RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000494136.1

LAMTOR4-212, Transcript of late endosomal/lysosomal adaptor, MAPK and MTOR activator 4, humanhuman

TSL 2

Gene LAMTOR4, Length 427 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMTOR4-212ENST00000494136 AVL9Q8NBF6 648 aa8.41□□□□□ -1.06
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LAMTOR4-212ENST00000494136 LINC00523Q86TU6 105 aa8.39□□□□□ -1.07
LAMTOR4-212ENST00000494136 SLC25A41Q8N5S1 370 aa8.39□□□□□ -1.07
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