509 494 aaPredicted RBP21.85■■□□□ 1.09
PACSIN3-209ENST00000532457 GM2AP17900 193 aa21.85■■□□□ 1.09
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PACSIN3-209ENST00000532457 CHRNA6Q15825 494 aa21.85■■□□□ 1.09
PACSIN3-209ENST00000532457 CACUL1Q86Y37 369 aa21.85■■□□□ 1.09
PACSIN3-209ENST00000532457 CEP97Q8IW35 865 aa21.85■■□□□ 1.09
PACSIN3-209ENST00000532457 AADATQ8N5Z0 425 aa21.85■■□□□ 1.09
PACSIN3-209ENST00000532457 ANKRD42Q8N9B4 389 aa21.85■■□□□ 1.09
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PACSIN3-209ENST00000532457 OMDQ99983 421 aa21.85■■□□□ 1.09
PACSIN3-209ENST00000532457 C19orf43Q9BQ61 176 aa21.85■■□□□ 1.09
PACSIN3-209ENST00000532457 SLC13A1Q9BZW2 595 aa21.85■■□□□ 1.09
PACSIN3-209ENST00000532457 SLC6A17Q9H1V8 727 aa21.85■■□□□ 1.09
PACSIN3-209ENST00000532457 CHRDQ9H2X0 955 aa21.85■■□□□ 1.09
PACSIN3-209ENST00000532457 MLXIPLQ9NP71 852 aa21.85■■□□□ 1.09
PACSIN3-209ENST00000532457 SNX15Q9NRS6 342 aa21.85■■□□□ 1.09
PACSIN3-209ENST00000532457 CD84Q9UIB8 345 aa21.85■■□□□ 1.09
PACSIN3-209ENST00000532457 AREL1O15033 823 aa21.85■■□□□ 1.09
PACSIN3-209ENST00000532457 MID1O15344 667 aa21.85■■□□□ 1.09
PACSIN3-209ENST00000532457 OR1I1O60431 355 aa21.85■■□□□ 1.09
PACSIN3-209ENST00000532457 ADRB3P13945 408 aa21.85■■□□□ 1.09
PACSIN3-209ENST00000532457 OGNP20774 298 aaKnown RBP21.85■■□□□ 1.09
PACSIN3-209ENST00000532457 SAT1P21673 171 aa21.85■■□□□ 1.09
PACSIN3-209ENST00000532457 XPAP23025 273 aaPredicted RBP21.85■■□□□ 1.09
PACSIN3-209ENST00000532457 DRD3P35462 400 aa21.85■■□□□ 1.09
PACSIN3-209ENST00000532457 P2RY2P41231 377 aa21.85■■□□□ 1.09
PACSIN3-209ENST00000532457 CNTN1Q12860 1018 aa21.85■■□□□ 1.09
PACSIN3-209ENST00000532457 EOGTQ5NDL2 527 aa21.85■■□□□ 1.09
PACSIN3-209ENST00000532457 FBXL19Q6PCT2 694 aa21.85■■□□□ 1.09
PACSIN3-209ENST00000532457 LIPIQ6XZB0 460 aa21.85■■□□□ 1.09
PACSIN3-209ENST00000532457 DSG4Q86SJ6 1040 aa21.85■■□□□ 1.09
PACSIN3-209ENST00000532457 SDCCAG8Q86SQ7 713 aaPredicted RBP21.85■■□□□ 1.09
PACSIN3-209ENST00000532457 FBXL6Q8N531 539 aa21.85■■□□□ 1.09
PACSIN3-209ENST00000532457 MKRN2Q9H000 416 aaKnown RBP21.85■■□□□ 1.09
PACSIN3-209ENST00000532457 SSU72Q9NP77 194 aaKnown RBP21.85■■□□□ 1.09
PACSIN3-209ENST00000532457 FAM95CA0A1B0GW59 222 aa21.84■■□□□ 1.09
PACSIN3-209ENST00000532457 SYNCRIPO60506 623 aaKnown RBP21.84■■□□□ 1.09
PACSIN3-209ENST00000532457 PRAMEF1O95521 474 aa21.84■■□□□ 1.09
