RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000519068.2

MSC-AS1-205, MSC antisense RNA 1, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene MSC-AS1, Length 569 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSC-AS1-205ENST00000519068 H0Y8X5 98 aa5.39□□□□□ -1.55
MSC-AS1-205ENST00000519068 RNF103O00237 685 aa5.39□□□□□ -1.55
MSC-AS1-205ENST00000519068 AURKAO14965 403 aa5.39□□□□□ -1.55
MSC-AS1-205ENST00000519068 TTI1O43156 1089 aa5.39□□□□□ -1.55
MSC-AS1-205ENST00000519068 RAD51CO43502 376 aa5.39□□□□□ -1.55
MSC-AS1-205ENST00000519068 SIGLEC6O43699 453 aa5.39□□□□□ -1.55
MSC-AS1-205ENST00000519068 ADAM11O75078 769 aa5.39□□□□□ -1.55
MSC-AS1-205ENST00000519068 GJB3O75712 270 aa5.39□□□□□ -1.55
MSC-AS1-205ENST00000519068 TMCC1O94876 653 aa5.39□□□□□ -1.55
MSC-AS1-205ENST00000519068 SLU7O95391 586 aaKnown RBP5.39□□□□□ -1.55
MSC-AS1-205ENST00000519068 METTL18O95568 372 aa5.39□□□□□ -1.55
MSC-AS1-205ENST00000519068 KLF8O95600 359 aaPredicted RBP5.39□□□□□ -1.55
MSC-AS1-205ENST00000519068 POP4O95707 220 aaKnown RBP5.39□□□□□ -1.55
MSC-AS1-205ENST00000519068 AGR2O95994 175 aa5.39□□□□□ -1.55
MSC-AS1-205ENST00000519068 HLA-DQB2P05538 268 aa5.39□□□□□ -1.55
MSC-AS1-205ENST00000519068 GSNP06396 782 aa5.39□□□□□ -1.55
MSC-AS1-205ENST00000519068 SRPRAP08240 638 aaKnown RBP5.39□□□□□ -1.55
MSC-AS1-205ENST00000519068 RHOXF2BP0C7M4 288 aa5.39□□□□□ -1.55
MSC-AS1-205ENST00000519068 CHRNB1P11230 501 aa5.39□□□□□ -1.55
MSC-AS1-205ENST00000519068 HNRNPLP14866 589 aaKnown RBP eCLIP5.39□□□□□ -1.55
MSC-AS1-205ENST00000519068 AGXTP21549 392 aa5.39□□□□□ -1.55
MSC-AS1-205ENST00000519068 IVDP26440 423 aa5.39□□□□□ -1.55
MSC-AS1-205ENST00000519068 GKP32189 559 aa5.39□□□□□ -1.55
MSC-AS1-205ENST00000519068 ACTN2P35609 894 aa5.39□□□□□ -1.55
MSC-AS1-205ENST00000519068 IL12RB1P42701 662 aa5.39□□□□□ -1.55
MSC-AS1-205ENST00000519068 KIR2DL1P43626 348 aaPredicted RBP5.39□□□□□ -1.55
MSC-AS1-205ENST00000519068 RGRP47804 291 aa5.39□□□□□ -1.55
MSC-AS1-205ENST00000519068 FNTAP49354 379 aa5.39□□□□□ -1.55
MSC-AS1-205ENST00000519068 VPS41P49754 854 aa5.39□□□□□ -1.55
MSC-AS1-205ENST00000519068 MRPS21P82921 87 aaKnown RBP5.39□□□□□ -1.55
MSC-AS1-205ENST00000519068 DR1Q01658 176 aa5.39□□□□□ -1.55
