RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000530513.5

PACSIN3-207, Transcript of protein kinase C and casein kinase substrate in neurons 3, humanhuman

TSL 3

Gene PACSIN3, Length 912 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACSIN3-207ENST00000530513 SLC12A9Q9BXP2 914 aa22.23■■□□□ 1.15
PACSIN3-207ENST00000530513 ZMYND15Q9H091 742 aa22.23■■□□□ 1.15
PACSIN3-207ENST00000530513 ZNF106Q9H2Y7 1883 aaKnown RBP22.23■■□□□ 1.15
PACSIN3-207ENST00000530513 A0A0J9YYE9 177 aa22.22■■□□□ 1.15
PACSIN3-207ENST00000530513 EML2O95834 649 aa22.22■■□□□ 1.15
PACSIN3-207ENST00000530513 TRBC1P01850 177 aa22.22■■□□□ 1.15
PACSIN3-207ENST00000530513 LIFP15018 202 aa22.22■■□□□ 1.15
PACSIN3-207ENST00000530513 UGT1A3P35503 534 aa22.22■■□□□ 1.15
PACSIN3-207ENST00000530513 ATP1A2P50993 1020 aa22.22■■□□□ 1.15
PACSIN3-207ENST00000530513 SQSTM1Q13501 440 aa22.22■■□□□ 1.15
PACSIN3-207ENST00000530513 PEX6Q13608 980 aa22.22■■□□□ 1.15
PACSIN3-207ENST00000530513 PIGHQ14442 188 aaPredicted RBP22.22■■□□□ 1.15
PACSIN3-207ENST00000530513 FILIP1LQ4L180 1135 aa22.22■■□□□ 1.15
PACSIN3-207ENST00000530513 ZNF765Q7L2R6 523 aa22.22■■□□□ 1.15
PACSIN3-207ENST00000530513 ZC3H8Q8N5P1 291 aaKnown RBP eCLIP22.22■■□□□ 1.15
PACSIN3-207ENST00000530513 DDA1Q9BW61 102 aa22.22■■□□□ 1.15
PACSIN3-207ENST00000530513 POLR1EQ9GZS1 481 aaKnown RBP22.22■■□□□ 1.15
PACSIN3-207ENST00000530513 THAP2Q9H0W7 228 aa22.22■■□□□ 1.15
PACSIN3-207ENST00000530513 OCIAD1Q9NX40 245 aa22.22■■□□□ 1.15
PACSIN3-207ENST00000530513 ANAPC7Q9UJX3 599 aa22.22■■□□□ 1.15
PACSIN3-207ENST00000530513 PTPN13Q12923 2485 aa22.22■■□□□ 1.15
PACSIN3-207ENST00000530513 INPP4BO15327 924 aa22.21■■□□□ 1.15
PACSIN3-207ENST00000530513 MAP3K6O95382 1288 aa22.21■■□□□ 1.15
PACSIN3-207ENST00000530513 IL4RP24394 825 aa22.21■■□□□ 1.15
PACSIN3-207ENST00000530513 CSTF2P33240 577 aaKnown RBP eCLIP22.21■■□□□ 1.15
PACSIN3-207ENST00000530513 FASLGP48023 281 aa22.21■■□□□ 1.15
PACSIN3-207ENST00000530513 STC1P52823 247 aa22.21■■□□□ 1.15
PACSIN3-207ENST00000530513 DSC2Q02487 901 aa22.21■■□□□ 1.15
PACSIN3-207ENST00000530513 ITKQ08881 620 aa22.21■■□□□ 1.15
PACSIN3-207ENST00000530513 KRT81Q14533 505 aa22.21■■□□□ 1.15
PACSIN3-207ENST00000530513 TDRD12Q587J7 1177 aaKnown RBP22.21■■□□□ 1.15
