RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000514384.1

SMIM20-202, Transcript of small integral membrane protein 20, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene SMIM20, Length 774 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM20-202ENST00000514384 DNMT3AQ9Y6K1 912 aaPredicted RBP7.23□□□□□ -1.25
SMIM20-202ENST00000514384 WDR27A2RRH5 827 aa7.22□□□□□ -1.25
SMIM20-202ENST00000514384 MEIS3P2A8K0S8 358 aa7.22□□□□□ -1.25
SMIM20-202ENST00000514384 UPK3BL1B0FP48 263 aa7.22□□□□□ -1.25
SMIM20-202ENST00000514384 UPK3BL2E5RIL1 263 aa7.22□□□□□ -1.25
SMIM20-202ENST00000514384 ACOT8O14734 319 aa7.22□□□□□ -1.25
SMIM20-202ENST00000514384 PSMD3O43242 534 aa7.22□□□□□ -1.25
SMIM20-202ENST00000514384 PAPSS1O43252 624 aaPredicted RBP7.22□□□□□ -1.25
SMIM20-202ENST00000514384 ZBTB14O43829 449 aa7.22□□□□□ -1.25
SMIM20-202ENST00000514384 HBP1O60381 514 aa7.22□□□□□ -1.25
SMIM20-202ENST00000514384 NPHS1O60500 1241 aa7.22□□□□□ -1.25
SMIM20-202ENST00000514384 PDE5AO76074 875 aa7.22□□□□□ -1.25
SMIM20-202ENST00000514384 HSPA4LO95757 839 aa7.22□□□□□ -1.25
SMIM20-202ENST00000514384 ITGB3P05106 788 aa7.22□□□□□ -1.25
SMIM20-202ENST00000514384 NFICP08651 508 aa7.22□□□□□ -1.25
SMIM20-202ENST00000514384 CXCL8P10145 99 aa7.22□□□□□ -1.25
SMIM20-202ENST00000514384 CD59P13987 128 aa7.22□□□□□ -1.25
SMIM20-202ENST00000514384 ZNF23P17027 643 aa7.22□□□□□ -1.25
SMIM20-202ENST00000514384 BCKDHBP21953 392 aa7.22□□□□□ -1.25
SMIM20-202ENST00000514384 ME2P23368 584 aa7.22□□□□□ -1.25
SMIM20-202ENST00000514384 FCARP24071 287 aa7.22□□□□□ -1.25
SMIM20-202ENST00000514384 ARRB2P32121 409 aa7.22□□□□□ -1.25
SMIM20-202ENST00000514384 PPARGP37231 505 aaPredicted RBP7.22□□□□□ -1.25
SMIM20-202ENST00000514384 PHKA2P46019 1235 aa7.22□□□□□ -1.25
SMIM20-202ENST00000514384 HCAR3P49019 387 aa7.22□□□□□ -1.25
SMIM20-202ENST00000514384 NPY2RP49146 381 aa7.22□□□□□ -1.25
SMIM20-202ENST00000514384 RPL14P50914 215 aaKnown RBP7.22□□□□□ -1.25
SMIM20-202ENST00000514384 NDST1P52848 882 aa7.22□□□□□ -1.25
SMIM20-202ENST00000514384 CDH8P55286 799 aa7.22□□□□□ -1.25
SMIM20-202ENST00000514384 HPCAP84074 193 aa7.22□□□□□ -1.25
SMIM20-202ENST00000514384 GBE1Q04446 702 aa7.22□□□□□ -1.25
SMIM20-202ENST00000514384 ZNF33AQ06730 810 aa7.22□□□□□ -1.25
SMIM20-202ENST00000514384 NSUN2Q08J23 767 aaKnown RBP eCLIP7.22□□□□□ -1.25
SMIM20-202ENST00000514384 LMAN2Q12907 356 aa7.22□□□□□ -1.25
SMIM20-202ENST00000514384 SLC10A2Q12908 348 aaPredicted RBP7.22□□□□□ -1.25
SMIM20-202ENST00000514384 SERINC3Q13530 473 aa7.22□□□□□ -1.25
SMIM20-202ENST00000514384 TMEM132DQ14C87 1099 aa7.22□□□□□ -1.25
SMIM20-202ENST00000514384 CNGA3Q16281 694 aa7.22□□□□□ -1.25
SMIM20-202ENST00000514384 CA9Q16790 459 aa7.22□□□□□ -1.25
SMIM20-202ENST00000514384 KIZQ2M2Z5 673 aa7.22□□□□□ -1.25
SMIM20-202ENST00000514384 GOLGA7BQ2TAP0 167 aa7.22□□□□□ -1.25
SMIM20-202ENST00000514384 GRAMD1BQ3KR37 738 aa7.22□□□□□ -1.25
SMIM20-202ENST00000514384 SPATS1Q496A3 300 aa7.22□□□□□ -1.25
SMIM20-202ENST00000514384 ZNF484Q5JVG2 852 aa7.22□□□□□ -1.25
SMIM20-202ENST00000514384 C16orf46Q6P387 395 aa7.22□□□□□ -1.25
SMIM20-202ENST00000514384 ZYG11AQ6WRX3 759 aa7.22□□□□□ -1.25
SMIM20-202ENST00000514384 HACD2Q6Y1H2 254 aa7.22□□□□□ -1.25
SMIM20-202ENST00000514384 ATG14Q6ZNE5 492 aa7.22□□□□□ -1.25
SMIM20-202ENST00000514384 TMPRSS7Q7RTY8 843 aa7.22□□□□□ -1.25