MSC-AS1-205ENST00000519068 DSC2Q02487 901 aa5.39□□□□□ -1.55
MSC-AS1-205ENST00000519068 PRKCQQ04759 706 aa5.39□□□□□ -1.55
MSC-AS1-205ENST00000519068 GPS1Q13098 491 aa5.39□□□□□ -1.55
MSC-AS1-205ENST00000519068 PDE1CQ14123 709 aaPredicted RBP5.39□□□□□ -1.55
MSC-AS1-205ENST00000519068 SPARCL1Q14515 664 aa5.39□□□□□ -1.55
MSC-AS1-205ENST00000519068 PRPSAP1Q14558 356 aa5.39□□□□□ -1.55
MSC-AS1-205ENST00000519068 ZNF234Q14588 700 aa5.39□□□□□ -1.55
MSC-AS1-205ENST00000519068 ZNF235Q14590 738 aa5.39□□□□□ -1.55
MSC-AS1-205ENST00000519068 IHHQ14623 411 aa5.39□□□□□ -1.55
MSC-AS1-205ENST00000519068 RFTN1Q14699 578 aaPredicted RBP5.39□□□□□ -1.55
MSC-AS1-205ENST00000519068 UBXN2BQ14CS0 331 aa5.39□□□□□ -1.55
MSC-AS1-205ENST00000519068 PPP1R7Q15435 360 aa5.39□□□□□ -1.55
MSC-AS1-205ENST00000519068 CRY1Q16526 586 aa5.39□□□□□ -1.55
MSC-AS1-205ENST00000519068 CWF19L1Q69YN2 538 aaKnown RBP5.39□□□□□ -1.55
MSC-AS1-205ENST00000519068 TIGD7Q6NT04 549 aaPredicted RBP5.39□□□□□ -1.55
MSC-AS1-205ENST00000519068 LETMD1Q6P1Q0 360 aa5.39□□□□□ -1.55
MSC-AS1-205ENST00000519068 NCEH1Q6PIU2 408 aa5.39□□□□□ -1.55
MSC-AS1-205ENST00000519068 C20orf204Q6ZNR8 217 aa5.39□□□□□ -1.55
MSC-AS1-205ENST00000519068 DPY19L3Q6ZPD9 716 aa5.39□□□□□ -1.55
MSC-AS1-205ENST00000519068 ARHGEF18Q6ZSZ5 1173 aa5.39□□□□□ -1.55
MSC-AS1-205ENST00000519068 PRPF39Q86UA1 669 aaKnown RBP5.39□□□□□ -1.55
MSC-AS1-205ENST00000519068 CAMK1DQ8IU85 385 aa5.39□□□□□ -1.55
MSC-AS1-205ENST00000519068 SUGP1Q8IWZ8 645 aaKnown RBP5.39□□□□□ -1.55
MSC-AS1-205ENST00000519068 STK40Q8N2I9 435 aa5.39□□□□□ -1.55
MSC-AS1-205ENST00000519068 BBS5Q8N3I7 341 aa5.39□□□□□ -1.55
MSC-AS1-205ENST00000519068 SH2D3CQ8N5H7 860 aa5.39□□□□□ -1.55
MSC-AS1-205ENST00000519068 CISD2Q8N5K1 135 aaKnown RBP5.39□□□□□ -1.55
MSC-AS1-205ENST00000519068 CAMKK1Q8N5S9 505 aa5.39□□□□□ -1.55
MSC-AS1-205ENST00000519068 DCAF4L2Q8NA75 395 aa5.39□□□□□ -1.55
MSC-AS1-205ENST00000519068 GALNT11Q8NCW6 608 aa5.39□□□□□ -1.55
MSC-AS1-205ENST00000519068 SPATA22Q8NHS9 363 aa5.39□□□□□ -1.55
MSC-AS1-205ENST00000519068 ARRDC2Q8TBH0 407 aa5.39□□□□□ -1.55
MSC-AS1-205ENST00000519068 GRK7Q8WTQ7 553 aa5.39□□□□□ -1.55
MSC-AS1-205ENST00000519068 CASKIN2Q8WXE0 1202 aa5.39□□□□□ -1.55
MSC-AS1-205ENST00000519068 EDAQ92838 391 aa5.39□□□□□ -1.55
