RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000513165.1

HOXC-AS3-202, HOXC cluster antisense RNA 3, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene HOXC-AS3, Length 533 nt, Biotype antisense RNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC-AS3-202ENST00000513165 CCKBRP32239 447 aa16.73■□□□□ 0.27
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HOXC-AS3-202ENST00000513165 LRP8Q14114 963 aa16.73■□□□□ 0.27
HOXC-AS3-202ENST00000513165 PYCR3Q53H96 274 aa16.73■□□□□ 0.27
HOXC-AS3-202ENST00000513165 TFDP3Q5H9I0 405 aa16.73■□□□□ 0.27
HOXC-AS3-202ENST00000513165 HENMT1Q5T8I9 393 aaKnown RBP16.73■□□□□ 0.27
HOXC-AS3-202ENST00000513165 C11orf63Q6NUN7 778 aa16.73■□□□□ 0.27
HOXC-AS3-202ENST00000513165 SPOCD1Q6ZMY3 1216 aa16.73■□□□□ 0.27
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HOXC-AS3-202ENST00000513165 KATNAL2Q8IYT4 538 aa16.73■□□□□ 0.27
HOXC-AS3-202ENST00000513165 ARL14Q8N4G2 192 aa16.73■□□□□ 0.27
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HOXC-AS3-202ENST00000513165 SRPK1Q96SB4 655 aaKnown RBP16.73■□□□□ 0.27
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HOXC-AS3-202ENST00000513165 ZFYVE1Q9HBF4 777 aa16.73■□□□□ 0.27
HOXC-AS3-202ENST00000513165 GLOD4Q9HC38 313 aa16.73■□□□□ 0.27
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HOXC-AS3-202ENST00000513165 FECHP22830 423 aa16.72■□□□□ 0.27
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HOXC-AS3-202ENST00000513165 CDK18Q07002 472 aa16.72■□□□□ 0.27
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HOXC-AS3-202ENST00000513165 NR1D2Q14995 579 aa16.72■□□□□ 0.27
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HOXC-AS3-202ENST00000513165 CCDC70Q6NSX1 233 aa16.72■□□□□ 0.27
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HOXC-AS3-202ENST00000513165 ZNF438Q7Z4V0 828 aa16.72■□□□□ 0.27
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HOXC-AS3-202ENST00000513165 SPRED1Q7Z699 444 aa16.72■□□□□ 0.27
HOXC-AS3-202ENST00000513165 SFTPA2Q8IWL1 248 aa16.72■□□□□ 0.27
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HOXC-AS3-202ENST00000513165 P3H4Q92791 437 aa16.72■□□□□ 0.27
HOXC-AS3-202ENST00000513165 TMEM159Q96B96 161 aa16.72■□□□□ 0.27
HOXC-AS3-202ENST00000513165 CCDC97Q96F63 343 aaPredicted RBP16.72■□□□□ 0.27
HOXC-AS3-202ENST00000513165 OR2M4Q96R27 311 aa16.72■□□□□ 0.27
HOXC-AS3-202ENST00000513165 CEP41Q9BYV8 373 aa16.72■□□□□ 0.27
HOXC-AS3-202ENST00000513165 DPH1Q9BZG8 443 aa16.72■□□□□ 0.27
HOXC-AS3-202ENST00000513165 PRORYQ9H606 182 aa16.72■□□□□ 0.27
HOXC-AS3-202ENST00000513165 SUDS3Q9H7L9 328 aaPredicted RBP16.72■□□□□ 0.27
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HOXC-AS3-202ENST00000513165 RAD18Q9NS91 495 aa16.72■□□□□ 0.27
HOXC-AS3-202ENST00000513165 SEPT10Q9P0V9 454 aa16.72■□□□□ 0.27
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HOXC-AS3-202ENST00000513165 CCDC173Q0VFZ6 552 aa16.71■□□□□ 0.27
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HOXC-AS3-202ENST00000513165 SLC30A9Q6PML9 568 aa16.71■□□□□ 0.27
HOXC-AS3-202ENST00000513165 RAB11FIP2Q7L804 512 aa16.71■□□□□ 0.27
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HOXC-AS3-202ENST00000513165 EID2BQ96D98 161 aa16.71■□□□□ 0.27
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HOXC-AS3-202ENST00000513165 VAT1Q99536 393 aa16.71■□□□□ 0.27
HOXC-AS3-202ENST00000513165 RBSNQ9H1K0 784 aa16.71■□□□□ 0.27
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HOXC-AS3-202ENST00000513165 TNFSF15O95150 251 aa16.7■□□□□ 0.26
HOXC-AS3-202ENST00000513165 ASMTLO95671 621 aa16.7■□□□□ 0.26
HOXC-AS3-202ENST00000513165 NDST3O95803 873 aa16.7■□□□□ 0.26
HOXC-AS3-202ENST00000513165 EPOP01588 193 aa16.7■□□□□ 0.26
HOXC-AS3-202ENST00000513165 ITGA2BP08514 1039 aa16.7■□□□□ 0.26
HOXC-AS3-202ENST00000513165 ACTR1BP42025 376 aa16.7■□□□□ 0.26
HOXC-AS3-202ENST00000513165 MAZP56270 477 aaKnown RBP16.7■□□□□ 0.26
HOXC-AS3-202ENST00000513165 ACTR1AP61163 376 aa16.7■□□□□ 0.26
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HOXC-AS3-202ENST00000513165 PPP2R5EQ16537 467 aa16.7■□□□□ 0.26
HOXC-AS3-202ENST00000513165 LYSMD3Q7Z3D4 306 aa16.7■□□□□ 0.26
HOXC-AS3-202ENST00000513165 KDELC2Q7Z4H8 507 aa16.7■□□□□ 0.26
HOXC-AS3-202ENST00000513165 DAAM2Q86T65 1068 aa16.7■□□□□ 0.26
HOXC-AS3-202ENST00000513165 TRIM74Q86UV6 250 aa16.7■□□□□ 0.26
HOXC-AS3-202ENST00000513165 FBXO39Q8N4B4 442 aa16.7■□□□□ 0.26
HOXC-AS3-202ENST00000513165 SPATA22Q8NHS9 363 aa16.7■□□□□ 0.26
HOXC-AS3-202ENST00000513165 GOLPH3Q9H4A6 298 aa16.7■□□□□ 0.26
HOXC-AS3-202ENST00000513165 EPB41L5Q9HCM4 733 aa16.7■□□□□ 0.26
HOXC-AS3-202ENST00000513165 NFKBIL1Q9UBC1 381 aaPredicted RBP16.7■□□□□ 0.26
HOXC-AS3-202ENST00000513165 SSUH2Q9Y2M2 353 aa16.7■□□□□ 0.26
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