SMIM20-202ENST00000514384 SATL1Q86VE3 508 aa7.22□□□□□ -1.25
SMIM20-202ENST00000514384 ERI1Q8IV48 349 aaKnown RBP7.22□□□□□ -1.25
SMIM20-202ENST00000514384 CCDC117Q8IWD4 279 aaPredicted RBP7.22□□□□□ -1.25
SMIM20-202ENST00000514384 CHERPQ8IWX8 916 aaKnown RBP7.22□□□□□ -1.25
SMIM20-202ENST00000514384 DSELQ8IZU8 1212 aa7.22□□□□□ -1.25
SMIM20-202ENST00000514384 NUP93Q8N1F7 819 aa7.22□□□□□ -1.25
SMIM20-202ENST00000514384 PHTF2Q8N3S3 785 aa7.22□□□□□ -1.25
SMIM20-202ENST00000514384 TAB3Q8N5C8 712 aaPredicted RBP7.22□□□□□ -1.25
SMIM20-202ENST00000514384 PACRGLQ8N7B6 248 aa7.22□□□□□ -1.25
SMIM20-202ENST00000514384 LRRC52Q8N7C0 313 aa7.22□□□□□ -1.25
SMIM20-202ENST00000514384 POU5F2Q8N7G0 328 aa7.22□□□□□ -1.25
SMIM20-202ENST00000514384 LINC01465Q8N7H1 131 aa7.22□□□□□ -1.25
SMIM20-202ENST00000514384 HM13Q8TCT9 377 aa7.22□□□□□ -1.25
SMIM20-202ENST00000514384 ADAMTS16Q8TE57 1224 aa7.22□□□□□ -1.25
SMIM20-202ENST00000514384 MPP4Q96JB8 637 aa7.22□□□□□ -1.25
SMIM20-202ENST00000514384 MAELQ96JY0 434 aaKnown RBP7.22□□□□□ -1.25
SMIM20-202ENST00000514384 FAR2Q96K12 515 aa7.22□□□□□ -1.25
SMIM20-202ENST00000514384 ZNF597Q96LX8 424 aa7.22□□□□□ -1.25
SMIM20-202ENST00000514384 LENG8Q96PV6 779 aaPredicted RBP7.22□□□□□ -1.25
SMIM20-202ENST00000514384 OSBPL11Q9BXB4 747 aa7.22□□□□□ -1.25
SMIM20-202ENST00000514384 ZNF768Q9H5H4 540 aaKnown RBP7.22□□□□□ -1.25
SMIM20-202ENST00000514384 EFCAB1Q9HAE3 211 aa7.22□□□□□ -1.25
SMIM20-202ENST00000514384 LRRC4Q9HBW1 653 aa7.22□□□□□ -1.25
SMIM20-202ENST00000514384 CASS4Q9NQ75 786 aa7.22□□□□□ -1.25
SMIM20-202ENST00000514384 SNX15Q9NRS6 342 aa7.22□□□□□ -1.25
SMIM20-202ENST00000514384 TMEM74BQ9NUR3 256 aa7.22□□□□□ -1.25
SMIM20-202ENST00000514384 OXSMQ9NWU1 459 aa7.22□□□□□ -1.25
SMIM20-202ENST00000514384 ERAP1Q9NZ08 941 aa7.22□□□□□ -1.25
SMIM20-202ENST00000514384 UBAP1Q9NZ09 502 aa7.22□□□□□ -1.25
SMIM20-202ENST00000514384 TXNDC16Q9P2K2 825 aa7.22□□□□□ -1.25
SMIM20-202ENST00000514384 HSFX1Q9UBD0 423 aa7.22□□□□□ -1.25
SMIM20-202ENST00000514384 SUCOQ9UBS9 1254 aaKnown RBP7.22□□□□□ -1.25
SMIM20-202ENST00000514384 HMGXB4Q9UGU5 601 aa7.22□□□□□ -1.25
SMIM20-202ENST00000514384 ZNHIT2Q9UHR6 403 aa7.22□□□□□ -1.25
SMIM20-202ENST00000514384 IPO11Q9UI26 975 aaKnown RBP7.22□□□□□ -1.25
SMIM20-202ENST00000514384 PTBP2Q9UKA9 531 aaKnown RBP7.22□□□□□ -1.25
SMIM20-202ENST00000514384 AP4E1Q9UPM8 1137 aa7.22□□□□□ -1.25
SMIM20-202ENST00000514384 SLC8A2Q9UPR5 921 aa7.22□□□□□ -1.25
SMIM20-202ENST00000514384 AP4B1Q9Y6B7 739 aa7.22□□□□□ -1.25
SMIM20-202ENST00000514384 MUC22E2RYF6 1773 aaPredicted RBP7.22□□□□□ -1.25
SMIM20-202ENST00000514384 MGAQ8IWI9 3026 aa7.22□□□□□ -1.25
SMIM20-202ENST00000514384 COL1A2P08123 1366 aa7.21□□□□□ -1.25
SMIM20-202ENST00000514384 ATG2BQ96BY7 2078 aa7.21□□□□□ -1.25
SMIM20-202ENST00000514384 CCDC163A0A0D9SF12 145 aa7.21□□□□□ -1.26
SMIM20-202ENST00000514384 TRIM64A6NGJ6 449 aa7.21□□□□□ -1.26
SMIM20-202ENST00000514384 TRIM38O00635 465 aa7.21□□□□□ -1.26
SMIM20-202ENST00000514384 LILRA1O75019 489 aa7.21□□□□□ -1.26
SMIM20-202ENST00000514384 BMP10O95393 424 aa7.21□□□□□ -1.26
SMIM20-202ENST00000514384 AP2A1O95782 977 aa7.21□□□□□ -1.26
SMIM20-202ENST00000514384 SOD2P04179 222 aa7.21□□□□□ -1.26
SMIM20-202ENST00000514384 KRT19P08727 400 aa7.21□□□□□ -1.26
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