MSC-AS1-205ENST00000519068 HDAC11Q96DB2 347 aa5.39□□□□□ -1.55
MSC-AS1-205ENST00000519068 MVB12AQ96EY5 273 aa5.39□□□□□ -1.55
MSC-AS1-205ENST00000519068 RUNDC3BQ96NL0 473 aa5.39□□□□□ -1.55
MSC-AS1-205ENST00000519068 PSKH2Q96QS6 385 aa5.39□□□□□ -1.55
MSC-AS1-205ENST00000519068 UHRF1Q96T88 793 aaPredicted RBP5.39□□□□□ -1.55
MSC-AS1-205ENST00000519068 VAT1Q99536 393 aa5.39□□□□□ -1.55
MSC-AS1-205ENST00000519068 SEMA3CQ99985 751 aa5.39□□□□□ -1.55
MSC-AS1-205ENST00000519068 RHOXF2Q9BQY4 288 aa5.39□□□□□ -1.55
MSC-AS1-205ENST00000519068 ERP44Q9BS26 406 aa5.39□□□□□ -1.55
MSC-AS1-205ENST00000519068 TRIM51Q9BSJ1 452 aa5.39□□□□□ -1.55
MSC-AS1-205ENST00000519068 CINPQ9BW66 212 aaPredicted RBP5.39□□□□□ -1.55
MSC-AS1-205ENST00000519068 TMPRSS13Q9BYE2 586 aa5.39□□□□□ -1.55
MSC-AS1-205ENST00000519068 MYLK2Q9H1R3 596 aa5.39□□□□□ -1.55
MSC-AS1-205ENST00000519068 SLC25A51Q9H1U9 297 aa5.39□□□□□ -1.55
MSC-AS1-205ENST00000519068 IPPKQ9H8X2 491 aa5.39□□□□□ -1.55
MSC-AS1-205ENST00000519068 PDFQ9HBH1 243 aa5.39□□□□□ -1.55
MSC-AS1-205ENST00000519068 NOD2Q9HC29 1040 aa5.39□□□□□ -1.55
MSC-AS1-205ENST00000519068 SSU72Q9NP77 194 aaKnown RBP5.39□□□□□ -1.55
MSC-AS1-205ENST00000519068 PRSS16Q9NQE7 514 aa5.39□□□□□ -1.55
MSC-AS1-205ENST00000519068 ARHGEF3Q9NR81 526 aa5.39□□□□□ -1.55
MSC-AS1-205ENST00000519068 DNAJC28Q9NX36 388 aa5.39□□□□□ -1.55
MSC-AS1-205ENST00000519068 EVLQ9UI08 416 aaPredicted RBP5.39□□□□□ -1.55
MSC-AS1-205ENST00000519068 SLC8A2Q9UPR5 921 aa5.39□□□□□ -1.55
MSC-AS1-205ENST00000519068 POLHQ9Y253 713 aa5.39□□□□□ -1.55
MSC-AS1-205ENST00000519068 HS3ST2Q9Y278 367 aa5.39□□□□□ -1.55
MSC-AS1-205ENST00000519068 MRPS17Q9Y2R5 130 aaKnown RBP5.39□□□□□ -1.55
MSC-AS1-205ENST00000519068 NEU2Q9Y3R4 380 aa5.39□□□□□ -1.55
MSC-AS1-205ENST00000519068 TTLL3Q9Y4R7 772 aa5.39□□□□□ -1.55
MSC-AS1-205ENST00000519068 PCDHGB6Q9Y5F9 930 aa5.39□□□□□ -1.55
MSC-AS1-205ENST00000519068 GPR45Q9Y5Y3 372 aa5.39□□□□□ -1.55
MSC-AS1-205ENST00000519068 STON1Q9Y6Q2 735 aa5.39□□□□□ -1.55
MSC-AS1-205ENST00000519068 MYO18AQ92614 2054 aaKnown RBP5.39□□□□□ -1.55
MSC-AS1-205ENST00000519068 ATG2BQ96BY7 2078 aa5.39□□□□□ -1.55
MSC-AS1-205ENST00000519068 NCOR1O75376 2440 aa5.38□□□□□ -1.55
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39.6 ms