PACSIN3-207ENST00000530513 HGSNATQ68CP4 663 aa22.21■■□□□ 1.15
PACSIN3-207ENST00000530513 ATG14Q6ZNE5 492 aa22.21■■□□□ 1.15
PACSIN3-207ENST00000530513 FAM129CQ86XR2 697 aa22.21■■□□□ 1.15
PACSIN3-207ENST00000530513 GALNT13Q8IUC8 556 aa22.21■■□□□ 1.15
PACSIN3-207ENST00000530513 CCDC112Q8NEF3 446 aa22.21■■□□□ 1.15
PACSIN3-207ENST00000530513 COX14Q96I36 57 aa22.21■■□□□ 1.15
PACSIN3-207ENST00000530513 TDRD1Q9BXT4 1180 aaKnown RBP22.21■■□□□ 1.15
PACSIN3-207ENST00000530513 IL17BQ9UHF5 180 aa22.21■■□□□ 1.15
PACSIN3-207ENST00000530513 TRBV23OR9-2A0A075B6M9 112 aa22.2■■□□□ 1.14
PACSIN3-207ENST00000530513 ARHGAP6O43182 974 aa22.2■■□□□ 1.14
PACSIN3-207ENST00000530513 SUV39H1O43463 412 aa22.2■■□□□ 1.14
PACSIN3-207ENST00000530513 PPFIA2O75334 1257 aa22.2■■□□□ 1.14
PACSIN3-207ENST00000530513 SFTPCP11686 197 aa22.2■■□□□ 1.14
PACSIN3-207ENST00000530513 ZNF30P17039 623 aa22.2■■□□□ 1.14
PACSIN3-207ENST00000530513 GARSP41250 739 aaKnown RBP22.2■■□□□ 1.14
PACSIN3-207ENST00000530513 GPLD1P80108 840 aa22.2■■□□□ 1.14
PACSIN3-207ENST00000530513 GALNT2Q10471 571 aa22.2■■□□□ 1.14
PACSIN3-207ENST00000530513 NCBP2-AS2Q69YL0 99 aa22.2■■□□□ 1.14
PACSIN3-207ENST00000530513 ALG1LQ6GMV1 187 aa22.2■■□□□ 1.14
PACSIN3-207ENST00000530513 SFRP1Q8N474 314 aa22.2■■□□□ 1.14
PACSIN3-207ENST00000530513 IL22RA1Q8N6P7 574 aa22.2■■□□□ 1.14
PACSIN3-207ENST00000530513 BMPERQ8N8U9 685 aa22.2■■□□□ 1.14
PACSIN3-207ENST00000530513 FAM71BQ8TC56 605 aa22.2■■□□□ 1.14
PACSIN3-207ENST00000530513 MAML1Q92585 1016 aa22.2■■□□□ 1.14
PACSIN3-207ENST00000530513 RIOK2Q9BVS4 552 aaKnown RBP22.2■■□□□ 1.14
PACSIN3-207ENST00000530513 SLC39A1Q9NY26 324 aa22.2■■□□□ 1.14
PACSIN3-207ENST00000530513 RCOR3Q9P2K3 495 aaPredicted RBP22.2■■□□□ 1.14
PACSIN3-207ENST00000530513 PRKAB1Q9Y478 270 aa22.2■■□□□ 1.14
PACSIN3-207ENST00000530513 TTLL3Q9Y4R7 772 aa22.2■■□□□ 1.14
PACSIN3-207ENST00000530513 OAS3Q9Y6K5 1087 aaKnown RBP22.2■■□□□ 1.14
PACSIN3-207ENST00000530513 RELNP78509 3460 aa22.2■■□□□ 1.14
PACSIN3-207ENST00000530513 EFCAB7A8K855 629 aa22.19■■□□□ 1.14
PACSIN3-207ENST00000530513 ATP1A1P05023 1023 aaKnown RBP22.19■■□□□ 1.14
PACSIN3-207ENST00000530513 EPHB1P54762 984 aa22.19■■□□□ 1.14
PACSIN3-207ENST00000530513 LRP8Q14114 963 aa22.19■■□□□ 1.14
