RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489160.1

CCL20-204, Transcript of C-C motif chemokine ligand 20, humanhuman

TSL 3

Gene CCL20, Length 673 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL20-204ENST00000489160 Q0VFX4 171 aa5.02□□□□□ -1.61
CCL20-204ENST00000489160 ASTE1Q2TB18 679 aaPredicted RBP5.02□□□□□ -1.61
CCL20-204ENST00000489160 PCGF3Q3KNV8 242 aa5.02□□□□□ -1.61
CCL20-204ENST00000489160 ACSM2BQ68CK6 577 aa5.02□□□□□ -1.61
CCL20-204ENST00000489160 SIGIRRQ6IA17 410 aa5.02□□□□□ -1.61
CCL20-204ENST00000489160 TYW3Q6IPR3 259 aaKnown RBP5.02□□□□□ -1.61
CCL20-204ENST00000489160 DPPA4Q7L190 304 aa5.02□□□□□ -1.61
CCL20-204ENST00000489160 CACNA2D4Q7Z3S7 1137 aa5.02□□□□□ -1.61
CCL20-204ENST00000489160 DSELQ8IZU8 1212 aa5.02□□□□□ -1.61
CCL20-204ENST00000489160 PRR26Q8N8Z3 221 aa5.02□□□□□ -1.61
CCL20-204ENST00000489160 MSANTD4Q8NCY6 345 aa5.02□□□□□ -1.61
CCL20-204ENST00000489160 TXNDC15Q96J42 360 aa5.02□□□□□ -1.61
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CCL20-204ENST00000489160 PCGF1Q9BSM1 259 aa5.02□□□□□ -1.61
CCL20-204ENST00000489160 PPP1R3EQ9H7J1 279 aa5.02□□□□□ -1.61
CCL20-204ENST00000489160 CWC15Q9P013 229 aaKnown RBP5.02□□□□□ -1.61
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CCL20-204ENST00000489160 TNFRSF18Q9Y5U5 241 aa5.02□□□□□ -1.61
CCL20-204ENST00000489160 SOS1Q07889 1333 aaPredicted RBP5.01□□□□□ -1.61
CCL20-204ENST00000489160 PASKQ96RG2 1323 aa5.01□□□□□ -1.61
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CCL20-204ENST00000489160 VCYO14598 125 aa5.01□□□□□ -1.61
CCL20-204ENST00000489160 CH25HO95992 272 aa5.01□□□□□ -1.61
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CCL20-204ENST00000489160 MUTP22033 750 aa5.01□□□□□ -1.61
CCL20-204ENST00000489160 C21orf33P30042 268 aaPredicted RBP5.01□□□□□ -1.61
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CCL20-204ENST00000489160 EFNB3Q15768 340 aa5.01□□□□□ -1.61
CCL20-204ENST00000489160 RAB41Q5JT25 222 aa5.01□□□□□ -1.61
CCL20-204ENST00000489160 PMS2CLQ68D20 193 aa5.01□□□□□ -1.61
CCL20-204ENST00000489160 C8orf82Q6P1X6 216 aaPredicted RBP5.01□□□□□ -1.61
CCL20-204ENST00000489160 B3GNT6Q6ZMB0 384 aa5.01□□□□□ -1.61
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CCL20-204ENST00000489160 ZNF713Q8N859 430 aaPredicted RBP5.01□□□□□ -1.61
CCL20-204ENST00000489160 KCTD6Q8NC69 237 aa5.01□□□□□ -1.61
CCL20-204ENST00000489160 OR14A16Q8NHC5 309 aa5.01□□□□□ -1.61
CCL20-204ENST00000489160 ASB5Q8WWX0 329 aa5.01□□□□□ -1.61
CCL20-204ENST00000489160 OIT3Q8WWZ8 545 aa5.01□□□□□ -1.61
CCL20-204ENST00000489160 ELMOD3Q96FG2 381 aa5.01□□□□□ -1.61
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CCL20-204ENST00000489160 HAUS8Q9BT25 410 aa5.01□□□□□ -1.61
CCL20-204ENST00000489160 EBF3Q9H4W6 596 aa5.01□□□□□ -1.61
CCL20-204ENST00000489160 RABEP2Q9H5N1 569 aa5.01□□□□□ -1.61
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CCL20-204ENST00000489160 SETD4Q9NVD3 440 aa5.01□□□□□ -1.61
CCL20-204ENST00000489160 CWC25Q9NXE8 425 aaPredicted RBP5.01□□□□□ -1.61
CCL20-204ENST00000489160 OGFRQ9NZT2 677 aa5.01□□□□□ -1.61
CCL20-204ENST00000489160 SUCLA2Q9P2R7 463 aaPredicted RBP5.01□□□□□ -1.61
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CCL20-204ENST00000489160 TAS2R40P59535 323 aa5□□□□□ -1.61
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CCL20-204ENST00000489160 TDRD12Q587J7 1177 aaKnown RBP5□□□□□ -1.61
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CCL20-204ENST00000489160 KIAA0930Q6ICG6 404 aaPredicted RBP5□□□□□ -1.61
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CCL20-204ENST00000489160 SCARB1Q8WTV0 552 aa5□□□□□ -1.61
CCL20-204ENST00000489160 JAKMIP1Q96N16 626 aaKnown RBP5□□□□□ -1.61
CCL20-204ENST00000489160 SLC25A33Q9BSK2 321 aa5□□□□□ -1.61
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CCL20-204ENST00000489160 PLK3Q9H4B4 646 aa5□□□□□ -1.61
CCL20-204ENST00000489160 CNGB3Q9NQW8 809 aa5□□□□□ -1.61
CCL20-204ENST00000489160 MORF4L1Q9UBU8 362 aa5□□□□□ -1.61
CCL20-204ENST00000489160 MYO6Q9UM54 1294 aa5□□□□□ -1.61
CCL20-204ENST00000489160 R3HDM2Q9Y2K5 976 aaKnown RBP5□□□□□ -1.61
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