PACSIN3-209ENST00000532457 TYK2P29597 1187 aa21.84■■□□□ 1.09
PACSIN3-209ENST00000532457 NEK3P51956 506 aa21.84■■□□□ 1.09
PACSIN3-209ENST00000532457 WDR4P57081 412 aaKnown RBP21.84■■□□□ 1.09
PACSIN3-209ENST00000532457 TAS2R39P59534 338 aa21.84■■□□□ 1.09
PACSIN3-209ENST00000532457 TIAL1Q01085 375 aaKnown RBP eCLIP21.84■■□□□ 1.09
PACSIN3-209ENST00000532457 CACNG1Q06432 222 aa21.84■■□□□ 1.09
PACSIN3-209ENST00000532457 ARHGEF7Q14155 803 aa21.84■■□□□ 1.09
PACSIN3-209ENST00000532457 LRRC14Q15048 493 aa21.84■■□□□ 1.09
PACSIN3-209ENST00000532457 Q6ZS52 159 aa21.84■■□□□ 1.09
PACSIN3-209ENST00000532457 Q6ZVL8 140 aa21.84■■□□□ 1.09
PACSIN3-209ENST00000532457 ERN2Q76MJ5 926 aaKnown RBP21.84■■□□□ 1.09
PACSIN3-209ENST00000532457 ARFGAP2Q8N6H7 521 aa21.84■■□□□ 1.09
PACSIN3-209ENST00000532457 GPATCH11Q8N954 259 aa21.84■■□□□ 1.09
PACSIN3-209ENST00000532457 MGARPQ8TDB4 240 aa21.84■■□□□ 1.09
PACSIN3-209ENST00000532457 OLFM1Q99784 485 aa21.84■■□□□ 1.09
PACSIN3-209ENST00000532457 HDAC8Q9BY41 377 aa21.84■■□□□ 1.09
PACSIN3-209ENST00000532457 PCMTD2Q9NV79 361 aa21.84■■□□□ 1.09
PACSIN3-209ENST00000532457 SLC17A7Q9P2U7 560 aa21.84■■□□□ 1.09
PACSIN3-209ENST00000532457 SERGEFQ9UGK8 458 aa21.84■■□□□ 1.09
PACSIN3-209ENST00000532457 GLYATL1P3A0A0U1RQE8 302 aa21.83■■□□□ 1.09
PACSIN3-209ENST00000532457 FAM47DPA6NHR8 397 aa21.83■■□□□ 1.09
PACSIN3-209ENST00000532457 PMLP29590 882 aa21.83■■□□□ 1.09
PACSIN3-209ENST00000532457 SPAM1P38567 509 aa21.83■■□□□ 1.09
PACSIN3-209ENST00000532457 MDH1P40925 334 aaKnown RBP21.83■■□□□ 1.09
PACSIN3-209ENST00000532457 ETV3P41162 512 aa21.83■■□□□ 1.09
PACSIN3-209ENST00000532457 RPS14P62263 151 aaKnown RBP21.83■■□□□ 1.09
PACSIN3-209ENST00000532457 ZNF460Q14592 562 aa21.83■■□□□ 1.09
PACSIN3-209ENST00000532457 USP10Q14694 798 aaKnown RBP21.83■■□□□ 1.09
PACSIN3-209ENST00000532457 CST6Q15828 149 aa21.83■■□□□ 1.09
PACSIN3-209ENST00000532457 PIP5KL1Q5T9C9 394 aa21.83■■□□□ 1.09
PACSIN3-209ENST00000532457 TAS2R42Q7RTR8 314 aa21.83■■□□□ 1.09
PACSIN3-209ENST00000532457 TECPR1Q7Z6L1 1165 aa21.83■■□□□ 1.09
PACSIN3-209ENST00000532457 SPEM1Q8N4L4 309 aa21.83■■□□□ 1.09
PACSIN3-209ENST00000532457 TCP10LQ8TDR4 215 aa21.83■■□□□ 1.09
PACSIN3-209ENST00000532457 LPGAT1Q92604 370 aa21.83■■□□□ 1.09
PACSIN3-209ENST00000532457 ELMO2Q96JJ3 720 aa21.83■■□□□ 1.09
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