PACSIN3-207ENST00000530513 NR1I3Q14994 352 aa22.19■■□□□ 1.14
PACSIN3-207ENST00000530513 CHCHD2P9Q5T1J5 151 aaPredicted RBP22.19■■□□□ 1.14
PACSIN3-207ENST00000530513 ANKS6Q68DC2 871 aa22.19■■□□□ 1.14
PACSIN3-207ENST00000530513 TMEM71Q6P5X7 295 aa22.19■■□□□ 1.14
PACSIN3-207ENST00000530513 CPNE8Q86YQ8 564 aa22.19■■□□□ 1.14
PACSIN3-207ENST00000530513 NDUFAF2Q8N183 169 aa22.19■■□□□ 1.14
PACSIN3-207ENST00000530513 SLC38A3Q99624 504 aa22.19■■□□□ 1.14
PACSIN3-207ENST00000530513 DPYSL5Q9BPU6 564 aa22.19■■□□□ 1.14
PACSIN3-207ENST00000530513 NUP85Q9BW27 656 aa22.19■■□□□ 1.14
PACSIN3-207ENST00000530513 GEMIN8Q9NWZ8 242 aaKnown RBP22.19■■□□□ 1.14
PACSIN3-207ENST00000530513 IP6K2Q9UHH9 426 aa22.19■■□□□ 1.14
PACSIN3-207ENST00000530513 CHKBQ9Y259 395 aa22.19■■□□□ 1.14
PACSIN3-207ENST00000530513 FLNCQ14315 2725 aa22.18■■□□□ 1.14
PACSIN3-207ENST00000530513 B4E171 279 aa22.18■■□□□ 1.14
PACSIN3-207ENST00000530513 DUX1O43812 170 aa22.18■■□□□ 1.14
PACSIN3-207ENST00000530513 RAD1O60671 282 aa22.18■■□□□ 1.14
PACSIN3-207ENST00000530513 DNAJC6O75061 913 aa22.18■■□□□ 1.14
PACSIN3-207ENST00000530513 ASMTLO95671 621 aa22.18■■□□□ 1.14
PACSIN3-207ENST00000530513 PRLP01236 227 aa22.18■■□□□ 1.14
PACSIN3-207ENST00000530513 GJC1P36383 396 aa22.18■■□□□ 1.14
PACSIN3-207ENST00000530513 TSPAN7P41732 249 aa22.18■■□□□ 1.14
PACSIN3-207ENST00000530513 PPM1FP49593 454 aaPredicted RBP22.18■■□□□ 1.14
PACSIN3-207ENST00000530513 ARSEP51690 589 aa22.18■■□□□ 1.14
PACSIN3-207ENST00000530513 DPYSL3Q14195 570 aa22.18■■□□□ 1.14
PACSIN3-207ENST00000530513 BORAQ6PGQ7 559 aa22.18■■□□□ 1.14
PACSIN3-207ENST00000530513 LUZP1Q86V48 1076 aa22.18■■□□□ 1.14
PACSIN3-207ENST00000530513 NLRP8Q86W28 1048 aa22.18■■□□□ 1.14
PACSIN3-207ENST00000530513 LRRC49Q8IUZ0 686 aa22.18■■□□□ 1.14
PACSIN3-207ENST00000530513 CACNA2D3Q8IZS8 1091 aa22.18■■□□□ 1.14
PACSIN3-207ENST00000530513 OR10G6Q8NH81 332 aa22.18■■□□□ 1.14
PACSIN3-207ENST00000530513 LRRN4Q8WUT4 740 aa22.18■■□□□ 1.14
PACSIN3-207ENST00000530513 AHCYL2Q96HN2 611 aaKnown RBP22.18■■□□□ 1.14
PACSIN3-207ENST00000530513 WDR24Q96S15 920 aa22.18■■□□□ 1.14
PACSIN3-207ENST00000530513 SLC25A18Q9H1K4 315 aa22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.9 ms